ClCG08G000300 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACAATCACAGCAACATTAGCAACACCCTCAATAACAGCACTACTTCTACTTCTCCCCAAGATCTCGGATTGCACTTCTTGGAAATGGCTCGATTGGGTCTGCCTCGGGGGCTATGCGACATGGACGAGGACGAGGAGTCTCCCACTGAACTCAATACCATCAACAGTTCCGGAGGTTTCTTGTTGGTTACCACCGATAAGCTCTCTGTCAAGTATACGAATGTGAATCTTCACGGCCACGATGTCGGGGTTGTCCAAGCTAACAAGCCAGCTCCAGTTAAACGACTTGTCTACTACTTCGAGATTCATGTAAAGGATGCTGGGGCCAAAGGCCAGATTGCCATTGGCTTCACCACCGAGAGCTTCAAGATGCGAAGGCAGCCCGGGTGGGACACACTTTCTCTATCTCTCTTTCTTTCTTGATTCCTTTTTCGATTTTTCTTTGATTTTCTTGATTATGTATATTATTTCCTGTCACCAGGAAGTGTTACGAATGTGCCTTTTTATTGGAATTGATTGATAAATGGAATTGAATACAGTATCTGCAATCATCCAGTTAGTGCTTATCTTTATAATCCCTCAGTGGATGTAACTCAGTTTGGCTCAATCTTTTGCATTTTCCTGAGATATCCCTTCCCCGATTCTAAGCCTCAAAAGTACTCATATGCCCTGTCCTGTTAATTTGGACGAGTAGGTGGGAGCCTAATAGCTGTGGATATCATGGAGATGACGGACTACTTTATCGTGGACTAGGTAAGAAAGAACCTTTTGGTCCAACATATACATCTGGTGATACGGTTGGTGCCGGAATTAATTACGCCTCACAGGAATTCTTTTTCACGTAAGACATTTGCGCACTGTAATTGTTGTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGTTATCATCATGATACTTTATGATTCTTTCTGTCGATGTACTAGAAAAAATGGGATAGTAGTCGGAGCAGTAGAAAAGGACATGAAGGGTCCCTTGTTCCCTACCATTGCCGTTCACAGCCAAAACGAAGAGTATGCTCGTCATCAAACTTTTATCCCTTTGATACCTTGTTTTGCATATACTTTGTCTATTCTGATAACTTAATTAGGATTATATATGCGTTAGGGTTTTATAACATCACAATGGAGTTTTACTGGTGATGTAGTAAGTCCTGTCTCAAACTAGATAGATGTAGTTGGAACCAGGACGTAAAGTATCTGATGTTTCTTTAGCTTAACAAAAGGCTTTCATTGCTTTTGTTATTCCTTCAAAGTAATCCTTTACCAATGTTACTGGTGTGAAGTATCTGATAATTCTATGGCAAACTTTCCTGATTTTTAGGTGGTAACGTGCCCAAATTTGAGGTCCGTTCCCTTGGATTGAAAGCTTAACGTGTGAAAGCTCTTTATGTTTCGAGCTGCCATTAGGCACATGGAATCTTTTTGTGGAGTAGTTGGATGGTGCCAAATACCATGGTTGTAAAAAAAAATTCACTCAGCTTTTTCTTTTATCGATCAATAACCAAGCTTTCATTGAGAAAAAAATAAAGAAAAGAATACAAGGCCAGAAGAAAAACTAGAGCCACAAACAAGCAGAGGCTAATTAAAAGAAAGACCTCCAGTCAAGCAAGATAAAACTAAGCGGATAATTAAAAAAAGGCTTCATTATTGAAGCCCACAAAGAAACATGAAACTTGGCAAAGGACCAAACATCATAAGTAGTCTGCTCAAGCCCTCTAAAGACTCAATTGTTCCTCTCGCCCCATAGACCCCACAACACATTGTACACCCCACTTTTCGAAAAAACTTATCTTTCTCCCTAAAAGGAGTATGGAGAAGGAACTCATTGATCATCTAAATGAACTTGATCAAAACCAAACTCATCAAAGAAACAACTCCACACAACATATGCAAAATCACAACTCCTATGCAATGATCAAGGTCCTTAACTGCCCTCCCGCACCATGACTCCATCAAGGAAGACATCCTCTTTGACACCCAGTTTTAAGGTATTTTACCTTTCCATGGAGCACTTGCCAAATTAAAAGCTTAATCTTTTTGGGTTCTTTTTCATCCTCCACATCGCGACATAGACTGAATCTCTCAATGGAGAAGGGTTAACCAAACAAAGAAAGAAGGAATTACAAGAAAAGCCCTTCAAAGGACTGGGGCACCACAAGCGAAAGTCCCTTCTCCCAGACGAACACTAAAAATCCCCCAATGAAGAGTCCCCTGTTTTCCTATCAAATAATGAATGACAAAACCCAAAGTAGGGGTTGGCTGAGCGAAAACATTAGCCATTGAGACATTTTTCATCAAAGACAAATGGTATAGATGAGGAAGAGCAGAGTAGAGGGGGGTTATCTCCCAACCACCTATCTTCTCAAAAAAACCTAACCCTCTCATTCCCAACCAAGCAACAGATAGAAGTAAGGAAGCTCTCCTACAATACCAAGAAGTGCTACTAACCCATTCAAGGTCCATTCAAAAGTGAACAAACCATATTTACTTGCAATAACCTTATGCCATAGGGTGCCAAGTTCATGTTAAGAGTCATTTAACCCTTATTACAAGCAGGTTCCCTTTACCTAAGCTGTCAAAATCCATGGGATTTGTAACCTCTTCCTAGTTAACTGTGTGAGACTCACCGCCTTCCTCCACTCCTTCCTAGAGAAAGTCATTATTTTTTTAGAAGGAAACGAAGCTTTTCATCAAAATAATAAAAAGAAAGTTAAAATTTATTGATATATTGCTTTGTATCATGGGTACTACTGACTTGAGCATGTTTCATCTCTTCCCTATAATTTCATGCCATCAATGAAATTGTTTTTCATTAAAAAAACTTCATGGGTACTACCAACGTGAGCATAGGCCAAGGAATTCACAATCTTCTTTAGAAGTTGAGGTTCAAGTTCCCACATCCATAATTGCAATGCTATGTTTTAAAAGAACATAATGGGTATTGTATTTTCTTCGATGGAAAATAAAGTAATTTTATTAGAGGAGTTATGAAAAAAAAATTGGATAAAGAACTCAATCATAAGCTGCAGCCCATCCTAAATGTCCAGGGACCTGACAAGTTTCAAAACACATGACTTCTAGGTAAGTGTTTTTCAGATATTGAGGTCTTAGCCAATGGGACTGCCCTTTAAGGTCTGGAAGCACAATCTTACTATAAAAGGAGTAGATTTATATAATGGATTAGCCAAAAAACACTAGGAAGAGAACTGGATCTTAGCCTTCTCGAAACACTTCATGAAAAGGTTTCTCTTGTTAAAAAGGAAAAAAAATTTGGTCAGTGATACACACAAGTGAAAGAAATGCCTCAAACTTTATTAAAAGATGATCAAATGATACAATTGATGTCCCTTTATAGGGAGCTAGTCAGTTCTAACTAAGAAGAAGGTGACCGGTTAAGCAAGTAACCGGTTTACATTAAAATAAAACTATATCTTGCTATTGGAAACAAATACAACATATGTTCCTACATCAATTCCTTCTAAAAAATTAAACATGCCCTCGAGTTACTTAGCTAAAGAGAAACAAGCCAAGCAAACAAGCAATCCTTTTCTTCCTCTCCAGCAACACCCATCCTTGCCAGCCAAGCTACCTCTCTTGGTAGTCACCCCTCTTTTACACATTGGTCATGGAAGTAGTCAGTTGCAAGATCAATGGAATTTTCTTTTGCACTTAGTTCGAAGATGGTAATTTCGTTGTAGAGGATATGGAAGTTCGAAAAGCAATTTACTTATCGGAGACGCATATGCATTGGATGGTAAAGCAAATCTCAGACCTCCTCAATGGATCAAGTGTTCGTTTTTTCTTAAGGGAAGTGTGTGATGACTGGGGAGCTATGAGATTATCAAAATTCAAGAGTAATATGGGTTGGAATCTAAGATTCGTGGTTTGGCCAGCTACCGGAGGACGCTTCTTCATTCACGTACCAAAAGGGACAGCGCAACAAGGTTGGAATGAATTTTTGGAAATGATTATTAGCTTTAACCATCGAATTGGGTGCTCAAGAGACAAAACAACGATTGTTAGTTTTTTGGAAGATCTTTATCAAATCAAAATTAGTATTAACCCTCTGTTTGCTGATAAGGCTTTGATTAAAGTATCCCAAGGAAATTTAGAAAAGATCATTGAAATGCCTGGAAAATGGTTTGACTATCGTAAATTCCATCTTCTATTTGAAAAATGGAATTCAATTCAGCATAGTAGGCCTACTTGCATTAAAGGTTATGGTGGATGGTTGATAATAAGAAACCTACCGTTGGAATACTAGAGCAGAGCAACCTTTGAAGCTATTGGCTCCCACTTTGGAGGTTTAGAAGAAATAGCATTTGAAACTCTCAATCTTTTGAACGTGTTAGAAGCAAAAATCAAAGTCAAAAGAAATTTATGTGGTTTTATGCCTGCATTGGTTGAAAGGAAAAATGAACTGAGAGGTTCCATATTTTTAAATTTTTGGGAATGTTGAAGCCATGGAGGTACCTTCTTATGCACACAAGGATTTATTTTTTAAAGAGTTCAATAACCCAATCGATCAAAACTGTATAAATAAAGTTGCAGAAGATGAAGATGCTTGTGGTATGGTAGCAAACTGCATCAGATTAGGTCGTTTTGTGACCATCTCGCCGGAGAAGATACCGGAAAATTTTGAAATCGTTGAGCCGGTGCCAGAGCGAAAAAGTTTAATTCTGGTGTTAATGAAGTAGTTGAAAAGTTGGAAGTTATTAGGAGAGAGAAACTCATTGGCTGAAATTGTAGTTTCTCAAGCAGCCAAAAAAATTTGCTCAAAATTCTTTATTTAATAAGGACCCCAAGGAGTCGGCGTCCCTTGATCTCCCCTCGTTGGAAAAAGACTTCATTAATGCCTTGTGGGTAAGCATCGACGGGCAAAATTTCGTGCAAGCTCCAGTTGTTTCGGACATTCCTTTGTCCCCGACTTCAGCAAACTCACCGGAGAAGAAGATGAAAACTTTCCAAACTA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BLAST of ClCG08G000300 vs. NCBI nr
Match: XP_011656119.1 (ran-binding protein M homolog [Cucumis sativus] >KGN52712.1 hypothetical protein Csa_007848 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 4.0e-267 Identity = 453/468 (96.79%), Postives = 463/468 (98.93%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. NCBI nr
Match: XP_038889904.1 (ran-binding protein M homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 930.2 bits (2403), Expect = 6.8e-267 Identity = 451/468 (96.37%), Postives = 464/468 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. NCBI nr
Match: XP_008459671.1 (PREDICTED: ran-binding protein 10 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 926.8 bits (2394), Expect = 7.5e-266 Identity = 451/468 (96.37%), Postives = 461/468 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. NCBI nr
Match: XP_022155235.1 (ran-binding protein 10 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 901.4 bits (2328), Expect = 3.4e-258 Identity = 439/468 (93.80%), Postives = 453/468 (96.79%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. NCBI nr
Match: KAG6607489.1 (Ran-binding protein M-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 896.7 bits (2316), Expect = 8.3e-257 Identity = 441/477 (92.45%), Postives = 453/477 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HYD7 (Ran-binding protein M homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RANBPM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 7.5e-184 Identity = 317/466 (68.03%), Postives = 370/466 (79.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4Z8K6 (Ran-binding proteins 9/10 homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=RanBPM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 172.6 bits (436), Expect = 1.1e-41 Identity = 92/297 (30.98%), Postives = 154/297 (51.85%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q28FM1 (Ran-binding protein 9 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=ranbp9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 1.8e-41 Identity = 96/312 (30.77%), Postives = 155/312 (49.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9PTY5 (Ran-binding protein 9 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=ranbp9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 4.1e-41 Identity = 90/288 (31.25%), Postives = 149/288 (51.74%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1LUS8 (Ran-binding protein 10 OS=Danio rerio OX=7955 GN=ranbp10 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 4.1e-41 Identity = 89/291 (30.58%), Postives = 152/291 (52.23%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KW89 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G651700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 1.9e-267 Identity = 453/468 (96.79%), Postives = 463/468 (98.93%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CB75 (ran-binding protein 10 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498719 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 926.8 bits (2394), Expect = 3.6e-266 Identity = 451/468 (96.37%), Postives = 461/468 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLW3 (ran-binding protein 10 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022376 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 901.4 bits (2328), Expect = 1.6e-258 Identity = 439/468 (93.80%), Postives = 453/468 (96.79%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GB42 (ran-binding protein M homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452559 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 894.4 bits (2310), Expect = 2.0e-256 Identity = 437/473 (92.39%), Postives = 451/473 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KBP0 (ran-binding protein M homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492850 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 893.3 bits (2307), Expect = 4.4e-256 Identity = 437/472 (92.58%), Postives = 451/472 (95.55%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. TAIR 10
Match: AT1G35470.2 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 5.3e-185 Identity = 317/466 (68.03%), Postives = 370/466 (79.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. TAIR 10
Match: AT1G35470.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 636.3 bits (1640), Expect = 1.9e-182 Identity = 315/466 (67.60%), Postives = 368/466 (78.97%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. TAIR 10
Match: AT4G09340.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 591.7 bits (1524), Expect = 5.3e-169 Identity = 288/427 (67.45%), Postives = 341/427 (79.86%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. TAIR 10
Match: AT4G09200.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 2.0e-83 Identity = 176/403 (43.67%), Postives = 237/403 (58.81%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG08G000300 vs. TAIR 10
Match: AT4G09310.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 2.0e-83 Identity = 176/403 (43.67%), Postives = 237/403 (58.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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