Cla97C02G045700 (gene) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C02G045700
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr02: 33670034 .. 33675950 (-)
RNA-Seq ExpressionCla97C02G045700
SyntenyCla97C02G045700
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGCACCGCCGCCGCCACCGTCATTCTTTCTTGGCAAAGAGACCACCAAACACGCCGCCGTTCTTCTTCGGAGGAACTTGGACGGAATTCTTCCGGCCACCGCGGACGGTACCACTGCCGTTACCTGCGGCGGCGTTCTTGCCCTCGACCTTTTGAAGAACAGGGTCAGTTTCAAGAAGCTGATCCTTATTCAAGCTTCCGATGATCCAATCAAGAAGGCCCTTTTCCTTCTTGCTTTCGCCGGCACCCTTAGCCGCCGTGGCTGCGAACACACGTCCAGCGGCCGGAGAGAATGCGATTGGTAGAGAGGCCATAATATTTTTTAAAGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTGGAATAGGAAAAATTGAAATGAAATGGGAAGAGGATATTTGGGTAAAATAAGAGGCGATGGAGTGTTGAGAAGCGCGAGCGAACCACAGGCGTCTTATCTCTTTGATTCTGAGTCCAAAATTTTTCCTTTTTTTTCTTTCTTTTCTTTTTGTACATTTTACGATTAATCCGCACCAGACTTGGCTCCTAATTCGACACGTCGGTTTGTCTTTAGCTTTCTAGAATGGGGTCCACGGGCCCAGACGGCTATTGGGCCGGCCCATTTAAATTAGAGCTCGAAGTATAGGTCTGTCGAACCAAAAGAATGTTGAGGTGTGAATGGCTCAGGGTTTTCAAATTGGAATTTTTGCATGCTAGTAGACAGTGGATGAAAAAGCTTCGCCCTTTTCAAATCTGGCATGTTGTTATTATCAAATTGAATTGTTTATTTTTTTTTCTTTATAAATTTGTTGAAGAAGAAATTTCTGCCAATCACAAGTCGCCACATCATCACAATTCAATTCCATTGTGGAATTTTGGGCTAAAGAAGGTACTGGGCCCAAGCCCAGGCCCACCTAGAGTCTATGAAAATCTTCTATAAATAGAGGTCCCTCCCATTCATTTAGGGGATGGAAGCATTGACGACAAAGTTGAAACTTTGAAGACTTGAAAATTAAAGCTCAATATTACAACCGTCTTCTGAAGATTGAAGACTTGGAAGACTTGGATGATCGATCCCAAGTTTACAATTTCTTGAAGATGGGAATAACCGAAGCTCTGAAGATTTGAAAAATACAACTCCTTCAAAATGTTGAAGATCATCAAAGATTAAAGCTCCAAAGATTAGCTTTTACTCTCCTAAACCTCTAAATATTAAAGCTCATAAGACTCACTAAAGCTCTTGAAATCAAAAAATCTAAATGTTCATTCAAGCATATCAACAAGCCTAACGCCAATCCAAGAAGATCATCAAGCCCAAAATCAATCCTTAAAACAAGAAATCTAAATAACATAGTTGTGCTCATTTATATCAACTAAACAAATATATATATATAGAAATTTCTCCGTGGTTCGTGGTGCCCAAGAACCCTCCCCATCTTCATCTCCCTCTTCACGAACCCTTTGTTGCCATCGACCAGGCGTGGTCTGTCGTCGCTCGATCGATCAAAGAAACCTATGGTCAAGGAACCTTTAGCCGTTGACGATCAAGTCTGTGCACTACAATCAACGGAACCCTAGCCATCTTCCATCACAGCACACCCATGTCCGAGGGTTGGGTCGGTAGCGGTGAGTTTGGTCATTTACAGGGATTGAAGAAAGGAGGTTTGGAGGGAGGAGAATTTGAGTCGACTGGGTGGGGCAGTGATCTAGGTCGTCAGGGGTTGTGTCAAGGGGCAGGAAGCCAGCCGACGACAGGGTGTGGGCAAGAGAGAAGAAAGGAAAAGAAGGAAAATCTTAGGGGTGGGAGAGCACAAAATGAGAAAACCTATAGTCAACTGCAGGTTTTTTTGTTTTTAATCATTTTGATTAATGGAGAATATTTGAAAATTAATAAATTTTTCTTAAAAAACGTGCGTGATCTTTGAATTTCCTAATTAAAAAATATCTTATAACTAAATGTTAGTTGGGGTCTAAATGGTAAATAACCCTAATTTTATTGTAAAATTAGACATTCTTGTAAATAAAGAAAAACTTCTGACACCACGCGTAGAAATCCCTTAATTTAAACCGATTATTTGCATTCTTCTAAATCCAGAAAAGAAAACGACCCGGAAGTTATTGGACTGTGTATGATTAACAACACAATCGAGCCCATTTTTGGGCCCATATTTATTTCCTAAGGGCCCATCGAATTATTGAGGCCCAAATTAATAAATTAATAAAGAAATGGTCATATATAGGCAAATAGGTGGAGAGGGTAATGGTGGCGCGTGCAGAACACGCGCCGACAACCTCTGCATGGCACAATAATTAACGGACGTGTTTTTTTGTCTCTCCACGTGCATCCCTGAATTCCAACTCTAATTTTGTTATTGTTCCAACTTCCAATTAACTTTTCTTTTTTTCTTTTTTAAATTATTTTGTATGTGTGTGTGTTTTGTTTAAAACCAATTTTTTTTTTTTTTCAACGGAAATATCATTAAGTTTTTGTATTCAAAAGTATGATTGGTTTATTTGTATCAGGACAGAGTACAAATTATTGTACCTCAAAACAATTAAAAACAGCACGAAATACTATTTTAAGAAAAAAAGAAAAATATATATATATATATATATATATATCTATTTAATCGTACTTATGGAATTTTTAAAGTATTTTTTTAAAGGTTAGATGATGTTTTAAATTGATTTAAAGTACGAGAACGGACATCACGCAAAATTAATTTAAGCATAATGATTATGATTTACTTGTTCTTTCTCTTATTATTAGTACTCATTATATCATAACTCCAAAGGGAACCATTAAATTTTCTTTAGAAACAAGCAACGGGTTTGCCGCGTCATCGGTTAAAAAAAAAAGTAATTTAAAAATAATTTAAGTCGCGATAAGTATTTGATTTTTTGTTTTGGAATTTTTTATACTAGATTGAAACTAGAAGTAAATAAACTACATATAACAAAATAACCAACTAATGAAAGATATACAATAACTAATTTTAATAGCTACTTTATTAAATAAACATGGGTTTACATCTCAAAATCAATTAACAAAGAGAAGAATAATTTATGTATCTTATAAATGGTGTGAGGTATCTCCGTTCTCTCAATGTGCGATTTTCGACATACTCCTTAAGATTATACATCTTTGTGTTCACTATTATTGGTTTGGATTTTTTTGGACTGAATGTTCATTTGAGCTTTATGGACTTTTAATACCATAATAGATAAACATAGGGTTCCACGTCAAAATCAATTAGTAATAGAGAAGAGTAATCCAAGCACCTTATACAAACTTGTAATGTCTCTTCGTATTCTCAAATCTCGATATGAGATTCTCAAAACATAGAGTGTCTTCAAAATGCAAGCCAAAATTTTAATACTTTTTTTATAAAAAAATGTTTTTTAGAATTTTACCAAAGATTCAAATGTTTTATTTGGGATGATGAAGACACGATTTAAAAATCACGAGAAACCAAGCACAATTTCAAATATTAAAAACTAAATATTTATCAAATGGAGTGCCAAAATTACAAGTTTAGTCTTGTTATGAAACTCCAGAGCATTATATCTAACTTTCAAGAATCATGTTGAACAACAAAAGTCAAAAAATTGAACACCAACAATTCTAAAACCAATTTGATCTCGAACCTTAAGATAGCTAGGCTTTGTGGCAAGTTATGATATTGGGTAGGCATAGGTGGATCAAGCAATTTTTTAAATACTGAGCTATTCATTCCAAGCAAGATAATATAATTATGAAAATAATAAACAAATAAAAAAGAAACAAAACAAGAAAACAATAAAAGTAACAAATAAACTTGAAAATTAGATTACCTCTTAGATCGAATATCTAGTAGCAAGATTTGGAACCTTGTTCTAGATTAAGTCACTCTACAATCAAACTTAATCAAGACTTGAATGGTTCAAATACATTCTATCCTAAGGATTGCAATGAAAACTTAGAAAATGCAAAGATAGTTACGTTGCTTATCAAAATTATATTTCATGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCGTCTTTTTACAATCCAATTCTGAACCTTTCTATAGCCATTACATGAAGTAACTCCCAACCTTTCAAATTACCAAAAATAAATGACAACTCAATGGGGATGATCCATTTCACTTGGAGGATTGTTTCTATTTAGTCTCTTAACTTTTAAAAGTGTGTAACAAATTCTGACACGTTCAATTTTTTGTCGAATAAATCTTTTTATTTTTAAATTTGCGCGCCTAGATATTTGAAGATTTTAAAAAATCAATTAACATATTATATATAAATTTGTATTTCATGTTTAATAATATATATCCTAAAGTTTTAAATTTGTTTCAGATCAAAGGGTTTTAAAAAAATTCCAAGTTCAAAAACTAAAATTATGATTTAAAAATTTCACTTGCCAAATAAGCACAGAACTAAAGTTAACAAACTAAATAACAAAAACATTTAATTTCATTATGTTGGCTACACTGCATCTAAAGTTCAGCTACATTATCTGAATTTATTGTCTTTATTATTATTGTAAAGTGAATAGCTAGGGGTTAGTTGCATATACAGCTCCTTTAATATTAGAAACAAATTTAATAGTTATATGTGTTTGTGGCATGAATACAATTAATTTTGAAAATAGAAATTTCAAATACCACTTACTCTATTTATAGGTAAGAACAAAATATACATATTATAGGGAGCTTAAAGTTTGTATCTTTATAATAAGAAAATTGAACTATTCAATATGTATATATGTACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATAAAAACAAAACAAGAAGTTGTGAAGCTCGTTTATTTTTTATTGGAGTAAGCGTAAGAGCAACTATCGATTCTTCTATCAGTATCTTTTTTTCTCTTGGAAGCTCCCGAATGTCTCATTTTGTCTTTGACTTTTTAAGATCAGTCTCACATTTTCCTTAGAGCACAATCACTCCTGAATTTACTAAAGCAATCTTTTCCTAAGCAGAAAAAACATACACATAAGCATTCGAGGATGTCGAATCATCCACTAAAGAGTAAGATTTTTGGAAGAATAAATTCATTGTCGAACCCTTAAAGCAACAAGCGCGAATAGACCAACGTGAGTATAGCTCAACTGACATGAACTTGTATTATCAACTTTGAAATTTAAGATTCAATCTCCACTGTAAATATTGTTAAAAAAAATGCAAACAAAATGTTAAATATATCTCATAATTCTAATTATTGGTATATATTAAAGATAATACGTCATCAATATAAGTATTTAAAAATGTAAACATAATCATAGCTCAACTGACATTCAAAGTATGTTATCAAACTCGAGGTCAGAGTTTGGATCCGCTTCCTCTATTATTATAAAAAATAATAAAAATAAAAAGTCCTTAACTAATTTGTTGGTATTATTTTAAAATTTGACATTGCATTTTAAATTGAAATTAAAGATTAATGAAGTAGATGGAAGGAGAGTGAAGGGAGGAGAGAGAGGATAACTTTTTAATTAATGTTATAAAACTTAATTCCTAAAAATTTGAATATCGAACATTTGTATTTTAAAATTTTGGACGAATTCAGATACTTTAAATTTAAAAAGTAAATTTACCAAAAAAACAAAAAAACAAAAAAACAAAACAAAAACAAACAAAGAAAAAACCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTCGTTTTTTTAGATAAACGTATGAAGTGATTAGATTTATTAAATGATAATAAATAAAAAAGCAACATTTCAAACTTTTTAGTTGATGACTGTGACAGTTGAGCAATCAAAGATCACAGACTCCACGTGGTTAAACCTAATTGGTATAATTGCGGTTAGACTGCCTCCTCAGGTAAGACTAGGGGATCCCCCGCCCATATATTTAAGCACGTTGACTGTTCAGTCACGTTTAGTGGGTCAACCAAAATAA

mRNA sequence

ATGGCACCGCCGCCGCCACCGTCATTCTTTCTTGGCAAAGAGACCACCAAACACGCCGCCGTTCTTCTTCGGAGGAACTTGGACGGAATTCTTCCGGCCACCGCGGACGGTACCACTGCCGTTACCTGCGGCGGCGTTCTTGCCCTCGACCTTTTGAAGAACAGGGTCAGTTTCAAGAAGCTGATCCTTATTCAAGCTTCCGATGATCCAATCAAGAAGGCCCTTTTCCTTCTTGCTTTCGCCGGCACCCTTAGCCGCCGTGGCTGCGAACACACGTCCAGCGGCCGGAGAGAATGCGATTGGCGTGGTCTGTCGTCGCTCGATCGATCAAAGAAACCTATGGTCAAGGAACCTTTAGCCGTTGACGATCAAGGATTGAAGAAAGGAGGTTTGGAGGGAGGAGAATTTGAGTCGACTGGGTGGGGCAGTGATCTAGGTCGTCAGGGGTTGTGTCAAGGGGCAGGAAGCCAGCCGACGACAGGGTGTGGGCAAGAGAGAAGAAAGGAAAAGAAGGAAAATCTTAGGGGTGGGAGAGCACAAAATGAGAAAACCTATAGTCAACTGCAGTTGATGACTGTGACAGTTGAGCAATCAAAGATCACAGACTCCACGTGGTTAAACCTAATTGGTATAATTGCGGTTAGACTGCCTCCTCAGGTAAGACTAGGGGATCCCCCGCCCATATATTTAAGCACGTTGACTGTTCAGTCACGTTTAGTGGGTCAACCAAAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCACCGCCGCCGCCACCGTCATTCTTTCTTGGCAAAGAGACCACCAAACACGCCGCCGTTCTTCTTCGGAGGAACTTGGACGGAATTCTTCCGGCCACCGCGGACGGTACCACTGCCGTTACCTGCGGCGGCGTTCTTGCCCTCGACCTTTTGAAGAACAGGGTCAGTTTCAAGAAGCTGATCCTTATTCAAGCTTCCGATGATCCAATCAAGAAGGCCCTTTTCCTTCTTGCTTTCGCCGGCACCCTTAGCCGCCGTGGCTGCGAACACACGTCCAGCGGCCGGAGAGAATGCGATTGGCGTGGTCTGTCGTCGCTCGATCGATCAAAGAAACCTATGGTCAAGGAACCTTTAGCCGTTGACGATCAAGGATTGAAGAAAGGAGGTTTGGAGGGAGGAGAATTTGAGTCGACTGGGTGGGGCAGTGATCTAGGTCGTCAGGGGTTGTGTCAAGGGGCAGGAAGCCAGCCGACGACAGGGTGTGGGCAAGAGAGAAGAAAGGAAAAGAAGGAAAATCTTAGGGGTGGGAGAGCACAAAATGAGAAAACCTATAGTCAACTGCAGTTGATGACTGTGACAGTTGAGCAATCAAAGATCACAGACTCCACGTGGTTAAACCTAATTGGTATAATTGCGGTTAGACTGCCTCCTCAGGTAAGACTAGGGGATCCCCCGCCCATATATTTAAGCACGTTGACTGTTCAGTCACGTTTAGTGGGTCAACCAAAATAA

Protein sequence

MAPPPPPSFFLGKETTKHAAVLLRRNLDGILPATADGTTAVTCGGVLALDLLKNRVSFKKLILIQASDDPIKKALFLLAFAGTLSRRGCEHTSSGRRECDWRGLSSLDRSKKPMVKEPLAVDDQGLKKGGLEGGEFESTGWGSDLGRQGLCQGAGSQPTTGCGQERRKEKKENLRGGRAQNEKTYSQLQLMTVTVEQSKITDSTWLNLIGIIAVRLPPQVRLGDPPPIYLSTLTVQSRLVGQPK
Homology
[Close]
BLAST of Cla97C02G045700 vs. NCBI nr
Match: KAG6570665.1 (hypothetical protein SDJN03_29580, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 3.2e-26
Identity = 75/102 (73.53%), Postives = 79/102 (77.45%), Query Frame = 0 

Query: 3   PPPPP----SFFLGKETTKHAAVLLRRNLDGILPATADGTTAVTCGGVLALDLLKNRVSF 62
           PPPPP    S  LGKETT+  AVL RR+LDGILPA  DG  AVT   VLALDLLKNRV F
Sbjct: 6   PPPPPSSSSSVSLGKETTE-PAVLFRRDLDGILPAATDG-AAVT---VLALDLLKNRVGF 65

Query: 63  KKLILIQASDDPIKKALFLLAFAGTLSRRGCEHTSSGRRECD 101
           +KLI +QASDDPIKKALFLLAFAG L RRGCEH S  RRECD
Sbjct: 66  EKLIPLQASDDPIKKALFLLAFAGALRRRGCEHASGSRRECD 102

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cla97C02G045700 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6570665.13.2e-2673.53hypothetical protein SDJN03_29580, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Cla97C02G045700 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C02G045700 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C02G045700 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 147..180
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 163..178

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C02G045700.1Cla97C02G045700.1mRNA