ClCG04G009590 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGTCCCTTCTTCTTTCCACAACCACAACCACTGTCCCAAACTCACTCACCCATAAATCTTTGCTTCCATCTCAACCCTTCTCCATAATTCCACACTCTTCCATTCAACTTTCCAACAAAACCAAAGTCGTCAAACGTTCGAATCTTCCATCACTTGTTGCTTCTCTTTCGAAGCCTCCTAAAGATAGTGGTAATAGTAAAAATACTAAGACCAAAGTTGTGGTCGATGGCTCGGTTGCAAGCGTTACGGAGGTTCCGGTGGTATCGTGGGAGGACTTGCAATACCCACCCGGGATGCTCGGTGCCATTCCCAAACGGCCGGAGGTTATTGATGAAAGAAGGCAAATGGAGTATTTGACCAAAATATTGTCCTCTAAAGTCTACGATGTCGCTATTGAATCCCCTTTGGAACTTGCTCGCAAGTTGTCCATTCAATTGGGGGTCAATCTCTGGCTCAAGAGGGATGACTCTCAATTTGTAAGTATACATTAAATTATCCAAAAACTAATACTTTGAACATCAACTCTCGTAGCTTTAGGTTTAGAAATATCTAAAAGAAACCTCGTACTAATAGTTTTTTCCCTCATTTATACACACATAATTTGACTTTCGTTGCATTCCCAACATAATCCTAATCTTCCCATTCTCAAACATGAATGCCCACTGAACCTCCCTTAAATATAAAGCTCACTATGGATCTCTACCATGGATATCTAAAGTCATATGACTGTATAAGGCTCACTGACTTCCACTAACACAACTAAATCAACATTTCTTTAGACACACAACAACTTGTTGGAAGAAGAAAAATACTCCCTTCAACTACAGGAGTAAGCAGAAAAATAATTATAAAATTAATGTACAAGACTCCAAAACCAAAGAACAATCACAACCAAAAAACAAACCTGTCAATTTATGGAAAGTATTTGTAAAATTATGATTGATTTTGAAGTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTGGGAAAAATTTCAGGTATTTTCGTTCAAGATTCGAGGAGCTTATAACATGATGGCCAATCTTCCAAAAGAAGCATTGGAAAGAGGAGTTATTTGTGCCTCAGCTGGAAATCATGCTCAAGGAGTTGCATTGGCTGCTGGAAGATTAAGAACTGAGGCCGTCATTGTTATGCCTCGTGGAACCCCTCCAATTAAGGTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTACGACTTAAATTATAAATTTAGTTCAGGAACTTCTTTTAATCTAGAAAATATTTTTTCTGACAGATAGAGGCAGTCCAGAATTTGGGTGGGAATGTTGTTTTGTTTGGAGATTCTTTCGATGAGGCACAAGATCATGCTAGACAGCTAAGTCAAGAGCGGAACCTTACAATCATCCCTCCTTTTGATAACGAAGATGTCATTATAGGCCAAGGCACAGTTGGGATGGAAATTGGCCGTCAAATGAGAGGCCCATTACATGCAATTTTTGTCCCCGTTGGGGGCGGCGGTCTTTTAGCCGGTGTTGCTTCTTTTTACAAGCTAGTTTTTCCTGAGGTGAGTTCGGCTTTGTCTCTATTAAGGAGTGTTTTTAAAAATTTAAAAAATTCATTTCAAACAAAACCTTAACATATATATAATTGGAGTACGTTGATGCCTTAGTAATCTAGTAAACCATGTGAATCTATGTGTCGAATTCTCTACCGTTTGAATTTTTTGTTTTCTTTGATTTGTGGATTTGATAACTAATATATTACATGTCAAACATTTGATTAATACAGGTAAAGATTATTGGGGTGGAGCCAAATGATGCAAATTCAATGGCATCTGCATTACATAATGACCAAGTAGTAAAATTAGAAAAAGTGGGAACTTTTGCAGATGGTGTGGCTGTTAAGCAAGTTGGGGATGAGAATTTTCGCATTAGTAGAGAACTCATTGATGGTATAGTTCTTGTTGACAAAGACGCCATATCTGCCTCAATAAAGGTTTTACCTATTTCATTTCTTATCTTTTATGCTTCTTCTTGCTATTTGATCGATAATTTAACATGGTATCATAATATGAAATGGTGTGGTTCAAACTCATTTTCTCCCCAATTACTATCAATTTCCATAGTAGTTATTCAACGTGTTTGGTTGTTCAAATAATAGGAAATGTTTGAGGACACAAGGAGCATCTTGGAACCTGCAGGGGCTCTATCAATTGCAGGAGCTAAAGCATATTGCAAATATAATAATATAACAGGAGTCAATATTGTTGCAGTAACCAGTGGTGCAAATATGAACTTTGATCAATTAGGTAGCATTGCTGATGGTGCTGATTCTGGAAATGAAACAGAGGCTACCTTTGCAACTATACTCCCTGAGAAACCTGGAAGCTTAAGAACATTTTCTGACTTGGTAATTTCTTTATATATAATCTTAATTACCTTAATTAACTTTTAATTTTGATTATCCATGATTATGAACCTAATTAATTCATTACAATGATATAATCCAATTTGGCAGGTGGGATCAAGAAACATTACAGAATTGAAGTACAGATATAACTCTGAAAAGGATGCCGTTGTGCTTTATAGGTAATTATTATATTAAAGTTGATGTTAGTTGCTAATTAAGTTTACTTTCTCTTCTTATTATAATTAAGTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGTGTTGGTGTGAATGCGGCTTCACAACTTGGAGATGTGAAGAAGCGGATACAATCTTCTCCATTTGAAGCTTATGATCTGACCAAGAATGAACTTGTTAAGGATCTCTTGCGTTATATGGTAAATTATTCCTCAATATATATAATTGCATATTACAACATTTTCTTTAGTACAATAATCACGAGAGTGAGAATTGAACTTCCACTTAAGAAAGTCATATCCATTACTGTTGAGTTATGTTCACTTTGGTGATATGTTACTATATTTGGAAAAAAAACTTAGGTGCAGCCAATTCTAATTGTGCATACAATAAAAATCTGACATGTGGCAGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGTGTTGGTGTGAATGCGGCTTCACAACTTGGAGATGTGAAGAAGCGGATACAATCTTCTCCATTTGAAACTTATGATCTGACCAAGAATGAACTTGTTAAGGATCACTTGCGTTATATGGTAAATTATTCCTCAATATATATAATTGCATATTAAAACATTTTCTTTAGTACAATAATCACGAGAATGAGAATTGAACTTCCACTTAAGAAGGTCATATCCATTACTGTTGAGTTAAGTTCACTTTGGTGATATGTTACTACATTTGGAAAAAAAACTTAGGTGCAGCCAATTCTAATTGTGCATACAATAAAAATCTGACATGTGGCAGAGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTACTTTGTATAAAAGTAGTCTATTAGGTTTTTTATTCATTGCCCTTACATTTGAGCTTTAAAACACTAAAATTAGGTGGAAAAAATTGGGTTTTTCTCTAATGAATATTTATATTATTTATTTTAGATGGGAGGTAGATCGAAGGTTCCAAATGAAGTTTTCTATCGTTTTACACTCCCAGAAAGGTCAGGAGCTCTGTTACAATTCTTAGATGCTTTCAGTCCACGCTGGAACATTAGTTTAATCCACTATCGTCGGCAGGTATAACACTATGTTGTTAGCTATTAAAGTATTGATATAATCAAAATGCAATTATGACGAGTTATTATCGCAATTATAATGTGTGCCATATATATGCTAATTGAAGTATAAACTATGTTGTGTTTGAGCAGGGTATAATCAGTGCAGATGTATTAGTTGGGCTTCAGATTCAAGAATCAGAGTTGGGTGAATTCCATGGAAGTGCTAAGAAGCTTGGGTTTGATTATGTGGGTGTAGCTAATAATCCTGCCTCTAAGCTTCTGACACAAGTGTAAAACAATATCATCCTTTGTGGTTCCTTTCTTTTGATGTATAAATTAAAGTCAACAAATTAAGTGAGTTTTGTTGTCAATGTATATTTATTTTGAGAGGAAGAGCATAGTGACAAAAATAAGCTCTCTCTCTGTTTGGTAGTGATTGGAGCCTATATGGGGTGGACTAATAATCATACATTTGTATGGGAAGGAGTAATTGTCACATCTATATCTATAGTTTTAAATAAACTAATGCAAATTATTTACCTAAACCATATGCTTTACTCTTATTTTTGTATTAAATACACCAATTTTTTTTTTTTTTTGGGTTAAAGGACAAACACTATATTAATTAAAAGGAAACATTCAAAAGCCCATTCACCCTATAATCACAACTATAAGCTAGTCTAGCCAATCAAGGGGAGAACGAGTCCAACAAATTAAACTGGAAATACCAACAGTTGACGAAAATACTCACGTCTCATTAAGGTGTCAATCAAAGTATTAATGTCGATGAATTTTTATGAAAAACAAATTATCTAATAAAATATGTAAATTAATGATAAACATTTTACACTTTTTAAATATGATTAGGAAAATAAATCAAAATATTTACAAATAATAGCAAAGTTTCATTGTTATTATTTGTAAATATTTTCAGCAATTTTGTCATTTAAAATAATGACATTTTGTTAATTATTTATTATGTTTTATGAATTTTTAACGATATAATAAAACTGTCAATTCACAATCGAATCTATAAAAGCGTATTGGGATAATAATTAAGGGTATAGTAACATTTAAAAAAAAAATACAAATATGGCAAAATCTATCAATGTTAGACTCTACCACTAATAAACTCCTATTAGCGATATGATCTATTACTGATAGACTCAAACTATTGTTATGATATATCACTAATAGACTTCAAAAGCAAAATTTAAATTTTACTATATTTGCAAATTTTTTCACATTGTATTATATCAACAAATATTTTGGACGCTATATTTGCAATTACCCTAGACATATAAATATCGATACCTCAACAAAAATGTAATACCATTTATCTTACCTAAACTTTAATTTCCAT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MESLLLSTTTTTVPNSLTHKSLLPSQPFSIIPHSSIQLSNKTKVVKRSNLPSLVASLSKPPKDSGNSKNTKTKVVVDGSVASVTEVPVVSWEDLQYPPGMLGAIPKRPEVIDERRQMEYLTKILSSKVYDVAIESPLELARKLSIQLGVNLWLKRDDSQFVFSFKIRGAYNMMANLPKEALERGVICASAGNHAQGVALAAGRLRTEAVIVMPRGTPPIKIEAVQNLGGNVVLFGDSFDEAQDHARQLSQERNLTIIPPFDNEDVIIGQGTVGMEIGRQMRGPLHAIFVPVGGGGLLAGVASFYKLVFPEPNDANSMASALHNDQVVKLEKVGTFADGVAVKQVGDENFRISRELIDGIVLVDKDAISASIKEMFEDTRSILEPAGALSIAGAKAYCKYNNITGVNIVAVTSGANMNFDQLGSIADGADSGNETEATFATILPEKPGSLRTFSDLVGSRNITELKYRYNSEKDAVVLYRSKVPNEVFYRFTLPERSGALLQFLDAFSPRWNISLIHYRRQGIISADVLVGLQIQESELGEFHGSAKKLGFDYVGVANNPASKLLTQVERERERERVGHGGQFRNPWERHPRDSQRDHEDDHNNTNYKAAEFGGSTNVIVDPNNETVVKIPVVSWKDLQYPSGELGAIPKRPEVYDVTDESPFHFAPNLSNGLGVNLWLKREDSNSGGQKEEVEKGYSFKTRGVYNLMANLPKEELKKKMQKEELEKAGYSFKARGAYNMMANLPKEELEKGIICASNGDHYAQGLALAAHKLGTQALIVMPTTTPPIKVEIVENLGGNVVLYGDTFDDAQAHAKQLSQEQNLLIISPFDHEDVIIGQGTVGMKISRQMRDPLHAIFVPVGGGDLLAGVASFYKLVKIIGVEAGDANCMALSLHKNEIVKMEEIGSSVEGLAVKQVGNESFRIARELVDGIVLVHKDAISTAIKEMYEDTGSMLEPSGVVSIAGAKAYCKYNNIKGVNVVAITNGSNINFNQLGSIVDIVDVANQTEATFATKLPDKPGSLTQFLHLVEPCYITEVKYRYNSENEAVVLYSVGAKVASELKDAKRRIESSPFETYNLTKNEVVKDHSRYMGISIGDVLVGVQIEESEMGEFHESAKKLGFNYSAVADDPASKLLLTQL Homology
BLAST of ClCG04G009590 vs. NCBI nr
Match: XP_004143369.1 (threonine dehydratase biosynthetic, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN48214.1 hypothetical protein Csa_003609 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 941.0 bits (2431), Expect = 9.3e-270 Identity = 503/620 (81.13%), Postives = 532/620 (85.81%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. NCBI nr
Match: KAG6771811.1 (hypothetical protein POTOM_023203 [Populus tomentosa]) HSP 1 Score: 918.3 bits (2372), Expect = 6.5e-263 Identity = 552/1197 (46.12%), Postives = 723/1197 (60.40%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. NCBI nr
Match: KAG7034531.1 (Threonine dehydratase biosynthetic, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 881.3 bits (2276), Expect = 8.8e-252 Identity = 510/1112 (45.86%), Postives = 673/1112 (60.52%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. NCBI nr
Match: KAG7034531.1 (Threonine dehydratase biosynthetic, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 505.0 bits (1299), Expect = 1.7e-138 Identity = 283/497 (56.94%), Postives = 359/497 (72.23%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 861.7 bits (2225), Expect = 7.2e-246 Identity = 521/1198 (43.49%), Postives = 698/1198 (58.26%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. NCBI nr
Match: KAA0025314.1 (threonine dehydratase biosynthetic [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 712.6 bits (1838), Expect = 5.4e-201 Identity = 367/535 (68.60%), Postives = 430/535 (80.37%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZSS6 (Threonine dehydratase biosynthetic, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=OMR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 568.9 bits (1465), Expect = 1.3e-160 Identity = 301/529 (56.90%), Postives = 375/529 (70.89%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0FKE6 (Threonine dehydratase 1 biosynthetic, chloroplastic OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=TD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 542.0 bits (1395), Expect = 1.7e-152 Identity = 304/591 (51.44%), Postives = 389/591 (65.82%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9AXU4 (Threonine dehydratase OS=Nicotiana attenuata OX=49451 GN=TD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 516.9 bits (1330), Expect = 5.7e-145 Identity = 275/514 (53.50%), Postives = 351/514 (68.29%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P25306 (Threonine dehydratase 2 biosynthetic, chloroplastic OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=TD2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 461.5 bits (1186), Expect = 2.8e-128 Identity = 260/529 (49.15%), Postives = 338/529 (63.89%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P53607 (L-threonine dehydratase biosynthetic IlvA OS=Burkholderia multivorans (strain ATCC 17616 / 249) OX=395019 GN=ilvA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 1.2e-118 Identity = 231/500 (46.20%), Postives = 318/500 (63.60%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KHC3 (Threonine dehydratase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G448720 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 941.0 bits (2431), Expect = 4.5e-270 Identity = 503/620 (81.13%), Postives = 532/620 (85.81%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SI54 (Threonine dehydratase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold541G001690 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 712.6 bits (1838), Expect = 2.6e-201 Identity = 367/535 (68.60%), Postives = 430/535 (80.37%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SJE6 (Threonine dehydratase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold541G001670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 709.1 bits (1829), Expect = 2.9e-200 Identity = 364/535 (68.04%), Postives = 430/535 (80.37%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C648 (Threonine dehydratase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold202G00760 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 705.7 bits (1820), Expect = 3.2e-199 Identity = 363/535 (67.85%), Postives = 429/535 (80.19%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KET0 (Threonine dehydratase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G448730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 687.6 bits (1773), Expect = 9.0e-194 Identity = 354/535 (66.17%), Postives = 422/535 (78.88%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. TAIR 10
Match: AT3G10050.1 (L-O-methylthreonine resistant 1 ) HSP 1 Score: 568.9 bits (1465), Expect = 9.0e-162 Identity = 301/529 (56.90%), Postives = 375/529 (70.89%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG04G009590 vs. TAIR 10
Match: AT4G11640.1 (serine racemase ) HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 2.1e-33 Identity = 103/333 (30.93%), Postives = 174/333 (52.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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