Chy3G058050 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy3G058050
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH03: 11462968 .. 11472787 (+)
RNA-Seq ExpressionChy3G058050
SyntenyChy3G058050
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AGACATAAATGTGGATCAAGTTTGAGTATATAGCCCAAATGGTCTATAGTGTATGAATAAGGTTGGGCGCCTTATTCTTGGGACACTATGGATGCGGCCCGCTTTGTAGTTGGTACAAACGATGTGATCCTGAATCGTTCATGTAGAGACATGGAAGTGGAGGCATCCTATGTAAAGAGTTTACATAAGACTGGAACTATGAAATAGTCACTTTTAAGTTATAACACTGTTAACTGTATAAAACTGACTATTTCGTTTATTGATGATCTAAGTAACTTAATCTTAATCCTAAGCTAACTATGAACTACTATTCACACAAAATTATCCTTAGATCTACATAGATGAGTGCAACTCAACTACGCTGACCCAACAAGCCTCCCATTTCAGGGGTAAGATCGGGTGGATGGCTAGGGACATAGGGTGCAAGACGGAATTCACTCTTACCTGTTTTAGGGTTAGTAGATATGTTGTTCTCTTAAGGACTTAATCAATGTCTTGAACAAGAGGCCACACCCTCTCATTGGTTCGAGAATGATTCGATTTATAGGTTGAACCTTAAACCAATTATTCAATAGTGGATCCATGAGACATAAGAAGCAAGTTGTTATCTCGGGGTAAAACGATATTTTGACCCAACCGAGGTTACGAAAAACCTATGAAGGATTAATTTACTGATCATGGTTATATTAAATGGACACAAATATATTTATAGGGAGGGAAGTGCAACTATGAGACTTTAGTGGAATGACCCGCTAGTTAACGAATGTTGATTAGCTCGGTCTAAAAGGGTTTAGCCAGTTAATCTTCAATCGATGGAGCCCGTAATCTATAGGTCCATTATGTTTCCCTGCTAGCTCATATGGAATAAACTTAGAACAGTATGTTGGAATAATTCGAATTGTTCGAATTAGGTAAAGAGAGAGAAACCGACGAATATATGTGATATAGTCATCGGTTATAAGTTTGAGATAGAGCTTTATGTTTAAATGTGATTTAAATATTAAAAATATGAATATGAATTCATATTTAGAAGCTCAAAATTGATGGAAATGATCAAAGTTGTAAAAAGTCAAAATGTTGACTTTTGATCGGGTTTATATTTAAATGTGATTTGAATTTTGGAAAAATGAATGTGGATTCATGCTCGAGAGGTTGAAACTAGTCAAGACGGACAAAATGTTGACTTTTGACTTGAAAAAATCAAAGTTTGACTTTGACTTGGACTTGAATGGTCAAATGACCATATTACCCTTGAACTAAGTTAGTGAAAATTCAACATTTAGTTAAATAATCCTACTAACACGTAGTGGGATAGGTGGCTACATGAGATGTAAACACCTAGCCCACTAAGTTTCACTAATGGTTAGTGGAATGCTAGATGTTAAGGTTTGGCCAACTAATTACACGTAATTTTGTATGTAATTAGGTTATAAATATAGTTCATTTCAAATTTACAAAGACATTTGGCCAAATTTGTATTTTTGTTTTTACAAAAATTTGACTAAATTATTTCTCTACCTAGATCCCTAAATATCACCTTCCAATTTTCATCTTGCTTTCCCTATTTTTCTTCACTTAACAGATCCCACAATCTAGTTTTAAGTCTGGAGAATAGCGGGTAAACTCTAGTGGTGATCCCGAGTTTGTGTTCGTGAGGAGATATTGAGTAATCGGGAAGCTACAAAGGTATAACTTCTATTAACTCTAATTTCATTTAATTAGGGTAGTTGATATGCATGTTAATCTCTAAATTAGTTTAGATGCAATTAGAGTAGAATTTATTCGTATTTTCGTTGTATATCTACTGTTTTCTATCAGTTTTGAGATTGGTTGTCTCCATAGTATGTTTGAAACCTTTGGCTTTTTTTTGTCCCCACCATTAATTTTTCTTTTGTTTCCATTTATTCTTCTACATTTTCTTCACTACTATCGCTGTCAATCTCTTCTTCAATTTCATTATCATCAACATCAACAACTTGATTCACCTTTTGTTTTCCTTTTGTCGTGAACACAATTCCTTCACTATTTGTATTTGTATCTTCTTGATTTTTCTCACCTTCGACTTTCTCATCCTCTTTTTCTATTTTCTTTTCTTCAACGACTTGCTGCAAGAAATTGTTGAAGTTAATAACAAGAACAATGAATGGTAGGCAATGATAGTTATTTATTCTTTTTAGATAGACAGAGATAGTGAAATATCACAATATTTACCAATTGCTCATGGCTTTGTTTTGTTTTATTTTTCCTCCTCTTATTTTCTTGTTTTCACTTTCGTCTGATGTTTCATTATCTGTTTCTTCATCTTCAGCTTATTCTTTTTCTCCATCTTTATCTTCATTTGTCTGAATGTAACAGGAAAATCTGTTGTCAAAATGTTGCAATAAAAAATATCTAAACGATCGTGTAAAGTTATATAAACGATTGTGTAAAGATATATAGGTGATCGTGTAAAGATACATAAATGAGCAATCGTATAAAGATATATAAATGATCATGTCTATATATAGACGATAGTATAAAGATACATAAATGAACAATCGTGTAACGTATATAAACAATCATGAAACCAATTGTATACAAAAGAAATCAAAACTTGTGTCAACACTTGTGTTTTTGGTGTTTCTAAATTTGTGGTTTCCGAATTCTCTTCTTCTTCATCATCATCTATCTGAAAGCATATAAAGTAAGAATGTTAAAAAAACATCATATAGATGTCTTGGATTGTGCATCTTATATATATAGATATAGATGACTATCTTTGACTATGAAAGATAAACATAGATAGAGCTCTATCTGTGTCTATACCAGATAGTGTGTGATGGATTTATTGTTTGCGAAAGAATTAAACCTGTGGCAACAGTTTTGTTTCGGGTGTTTCTAAATCTATAATCCCTATTGTTTTCAAATCACTTTGTGTTTCAAAGACCACAGTTCCCTACATAGAAAAAGAAAAAAGACAATTGTTTTTTATTTAGAATTTAAGCAATTTTAAACAATAGAAAGCAGTAGATAATGAATCAAACACTAATTGTACAGCAATATGTTATTGCATAGTTAACTATTATTAACTTTTTCATCTTCCGCAAGAAGGCCAAGGCTAGAAGTAGGTAATTTATTTCTTTCCACAACTCCTCGATATGCACTTTCTTTCTCTCTCTGTTGTTGTGGAAGCTTGTCTGATGATAGCCCAACATTTAAGCTTCTTATAACCAGTGTCAACATACTTTTTATTTCTTTTAGTCCTTGTCGTAACAAGATTTGTTCTGCTTCTATTTTTTCTTTATATTTTCTTAACTCACTTATTTCATTCAAGATTTTGTTTTTCTATTATTTCTATGTTTTTTTCCATTTCTTTCTCTCTTTTTTCTGTTCCTCTACCTGTTCTTTTTTATCCCCCTCCTCAATATCTTTGAAATATTTCAAAATTGTTTCTTCTTATGTTGAGTCTAGTGGTGTCATAGAGTACTACAAGTAAAATGATGTGAGATTATTAGTGAAAAAGTAGTAACTATATTGATAAACAGTGATAGATTTTTATCAACGTTTATTCCAAATAGACATGGATAGAAATCTTTCATTGTCTATCTAGATAGACATATATAGAACATGGTCTAAATTTACTTCCATTAGCAAATTAATAAAATGTTCATGTTTAGAGTCCTCCAGTCACTTGACTCCAAACATTCTCATGTCATTATTGTTGGCCCTTGAATTCCAAGCGTTCTTCCAAACCCAACATCTAAATTGAAAAGTTTTGGTATTGTCTCAAAAATCCAATAAATTAAAGCTAGGCGAAATCCTTGAAAGTATATAGCATCCTTGTCATTGTATGATGCTTTCTTGAAGAATTGACATTTTAGGATGTATGGTGATCTCCCCCATGGATAGTCTTTGAATGTTTCTTCATGATCCAATATGTCTAGATGTTGGAGATTTATGTGGTTGTGTTATTGCTTAGGAATTAAAAAGGTTTCTAAGATATAGAGGTTAACTAATTTTTCTTTCAATGAGTCTTCCTCATTGCATAATGCTTTGAAATTTCTTTCTATATCTCTTCTTGTTATAAAGTCGTCATGACGGAAAAGGGCATTTTTCATACTATTCTCTTTTCTTTCTCTTAGATTTAACTCTAGGCATTTGTGCCATTTTAATCCAGTCATCAAACAGAATTCTCTCAGTCCAAATTCTGCTATATGTCCATTAAAGTTGAAAGTAAAGACATTGGTCTTTTTTGATGACGTTGCTTCCTTATTAAGGAATTAAATTAGGAACCGTGTTGGTATTTTGGCTATTTTAATGTTAAGAAACTGACCAAAAGAGTTGTTCATCAAAACTTGAGAATGAATTGTTTGGTCTATTTTTTATTTGATCTAATTCAATATCTCTAAACTCTAGTACACAATAATCCTAAGATTTTTATATTCATCTTCCATAATAATGTCATTTTGATGGTGTTTGACCTATTGAAAAGATATAATAAACAATATGTTATAAACAAATGGCTAGTTCTAACATATTCACAAATACGCAGCACCATTCATATTGATATTGACAAAGATAGAGCAATCAAACAAAGATTACACAAATGTAGACAAAGATAGAATATTATACAAATAGATATTGATATTCTATTTTGTTACCTTCGTTTCTTTTTCTTTCTAAATTTTTTTTCTTCTGCCTTTCATTTAGATTTCATTGATTTGCTACTTGATGATGCTTGCTTCTTGCTCACCATCTATTTACTTAAAAAAAAGTTAAAGTTGAGATACATATGATAAGAATGATTATTCAATTAAATATAACAAATATAGATTCAAACCTCTTTGAATGGGTAGATCAGAATAGAAAAAGATCGATGGTGTTGATAGATCAACGACCAGAATGCCGGAAACAAATTTTGGAAGATTGATGAGAATGGAAGGTGAAGAACAAGGCGAAGAAGAATTTCGAAAGTTTTGTTTAAGAAGGTACAAGGAAATAAACGATTGATAAAGAAGATGTACAACGAAAAGTCTGAACAAATGTCTTCTCCTTTTTATAGCACGTTGATTTCGATGGTATTTTTGCAATTATGAGTGATTGGGCTTGGCTTCTCTAAATGATCGTTTATACTTACATACACGATCGTACATACATATCCGGCGATCATTTATATCTAAAGTTTTTAGCCATCGTTTAGTGTTTATTATCTGATCGTTTATATTTATGGCAATCTACAAGATCATGTATGAGTTGCATCTTTGTCTACAAGATCACATATGATGATCGTTTAGTACAACATTACTTGCGCGGTATGACCGATTAATCGCGCGTTCATTAGGGCATTTTTTATATTTTGCATTGTGTACCTGTGGGATTTTCTATTTTCAAAATTGTTCTATAAATTCTAAATATTTTGCCGATTTGTTATAGTTTTGAAAAGACCCCATTAATTTAAATAATTTTGTCATATATGTCATCATCCATAATATTTAATGATAAATATATTTGGAGCGTTTTGCAAAAATAACAAAAAAATTGTGATAATAGAACTCATGTCACTATATTTTCTAAATTACAAAAGTAATAAATTTAAAAAATAGATAACCTTTTGATAGTCATCTAATTGTTGTATGATATATTTAATTACTTGTCATATTTGTAATATGCAAAATAGAAGTGTTATAGACTGTTTTTTTCTAAATTTTTTTATCATCTGATGCAATTCTCCAATGTAATTTTGGTAAACAATTAATTAACTAACAAAATTCCCCTAGATATAATTCTTTTTTATTTTTTATTTAGTTATTCCTAAAATGGATATATACCAGTAAATGGAGGATTGAATATTGATATTAATGATTAACCAATATTTTCAATCTTTTAGATATCCATAAAGCATGAAAAAATATATAATCATCATTTCATAATCCAAATATGAAAGTATGAAAATATAGCACAATAACAAGATCTATAACTTACTCTGAGAGTAAAGACAATATTTTCATAAAATTAACTCATGATATTTATATCAACATGATAATTTTAATTATGTGAGATGATTGACGTGTAAGACTTCATTAGTCAAAACCAATTGTGTCCTGCCGGAATTTTGTTGCATCCCTTGAAATCAATTTTTCAAATTTTTACACTAATTTTACTTAAAAACAAGGGAAAAACTCCATATACATATTCTCGAAATAGTCACAAATATAGCATTTAAAAAAATAACTCATTGATCAATATATAATTTCATTTCATTGTAATCATGGATTTTAAATTTTAAATTTTAAATTACACTCATTGTTCATAAAAATGGACAATTAAAGACGAGTTTGAAAGTTAAAAATAAGGATTAAAATTACTATATTTTCAGTCCTTCAAAACTATTTTTCAAAGATATAAAAATTACATTTAAAAGTTTAAAATTCAATATTTCAACAATTTTTGAATGGTTAAAAGTATATTAAAGTATTAGAAGTGAGGTGACAATTTTAAAGTCAATGAATTTGAGCATCCAATATAAAACCACCTGCTAATTAATTGTAATTATGATAATTATAAATTACAATTTGAGTTGTCATATTTGTGATTTCCACCAACATGTGGGTCTGGGTCCATGTAGGATGTATTGACTTGAGTATAGTTTCATCGACCAAAAAGTTTGAATCTTAAATTATGATATATTACATCAAAGGATCAAATTGATGAGAGATTTAGGATTTTGCCAATCAATGTTTTGTACATGCAAAACACAAAGCTACTTCAGCTTGGGCATGGAGCTCTTCCAAGATCTTAACAATCTTCTCACGGCATATGCTTATTTCACTCTGCTCTTGTAGCATTTTTCTCAATCTACATCCATATAACATCAAACTTTATATTAGATACTGTTTAGAAACACAACTCCTAATGAAGTTAATGAGAAATGCACCAATTTTTGCGTGAATTGATATGAAAAAACTATAAAAGTATTTCGAAATAAAATATATTCAAACTCTAAGGTACTGATATTTACCTACCTAATATAGGTCCGACAAATTTTGGAACTAGACGTAAAGATCAAACAAATAACCTGTGCTTAACACATACACAGACAGAAGAATTAAGAACTAAATCTAGCCAACTCCAATGGGGACTATCGAGCCCTGTAAAACTCCTATTCATCTTTTCTCTTTTAGATAAATAATTACCATGGATTGAAATTATTTCTTCCAAGTTCTAACCAATTGGTAAAACCGTATCGTTTTGCGTTCCCACCAATACTAATATTCAATTCAACAAATTTTCTTTTCAGCAATCAGATCGTTGGCTTTGGGGTTGCAGTGAAAACAAAAGCTAATAATATAGCGCAAAGGAAAGTCGTAACAAAAGAGCTAATTACATACATTAGCCATATAAAGAGTTTTTCTTCTTTCTTTTTTGCTAATTTACACCTAAGCAGTTTTTCTTTATCACAGTTTATAGCCATAAGTCATGTTGACGTCAGCTAACAAGTTTTCATCAATCGATTTATCAAAGTAATTACATTACTGCATGAATAAGTTCAACGAAGCAGGCAGAAAGTGGTAACTCCTGCAGTATATTGTCATCCATGTTTTAATAATTGCTAGATTCTTTGTTATTTTCTATTGATCTATTAAATGGAAACTTAGGTACTTGGAAGCAGTCAGAATTTACCATAATAAATGGAAAGGAAAGATTTCAGTTGGGCTATTCACATACCTCTGTACAAGTGCTATGTCGCCATGACCAGTGCAAATGATAAGCATAGCATTAGTAGGTAATGAGGTATAGAGGTCATTGATTCTAGAATCCATGCGAGCCAAAATTTCCTGCAGTTCAACAGAGATCTTGGACCTATTCCTTTTCTTGTTGACAGATTTTGTATCACACGTAAGCAATGACAGCAACTCTGCAAGCTTGACATTTAATTTTTCTTCATCATCTACCTGCTTCTTATGGTAAGAATTTAATTCTGAAAACTGTGTCCAGATGAAGTGAACTTTCTCATTCATTGCCTAGTACAATAATAGGCCCAAACAAACCATTAGATATCAGTTATATTTGAAATTTCAGACAAATACAATCAGCAGTTAGCCAACCTCCTTTTTTGCCCTTGAAAGAGCTTCATCATCAGAAGTTACAGGAAATGCATGTGATGATTCAGAGGAATATCTCTTCACTGTTGAAATATCATCAATGAAAGAAGATGTCTTTCCACTCTCACCAAGTATATTAAGTAGTTTCTTTCGGATTAATGATGGAGGTGAACCAAAGTCTGGTCCTGATGGAAAACAATAGAAAAGCCTTTAAATTTGACAATTTATAACACAACATCACAGGGTAAGATAATCCCAGGACTAAACTGTACAATGCAAAAGATATGCTTGTTATCAATCAAGACTGCTGCGAATAATTTTCCCACTGTCAATCCCAAAGAAATGGTAACAGTTATAACATATGAATGGAACAAGAGTTTTGAAAGTAAAAACCCTTGAAAGCAAAATGGCAGTGTAGAAACAGATGGTCTAGTGCTAAGAAGCACGGACACTTCATATTAGAGGTGTATCAGTGTCGGACATTTTGCGGACACAGATTCGTCTGGACACGTGTCCAACACGCCATTTTGCGTGAGTTTTTTATAAAAAATAAAGAAATCAGACACGCTTGGACACACTGGAGATACTTCACAAACATGCTGGAAAAGAAAAATAAAGAAGAATGGGCCGAAATTTTAAAGCCCATTAACTTTATTTTTAAAAAAATATAAAAAATCACAAAACCTAAAATTTAAATTGAATAAGCTCCCCTTTCGTGCACTTCTAAACAACCAACTTCAAATGTTACTGCCGTTTACCAGTGTCCAATCCTTAAAGTTCATAAATTTTTCTTCTTTAAATCTATCTATCATGTTAGTTGTTAGCCATTGCCTATTTCAAGTTGAAATTCTTTTATTTATATATATATATATATTTTTTTTTTTCATTTTAAATGTTAGGATGACATCTACAAACTCTAGTCCCTGCCCTTTAAAGTTGAAAGTTTTGTACTCGTACAAACTAAAATGGCTAATTAATTTGACACTTAACATTTTATGTTTTTTATTAAACCACCAATTCACTCAAAAGCTTAAGTTGGTGGTTGAAAGCAAATTTAACTATAAATCACCAACACTCCCCTTTACTTGTGGGCTTGAAATATTTGAAAAGCCCAACAACAAGTGGAATCAATTTTAATTGGTGAGAAAACAACAATGCAGGGACTTGCATACAGGACCTCCCTAGATTACCTGCTCTGATATCATATTAAACCACCAATTCATCCAAAAGCTTAAGTTGGTGGTTGAAAGCAAATTTAATTATATATCACCAGCACTTTTTATAGTGTACATTTAGTATTTTATGTCAAATTAACATATATTCTTAGAAAATAATTAAAAAACAGTGTATCCCCTACATGTTCGTATCCTAAAATTTTAGAAATTAGCGTATTGCCGTGTCCTATCGTATCCGTGGGTCCATGCGTCTTAGGTCTAATGATTGATCATTATTCATATACATTCTGCAAACCTATGGGTAAAGGTACCAAGAAGGGAACATCCCTTGGAGCTTCTCTGTTTTGTTTATACTCCAATACATTATCATCAGGAGGAAAAAAATTCACTTTTCTGGGAACCTTGAACTTCCAGATTTCTTTCACCAAGGAGATCGCAAGCCTATTGTTCAATATCAAGAAATGAAAAAAAAAGTAGACTTGGTAACTAATTCCCCATAGCCCATCTAAACCTGTTGTAGCCCTCTTCCGACCAAACAGGATCAATCACATCTAACCCTAAAGT

mRNA sequence

AGACATAAATGTGGATCAAGTTTGAGTATATAGCCCAAATGGTCTATAGTGTATGAATAAGGTTGGGCGCCTTATTCTTGGGACACTATGGATGCGGCCCGCTTTGTAGTTGGTACAAACGATGTGATCCTGAATCGTTCATGTAGAGACATGGAAGTGGAGGCATCCTATGTAAAGAGGGTAAGATCGGGTGGATGGCTAGGGACATAGGGTGCAAGACGGAATTCACTCTTACCTGTTTTAGGCGGGTAAACTCTAGTGGTGATCCCGAGTTTGTGTTCGTGAGGAGATATTGAGTAATCGGGAAGCTACAAAGAGTAGAATTTATTCGTATTTTCGTTT

Coding sequence (CDS)

AGACATAAATGTGGATCAAGTTTGAGTATATAGCCCAAATGGTCTATAGTGTATGAATAAGGTTGGGCGCCTTATTCTTGGGACACTATGGATGCGGCCCGCTTTGTAGTTGGTACAAACGATGTGATCCTGAATCGTTCATGTAGAGACATGGAAGTGGAGGCATCCTATGTAAAGAGGGTAAGATCGGGTGGATGGCTAGGGACATAGGGTGCAAGACGGAATTCACTCTTACCTGTTTTAGGCGGGTAAACTCTAGTGGTGATCCCGAGTTTGTGTTCGTGAGGAGATATTGAGTAATCGGGAAGCTACAAAGAGTAGAATTTATTCGTATTTTCGTTT

Protein sequence

RHKCGSSLSI*PKWSIVYE*GWAPYSWDTMDAARFVVGTNDVILNRSCRDMEVEASYVKRVRSGGWLGT*GARRNSLLPVLGG*TLVVIPSLCS*GDIE*SGSYKE*NLFVFSF
Homology
[Close]
BLAST of Chy3G058050 vs. NCBI nr
Match: KAA0041137.1 (putative serine/threonine-protein kinase nek2 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 50.1 bits (118), Expect = 3.64e-04
Identity = 27/45 (60.00%), Postives = 29/45 (64.44%), Query Frame = 0 

Query: 33   ARFVVGTNDVILNRSCRDMEVEASY--------VKRVRSGGWLGT 69
            AR VV TNDVILNRSCRDM V+A          + RVR  GWLGT
Sbjct: 1002 ARSVVSTNDVILNRSCRDMGVKAVQWRWPNKPPISRVRPDGWLGT 1046

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy3G058050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy3G058050 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy3G058050 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0041137.13.64e-0460.00putative serine/threonine-protein kinase nek2 [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of Chy3G058050 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy3G058050.1Chy3G058050.1mRNA