CcUC11G222630 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC11G222630
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr11: 27184421 .. 27189249 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC11G222630
SyntenyCcUC11G222630
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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AGGAAAAAGGAGATGAAAAGAAAAGTTATGGAATCAGATATTCCCACGAATGTCTCAGTTTCGCTGGCGCGAACCCGCCAATACTCATCCGATCCCATTCGCGCCAAAATGGCGCCCCAAATCACCGCTCGATGGGCGAAACCTAAAACCCATTTGCATCAGACGGTGCCTGGCCCCTGCTCTCCGATTCACTCAATTCCCACGATCACATAGATTTTCAATTTCACCAATCCGATCCTTCTCATGTCGGTCGTGCCTTCGTCAGATAGAGAGAGATTGGTGGGTTTTGTGACAATCCCCCCGGTTCGCAGTACGGGAAATTCAGTTTTCAAATGCACCGACACAGGGCGCGTTAATGACGAAGCGCTCTTCGCCATTTCCGTCGACTTTGCTCCTCCTTACGAGGTACGATCTGTGATTCTCTACTCTTGTAATCTTCACTAGTTTCTCTCGTCTGTATAAATCACCATTGTTTTGTTTACAATCAGCTCTCAGAGCTCGCCTTGGTCGCGCTTATCTTCTTCTTCACCAGAGAAGTACATGCGTGTTAACTAGCTTCTTCAATCTTGATTTCTTTCTAGGGCTGGAGTTCTGGTGTTAAGATTGATTGTTGTTTTCGACATTAATTCTTTGAATATTTGGCTTTCTGGAATTGATTCGTAAGATTACTTAGTGTAGCGAACTGGAACGATTTCCAATTTTGCCCCAAATTTGGTGAAACAAAGATTGCATAACGACGAATTAGGTATGTTCTATTTCTATCAGAGCGATCGGCAGTCACCAACTCGTATTTCCAGCTGCACTTCAAGATGGATTCTCAAACAAAATATCACATCCACGTGGCGTAACCCATTTCGATTTCATTTGGCGAGGCTAAAGAAAACTATATGGAAGGAGTAATAAATTAGTTATTATAGTTTATGCATAGTTTGAGGATTATAATAATGATTAAGTTATTTGTGTTTGGAATCAATTTTATTTTAGTATGAATTATAATAATATGTGTTAAGCGTGCATGCTATTTTAGTCTATGTAGAAAATAATAAATATTATATCAAGAAGAGAAAGAAAGAATGAGTAGGGAAATAGTAAACACGGTAGTAAATAGTAAAAATAGTAACAAAGAGATATCTGAAAGAATAGTGTGAAGTTTATTGTAAGTTATAATAGTTAAAAATACAAACTATTATAATTAGCATCTAAATATAGGTGAACTAGTCAACTTTCCAAAATTGTGGCCCAAGCACACCCTAACATTTTTGGCCCCACAACGAGTGAGGGTTCAATTGGCTTCTATTTGGTTGTTTGTTGCGGTTCAACCGCTAGAACAGTCCTCAAGTTGCGGCCCTTTCATCAATTCCCCACCCTTGGCATGAGATTCTTGATACTGGAGTTGCATGGGGAATGGGTTTTCCTCTAGTAATTTCCTTGTCTTTATGATATCTTTTAGTAGGCTGTAATGATAATTAATCAAGTTTATTGTCGGTATGAAGAGCTTAATTATGAATTATCAAAGTGTTCACAAATAACTTTATAAGACCAATTTTTTTTGTTACATAATGTCAACCTCTCTTTGGAAGATATACAAAAATATAGTTAAGATGGAGATTTGTTGAAAAAATTGTGATGAAAGTCTCACATTGGTTAGACAATGGAAGAATTATGAATATATAAGAGAGAGAATAACATTTCTATTAGTATAAAATCTTTTGGGTCTAAAAGTAAAGACACATAAGGATTTATGCTCTAAATATAAAATTTGACTGTGAATGCTAACATGAACTTGTATTATCAATCTCGAATCGATGAATTAGTATGAAAAATGGACATAAAATTAAAAGTTGGAAGAATTATTAAACACAACAGTTCAAATAATGGTGGATGTGTACAAAGGGGTTTTCTTTTGAGTATAGTTTAACATTATGTATGTTTATATATCGACTATTAATTCAATTTAATTTGTTTCTTTCCACAGCTGGTCCGGGTTTCTATATCTAGTATGTATTCGCCGAGGAGCAAAATAAATTATGTCAAATGAAAGCGCTTCAATATCTAATTCACTCAAATGGCCCAGTAAGTTTGCTTCCCTTCTTCCCAATTTATATTATTTAACAAAGAAAAATTAGTAACAATAACAACAATAATAATGGGAAAAAAATATAGCTACTACATCGACAAAATTATGTTAAAATTTTGACATTTTTTCTACAAAAGGTTGTGGTAAGCAATCTGTTTACTTTTATAACATCAGATTTTTTTGTACAAGGGCCAGACATAAACCAACTTTAGTTAAGGAATAATGGAAGTAGTTTAAACCATCAAATGATCTTTGTTTTCTATAATTAGATTTTTGAAGTCCAACCCCTTTTCCCTTCTATCCATTTGTTAATCCTAGGAGGAAGCTGCTTCTTTCTCTTCTCTCTCCTTTTATTTTATTTTATTTTTTCAACAAATGTGAAAATTTGAGATTTCAATACTTGGCCTTCAGACATGTGCGTACTTATCATTATGATGTAACTTTTGAATTGTTTGAAAAAAAATTGAAACCACATGAATTTTAGAAAAATGTCCATTATGTAATTGTGTTCAATTTTGTCCCTAGTGTTGTGAAAATTGAAAATTTACCCCAATCTTATTGCTTTCTATTAGACGTTTTAATGCAGATTATTAACGGAGGGGTTTTGTGGGAATTTTCTTTTGAAGATGATGGTAAAATTGAAACCTTTAGAACATGAGCTCAATTTAACCAACTATACACATATATGTCGCCCCCAACAAAGACTTAAAAAGAAAGAAACGAAGAGAATATAACTTTTTAAGGCCCATTGTTATTATTAGACACGTCATCTTCTAGAGAATACCATTGCCCTGTTACTGGTCCAAGGAAGGTTTGTCCTCCTTTTTCCTTTTTCTGTAATACTAATAATATCATCTCCCAAAAGTTCATGATATCAGAACTCAGAAGCTGTGCCCTTTGAGTAAAACTTATGTGCCGTAGATTATCTCTGAAGTAATGTTTTTGATGTGGCCCATGTAGGGCACAAGCAGCTACGGACTCTCAGGAGGACGACCCCATTTTGTTGAATTTTGACAAAATATTAGAAGTATAGTTATCTCACATCGAAAAACTGAAGAAAGTGATGGACGCCAAACACTATAAAAGGAATCTATGCCTTGAGAGACATAAATTTGTGCCATTTAAAAACATTTTTAGTTTAAATGTGCTAACTCTAGTTAAATCTTCTTTTGTATTATCTAGTTTGACCATGAGAAAAAGGGTCTAAATAGTATAAAGGTTTTGAGAGAGTGTTCTTGTAATTGAGATTAGGATAGAGAATTATTCTATGTGACTATAATAATTTTTTAGATAATGGATCTTTTTCTGGTGATCATAGTTTTTATTCGAATTTGGTGTTTTTCACGTAAATTTTGGTGTCAATTTTAAAGTCAGAGGGTGTTCCTAATACATTTGTGCCTTATTCGGAAGACTGTTGATGATAGTCAGCAAAGACCTAATTCAAGCGCCTAAAAACCGACTTAAAAACAAAAGAAGAGAAGAAAAAGAAGAGAAGAATGAAGGAAAAGAAAAAGCACCTAACACTGTATAGGCTTGGACTGTGTCTAAAGGTTGCTTGTACATCATTGTCTTTTCGTAGAGGAAAGAAAAAAGGTTCTCTCTAGAAGCGAATGAACTTGAACAAGATACCCTAACTTTTGAATGTCTAACTAGAGGAACCAAGTGAGTGGTACCGGTACTCCATGCTTTTTCATCTTTACTCATATTTTGAGAATCATTGTACGTATATAAATGAGACAACTGTATACATTTCTATTGGGTATGAAGTCTACGGATAAAATCAAAAGTAAAGTCATGTGAGCTCATATAATTACGTCCAAACTAGATGTTCCTCGGCCCTAATAGAGTTAGGAGTCTTGTAAACCTTTATGACAAGTCCTAACCAAATGGTACTGCTTTCACACTTTTTTGAAGGTTAGAGTTGTTTTTATCAGATTTGACTCGGTGAAATAGGCATAATGTGAAACTGCAGTTTTTATTTCTGGAACACTGAACACATTTAAGTTATGTATGTGTTGTTAGACTTAGATGGTGGAGCTGTTTGGTTCCGGAATTTTAATTTGCTAGGGAACTGCTTCCTCCACAAAAATGTTGCGGACAGTGAAGCTGCTGGAGATGACATAATGCAATGCAGCTCGTACAACCCTAGATCGTAATATGCATTTGTACCAAATTAAAGATTGTCAGCATGCAGTTCCGTGAATCACAAGAATCGAGGTGTACGGTACTGGCTCCTAATATATGATTTTTCTTTTCCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAAATAAGTGGTTTCTGCTTTACTTTTGCACGGTTTACTGTATTTATTTGACAGTATGCTTTTACTGGTGGACAATATCCAGATTCCAGGGTTTACCAAGATCATAGTGGCATGCATGTTACATTCAAAAGGTAGCTAATGCAGCCAATTTACTTGGGGAGGTTGGGTCCTGTCCAGCCTTATAAAACCAAATAAAATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGAAAAGATATTAGTTACTTTAATTTAATTTACGTTAACATGCTTTATGCGTATATTTACTAAAAGAAAGAACAATTAAGTACTTTATGCACCCTCTTCAAATCTCTACACATCTTTTCAAAGGGGTTGAATTTATTTATTGTGAACTAGTTCCTTTCTTTTACTCTGATCAGGAAATTCAGCCTACTCAACCAGGTCAGAGCTCTTGCACAGTGGCATCACCCGTGCGGCACTTCAGACGCTTACAGCTGAG

mRNA sequence

AGGAAAAAGGAGATGAAAAGAAAAGTTATGGAATCAGATATTCCCACGAATGTCTCAGTTTCGCTGGCGCGAACCCGCCAATACTCATCCGATCCCATTCGCGCCAAAATGGCGCCCCAAATCACCGCTCGATGGGCGAAACCTAAAACCCATTTGCATCAGACGATTTTCAATTTCACCAATCCGATCCTTCTCATGTCGGTCGTGCCTTCGTCAGATAGAGAGAGATTGGTGGGTTTTGTGACAATCCCCCCGGTTCGCAGTACGGGAAATTCAGTTTTCAAATGCACCGACACAGGGCGCGTTAATGACGAAGCGCTCTTCGCCATTTCCGTCGACTTTGCTCCTCCTTACGAGCTGGTCCGGGTTTCTATATCTAACTTAGATGGTGGAGCTGTTTGGTTCCGGAATTTTAATTTGCTAGGGAACTGCTTCCTCCACAAAAATGTTGCGGACAGTGAAGCTGCTGGAGATGACATAATGCAATGCAGCTCGTACAACCCTAGATCTATGCTTTTACTGGTGGACAATATCCAGATTCCAGGGTTTACCAAGATCATAGTGGCATGCATGTTACATTCAAAAGGAAATTCAGCCTACTCAACCAGGTCAGAGCTCTTGCACAGTGGCATCACCCGTGCGGCACTTCAGACGCTTACAGCTGAG

Coding sequence (CDS)

AGGAAAAAGGAGATGAAAAGAAAAGTTATGGAATCAGATATTCCCACGAATGTCTCAGTTTCGCTGGCGCGAACCCGCCAATACTCATCCGATCCCATTCGCGCCAAAATGGCGCCCCAAATCACCGCTCGATGGGCGAAACCTAAAACCCATTTGCATCAGACGATTTTCAATTTCACCAATCCGATCCTTCTCATGTCGGTCGTGCCTTCGTCAGATAGAGAGAGATTGGTGGGTTTTGTGACAATCCCCCCGGTTCGCAGTACGGGAAATTCAGTTTTCAAATGCACCGACACAGGGCGCGTTAATGACGAAGCGCTCTTCGCCATTTCCGTCGACTTTGCTCCTCCTTACGAGCTGGTCCGGGTTTCTATATCTAACTTAGATGGTGGAGCTGTTTGGTTCCGGAATTTTAATTTGCTAGGGAACTGCTTCCTCCACAAAAATGTTGCGGACAGTGAAGCTGCTGGAGATGACATAATGCAATGCAGCTCGTACAACCCTAGATCTATGCTTTTACTGGTGGACAATATCCAGATTCCAGGGTTTACCAAGATCATAGTGGCATGCATGTTACATTCAAAAGGAAATTCAGCCTACTCAACCAGGTCAGAGCTCTTGCACAGTGGCATCACCCGTGCGGCACTTCAGACGCTTACAGCTGAG

Protein sequence

RKKEMKRKVMESDIPTNVSVSLARTRQYSSDPIRAKMAPQITARWAKPKTHLHQTIFNFTNPILLMSVVPSSDRERLVGFVTIPPVRSTGNSVFKCTDTGRVNDEALFAISVDFAPPYELVRVSISNLDGGAVWFRNFNLLGNCFLHKNVADSEAAGDDIMQCSSYNPRSMLLLVDNIQIPGFTKIIVACMLHSKGNSAYSTRSELLHSGITRAALQTLTAE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC11G222630.1CcUC11G222630.1mRNA