Chy10G184310 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy10G184310
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH10: 16995141 .. 17000346 (+)
RNA-Seq ExpressionChy10G184310
SyntenyChy10G184310
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGATTGGTTGGGAGAATGGAGGGCAATTGCTTGAAGTGGAAATGACCAAGCTGGTAAAAACTTCTCTACAAAAGTATTTGGTTTTGAAAGAGAACTTGTCCTTTTGAGTTTAAAGAAAACCTCGAACGCCTAAACGATTATTGCTTAAATTATCCTTATGCTTTCTGACCATCTGAGTTCCCCTATATTTTTTTACTATCTCTAGGTGTAATTCAATCGCTTTGATTTTATTCCAATTGAATCAAAGGCTTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTTTTTTAAATGTTTTTTCCCCTTCTGTATGAATGAACTAAGGATTGAAATGTCAAGGTCTCAGTTAGAAATGTCAATTCAAACAAAAATCAAGTTTCTTAAATAGAAAAATAGTTGGGTGCATTTAGGTTTCCTCATTTTTGCATTGTCCACCTAAGTCTTTAATGTCGCCGTAATAAGAAACTTTTCTTTTTTAAAATTAAAAGATTTTCTAATATATATTTTTCCTTTATAATTGAAGGGACATGAAGATGGGTGTCATTGAATTACTCTCTAAATTTCGTTTTCGTTATTGTTTGAAAATGTAGATTTACTAAAGTGGCCTCAAGTTTGATGTCGATAGTGCAAATTCATGGCAGTTGATGGCATGTGAATAGGTAGGTAGGCAAATAATTTGTTTGTGATTGCCCATGTGATTTAGGTACAAGATCATGCAATCGGAAGTTGTGACGATTGATATCTGGATCGTGTTGCTGGAGGTCACATTCCGGGTAAGTGATGATATCTTCTTACGTCTTTCTCAATCTGGTATCCAAAGTTAAAAGAAACGGTAGATGACTAGTAATTTTTTAGAGAAGATAGGTAAAATTGCATCATTGAGAAAAATATTTACAAAATATAACAAAATTTTATATCCTATCATTGATAAGACACAGATAAACACTGGTTGACATTTTAATATCTACCAAATGCACTTTGGACAACTAATCATTAACTTGTAAAATGAGAATCTGTCGAAAGGGTTTTGGTTTTCAAAATGTTCAAATTTAGTTCTTATACAATTAATTGTCTAACTTTATTTCTTAAAGTTAGATTTTTAAAATATAAATAAATAATAACAATAACTTTCTTTCCTAAAGTTAGATTTTTTAAAATATAAATAAATAATAACAATAACTTTCATGGAAAGAAATTGTGGAAATTTTTTAAAATAGTAGATTTTATAAAATATTTACAACTTATAGCAAATTCTATCACGGATAATCATTGATATCCTATAGTGATAGAATCCAAAATTTTGCTATAGCTTGTAAATATTTTAATTTATTTTGCTATTTTTAAAAATATCTCAAAGAAATATATGATGTGAATATGTTTTCAAAGTTTATAGTAAAATCTTACACATAACAAAAAAAAACATTTAAATTGCACAATTAAAAGTATAGAAACTAAAATTGAACAAACTTTAAAATATATAGAGTTAAATAATATTTTAACAAATAAATAAATGTGAGAGAAGTCCTTAAAATAGCTTCTAGGCTTCTAACACTCATGTTCCTCAATCCAAACGTCAATAGTACATGTCGGTCTCACACGATTAACCTTGTGACGACTGTACATGGCAACTTGTAATTTGCATAATAAAAGATTCTAAATACACAAGTGTATTGCACATTATAAAAGGTTTGGAATGTGTTTGGATATCATATAAATCTACACAAAAGTGCAATAGAGATGGAAACACCAATTATTATAAACTCTATATAGTTGTTATGACGATTTCCAAGGTTGTGGCTATGCTTTCCATGGCGGCCTGATGAAGCGCCAGCCACATATATTGGGATCACTCCCCTACCTCCCCCTCGACGTTCAACAAATCTTGAATTATTGTGTTCTCTAACAATTAATTGCTGTTTAGAATCTACAAAATACAAACATAATTAAAAAAAAAAAAAATACAAACATTATCATGGCTATGATAATTGTCACATGGATTTGATAAAAAAAAAAAAAGCTGACACATTAATTTTTATTTTAGTACATGTTTAATAACTATTTCAAGTTTTTGATGTTGTTTATCAAAAGTAAAAACCATATATGTTTTGATAATTGGTTTTTGTTTTCTGTTTTAAAAACAAAATGTATATTTTTCATTTTTTTTTCATTTGGAATATTGCTTTGTAATTTTAAAAACGTGTCTGGATCAAAAAAACAAAAAAGTAAATTAGTCATTAGATCTACTTCTCTTTTAAAAAACAAAAAACGAGTTACCAAACATGCTCAAGCTTAAAAATATCATACATTAACCATTTTTTTAGCTTATAAATTTACAAGACACATAACTGAACAGTGTTCGAGATTATTAAACAGTTACTTAATATAGGTTTGAAAACCATTTTTTAAGGAATTGAACTCAGTAAGCATAACCTATATCTATACCTACAATTCGCTTTTTGTTTGGTTGTGTATCCTACTAGATTGTTAATCAAAATCCAAGCTAAATTTTGTAAACTAACGAAGATATGTTTTAAGAACTAGATTTGGTTTTTACAATTTGGTTAAATATTCAAATGTTTTTTTTAAAAAGAGTGAGAATCGCCAATAATAAAATGGTGAAAAGACAAGCACATTTTTCAAAACTCAATAATGAGGGCATAAACCTTTTTTCTTTTTGGTATTTGAGAAGTAAACTTGTTTTGTCATTCTTTCTTTACAACCTTCTTCATAAAATTTGAATTCTTAGGCACATTGTACACATAAAAAAACAAAAATGGATATTTTTTCTTTTAACAAACGAATAACAAAAAAAATTAAAGGAGCTTATTTAGAAACTAATGATCAAATATTAAAGATTGTATAAAAAAAATAAACACTTATTAATCCTCAAAACAACGAGATTTGATTTCTCCACTTTCACATATTATGAAATTAAAAAAAAAAAACTCATTTGGACAATAAGTATCTTTAAAAATGAAAAAAAGAAGAAAAGAGAGTGGAGAGGAAATGAACCTATTGTGAAGAGTTGTGTGAAAGCAAAGGAAGCCATCATAGATGAACAAAGAATTACGAAAATGAATGCCATCTCTCTTCTTCTTCTTCCCATTTTTATTTCTCTATTTTTCTCTCTCAATGGAACTAATTAATGGAGGAACTGTACAAAGAAAGAGGGTATTTTCTGTGGTTTATATATATATAAAGTAAAAGAAATTGGTGGGGAAAATTGAAATATGGGTTGGGTCTTATCTCCTGTCTTTTACCTTTCGCAAGTACTTGGAGTGTTTGGAACTAAAAGAGAATCTTTTTAGAAAATAAAATAAAATGAAACTATAAAATACTATTTCGGTCTTTTATTAATTTAAAAGAAGTATTTTTAAAAATAACAAAATAAATTAAAATATTTACAAACTCAAAATTTTGAATTTTATCATTGATAGTCTTTTATCACTATAGCATATCAATCATTATCAGTGATAGAATCTATAGGTTATAAATACTTTATAATTTTAGTTTTGGTTTGTAATTTTATTTGAATAGAAAAAAAAATTGAAACTATTTATGAATTATATAAAAAAAATAGTTTCAATCTTTTTTTGTTACATCTAAAAATTCTCATTTTAATAAATTTTAATTAAATTTATTTGCTACTTCTAGTTTGTTGTTAAGTTTGATTAAAAAAACAACAATAAATAAGGTTTGTTTTAAAAAAATAGAGATTAAAATTTTACATTTAAAAATAGGAAATTGTCAAAAAAAAAAAAAATTACACTCCAAATGTAGTAGGTTTTATCTTTTAGTTGTTTTGTTTTTAAACAAAATAGAGATTAAAATTTTACATTTAGAAGTGGGAAATTGTCAAAAAAAAATTCATAAAATATTTACAGTTTTTTATCTTTTAGTTGTTTTGTTTTTAGTTTTGTTCTACAAAGTGAATAATTTGGTTTTTTTTTTCTATTTTTGTAAATAACCTTTAGAAACAATATTGAAGTTGGAATAAATTTCAAAGCATAAAGATAGAAAATGATAATTTAACTTTAGAAAACTTATGAGAACCTTTTTTTTCTTCTCGTTTTACAGCTGTGTTCTTGCTTTTCGTTTTTATTTCAACAAATCATTATTAGTAGTAATTATTTTGTTTTTAAAAATTAAGTCTATTATTTTTACCATTTTCACCCTGATTATTAGCATATTAGTGGAGTAGAAAAGTTGGATTCTTAGCTTAATTCTAGAAAAAACACAAGTTTTTAAAAACTTTAAAATTTCAAACTTTTACTTGGTTTTAAAAATACTCCAACAATATTATCAACACTAATGGATGAAATTAGAATTGTGAGCATAATTTCCCAAAACCAGAAATAAAAAACTAAATAATTTCCAAAAACCGTACATAGTTATTAAAAACTTGTTTTTACAAAAATTCTTACTTTTTGACTAATTTCATTTAAAGTATATATCTATCTGCTTTCGGCCTTTATTTTAATAAACTACCTTCGTTTTGTTCATGATGAAATTCTTTAAATTATAAAAAGTCAGTTTTTGAACTGATTTGGGAATTAAATTGACGTTTCAGTTATGCTTATTAACTTATAAAAAGAATCACTTTTATTCTCAAATCTTGAAAATAATAATTTACAACAAATATATATATATAATGAGATGAGATAGAAATTAATACACCATGGTTAGTTCTTATGTATTAAAGGTCTTAATTAGTATCAATTACAACATCATTCATGTACATTACCTTGACAACTAACGAATAATTGACTTTAAAGTGATTTTAGCTATGCATTCTTTTAGATAAAATAAATGTTAAAACTATTCTTAATCTTCTATGAGAGATAATGAAAATAGTATTTTGAGAGACTAATATATAATTGTATAAAATAATGAACAATTGAATTGGTCTGCACAAATGATTTTATGTAATGGTAACGAATTGTCTAAACTGATTTACTATAAACCTCATGCTGATTTCCTGTCCCTCTGTTATCCACTCGTCCCCGGTCTCTGCTGTCATCCGCACTGCCACTTCCACTTCCACCGCCGTCGTCACCACTGCGTCTGTCACCTCCAGTACTTCCACTTGCACCCACACCTCCACCTCCACCATCACCATCATCTCTGCCGCCACTTCCTCCTCCACCTCCATCTTATGAAAGGGGCAGTAGAAGAGGGTAAACGAGTACAGAAAGTTTGGTAATCTTAG

mRNA sequence

ATGGCGATTGGTTGGGAGAATGGAGGGCAATTGCTTGAAGTGGAAATGACCAAGCTGGTACAAGATCATGCAATCGGAAGTTGTGACGATTGATATCTGGATCGTGTTGCTGGAGGTCACATTCCGGTACTTCCACTTGCACCCACACCTCCACCTCCACCATCACCATCATCTCTGCCGCCACTTCCTCCTCCACCTCCATCTTATGAAAGGGGCAGTAGAAGAGGGTAAACGAGTACAGAAAGTTTGGTAATCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCGATTGGTTGGGAGAATGGAGGGCAATTGCTTGAAGTGGAAATGACCAAGCTGGTACAAGATCATGCAATCGGAAGTTGTGACGATTGATATCTGGATCGTGTTGCTGGAGGTCACATTCCGGTACTTCCACTTGCACCCACACCTCCACCTCCACCATCACCATCATCTCTGCCGCCACTTCCTCCTCCACCTCCATCTTATGAAAGGGGCAGTAGAAGAGGGTAAACGAGTACAGAAAGTTTGGTAATCTTAG

Protein sequence

MAIGWENGGQLLEVEMTKLVQDHAIGSCDD*YLDRVAGGHIPVLPLAPTPPPPPSPSSLPPLPPPPPSYERGSRRG*TSTESLVILX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 40..84
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 43..69

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy10G184310.1Chy10G184310.1mRNA