ClCG08G006020 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGAGGAAAATTTTAGTGGCGGCGCCGGCGTTGGAACTCGCACGGGAAATGGTGGTGCTGGTGATTCCTCGAGAGCTTCTTCTTCGTTCCTGAAATCAGGTGACCGCCAAATGTTCACTGTGGAGCTACGACCTGGAGAGACTACCATAGTTTCGTGGAAGAAGCTTGTCAAAGATGCCAACAAGGTTAATGGACTCAACACTGTGCCTGAACCTCCAGCCAACCCCAACCCTGCCATCGAGTGTCGCATTGATCCGGTGAGGACTTTGTTTTCACTGTGGAATGTATTAGATGTATAATGCGTTTTATTTCTTGTTATAGTGTGATTGGAATTTGCAGAAGCCTCTTTTAGTTATGGCATTGCGTCAATCATTTAACATTCAGTTCGATATTTTGTTTCTTGCAATTTTATTAGGGACTTTTAAGTAATCAAACAATATGGGGAATGATCCTTCAAGCAAGATTCTTGAAGTGGTCCAGAGTACTTCTATAATACTTTAAATGGGCGGTGCGTTAGAACTTTAATAGGTCTATTTTTTGTTTTTTTTTACATAAATATGGAAAACATATGTAGAACTCGATTTGGTCTACTACGCATTTCAAGTCTTTTGATGCAGTGACTATAAAGTGTTAATGGTCTAGGCATATTTTATAATATTGTGCACACGTATTATATATTTTTACTAACGTTTATTTGTAAATATAACTTGGTTATGCTATAATATTATGCATGAGCGTGCCGACCACAGGAATGAGATCCCTATTCACTTGATTTACAGATCATATATGTGGATTTCAGTTCTGTGGGCTATTTGTTAGAGTTTCAAACCTACCTTGGTTCTAGCAAGGTTTCACGAAAAAGGTTTTGTTGTCTATTACAAGCCGTAGTGTTGCAGCATTGATATCCTCATGGCTCGCCTGCTATAACTGATTATTAAAGAAGGTTGCATGATAACCTTTTTTTTTTTGAATTGCATTTATTACTTCAGGAAGCCATAGGTGAGAATGTTGTAGGTGTCTGACATGGTTAATTTTGAAGCACGAATACCTTAGTTTGTATAGTGTTTCATTATAAACCCTTTTGAGGCATCTTTTGCTATGACTCCCGCATGAAAAGGGTCTCCATAGCATGACTGATACCACAAAGAAAGGGTATCTAAGTCACACCGGTAGTTCAAAACTGGAATTGGCATATCGCGACACCCATTTCTTTTAAGTCAAATTTTTTGACAATATAGAAACTGCAAATTTTCTTTATTATTATTATTATTATTTAGTATGCATTAAACCCTTTGTAGACATCTGTTGCACATCCATAATAGAGTGATAGTTTATGTATAAATGCATATATACATACTTTATTTGATTGAAAGCGAATGTTAAAGGAAAATGATTCATCTTGGAGTGTGGAGGGGGCTGATAAATTTCGTGTGAGAAGATTGAATTTTTATTCGCATAGTTCATTCTTTGAATTCGATTCATGGACACAGCAAAAACTGTTGGGCAAAAGGAATAAACTAATGAATTTCAATCTAGAGACATTATTCTCTCTGTTAGAAGCATTGCTCAAACTGTTTGATACGAAATTCTACGTTCTTATTAGATATCAGATGTCATAATTGAAAGGCAAATTCTGGAGCATGCAAATCACAGATGTGCGTTAAAATATATACTTGAACACGATATATGTGTTAAATCTTCTCATTGGTGTTGTAGGTGTCACCCATTCCCATTTTATTAATGTATTTTTCTTTAGAAAATGGCTCATAGGCTATGTTAAATATGTATTTATTCCTCCATTATTTTTATAAAAGGAAATGGTTCGTTGGCCCGTCTATATCTTGATATGTTAATTACTTGTGTAATTTTGTTCTGTTTTCTTCACGTTGTCGGTATGTTTTATTTATGTCCATATTCGTTCCTTTTCGATGTTCAACGATGTATTTACTACTTAGGATTTAGGGGTTGGTTTTTAAAATAACTGAAGAGAAAATGATCTATAACTCACGAAGTACTTGTCTTTTTATTTGCCATTAGGGGCAACTGATTGAAGATGAAGTGAAAGATCCAACGGCACCAAATCGTTTTAATGCTGTTATTGAGAAGATTGAGCGCCTATATATGGTACTTGGTTTCTTCTTAACACTATCAGTTTGTTTTCCAATTAACTGTGATTACATCTTTTGCATTCGATAATCAAAGAATCACTAGATAATTCAATTTCATTGTTACTAACTGGACAATTAAATTCTCATAGGGTAAGGATAGTAGTGACGAGGAAGATTTAATTCCAGATGATGATCAGTACGATACAGAAGACTCATTCATTGATGATACCGAGTTGGTTGGTTTCTTTCTGTTGCTCGTGTGGTCTTGTTTGTCCTTTCTGCAATGTAAATTACAATTTCTTTTTTTCTCTGAGAGTGTGGCGATAATCTTTTATGTGTGGTGATTATTGTTGACTACTTGTTCTGCAGGATGAATATTTTGAAGTTGATGATTCGGCAATAAAACATGATGGATTTTTTGTTAATAGGGGGAAATTGGAGCGCATGTGAGTTTCTGACTTTGTTGACCATTTTCCTTCTCTTCAGTTTTATGATTTGTTAGTATTCATGTTAGTTAAGTCAACTATTTTGTTGGGTTCTCTATTGCTCGAGTGGTTGGTGATACATTGCACCATTGTTTTCTTCTATTGGTGAAATTGCACTTTATGGCTGCATAAAGTTACAATTCCTACTCTCTTTCTCTGTTTTATTTTTTTTGGACAAGAGATTCCTACCATTCTTTTATCATGGAAGGATGTTACTTATGGACTTGGTATGTGTTGATCTGTCGAGATTATGTTATGGTATGTACTTCTCATTGTCGGTATGCTATAGGTGTTTGATCTCACATGGTAGTGGAGTAAAGCACAATGAAAGCAATAAGTATGTTTTAGCTTGTTAGGTTCTTGTTATGGTCTTTTATATCTATGGATTGCCACCATTGATTTTCAGTTTTTACGAGTAAACTATATTATATTTTATTCATTCATTTGTAACAAACAATTAACAACAATTTTTATTGATAAAATGAGAAGTACAAGAGTGGGAAAAACCATAACACGGCTGAAACTTTTGAATATTAACTCCAAACCAAAATGATATTAATCTTTTGGGAAGATTGATGGTGGGTGATAAACCCCTCAAGGGGCGTTTGGGGTGTTGAGTTGGTTATTATAGTCGTTGGGTTATAATAGTTTGTAGGTTACAGTAGTCTGCGTTTGGGTGCAATACTATTTTAGTCTGGGCTTGGAGTGGTTTTAGTTTGGGCAGGAAATAGTAAACTCTATAACAAAGAGGGAAAGAGAGGATGAGTAGATAATAGTAAACATTGGAACAAATAGTTAACACTATAACAAAGAGGGATTTAAAATATTAATACTGTAGTTAATTGTATGTTATAAATTATAATAGTTGGAAGCACCAACTATTATAATTGGAGCCCCAAACATGGAGTGGGTTATAATAGTCCACTCCACCCAATTGATGTTGGGGCCCCAACAACCCCTTGAGTTGTTTCTACGTTTATATCATCTCTCGAATAAGGGGTTGCATGATTTGGCTTCAATTTTACCTTTCTGAGATCATCCTTCTTCAGTTTCTTTGGGTTTTCATTGCTCTCTTTTGGATAGAGAGGCAATAGATGTGGTGGGTTGGGTCTTCTTTCTCTTCCATGTGATCACCATGTGTTCCTCGAGAGAAAGGACTCTAGGTTTTGGACTCCTGATTCTGTTAGGGCTTTTCCTTCAGTTCCATTTTCCACATTTTGTATGCCCCTTCCTCGCCCCAAGTTGCCTTTGCCTTTGCCTTATTCTCTCTAGAAGGTTAAAAATCCAAGGGAGGTCAATTTTTTATGTTTGGCAAGTTCTACATGGGGAGTTAACACTATTGACTGTGTTTAGAGACACGTTTCCTTTGTGTTGTATTTTCATATTCTTTGTAGGTGACAGGAGGACCTCCATCACTTATTGTACTGCCAATTTGCTCATTGGATGAGTTTGTTTGGTTTATGTTTGGATTGAAATCTAGACTATTATGCTTTGGTTGAGAAGGTGCTTCTGGGATTGCGGATTGCCTTTCTAGGAGCAGGGAGAAATTTTGTGGCAAGCTAGGTTCTTTGCTGTTTTATGCAGAATTTGGCTCGAGAGAAATAATAGGGTTTTTGAAGAAGTGGAGAGGTCTTGTGAGGAGGTTTGGGAGTAGTGAGGTTTAGTCCATCCATGTGGAAGTTGGTTACTATGTCTTTTTGTAATAATGATCTTGGTTTGATTTTTTTTAGTACAACAATGGTGGGGATGGGGGATCGAACCTTCCACCTCGCTAATTATTGCTGAGCTAAACTCGCTTTGGCATTCTTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTGATAAGTCCTTATTAACCACATACCAATTTCATATATTTATTTCTAGTAGGAGCTGAGGGAGTTGACCAAAAACTATATAAATGTCTGCCAGTTGTCCACCATGTCCCAGACTTCCAGGATTGACGAAAGACTTCAATTTTTTTCTTTTTATTTTTTTGGTTGCATTACATTGCAAGTAAGAATATTGTTTTATTCTCATCTCATGTGAAATTAGCCTAACGAGTTGTTGAAATTACACACAAGTTCGATACCAATAATTGCTTACAAGATTTCAAAAAACCTTTCATATTAGAGAATAGAGATTGATGCTTGAGGTAAATAGTCGAAAAGCACTCTTAAATCATACCAACTATATCTTTGTTGCTTTGGTCGCAAACTGAGGCTCTAGGTCTAAGTGGTTGCCTGGGATGAAGTGGGATGAAGTGTTGGTAAGGGGCTACATTTTATTCTATGCATTAAAATACCACATTTTAAGGTTTCTTCATAATCTCATCAAGTTTCTTTAAAAGAAAAAAAATAGATCCTCCACCGCTGATACTGGATGTCAGTGGCACAACTAATAGTAGT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ATGGAAGAGGAAAATTTTAGTGGCGGCGCCGGCGTTGGAACTCGCACGGGAAATGGTGGTGCTGGTGATTCCTCGAGAGCTTCTTCTTCGTTCCTGAAATCAGGTGACCGCCAAATGTTCACTGTGGAGCTACGACCTGGAGAGACTACCATAGTTTCGTGGAAGAAGCTTGTCAAAGATGCCAACAAGGTTAATGGACTCAACACTGTGCCTGAACCTCCAGCCAACCCCAACCCTGCCATCGAGTGTCGCATTGATCCGGTGAGGACTTTGTTTTCACTGTGGAATGGGCAACTGATTGAAGATGAAGTGAAAGATCCAACGGCACCAAATCGTTTTAATGCTGTTATTGAGAAGATTGAGCGCCTATATATGGTACTTGGTTTCTTCTTAACACTATCAGGTAAGGATAGTAGTGACGAGGAAGATTTAATTCCAGATGATGATCAGTACGATACAGAAGACTCATTCATTGATGATACCGAGTTGGTTGGTTTCTTTCTGTTGCTCGATGAATATTTTGAAGTTGATGATTCGGCAATAAAACATGATGGATTTTTTGTTAATAGGGGGAAATTGGAGCGCATGTGGCTTCAGTATCATGCGTACAAGAATAACTTTATTCTATACTTTGAATATTTAATTTTAGACTTCCATTTATCAGTTTGCTTTTTGAAATTCTCTATGCTTATTTTTACTTATTTTCTTTCTGAAAGAAGTGAACCATCTGGACAACCTAATCAACAGTTGAAGAAAAGACGGAGAAAAGATTTAGAGAAAGGCCATCCTGAAAACCATGATGCTCGCTTATCAAATAAGCATACAAAAGTGGGAAAGACAACTACGGGAAAGAGTGCACTGATGGTTGCAAAGAATTTTTCTAATCTGTCTCAAAACATGGCGATCACACATGAACATCTTGAAGACGACAAATTGCAGAACCAATTGAATGTGCCTGGACATAGTTCCAAAAAAAAATCTGGTGATACAAAAATGATATTGGACCCTTCTCCATCTTCAAAAGTTTATAATGGTGATACCTCTACATCTGTAGCAGAAGCGAAGGACACTGATCCTCCAAAGCCTGGTGTTTTTCCATCCAAGAACCTTGGTAGCAAATCAAAAGAGTCATGTGGACCATCAGATTCTTTACAACAGAACATACTTGAAAAAATTGCACATGCACCATCCAAACCCCAACCTGGGAGACCATGCACAGATGAGATAGATTCGTCAATTCAGATGAAAGAGAAACATGGCATTCGTGAATTGCCGGACATTAATTTGCCAGAGGGCAAGTATTCCATGCAAACAGCCAAAACACCATATGTGCACAAAAAGGATGGATCTAGTGTTAGACCAAAAAGCTCCTTGCTAGAAAAAGCTATTAGAGAGTTAGAGAAGATGGTTGCCGAATCTAGGCCACCGCTTACGGAAAATCCAGAGGCAGATAATTCATCTCAGGCTATCAAAAGGAGATTGCCCAGAGAAATCAAACTCAAGCTTGCTAAAGTTGCCAGATTAGCGGCAAGCCATGGGAAATTGTCAAAGGGGTTGATTAACCGACTTATGAGTATTCTTGGTCACTTGATACAACTGCGAACTTTAAAGAGAAATTTAAAAGTCATGGTCAGCATGGGTGTCTCAGTGAAGCAGGAGAAGGATGATAGGTTTCAACAGATAAAGAAGGAAGTTATCGAAATGATTAAAATCCGGCCTTTGTCCATGGAGTCTAAGGCAATCGAACAACAAGGGGGAGCACCTCATGATATCCGCGAACTTGTTTCTGAAGAAAAAGGAGTTCTGAAAAAAAAATTTGTTATGGATCCTGCATTGGAGGACAAGATTTGTGATCTCTATGATCTGTTTGTTGATGTACTGCTTCATGGACTGGATGAGGATGCTGGTCCACAAATCAGAAAGTTGTACGCGGAGCTTGCAGAATTGTGGCCAAATGGGTTCATGGATAATCATGGGATTAAACGTGCAATATGCAGGGCAAAAGAGAGGCGGAGAGCGTTGCATGGCAGACATAAGGATCAAGAGAAAATCAAGAGGAAAAAGATGTTACCACCTAGAGTAGAAGAGACCGTTAGAACTGATGTTGGTTCAGTTGCTCAGCCACAGTATGCCCGAGAACGATTAGCCTCAGAGTCAGGTTTACAGCCAACCCCAGCAACCAAGCCTACATCTGTTTCGACAATTGCAGTGGCCCAGGTACCGAGTCCTTCCATGAGTGTTGGAAATTTAGACAGGCTAAAATCCGAGAAGTTGAAGGTAAGCTCAAGCAGTTCCCACGAGGATGCAAGAATGGTGGACGGTGCCTTAACCAAGAAAAAGACAAAGAGGAAGGCAGAGCTGGAGTTGGACGAAACTCATAATCGCCCTGAAAAGGCATCCATCCAACATGGAGATGAAAAACACAAGTCCATGAACAAGCCAACTGCCAGTCTTCCTCCTAAGCCAACAATTCAATCAGCTGCTCCTTCAAGTCTGGAACAGTCAAGCTAA MEEENFSGGAGVGTRTGNGGAGDSSRASSSFLKSGDRQMFTVELRPGETTIVSWKKLVKDANKVNGLNTVPEPPANPNPAIECRIDPVRTLFSLWNGQLIEDEVKDPTAPNRFNAVIEKIERLYMVLGFFLTLSGKDSSDEEDLIPDDDQYDTEDSFIDDTELVGFFLLLDEYFEVDDSAIKHDGFFVNRGKLERMWLQYHAYKNNFILYFEYLILDFHLSVCFLKFSMLIFTYFLSERSEPSGQPNQQLKKRRRKDLEKGHPENHDARLSNKHTKVGKTTTGKSALMVAKNFSNLSQNMAITHEHLEDDKLQNQLNVPGHSSKKKSGDTKMILDPSPSSKVYNGDTSTSVAEAKDTDPPKPGVFPSKNLGSKSKESCGPSDSLQQNILEKIAHAPSKPQPGRPCTDEIDSSIQMKEKHGIRELPDINLPEGKYSMQTAKTPYVHKKDGSSVRPKSSLLEKAIRELEKMVAESRPPLTENPEADNSSQAIKRRLPREIKLKLAKVARLAASHGKLSKGLINRLMSILGHLIQLRTLKRNLKVMVSMGVSVKQEKDDRFQQIKKEVIEMIKIRPLSMESKAIEQQGGAPHDIRELVSEEKGVLKKKFVMDPALEDKICDLYDLFVDVLLHGLDEDAGPQIRKLYAELAELWPNGFMDNHGIKRAICRAKERRRALHGRHKDQEKIKRKKMLPPRVEETVRTDVGSVAQPQYARERLASESGLQPTPATKPTSVSTIAVAQVPSPSMSVGNLDRLKSEKLKVSSSSSHEDARMVDGALTKKKTKRKAELELDETHNRPEKASIQHGDEKHKSMNKPTASLPPKPTIQSAAPSSLEQSS Homology
BLAST of ClCG08G006020 vs. NCBI nr
Match: XP_038885068.1 (ubinuclein-1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1336.2 bits (3457), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/836 (86.24%), Postives = 740/836 (88.52%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. NCBI nr
Match: XP_038885069.1 (ubinuclein-1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1333.9 bits (3451), Expect = 0.0e+00 Identity = 720/836 (86.12%), Postives = 739/836 (88.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. NCBI nr
Match: XP_038885070.1 (ubinuclein-1 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1331.2 bits (3444), Expect = 0.0e+00 Identity = 719/836 (86.00%), Postives = 738/836 (88.28%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. NCBI nr
Match: XP_011657419.1 (ubinuclein-1 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1304.3 bits (3374), Expect = 0.0e+00 Identity = 706/836 (84.45%), Postives = 733/836 (87.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. NCBI nr
Match: XP_004149441.1 (ubinuclein-1 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN47689.1 hypothetical protein Csa_018301 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1302.3 bits (3369), Expect = 0.0e+00 Identity = 705/836 (84.33%), Postives = 732/836 (87.56%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX78 (Ubinuclein-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UBN1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 1.3e-125 Identity = 346/785 (44.08%), Postives = 433/785 (55.16%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4I700 (Ubinuclein-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UBN2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 419.1 bits (1076), Expect = 1.2e-115 Identity = 327/790 (41.39%), Postives = 420/790 (53.16%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KFR0 (HUN domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G381790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1302.3 bits (3369), Expect = 0.0e+00 Identity = 705/836 (84.33%), Postives = 732/836 (87.56%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UPM9 (Ubinuclein-1-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold221G00920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1297.0 bits (3355), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/836 (83.97%), Postives = 727/836 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CS15 (uncharacterized protein LOC103504093 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504093 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1297.0 bits (3355), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/836 (83.97%), Postives = 727/836 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3B6W4 (Ubinuclein-1-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold282G00440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1295.0 bits (3350), Expect = 0.0e+00 Identity = 701/836 (83.85%), Postives = 726/836 (86.84%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CRZ1 (ubinuclein-1-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504093 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1295.0 bits (3350), Expect = 0.0e+00 Identity = 701/836 (83.85%), Postives = 726/836 (86.84%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. TAIR 10
Match: AT1G21610.2 (wound-responsive family protein ) HSP 1 Score: 456.8 bits (1174), Expect = 3.7e-128 Identity = 346/784 (44.13%), Postives = 433/784 (55.23%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. TAIR 10
Match: AT1G21610.1 (wound-responsive family protein ) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 9.0e-127 Identity = 346/785 (44.08%), Postives = 433/785 (55.16%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. TAIR 10
Match: AT1G21610.3 (wound-responsive family protein ) HSP 1 Score: 449.9 bits (1156), Expect = 4.5e-126 Identity = 346/786 (44.02%), Postives = 432/786 (54.96%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G006020 vs. TAIR 10
Match: AT1G77310.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wound-responsive family protein (TAIR:AT1G21610.1); Has 493 Blast hits to 482 proteins in 163 species: Archae - 0; Bacteria - 100; Metazoa - 172; Fungi - 66; Plants - 65; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 83 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 419.1 bits (1076), Expect = 8.4e-117 Identity = 327/790 (41.39%), Postives = 420/790 (53.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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