Chy7G136990 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACGGAGGACAGTTGCGTTAGGGTTTCCTCCGAAGAACCCATCGCAGTTCCCTATATCGATTCCTCTTCTCAAACTAAGCAAAGGTATTTCTCATCTCTCCATATCCTATCGTACTTGATTTCCCTTCTTATTCGTTTCATTTCCTTGGAGAAAATGAGCAAGATCTTGGTTGTATTGTTCTGAATGATATCGTCATTTCTATTGCTCTGTTGTCATAAGATCTATCGTTGTACTCGTCTCTAAATTTGATTTGAGAGATTCTGATGAAATTATTCTTAGTAGTAGAAATGGGAGTTTAAAAAATAGGTTAGTTCTAGTTCATCAATTATTGAATTCTAGAAATGGACAACTTCAAAAATAGAGTATCCAGGAATAAACACAAGAGTTGATATTTTCATAATTATCGCTCTCTGTACTGTGTGAATGTGTGCGTGCGTGTGTTTTTTCTTTTTCCAATTATTGTATATTTTAACATCCGCAGAAAGAAAAGAAAGTGGGATCAACCTGCGGAGTCCTTTCTTTCTGCTGCTACTGCAGTTCCAGGGGTTCTTCCATCATACAACCAGACGCTACTTGGCGGAGTTGCTGTCACCACTGTGGCGGCACTGGCGCAAGTTTCTCCCATCAACTGTGCAACCTCAACCCAGGTGATTTAATATGTTGTTATAGTGATATACGACCTTATCTATAAAAAAATTACAGCGGATATTTGGGGCGTTGAGTTGAAGATATAGAATGTCTGGAGTTCATATGGTTATGGAGTCCATATGTTTGTGGGGCTCATATGTCTGTGGTTGGAGGTGCAAAGATGTTGTGTCTGCGTTTATATGTTTGTGTTTGGGGGTGCAGAGTTGAATTCATATGTTAGAGGTATTTGGTGCCATTTTTCTAACTCTAAAATAATGTGTTTCTAACTTTCTACCCATGATTTATTTTAATACAATATGGCTTGATTCTTTTTAGGAAACATATATTATTTGTAATCTTGAAATATGATCTAGTGTTATACATTGAGCAAAAGAACCTAATGATCAGTAGGCGCATCCGAACAACTCAACTAGGTTGACACCCTTTTAGCGCCCCATCATATCCAAAATAAATGATACAAGCATGACTAAAAGGGCCAAACAAATAATTTTTACAGCATAAGATATTAATACTTGGAAAACAAAGAGACAAACCTTGATAAAACAGAAAACTATCTATCTGTTAAGGGTCTATCAAAAAGCAAGCAAGACGATCTATCAATACCGATTCATAATCAAGCTTAAGAGATAATAGCGCTTCAATTTAGGTTGAACTCTGAAATGCTGTAGTTGTCAAAGTCTTTACAGAGAACCCCTGGTGTTTAATTTTGGAGGAAAAAAACCCTTCTCCATTGAAGAATAAAAAAAATTTGAGATGAAGTTTGTGAGGGTATTGAAATGTTTGGGAAGAGTAATGAGGGGGAGAGAAGCAAAAAAAAAGTGATAACCAAGAAGAGTTATGATATCGGGCTACTGTGCAGATGACATGTATCAAGGCTATCTCAGCGGGCCAAATGCTGAGTTGGGTATAACCCAACTCATCCCATCTCATCTCAATGGGCCAAACAGCTCCAAGTGATATATAATACAGCCATAGGTCATTTCAGATACTTTGTATCTTCGTACAAAGGTTTTTTACCTTTCATGCAGCTTCAGGATTTACATTAATCCTACATATAATTTCTGCATCTATCAGTCGTACTCTATTGTTCCTTGTAATCCAAAGACACCCAAGGAGGGAATTTGATGCAGTCCTTCGTAGCATGCTTGGTTGTGTGTGTGTTTTCGTGCATATGTCACACAAAGAGATGCAGTGTTAATTATTAATAAGGATTAATATTTAATTAATTTATTATAACAATTCATACATGTTCATGGTACCCCTGTTTTTTGTTTGAAATTTGAACTTATATAGTTTCATTGTTGTTGGTGTCCTGTATTGGCCTATGTTAATTACTACCAAGGGTTGCTGACTGAAAGCAATTTGATGTTACTAGGCTGTGTTCATATTATTTTCATTGTGGTTACATAGATGTGTGACCCCCTTGAGAAACTTTTCTTTGGATAACCAGCGTAATTTCAATTTCATTTGCATGCACCTCTTTTTTCTTCCTATAACTATAAGGTGTTTGATATTTGCATGTCTTTCTTTAGTCAAAGATTCAAGATGAGTTAATAGCAAGAGAAATATCAATAAATGACGCGGAGCCTTCTGTTCGGTACAAGCTCACAAAGCGACAGACACAGGAGGAGGTGAGTGATCTTTAGGGTACGCCTGGTCTGAGTGTTTGATAAGTTTTCGTTTCATATGAATTGTTTCCTTCAACTAACCCAGTCTTTCTTGTTCTTCATTTATTTTAATTTTTTGGTTTTTTTGTAAAATTGTTTTCCCTACTATGTCACTTTCTATGCAGATTCAAAGACACACTGGTGCCGTGGTGATAACTAGGTCTGAAAGTAATTAAAGTCAATTATGGTGGAATTTTTTTTAATGATGTACTCTTTTGAAGTAAACTTTGATAACACTTGCAGGGGCAAGTATCATCCTCCAAACACGCCCTCAGATGGTAACAAGCCACTTTATCTTCATATCTCCGCAGGAGCCCATGTAAGTAGGATTCACTGATTCACTGGCACATTATGAAATGAACTATTTCTACTAGCTTCTGCCATGACTCTTGTTAAGAAACCATGACAAGTAGTATAAGGTATTCCCATTTTCCCCTTTAGAGCCCCATGTCTGGTGTGTAAGAGCTTGGAGAAGCTGCTCGTGAGGGACTAATGTGCGCAGGAAGGCAAAAGAGCTCACCACTGGGAGAACATTGGTAAACCCATTTACCTGGGAGGGTTGAAATTACAGAATTTAAAGGGCTTGTAATAGGGAGTTATTGGCAAAGTGGTTTTGGCATTTTCCCCTTGTGTCTTCTTTCCTATGGATTTGGATTGTCCTGAGCAAGCATGATCCCGATTCTTTTGATTGGATTTTGAGTGGGGTTAGATACATTGAGAAATCAGTGTGAAAAAATTTCTACTGAGCTTCCATTTTCTTGATTGGATTTTATGTGTGGTCGGTGTTGGGCATGGTACTTATTTCTGGACGATAGATCATAGATGTTTAGGGGATCGTCCCTTGCGTTGTAGATTTTCTAACTTTTATTATTTCTCCACTATGAAAAATTGTTTTGTTGCTGATGTTCTAAAGCATTTGGGGAGCTCAGCCTCTTTTTTGTTTGTTTTTTCTTGACCTTTGTTAGAAAAGGAAATGGCGGAGGTTATGACCATCGTTTCTTCATTGGGTGAACCTGAGTTTAGACAGGGTTTTTTCGTTTTCGAGGCAACACTTCCTATTGTACTCTTAGGCCTAACTCCACTTATTTTTTTTCTTCATGATACCTGCCTTCTACAGTTGTTCTTGAGACACCAGCAACCATAATGTAAACTGAAACATCCTCCAAATCTCTTGAGAAGTGGTCTCTTTAACAAAGAAGATGACCGTACACATTCATAATCTGAATATCAATATCATTTTCAAAGGGTACCGATAAAGGGGAATAGCCTAGACAACATTGCAGACAGAACCCAAACTCCCATTCTACACAGCAAGAATGCATTGCAGGCCTAAAAAGAGTCTTTGTCCAACAAATACTATCTTCGAGCAAAACCTCTCCTTTTCCCTCTAGAAAGAAGGTCGAGTCCTTTTTCGACTCTCCTTTCAGCGTTAGTAGCGAGGATTTGGAGCTTATTGATGAGTCATCCGAGCTTGAGAGGCAGAGACTTCTTGAGCCTTTAGAAACAGACCTCAATGCTCTATTCCAATGTGGTTATCCAAAATTTTAAGATCTGCCCTCTGCTATCGTTCTTTTCATCAGTCTTGCAAAATTCCAGATCATCTAAAGTCAATAGTCGCTGACTGCGGACTTATTCTAGTTTGAATCTTCAGGGTTTAATTGGAGCTCCTCCGGTTGTTGGACCATCTTCTGTCTTCCCCTGATTTCTCTTGCATGGGTGAATGAGTAAAGCCTTGTTGTTTGGGGTAGTTTGCTTGATATTGTTTTTGTTTTTGGTCTCCGTATTTCTGGCTGGCCAATGGGGAGATTCTGTGGGGGAGTTCTTTTGGAATCAGATTCTGTTTGTTTTGGAAGTTTTATTCAAGTTCCTGTGGATTCTGGATGGTTTCGACAAGACAGATTTGAGGCAGCCAGTTGCTTCTACTGGCGTATCTCTTTCTCCTTTCATCTTGAAGATTTGGGCTTGCAAGTTTTTATTCAAATGGGCTCTTCTTGAAGGAGTTTTAAGTTTTGCTTTGTATTTACCCTTCTATGGATGTTATGTCTTCGAAAGGCTTTGTTTTGCTCATTACTTTTGTGGTTGATTTCGATTCTTAGGTTGCCATATTTTATGTTTCCCAAGTATAGTTTTGCCCAAGTTCTCTTTGCTCTTAGTATAATACTCTTGTACTTGAGCTTAAAGTCTCAGTTATTTTCATTCATAAAGGGGCTTGTTTCCGTTTTAAAAAAACACCCTCTCCAGATGAATTTCAGAGTCATAAATTTTCCAAGAGAACAATTCACAGCACACCTCGTCTCTTGGCCTGTAGGCAGATATGGCTTACCAGCATCAAAGAAACTAAAGTTTTCATCAAAAGCTTCTCCATCAAAGCTAACGTCAAGGTTTTTCTTGTACTTCACACATTAATTGTCAAGTTCCTGAACTCCTACAGTCCCATTATACCCCTCCCCACTTTCTTTCCCGCCTTGGGTTTCTTCTTTCTCTTGTATCTTATATATGAGCTAAGAGCCTAAGACACATACTTCCATGGAGCCACTAGTTACTATTGCAAATGTAGGGGATCGTGAATCAATTCAGATGGTTCTCTGTTATTTTAGTGTTGTTCTTCCATTCTTTTGTACTCTGATATTGTATTTTCTTTAGATTTGCACAGCTTTACCATCTTTTCTATTCTTG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ATGACGGAGGACAGTTGCGTTAGGGTTTCCTCCGAAGAACCCATCGCAGTTCCCTATATCGATTCCTCTTCTCAAACTAAGCAAAGAAAGAAAAGAAAGTGGGATCAACCTGCGGAGTCCTTTCTTTCTGCTGCTACTGCAGTTCCAGGGGTTCTTCCATCATACAACCAGACGCTACTTGGCGGAGTTGCTGTCACCACTGTGGCGGCACTGGCGCAAGTTTCTCCCATCAACTGTGCAACCTCAACCCAGTCAAAGATTCAAGATGAGTTAATAGCAAGAGAAATATCAATAAATGACGCGGAGCCTTCTGTTCGGTACAAGCTCACAAAGCGACAGACACAGGAGGAGATTCAAAGACACACTGGTGCCGTGGTGATAACTAGGGGCAAGTATCATCCTCCAAACACGCCCTCAGATGGTAACAAGCCACTTTATCTTCATATCTCCGCAGGAGCCCATCTGAAAGATATGGCTGAAAGGATTTTAGCTGTTGATCGAGCTGCTGCCATGGTTGAAGAAATGCTTAGACAGGGTCAGAATTTGGCGCCATTGTCCTTTAGTTCTTTAAACAATGAATTCAAGGTTAAACAGCCATTAAGCATGAGTGTGTTCTTGGGCTTTGACACAGATCCATCTATGAACATTGCTGCTCGAATACGGGGACCAAATGACCAGTATATAAATCACATAATGGCTGAAACCGGAGTAACTGTCTCTCTTCGAGGACTTGGTGCGGGAAATACTGAAGGTGCATGTGAAGAACAACGATTGCATTTATTCTTGACAAGCAACAATTCCAAAAATCTTGAAGATGCCAAAAAATTGGCTGAAGACCTGATGGATACAATCAGTAAAGAGTTTGGCGTTTCAAGGGTTTCATCATGTAAGGTTTATAGTGCTGTTCCACCTCCACAGCAGGTTTATGGAGCTGTTCCACCTCCCCCACAGGTCTATGGAGCCGTTCCACCTCCACTTCAGGTGTATGGAGCTGTTCCACCTCTGCCAAAGGTTTATAGTGCTGTTCCACCTCCACTACTTTGTTCAACACCACAGTTCGCAAGAGTTGAGAGCTTGGGAAATGAGCCGACTACAAGTTCAGCTTCAAGTTTGATCTCGTCAGCTTCTCCTACCATAGTCTCACCGGTTTCTTCAGTTATACCAGGAGTTGCTCCTGTCATCTCTCAAGGTTCAATATTACAATCTGGACTGCCTCAGTCTCAATCAACCGCCATTAGTTATACCAAGCCATGTATATCTGGCGGGACAAACTATAATGGATATAGTGGAATATATCCTCAAGCAACACCTTTGCAGCAAGTTGCCCTTGCCCTTAAACAAGTATCTTCAACTACCACTCCTGTAGCTGTCCCAAACAGGCCAGCACTGAGCGTGTCAAATATGAATGTTAACTCTGATGCAGAGAAAGAAAAACGCCCTAGTCAGAGACGTAAATTTCAAGAGCTACCAATTTGTGTGCAGGGTTCCTCAATAAGCAATCAGGATTCAGAACTTTCGGACAACCCCTCAAACAAACCCACTGTGAAAAGTGTATCAAATATGCCAGCTCCTAGGAAGCTTGTTCAACCTTCGTCCAATGGAATGGGACCACCTCAACCACGATCCATGCCACCACCCACACCAATAAAATCTACATCAACAGTTAAGGTCATAGTGCAAGATAAGGAACTTTCTTTGGACACCATTAAACACGATGTTGTCTCAGATACATTAGTGAAGCTAATGGAATATGGAGAAGAAGATGATGATTCAGAGGAAGGGGTTGAATCATTGAACAGCGATAACACTACTGGTGGCATAGCAAATCGAAAACCTTTCTGGGCCGTGTAG MTEDSCVRVSSEEPIAVPYIDSSSQTKQRKKRKWDQPAESFLSAATAVPGVLPSYNQTLLGGVAVTTVAALAQVSPINCATSTQSKIQDELIAREISINDAEPSVRYKLTKRQTQEEIQRHTGAVVITRGKYHPPNTPSDGNKPLYLHISAGAHLKDMAERILAVDRAAAMVEEMLRQGQNLAPLSFSSLNNEFKVKQPLSMSVFLGFDTDPSMNIAARIRGPNDQYINHIMAETGVTVSLRGLGAGNTEGACEEQRLHLFLTSNNSKNLEDAKKLAEDLMDTISKEFGVSRVSSCKVYSAVPPPQQVYGAVPPPPQVYGAVPPPLQVYGAVPPLPKVYSAVPPPLLCSTPQFARVESLGNEPTTSSASSLISSASPTIVSPVSSVIPGVAPVISQGSILQSGLPQSQSTAISYTKPCISGGTNYNGYSGIYPQATPLQQVALALKQVSSTTTPVAVPNRPALSVSNMNVNSDAEKEKRPSQRRKFQELPICVQGSSISNQDSELSDNPSNKPTVKSVSNMPAPRKLVQPSSNGMGPPQPRSMPPPTPIKSTSTVKVIVQDKELSLDTIKHDVVSDTLVKLMEYGEEDDDSEEGVESLNSDNTTGGIANRKPFWAV* Homology
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LIA4 (Protein RIK OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RIK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 380.2 bits (975), Expect = 4.5e-104 Identity = 278/643 (43.23%), Postives = 363/643 (56.45%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q32SG5 (Protein RIK OS=Zea mays OX=4577 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 362.5 bits (929), Expect = 9.7e-99 Identity = 269/594 (45.29%), Postives = 336/594 (56.57%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3TCX3 (KH homology domain-containing protein 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Khdc4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 1.3e-18 Identity = 102/360 (28.33%), Postives = 160/360 (44.44%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZL54 (KH homology domain-containing protein 4 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=KHDC4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 3.8e-18 Identity = 121/465 (26.02%), Postives = 188/465 (40.43%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7Z7F0 (KH homology domain-containing protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KHDC4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 6.5e-18 Identity = 144/566 (25.44%), Postives = 228/566 (40.28%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KVP0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G102290 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1126.3 bits (2912), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/617 (97.57%), Postives = 604/617 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VGN4 (Protein RIK isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold25G00090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1047.7 bits (2708), Expect = 1.9e-302 Identity = 568/637 (89.17%), Postives = 586/637 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCJ5 (protein RIK isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1047.7 bits (2708), Expect = 1.9e-302 Identity = 568/637 (89.17%), Postives = 586/637 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GTP6 (protein RIK isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457404 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 971.8 bits (2511), Expect = 1.3e-279 Identity = 532/624 (85.26%), Postives = 566/624 (90.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IWQ3 (protein RIK isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479889 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 966.8 bits (2498), Expect = 4.2e-278 Identity = 531/624 (85.10%), Postives = 564/624 (90.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. NCBI nr
Match: XP_011653367.1 (protein RIK isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1134 bits (2934), Expect = 0.0 Identity = 602/617 (97.57%), Postives = 604/617 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. NCBI nr
Match: XP_008460254.1 (PREDICTED: protein RIK isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0066474.1 protein RIK isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1056 bits (2730), Expect = 0.0 Identity = 568/637 (89.17%), Postives = 586/637 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. NCBI nr
Match: XP_038901396.1 (protein RIK isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038901405.1 protein RIK isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1021 bits (2639), Expect = 0.0 Identity = 545/622 (87.62%), Postives = 572/622 (91.96%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. NCBI nr
Match: KAG6581700.1 (Protein RIK, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 986 bits (2549), Expect = 0.0 Identity = 534/624 (85.58%), Postives = 569/624 (91.19%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. NCBI nr
Match: XP_023514657.1 (protein RIK isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 984 bits (2545), Expect = 0.0 Identity = 534/624 (85.58%), Postives = 567/624 (90.87%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. TAIR 10
Match: AT3G29390.1 (RS2-interacting KH protein ) HSP 1 Score: 380.2 bits (975), Expect = 3.2e-105 Identity = 278/643 (43.23%), Postives = 363/643 (56.45%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. TAIR 10
Match: AT1G20920.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 1.2e-06 Identity = 39/123 (31.71%), Postives = 59/123 (47.97%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. TAIR 10
Match: AT1G20920.2 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 1.2e-06 Identity = 39/123 (31.71%), Postives = 59/123 (47.97%), Query Frame = 0
BLAST of Chy7G136990 vs. TAIR 10
Match: AT4G08370.1 (Proline-rich extensin-like family protein ) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 1.4e-04 Identity = 23/48 (47.92%), Postives = 33/48 (68.75%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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