ClCG02G009870 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG02G009870
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr02: 15573181 .. 15580307 (+)
RNA-Seq ExpressionClCG02G009870
SyntenyClCG02G009870
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGGAGAGGGTCCAAACTTGGAATATCGTCAAAGAGGATATGGTTGAGGTGTCCCAAGATTTTTTTAGAATGGAATCCTTAATTCTTGTGTAATGAGACCTACCTTTATATGATTCCACCAAAAAAAAAGGGGGAGGAGGGATCTTCAACGTTGTTGACGATCAGCCAAGTAACCTCACTACAAGTCTGTACAAAATTGTTGCAAGGTCCTAGCTAAAAGACTTTGCAAAATTGTTGCCCAGGTCCTAACTAAAAGACTAAAGAGTTGTCCTCCACACCATAGCTCAAAATTAATCAGCTGATTCTTACGGAATACTCCCAACAAAAATGGTCATAATCTTATTTGGATATACCTTTAGTATTAGTCAGAGCAGACTTTTGGGCTCCAATTGAAGACAGAATTTCATCCAAGCTAGAAAAGTGAAATAATTTTACCAGCTCTAGGCAAGTTACCTCTTCTGAGGACTCCATTTCTGACTCATCACTGGACATATTTGTTACTTGAGGCCTTGGAGTGGCAAGAGGAGGAAGAGGTGGCAGCGTTAATGATGGTGATGGTGGTGCAGGAATGCAAGGTGGGAGAGGTGGAGTGGGTAGAGGCAATCGGAATGGAGCTGGAATGTTCATCTTGTTCATTAAATGCAGCACCTACAATTAAAAAACTAAGTTGTAAGAATTTACTTCAAATATGCTCCAGCAATTAAACGTATAAATTATCATTTCATTTGTAGTAACCTGAGTATAGAAGCGAGGGACAGCTATGAGGGCATTAACAATGTTGGTCAGGATATTACCATCTGGTGGAGGATAAGCATACCTAAAAAAAGTTTTTACCAAATCTTATTGAATGCACAACCAAATACAATTGTCTCCACAAAAACTTAGTAAAGAACAAACAATTTTGATCAGATCAATTACAATGGATAATGAAGAACCTAAAGTAAAATAGTACTTTTAAAGGAAACAAATCTAATCAAGACATGAAAAACAGGTGATACAGGACAAATGGTATGCCAAGAATATTTAGACATTTTCCAATTAGGGATTGTATGTATTTTCTCTTTGGACTTTTTTTTATAATGATACACCAAACTTTCTTTGAGAAAAAATGAGCCCAACCAAAGAGGACCTAGTAGCCAATATTGTATCCAAGATGTTAACTCTTCTATGCATAACTTGCCACACAAAAAAACTGAACCTTCTTAGATGTTTACCTTCCACATAGAGGAAAAGTGGAGACATTTGACTGAAAGGAGCCAGCCAAACAACGACAGAAGAAGCTAACAGGAAAAGGTTTGGAAGGGCAAGGAGTCCAAAGGCAGATATACCCCAATCACTGAAGGGGGAGCCCACAAGTAAAGATAACAAAGCCATGACATCTTTACTCATATATTTATGATTCTTTTGAAGCATCCTTTCAAAAAAGGACCAAAAGATCCTCTAGCTCAGTCATCTTCAAGCTTTATATTGGAATCTCAAGTTGGAAAACAATGCCTGTGTCTTCACAGATAAGCCATCCACTGCCCAACCTTTTGAGGAAGCAGACCAGCACTGAAGAATCCTGTTAGACCTCCTATAATATTAACTTACAGCAGAAAAAGAAATAAAGGGAAGGGTATGGTGTGTGGGAGTGTGGCTTCTTCTAGCCAAACTTAATTAGTAGTTAATTTAATTAGTAATTATTTATGTCTTTGTTTTATTGTGGGGGAGGGAGGTAGTTAAGGGAGGAATAGGTGAGAGGGGGAAGACAGTTTTTATGTTTTCGGGAATTGCTTATACAACAGTTGGGGAAGGGGACTGAGGGCAGTTTCCTTGTGTAGTGTAGGGCTGTAATTTTGATGAAATTCAATAAGAAAGTTTGGTTGGAATCTTATCAAATTGGTATCAGAGCATCACCCTGGGGAAGCACGATACAATGGCGCAGCAGAAATTTGATGAGCGGATGGAAGCAATGGATCAAGAGGTTTCGGAACTTCACGCTGAAATTCAGAAACTTCCCGGTATTGAAGAATCTCTACTTTCGCTGTCCGTATTGAAAAGTTGGGAGTTCAAGCTGAAAAGCAGCAAATCATGTTGACTACGATACCCGTAGACTTAGCCCGTGGTCAGAAATTGCCGGCAGGGGATGAGTCGGGCAGTCGTACCACAAGTATGTTGCCGCAACCGTCGATAACTGATCAAACAAACGCGGAATCTTCTAACGCGGCCATGGATCGGAGTAAATTCAAGAAGGTGGAAATGCCCGTGTTCAGCGGAATCGATCCGGATGGGTGGCTATTCAGAGCAGATCGATATTTTCACATACACCGGTTGTCGGAGACGGAGAAGATGACGGTGGCAGTCATTAGTTTTGATGGTGTTGCACTCAACTGGTATCGGGCTCAGGAAGAACACGACTCTTTTACGGATTGGGCAAATTTGAAGCATCGTTTGTTGATGCGTTTTCGTTCTGAGAGGGAGGGGTCGTTGTGTGGTCGGTTTTTAGCCATCAAACAAGAGACTACCGTGGAGGCTTATCGGAATTTGTTCGATAAATTGGTTGCACCATTGCCACATTTGTCAAATGAGGTTCTGGAAGAGACGTTCATGAATGGCCTATTGCCGTGGATCAAAGCTGAGGTTGAGTGTTGGGAACCAGTCGGTCTGGCACAGATGATGAAGTTGGCTCAGAAGGTTGAAAATAGGGAATTGCGTCGTTTTGATGTTGGTCTGGGCACAAAATCAGTTGGACGACCGCAGCTGTTTGATCAGAAGGATTCGTCCTTGCCTGCTGGGCTGAAGGAAGGAGGGAAGACGACGGAAACGCCTACAATGAGGACGATAACATTAAGGGGATTGTCGATTGTGGGTAACAAACGGGAAGGACTAGCGAGACGATTGACAGATGCTGAATTTCAGGCCAAACATGATAAAGGGTTGTGTTTTCGTTGTGATGAACGGTATTCAACAGGTCATCGTTGTAAAAATCACGATCAACGGGAACTTCGGGTGCTGGTTGTTGCGGATGGGGTTGACGATTTGGAAATTGTTGAAGATGAGGATTATCAGGAGGTTCAGACAGAGTTACAGATGATTAAAACAGATGACACTATGACCGCCATAGCGAAATTGTCAATTAATTCTGTAGTAGGATTATCCAATCTGGGAACTATGAAGATGAGAGGTCACATTGAAGGAGAGTCAGTTATAGTGCTAATTGATTGTGGAGCGACACATAATTTTATTGCTGAAAGATTAGTTTCGTCTCTACGCCTACCAATTGTGGAAACCTCCAATTATGGGGTAATTTTGGGATCGGGGTCCGCAATTAAAGGAAAAGGTATCTGTAATGTGATGAAATTAGTGATTGGGGATTTTATTGTCTGTGGTAATTTCTTACCTTTAGAATTGGGAGGAGTGGATGTAATACTAGGCATGCAGTGGTTACATACTTTAGGAATGACAAAAGTTAATTGGCAGAATTTGACAATGTCATTTAACCAGGATGGGAAGACCGTGGTATTAAAGGGAGATTCTAGTCTCACAAAGTCGCGGGTGAGTTTAAAAAGTATGATACGATCATGGACAGAGCGAATCAGGGATTTCTCATCGAATGTCGGTTCATGGAGGGCGGAGTTTCGTTGGCTAAATGGTATGGTATCGATGAAGTGTATACTATTTCTGATTCAATTCCAGCAGTGCTAGATACCTTTGTTGATGTGTTTGAGTGGCCGGAAACATTACCACCAAGGAGGAGTATTGAACATCACATCCATCTGAAGCAGGGCACGGATCCAGTTAATGTGAGACCTTATAGATACGGATCCAGTTAATGTGAGACCTTATAGATACGCCTATCATCAAAAGGAGGAGATGGAGAAGTTGGTGGATGAAATGTTAGCATCAGGAGTTATTCGTCCTAGCACAAGTCCGTATTCGAGTCCTGTTTTGTTGGTTAAGAAGAAGGACGGAGGTTGGAGATTTTGTGTTGATTATCGAGCTTTGAATAATGTTACTATACCTGATAAGTTTTGCATTCCGGTAATTGAAGAATTGTTTGATGAATTGAATGGTGCCACATTATTTTCCAAGATCGATTTGAAGTCGGGTTATCATCAAATTAGAATGTACCCGAGAGATGTGGAGAAAACAGCTTTTCGGACTCATGAGGGCCATTATGAGTTTTTGGTAATGCCATTTGGATTGACTAATGCTCCATCAACATTTCAAGCACTTATGAATACCATTTTTAAACCATATTTGAGTAGGTTCGTACTAGTTTTCTTTGATGTCATTTCAGTCTATAGTCGAACAGTAGAGGATCATGTTAAGCATTTGGAGAAAGTCTTTCTGATATTGAGGGACAATGAATTGTATGCTAATAAGACTAAATGTCAGTTTGCTAAGGAAAGGGTGGAATATTTGGGGCATTAGATATCAGGTAAAGGTGTAGAGGCAGATCCTGAAAAAGTTCGAGCAATGTTAGAATGGCCTGTACCTACAAACGTCAGGGAGGTGCATGGTTTTTTGGGATTGACTGGGTATTATAGGCGTTTTGTTCATCATTACGGTAGCCTCGCAGCTCCTTTGAGTCAGTTGTTGAAAGGGGGAGCCTTTGAATGGAATGCAGATGCGCAAGTTGCTTTTGAACGTCTGAAAAATGCTATGATGACATTGCCCGTTTTGACATTACCTGATTTTGATTTACCTTTTGAGGTTGAAACGGATGCTTCTGGTTTTGGATTGGGGGCAGTTTTGACACAATTGAGGAGGCCCATAGCTTATTATAGTCACACTTTGTCCCTACGAGATAGGGGGAAACCAGTATATGAGAGAGAATTGATGGCCGTAGTGATGGCGGTGCAACGTTAGAGACCTTATTTGTTGGGTAGGAAGTTTATTGTGAAGACTAATCAGCAGGTTTTGAAGTTTTTGTTGGAGCAGAGAGTGATACAACCACAACATCAGAAATGGATTGCAAAGTTGTTGGGTTATGGTTTCCAGGTAGTTTACGACCAGG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mRNA sequence

ATGGGAGAGGGTCCAAACTTGGAATATCGTCAAAGAGGATATGGCCTTGGAGTGGCAAGAGGAGGAAGAGGTGGCAGCGTTAATGATGGTGATGGTGGTGCAGGAATGCAAGGTGGGAGAGGTGGAGTGGGTAGAGGCAATCGGAATGGAGCTGGAATTAACCTGAGTATAGAAGCGAGGGACAGCTATGAGGGCATTAACAATAGCATCACCCTGGGGAAGCACGATACAATGGCGCAGCAGAAATTTGATGAGCGGATGGAAGCAATGGATCAAGAGGTTTCGGAACTTCACGCTGAAATTCAGAAACTTCCCGGTATTGAAGAATCTCTACTTTCGCTGTCCTTGGGAGTTCAAGCTGAAAAGCAGCAAATCATGTTGACTACGATACCCGTAGACTTAGCCCGTGGTCAGAAATTGCCGGCAGGGGATGAGTCGGGCAGTCGTACCACAAGTTATATTGTGGATTCTTGGGAAAGAAAACTTGAGCGCCCTATCTTCAATCCACAAATCCTCCTCCCAAAAATGGATTCTATCGCCTCTGATCAAATTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGAGGGTCCAAACTTGGAATATCGTCAAAGAGGATATGGCCTTGGAGTGGCAAGAGGAGGAAGAGGTGGCAGCGTTAATGATGGTGATGGTGGTGCAGGAATGCAAGGTGGGAGAGGTGGAGTGGGTAGAGGCAATCGGAATGGAGCTGGAATTAACCTGAGTATAGAAGCGAGGGACAGCTATGAGGGCATTAACAATAGCATCACCCTGGGGAAGCACGATACAATGGCGCAGCAGAAATTTGATGAGCGGATGGAAGCAATGGATCAAGAGGTTTCGGAACTTCACGCTGAAATTCAGAAACTTCCCGGTATTGAAGAATCTCTACTTTCGCTGTCCTTGGGAGTTCAAGCTGAAAAGCAGCAAATCATGTTGACTACGATACCCGTAGACTTAGCCCGTGGTCAGAAATTGCCGGCAGGGGATGAGTCGGGCAGTCGTACCACAAGTTATATTGTGGATTCTTGGGAAAGAAAACTTGAGCGCCCTATCTTCAATCCACAAATCCTCCTCCCAAAAATGGATTCTATCGCCTCTGATCAAATTTAA

Protein sequence

MGEGPNLEYRQRGYGLGVARGGRGGSVNDGDGGAGMQGGRGGVGRGNRNGAGINLSIEARDSYEGINNSITLGKHDTMAQQKFDERMEAMDQEVSELHAEIQKLPGIEESLLSLSLGVQAEKQQIMLTTIPVDLARGQKLPAGDESGSRTTSYIVDSWERKLERPIFNPQILLPKMDSIASDQI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 80..100
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 20..48

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG02G009870.1ClCG02G009870.1mRNA