Clc01G12010 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGTTATATTGGTAAATATTTTCAATATGATTTAAAATAGTTGTTCAAACAGAAACTCAAATATCTCTAATAATATTTGTGTTTTGTTAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAACACTTCCGAAGGGGCAGTTACTCTAAGAGTCAGAACATTTAACAAAACTTGGGGTCAAGTGAGGTGTATGCAGGCGGTGGGCATCTCTCCTCAACGGCGAGAACACAGCAAGAGCCGCGAGCTGATTCAATCTCCATGTGCGCATCATCCATTTTATTCTAATCAATTCCCTTCCAAATCTCATCCTTCTAGTCCTCATATCTGCCAACGCCCTTTCCCTCCAGTCTCACCTCCAGATCTTGCATCCATGGCTCCTCGTAAACCCCGCGAGCCACAAGTTCTCGAATCCTTCTACCCCGTCGTCGCCCTTGTCTTCATTCTAGTTGCCTGTGTCGAGCTCTGTGACGCCGCCACAGTCGTCGATGTCTACCGTCTCATTCACTACGATATCTCTGGTGTTCCCTTTGGATCCCGCGCCGCCACACTCAATCACCATGCTTCCTCTCTTCATTTTCCCTCTGCTGCTGATCTCTCTCGCTCCGTTCTCATCATTCCTCTTTCTGAACTCAATATCACCTTTCTCCAAGGTACCATTCTCACTTTCTTAGCTGCTGGATCCTCGTCGTTAATATGTGGAGATTTTAGTAAACCACTTGTGAACTGTATTCAACTGGCTGCGCCTTGAATTACTTTAATAGATACAGTTTTGGATAGTTTCTTACTTTGTGTATTTGTATTCAAATATTCAAAATTTGGGAGGTTTTAATCTTCTTTCTATTACCAATCAGTACTGTGTTTGTAGACTTGCAGAACTTTGTTAATCTAATTTCTCTTCTATTTGAAGGAAGAAGAATATGATTGTAGGCTTTGTTCTTACTTCTTAACTTTTTACATATCAGAAATCATGCCTGTTTTTCTCAGTGAGAAATTATGTGAACTTTAATATATGTATATTTTATAAGAATTTAGGGTTTACTACTCCCGCTCGTCTTTCACCTGTTGGTAACCGGGCTATCTTTTGGTCCTGTGCAGAATGTATATCTCAGAAAAAGCGTCTGGGAGGTCTGTTGATTTTGCTTCCCAGGTTTCTTGGCTCGGATGGCCCGAAAAATGATGACATTAAATGTCCACATAATGGAGAGGGGATGATCAAGGATTTATTGGTTGAACTTGAACGGTTGCTCATACATTCTACTATACCTGTGAGTGAAATGAAAATAACTTCTGGTGAATCTTCATCATTTCACCAGACATTTTAATAATTAACAGTTATTGAGTTCTCATTTTCTGAATTTTCTATGTTTATTCTTTCTATGTTTATTCTGAATTCTGTTTTATATTCTGTTCCTTCTATACATGGTTGAAGCTTTTAAGCATTTAGCTTCCATTTATATTCATCTAAACTTTATATTCTTTCTACATTAAATAAATGAATGTTATCTACTCTCATTTTGTGAGTTATGACCACCTTACCTTCTTGTATTCCTTTACTTCAATTTATATTTTCAGTTTCTATAATGTGTTTGCGTTTCTGAGAGTTTCTATGTCGTTCCAGTATCCTGTATATTTTGCTTCAGAAGGTGAAGATATTAATGCTGTTTTGGCTGATGTCAAGAACAATGACGCCACTGGTCAGCTTGCAACTGCAACTACTGGCGGGTTAGTTGAATCTATTATGAAATTATGTGCGCTGTAGTGGATTTTATGTGTTTAACGGAAATCACAATAGAGAAAGGAAAGAATGGTTACTTTTGGCATATGAATATATTTTTCTATGTTTTATATTTTAATTCTGATTTTGATATGATTATTTAAGGGTTATTATTATTATTGTTATTTATTATTTTTTTTTTTTTGTTGCAAGCTTACCTTCTATTGCAACAGACAACAACATTAAGTTAGAATGTGTTGAGGGCAAAATTGTGTGCAAGTGTGTTGAGGGCAAAATCGTTTGCAAGTGTGTTGAGGGCAAAATCGTTTGCAAGTGTGTTGAGGGCAAAATCGTTTGCAAGTGTGTTTGAGGGCAAAATCGTTTGCAAGTGTGTTGAGGGCAATATCTATGAGTCGTTTGAGGTTGGTGAGGATAGGGTTGTCCTTTCCCATCTTCAATTCTGGAATGACACCCTCTTTTTCTGTTCTGGTAAGGAGCCGTCATTCTTGATTTTGAATAATGTTCTTGCCTTCTTTGAAGAGATGTATGGGTTGAGAATTAATAGAGGGAATTGTTGTGTTATGGGGATTAACTGTGGTGAGGAGAAACTCAATCGTTGGGCCGAAATGGGGGGGTGATGTCGGCAGTCTTCCCTCTTCTTACCTTGGTCTCCCTCTTGGGAGCATCCCTAACTCGAGTTCCTTATGGGATTTGGTGGTGGATAGAGTTCGGAAGAGGTACGCTTCTTGGAAAAAGGTTTTCTTTTCTAAAGTTGGTAGGCTCATCTTGATGAAATCTATCTTGAGTGGCATTCATGTCTACTTCTTTTCCCTGTTTAGAGCCTTGTGTGAAGTGTGTAAGAAAATTGAGAGGCTCATGCATGATTTTCTTTGGGAAGGGATTGAAGAAGCTAAGGGCCAGGGATCGCATTTGATTAATTGGGATGTTGAGAGACCAGTCTCCTGGGGGGAGGGGGCTTGGAATTGGGAAGCTTAGGGTGTGAAATAGAGTTTTGTTAGACAAATGCCTGTGGCATTTTTCCTCTGAGCCCAACTCTTTGTGATGCAGGATCATAGCTAGTAAACATAGTCTCCATCCTTTTTAGTGGCTATCTAAGAGAGCTAAGGGCACTTACCAGAATTTGTAGAAAGATATTTTGGAGATGTTAGGAACCAAGATAGTATGGCTACCTTTGTCCCACATTGGTTAGAATGGGACGACCAATTGGCTTGACTCTCCCACCTCAATACCTAACTTTGGGGTGTGGTTCACCAAGGTGCTTAAGTACCTAACAATGGTATCATCAGATCGGGTGTGACCGAGTGAAGTATCGTCGAAGTAGCCGTCGGGACATCGACTTTTCGGGGATAGGGTATGGTTAGGAACCAAGGTAGTATGTGTTACCTTTGTCCTACATTGGTTAGAATGGGATGACCAATGTGGTACTTAAGTGGCTTGACTCTCTCACCTCAATAGCTAGCTTTTGGGGTGTGGTTCTCCAAGGTGCTTAAGTACCTAACACTCTCTTCTTTTTTGTTCCTTTGGTTCGTTGTGTGGTGGGGGAGGGGAGGGCAACATACTTTTGGGAAGATCATTGGGTGGGGGAGAGACCTCTCTCTGCTCTTTTCCCTCGTTTGTTTCACCTGTCGTCCCTCAAAAATCACTTTGTTGGTGGTTTTCTTGTATGGTCTGGGAGCTCTTGTTCTTTTTCTTTTGGGTTCCGTCGTTTTTTTCCCCTTTTTGATAGGGAGGCGAAGGAGGTCACTGCCCTTTAGATTAAGGAGAAGGAATGTTCGTGTTTGGAGCCCCATTCCTTTGGAAGGGTTTTCATGCAAGTCTTTCTTTCCGTGTTTGGTCAATCCCTTTCCTATAGGTGTATCAGTTTTTTCATTTCTTCGAAGGACTAAGATTCCTAGGAAGGTGAGGTTCTTTACTTGGCAGGTCCTTCATGATTGTGCTAACACATTGGATAGGCTTGCAAGGAAGTTGCCTTCGCTTGTTGGGCCGTTCTGTTGTATTCTTTGTCGGAAGGCGGAGGAAGACCTGGACCATATTCTCTAGTGTTGTAACTTTGTGATATCTGTTTGGGATTTATTCATGCAGACGTTTGGTATGTCGTACGTTCATCATAGAGATGCTAGTGCTATGATCGAGGAGTTCCACCTCAATCTGCCTTTTGGGGAGAAGGGTTGCTTCTTATGGACGGTGGGAGTGTGTGTGATTTTATAGGTCTTGTGGGGTGAGTGGAACAATAGTGTGTTCAGGGGGATGGATAGGGATCCTAGGGAGACTTGGTCCCTTGCCTGCTATCATGTCTGTTTGTGGGCTTCGATTTCAAAGACCTTGTGTAACTATTCTATACGAATGATCTCTTATAGTTGGAGCCCCTTTGTAACATCTCGAGTTCTAGATAAATTGGAATTAATTATATCAAATTGTTGGGCTTTGATTCCCTTTAATTTTTGGATTTTGGAGCCAATCTAAAGCAATTGAGAAGATCATTAATTTGATGAGGATTTAAATTGATTAAATGTTTGGAAGGATTTAATTTATCTCAAACTATTGAATTTTATGTTCCCTTTAATTTTGGTTTTTGAACCAAAATGGGGCAAATTTGAGAAGATAATTGGTTTAGATTAATTGGCAAGATAATTTGAGATTAGTTGGTATTAGAGCCCAAGATTATAGGTTCTAGGTTCTGTAGAGTCACTTACAATGTAAGTCCAGAATGTCCCTATGGCCCATTAACGAAATCTTCGTCATCGCCAAGTATGTTCTTTAAGTAAAGGTTTACAGAATTGTATGCATAGTGTTTGTTTGATTTAATGCATTTGTAGATTATGTTTGCTTTGACTGAGAATTTGAGATGGGGTAGTTATGTATGGATGTTAGGAGATGACATGTTGAGTCAGAGGAGGTAGAGGAGGCATAACCGTTAGAAGAGGGATATGGGACCCTCATGTTCAGGGTCCACAAGTGTAGGACCCTTAGGTTTCAGACCCTCTTGCACCGCAGGATCTCCCTCAACCACTTCACCCTTAGGTCAAGGGAACAAGGAATTGCACCGGGAATTCAGACCCATAATGTACATGTGCCTCTGTACCTCCGTAGACAAAGACTCCACCTTTCTTCTTGGGTGATTATGCTGCAATTGTAGTGTTGATATGAGAAGTTGTTACAATAATTGTGATGGGAAAGGTAAATGACATAGTGGCGAAACAAATAGCTTAGCATGCCCAATCTTAACAAATACCACCTCACCCCAACGATTCCAGTGCCACATGTTCAAACT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GGTTATATTGGTAAATATTTTCAATATGATTTAAAATAGTTGTTCAAACAGAAACTCAAATATCTCTAATAATATTTGTGTTTTGTTAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAACACTTCCGAAGGGGCAGTTACTCTAAGAGTCAGAACATTTAACAAAACTTGGGGTCAAGTGAGGTGTATGCAGGCGGTGGGCATCTCTCCTCAACGGCGAGAACACAGCAAGAGCCGCGAGCTGATTCAATCTCCATGTGCGCATCATCCATTTTATTCTAATCAATTCCCTTCCAAATCTCATCCTTCTAGTCCTCATATCTGCCAACGCCCTTTCCCTCCAGTCTCACCTCCAGATCTTGCATCCATGGCTCCTCGTAAACCCCGCGAGCCACAAGTTCTCGAATCCTTCTACCCCGTCGTCGCCCTTGTCTTCATTCTAGTTGCCTGTGTCGAGCTCTGTGACGCCGCCACAGTCGTCGATGTCTACCGTCTCATTCACTACGATATCTCTGGTGTTCCCTTTGGATCCCGCGCCGCCACACTCAATCACCATGCTTCCTCTCTTCATTTTCCCTCTGCTGCTGATCTCTCTCGCTCCGTTCTCATCATTCCTCTTTCTGAACTCAATATCACCTTTCTCCAAGAATGTATATCTCAGAAAAAGCGTCTGGGAGGTCTGTTGATTTTGCTTCCCAGGTTTCTTGGCTCGGATGGCCCGAAAAATGATGACATTAAATGTCCACATAATGGAGAGGGGATGATCAAGGATTTATTGGTTGAACTTGAACGGTTGCTCATACATTCTACTATACCTTATCCTGTATATTTTGCTTCAGAAGGTGAAGATATTAATGCTGTTTTGGCTGATGTCAAGAACAATGACGCCACTGGTCAGCTTGCAACTGCAACTACTGGCGGGTACAAGCTTGTTGTTTCGGCAGCAGAACCAAGAAAACTTGTATCTTCCACGATTACAAATATTCAGGGTTGGCTGCCTGGACTAAAATCTGATGGGGATGCTAGTCAACTCCCAACGATTGCTATTGTAGCATCATATGATACATTTGGCGCTGCTCCTGAATTATCCGTGGGAAGTGATAGCAACGGAAGTGGAATTGTTGCACTTCTTGAAATTGCAAGGTTATTTTCTCTTCTTTATTCAAACCCTAAGACAAGAGGAAGGTACAATCTACTTTTTGGGCTCACTTCTGGCGGGCCTTACAACTACAATGGGACTCACAAGTGGCTTCAAAGCTTTGATCACCGTCTCCGTGAGAGCATTGACTATGCTATTTGCTTAAATAGTATTGGCTCATGGGATGACAAATTATGGCTGCATGTCTCCAAGCCTCCGGAAAATGCCTACATTAAGCAAATCTTTGAAGATTTCTCAAATGTTGCCGAGGATTTGGGCTTTAAAGTTGATCTGAAGCACAAGAAGATCAATATTTCAAACCCTCGAGTAGCCTGGGAGCACGAACAGTTTTCAAGATTGAGAGTAACTGCTGCTACCCTTTCTGAACTCTCTGCTGCTCCTGAGCTTTTGGAAAGGACTGGAGGTTTGGCTGACAACAGATTGTTTCTGAACGAGAATAAAATTGCCAAGAGTATCAAGTTAGTTGCCGAGAGTCTTGCAAGGCATATTTACAGATATGAAGGAAAGAATATACAAGTATTTGCAGATGATAGTAGTTTGGCAGTCAATCCAACTTATATTCGATCATGGTTGGATCTTTTATCACGAACGCCTCGAGTTGCTCCATTCCTGTCGAAAGATGATCCTTTCATATCAGCATTAAAAAAGGAACTGGAGGTCCATACCCATGATGTGAGCTTGCAACATGAAGTATTTGACGGAATGTTCACCTTTTATGATTCAACTGCAGCTAAACTTCACATATACCAGGTTGCTAGTGTGACATTCGACTTGCTTTTGCTTTTGGTATTGGGGTCGTATTTAGTTTTACTCTTCTGTTTCCTCGTGATCACAACCAGGGGTCTCGATGATCTGATCGGTCTATTTAGACGCCCTCCTTCCCGAAAAGTAAAAACAGCTTGACGACTGCAGTAGATTTTGATGCTTGGATTTGCATCATTGCCACCCGAATTTTTGCCATCTAGATTAGACAGGCCTTACGATGGAGGTCCAAATGTGACAAAGGTGTGAAACCAATCATCAGGGCTCGAGGAACTGAAGGTTTTATGTGGCCATTCCTTGCACGATTTTATTTTTCTTTCTTTGACATCCTCTCTGTGACATAATTAACAGTTACAAGAACTCTCGAGGTGCGATAATTTTTGTTTGGTCTCCATATTTAAATTCTTACTGTTTAACCCTCATTTGTGGCTTCCACTTTTGACAATGATCTTTTCCTTAGAATTTGTTGGGTCTATTATTTCTTGCTCAGTTGATGTTAGTGGCAGGCAATAGATTCTGTTCAACAGTTAAAGAAAATCTTTCTCAGAGAATATGTTTGAGGTTATTTAATAGTATTATTATTTTTTCACAGTTGACTGGTGGTTTTTGTCTCGTTATTTTGCTAATTATTCAGTTTTATCAAATATTTGAGTTGCATGGAGTTAAAAAGTTACCGAGAGAAATACTATACAAGATTTCATCTATTGCTACAATCATCCAGAATCCATATTTTTCTACATTATAATATGTTAAATCTTGTTCTCGTTTCCGAGCCTTACTGACACAACTACAACTACATATCTTAGGAGTTGTCCCATGATACAAACCCATTGATGCATAACTTGCTTGGACTTCGCTCGGATTTTA ATGCAGGCGGTGGGCATCTCTCCTCAACGGCGAGAACACAGCAAGAGCCGCGAGCTGATTCAATCTCCATGTGCGCATCATCCATTTTATTCTAATCAATTCCCTTCCAAATCTCATCCTTCTAGTCCTCATATCTGCCAACGCCCTTTCCCTCCAGTCTCACCTCCAGATCTTGCATCCATGGCTCCTCGTAAACCCCGCGAGCCACAAGTTCTCGAATCCTTCTACCCCGTCGTCGCCCTTGTCTTCATTCTAGTTGCCTGTGTCGAGCTCTGTGACGCCGCCACAGTCGTCGATGTCTACCGTCTCATTCACTACGATATCTCTGGTGTTCCCTTTGGATCCCGCGCCGCCACACTCAATCACCATGCTTCCTCTCTTCATTTTCCCTCTGCTGCTGATCTCTCTCGCTCCGTTCTCATCATTCCTCTTTCTGAACTCAATATCACCTTTCTCCAAGAATGTATATCTCAGAAAAAGCGTCTGGGAGGTCTGTTGATTTTGCTTCCCAGGTTTCTTGGCTCGGATGGCCCGAAAAATGATGACATTAAATGTCCACATAATGGAGAGGGGATGATCAAGGATTTATTGGTTGAACTTGAACGGTTGCTCATACATTCTACTATACCTTATCCTGTATATTTTGCTTCAGAAGGTGAAGATATTAATGCTGTTTTGGCTGATGTCAAGAACAATGACGCCACTGGTCAGCTTGCAACTGCAACTACTGGCGGGTACAAGCTTGTTGTTTCGGCAGCAGAACCAAGAAAACTTGTATCTTCCACGATTACAAATATTCAGGGTTGGCTGCCTGGACTAAAATCTGATGGGGATGCTAGTCAACTCCCAACGATTGCTATTGTAGCATCATATGATACATTTGGCGCTGCTCCTGAATTATCCGTGGGAAGTGATAGCAACGGAAGTGGAATTGTTGCACTTCTTGAAATTGCAAGGTTATTTTCTCTTCTTTATTCAAACCCTAAGACAAGAGGAAGGTACAATCTACTTTTTGGGCTCACTTCTGGCGGGCCTTACAACTACAATGGGACTCACAAGTGGCTTCAAAGCTTTGATCACCGTCTCCGTGAGAGCATTGACTATGCTATTTGCTTAAATAGTATTGGCTCATGGGATGACAAATTATGGCTGCATGTCTCCAAGCCTCCGGAAAATGCCTACATTAAGCAAATCTTTGAAGATTTCTCAAATGTTGCCGAGGATTTGGGCTTTAAAGTTGATCTGAAGCACAAGAAGATCAATATTTCAAACCCTCGAGTAGCCTGGGAGCACGAACAGTTTTCAAGATTGAGAGTAACTGCTGCTACCCTTTCTGAACTCTCTGCTGCTCCTGAGCTTTTGGAAAGGACTGGAGGTTTGGCTGACAACAGATTGTTTCTGAACGAGAATAAAATTGCCAAGAGTATCAAGTTAGTTGCCGAGAGTCTTGCAAGGCATATTTACAGATATGAAGGAAAGAATATACAAGTATTTGCAGATGATAGTAGTTTGGCAGTCAATCCAACTTATATTCGATCATGGTTGGATCTTTTATCACGAACGCCTCGAGTTGCTCCATTCCTGTCGAAAGATGATCCTTTCATATCAGCATTAAAAAAGGAACTGGAGGTCCATACCCATGATGTGAGCTTGCAACATGAAGTATTTGACGGAATGTTCACCTTTTATGATTCAACTGCAGCTAAACTTCACATATACCAGGTTGCTAGTGTGACATTCGACTTGCTTTTGCTTTTGGTATTGGGGTCGTATTTAGTTTTACTCTTCTGTTTCCTCGTGATCACAACCAGGGGTCTCGATGATCTGATCGGTCTATTTAGACGCCCTCCTTCCCGAAAAGTAAAAACAGCTTGA MQAVGISPQRREHSKSRELIQSPCAHHPFYSNQFPSKSHPSSPHICQRPFPPVSPPDLASMAPRKPREPQVLESFYPVVALVFILVACVELCDAATVVDVYRLIHYDISGVPFGSRAATLNHHASSLHFPSAADLSRSVLIIPLSELNITFLQECISQKKRLGGLLILLPRFLGSDGPKNDDIKCPHNGEGMIKDLLVELERLLIHSTIPYPVYFASEGEDINAVLADVKNNDATGQLATATTGGYKLVVSAAEPRKLVSSTITNIQGWLPGLKSDGDASQLPTIAIVASYDTFGAAPELSVGSDSNGSGIVALLEIARLFSLLYSNPKTRGRYNLLFGLTSGGPYNYNGTHKWLQSFDHRLRESIDYAICLNSIGSWDDKLWLHVSKPPENAYIKQIFEDFSNVAEDLGFKVDLKHKKINISNPRVAWEHEQFSRLRVTAATLSELSAAPELLERTGGLADNRLFLNENKIAKSIKLVAESLARHIYRYEGKNIQVFADDSSLAVNPTYIRSWLDLLSRTPRVAPFLSKDDPFISALKKELEVHTHDVSLQHEVFDGMFTFYDSTAAKLHIYQVASVTFDLLLLLVLGSYLVLLFCFLVITTRGLDDLIGLFRRPPSRKVKTA Homology
BLAST of Clc01G12010 vs. NCBI nr
Match: XP_038894420.1 (nicalin-1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1080.9 bits (2794), Expect = 0.0e+00 Identity = 543/564 (96.28%), Postives = 556/564 (98.58%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. NCBI nr
Match: KGN64956.1 (hypothetical protein Csa_022770 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1073.5 bits (2775), Expect = 4.8e-310 Identity = 547/593 (92.24%), Postives = 568/593 (95.78%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. NCBI nr
Match: XP_023520704.1 (nicalin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1065.8 bits (2755), Expect = 1.4e-307 Identity = 532/564 (94.33%), Postives = 553/564 (98.05%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. NCBI nr
Match: KAG6583712.1 (Nicalin-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1062.8 bits (2747), Expect = 1.2e-306 Identity = 539/586 (91.98%), Postives = 560/586 (95.56%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. NCBI nr
Match: XP_008463652.1 (PREDICTED: nicalin-1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1058.9 bits (2737), Expect = 1.7e-305 Identity = 535/564 (94.86%), Postives = 552/564 (97.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NZ07 (Nicalin-1 OS=Danio rerio OX=7955 GN=ncl1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 2.3e-71 Identity = 200/595 (33.61%), Postives = 319/595 (53.61%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VCM8 (Nicalin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ncln PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 9.0e-68 Identity = 183/545 (33.58%), Postives = 291/545 (53.39%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XIA1 (Nicalin OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ncln PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 9.0e-68 Identity = 185/545 (33.94%), Postives = 287/545 (52.66%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q969V3 (Nicalin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCLN PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 250.4 bits (638), Expect = 5.5e-65 Identity = 171/540 (31.67%), Postives = 283/540 (52.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZJH2 (Nicalin OS=Gallus gallus OX=9031 GN=NCLN PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 222.6 bits (566), Expect = 1.2e-56 Identity = 165/547 (30.16%), Postives = 275/547 (50.27%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LYB7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G167840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1073.5 bits (2775), Expect = 2.3e-310 Identity = 547/593 (92.24%), Postives = 568/593 (95.78%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJR5 (nicalin-1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501746 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1058.9 bits (2737), Expect = 8.2e-306 Identity = 535/564 (94.86%), Postives = 552/564 (97.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IC52 (nicalin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471642 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1055.4 bits (2728), Expect = 9.0e-305 Identity = 528/567 (93.12%), Postives = 552/567 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EL15 (nicalin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434272 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1054.3 bits (2725), Expect = 2.0e-304 Identity = 530/567 (93.47%), Postives = 551/567 (97.18%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CME5 (Nicalin OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012612 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1035.8 bits (2677), Expect = 7.4e-299 Identity = 524/564 (92.91%), Postives = 536/564 (95.04%), Query Frame = 0
BLAST of Clc01G12010 vs. TAIR 10
Match: AT3G44330.1 (INVOLVED IN: protein processing; LOCATED IN: mitochondrion, endoplasmic reticulum, plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nicalin (InterPro:IPR016574), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Nicastrin (InterPro:IPR008710); Has 245 Blast hits to 243 proteins in 99 species: Archae - 6; Bacteria - 10; Metazoa - 139; Fungi - 0; Plants - 46; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 44 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 818.1 bits (2112), Expect = 4.7e-237 Identity = 411/552 (74.46%), Postives = 473/552 (85.69%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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