Chy12G213820 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy12G213820
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH12: 12176665 .. 12179370 (-)
RNA-Seq ExpressionChy12G213820
SyntenyChy12G213820
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TGGTTGAAGGTGTGAGATGCATGGATCCTACTATTAAGTTAATTTTGCTTCTGATATTCTTCAGAATAGGTTGGTGCCTACCCACCCCTGCCTTATTTGTTTAGATTTCTTTATACAACTTATTTTTTTTTTTATCATTTTTACCTCTATATATATTCCTTGTCTCTAGTAAAATAATGCGAATCTATAAATTTAAATTTGAAGCTCAATCAGATTAGGTCATATTCATCGTTGTATAAATTGGAGCCTTAAAATTTGTAGTATTTTTTAAGATCATGTTTATTGGCGTTTTGCTTCTATTACTGAACTCGTTGATGAACTAAGTTCTTTCCGTTACATGCCAGCATGTGCTTCAACCACTGAAAAAAATTTTGAACACTGTGAAAGGGTTGTAAAAGATTGGGCCTTATCTTCTCTTCATCAAGGTATCAACAATGATAAACATACATTAAAAGATTTACTGTTCTTTCTACATGTTCCAAGAACAGGAGGGCGATCGTACTATCACTGGTAACTTTCAAATCATAAAGTTCGGTGGGTATTAATCACTCAAGTGTCGGAGTCTTAAGTGTTTATTTGGTTTTGTTCTGTAACTATGCAGTTTCTTGAAAAAGTTGTACCCAAGCTCTCAAGAGTGTCCCCGTTCTTATGATAAGCTACGGTTTGATCCCAGGTATAATTTTATGATCCCAAGTATAATTTCATTTTTCCAAGATGATTATTATTTTATTTTATAAATTGTTTCATATGACATTCATTCAACTTTTTAAATGTTATGTCTTACTCGCTTTACTGCCGCCTTGATGTAAAATAATTACCAACCCTTAGTTGCATACTGACGTTATGTTTGATTATGATTGATTATGATTGCTAAAACCGTGACATGCAACTTTAGTATGAACCTGGTAAATTGGTAATTGAATTAAAATAACTAGGATGTGGACGCATGAGCGGTTTACAAATTTTTTTAGTTTAGTTAGCGCAGAAGGTTAGCTTATATAGATAAACAATGAAAAAATGAAACTGAATAAGAAACATCATTAGGACTAGTATGGTGGAAGAACATTGTTTAAAATTTTTTTTCTTCTTTTTCAGTATTATATTTTCTTTATTGTTTTTTGTTGGTGGGGAGTATGGGATGGGTCCTCCAAAGTATATTGGGAAACAGATGGAAAATCAGAACCTTGAACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTGTATTCAAGACTGACTCTTTGATAGTTTTAACTAATTTTGTGCGTTTGTATGGTATTTGAATCTGAATTGCAGCAAGACTAAGTGCAGATTGTTAGCTACTCATGATGATTATAGCATGATGGAAAAACTACAGAAGGAGAGGACTTCGGTGGTGACAATTGTCAGGAATCCAGTTGACCGGGTTCTTAGTTCATATGAATTTTCAGTTGAGGTAGCAGCTAGATTTTTGGTACATCCTGACCTAGCTTCTGCAACCAAAATGTCCAAACGTGTGCGTGCAAAGACAAATGGAGTGAGCACACTGGATATTTGGCCGTGGAAGTATTTGGTTCCATGGATTCGGGGAGACCTATTTACTCGAGTATGTGTCCTGTTGGCTGATCTTGTGCTTCTTAATGATTATTTTCTTTTAACTCAAGCGGAGTGAAGATAAATATAATTAGATCTTGTGCATTTTTAATGATTGTTTTGTACTTTCTTGTTTGGTCGGGGAGCTCTGTTTCTTTCTCGTTTGGTTTTCATCGATAGTTGATTAATAGGGAAACAACGGAGGTTGCCACTTCTCTGTCTTTAATTGGGGAGTTCAGGTTTTAGGCTTGGGAGAAGGGATATTGAGTTTGGAGTCTCGACTCCTTAGAGGGTTTCTCTTGTAAGTCTTTTTGCATTTGCTGGATCCCTCTCTCGTTAGTAAGTCTGTCTTGGTTGCTTTGTGGAGAAGATTTTGAAGAAAGTCAACTTCTTTTCTTGGCAAGTTTTTCTCAGTTGTGTGAATTATATGGACTGATTTTTGAGGAAGTTAACCTTTGGGTAACGGTTTTGAAGACCTTTTGTGGTTGCTCTTTAGGCAACATTGTACTCAGTTGGACCCCTTTTCTTTAATGGGGGGTTTCGTGGGTTTGGTTTTTGAATTATTCCATTTTTTCTCCATAAAAGTAGTTGTTTCTTTATATATAAAGCTTTGGAGCTGTTTTAGTATGAATCAGAATTCGATAAGTTAAGCAAGTTGTATTCGTAGTTTGAAGCCAAACCCGTCTGGAACTTTGTTTTTTGGCTTGCTTTAATGGATGATCTTGTCATTTCTTTTTTTTTTCTGGAACAACTGAATCTATTTTTCATTAGCTTGTCAATAATGATTTTCAAGTGCTGAAACTAATAGGGAAAATAGTTGCTGCCACAAACTAATTTGGAGTTGTGCGTAGCTTTGGATGGAGATGTTAGAATCTAATAACAAATAATTTTTGTTTTGGCTCTGTTAGCCTATGTTTGTGATCGATTAATCTTGACAATTTCTCTCTTATTTACTACAATCTTATAAAGAGATTACTGTTTGCCCACTGTAATGAACAGAGAGATGTTAGAAGACAGAAAGGTTCAAGTGAAGCTAAAAGCGACAGTCCATATGACATGGAGGACATTCTTATGCCACTAAAGGAGTTTGTTGATGACCCCATTGCTCATGATCTTGTTCATAATGGGGCTACTTTCCAG

mRNA sequence

TGGTTGAAGGTGTGAGATGCATGGATCCTACTATTAAGTTAATTTTGCTTCTGATATTCTTCAGAATAGCATGTGCTTCAACCACTGAAAAAAATTTTGAACACTGTGAAAGGGTTGTAAAAGATTGGGCCTTATCTTCTCTTCATCAAGGTATCAACAATGATAAACATACATTAAAAGATTTACTGTTCTTTCTACATGTTCCAAGAACAGGAGGGCGATCGTACTATCACTGTTTCTTGAAAAAGTTGTACCCAAGCTCTCAAGAGTGTCCCCGTTCTTATGATAAGCTACGGTTTGATCCCAGCAAGACTAAGTGCAGATTGTTAGCTACTCATGATGATTATAGCATGATGGAAAAACTACAGAAGGAGAGGACTTCGGTGGTGACAATTGTCAGGAATCCAGTTGACCGGGTTCTTAGTTCATATGAATTTTCAGTTGAGGTAGCAGCTAGATTTTTGGTACATCCTGACCTAGCTTCTGCAACCAAAATGTCCAAACGTGTGCGTGCAAAGACAAATGGAGTGAGCACACTGGATATTTGGCCGTGGAAGTATTTGGTTCCATGGATTCGGGGAGACCTATTTACTCGAAGAGATGTTAGAAGACAGAAAGGTTCAAGTGAAGCTAAAAGCGACAGTCCATATGACATGGAGGACATTCTTATGCCACTAAAGGAGTTTGTTGATGACCCCATTGCTCATGATCTTGTTCATAATGGGGCTACTTTCCAG

Coding sequence (CDS)

TGGTTGAAGGTGTGAGATGCATGGATCCTACTATTAAGTTAATTTTGCTTCTGATATTCTTCAGAATAGCATGTGCTTCAACCACTGAAAAAAATTTTGAACACTGTGAAAGGGTTGTAAAAGATTGGGCCTTATCTTCTCTTCATCAAGGTATCAACAATGATAAACATACATTAAAAGATTTACTGTTCTTTCTACATGTTCCAAGAACAGGAGGGCGATCGTACTATCACTGTTTCTTGAAAAAGTTGTACCCAAGCTCTCAAGAGTGTCCCCGTTCTTATGATAAGCTACGGTTTGATCCCAGCAAGACTAAGTGCAGATTGTTAGCTACTCATGATGATTATAGCATGATGGAAAAACTACAGAAGGAGAGGACTTCGGTGGTGACAATTGTCAGGAATCCAGTTGACCGGGTTCTTAGTTCATATGAATTTTCAGTTGAGGTAGCAGCTAGATTTTTGGTACATCCTGACCTAGCTTCTGCAACCAAAATGTCCAAACGTGTGCGTGCAAAGACAAATGGAGTGAGCACACTGGATATTTGGCCGTGGAAGTATTTGGTTCCATGGATTCGGGGAGACCTATTTACTCGAAGAGATGTTAGAAGACAGAAAGGTTCAAGTGAAGCTAAAAGCGACAGTCCATATGACATGGAGGACATTCTTATGCCACTAAAGGAGTTTGTTGATGACCCCATTGCTCATGATCTTGTTCATAATGGGGCTACTTTCCAG

Protein sequence

WLKV*DAWILLLS*FCF*YSSE*HVLQPLKKILNTVKGL*KIGPYLLFIKVSTMINIH*KIYCSFYMFQEQEGDRTITVS*KSCTQALKSVPVLMISYGLIPARLSADC*LLMMIIA*WKNYRRRGLRW*QLSGIQLTGFLVHMNFQLR*QLDFWYILT*LLQPKCPNVCVQRQME*AHWIFGRGSIWFHGFGETYLLEEMLEDRKVQVKLKATVHMTWRTFLCH*RSLLMTPLLMILFIMGLLSX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy12G213820.1Chy12G213820.1mRNA