CcUC11G213630 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACTCAAACTATATTCACCAAGTCTTTCTCAAGTTCTAAGCTCCTAATTTTGTGTTTTTAAAATTCATTAAAAAAAAAAAAATGGATAACTCTCAAAAGATGAGCTACCATGCTGGAGAAGCCAAGGGTCAAGCTCAGGTTCACACCTATCCATCATCATTTATTGATTGCATGTTTAATTATTATATTTTTAATATACATTATGGTAATTGAATATAAAATGAATATGGTAATAATTGCCAAATATAATAATTTAATTCTCAATATTTTTGTTATCTTTTAATGCCATTTTTTATTATTTTATTTCATGAATTTTACATTGCTGTTATTAGTTGTCATCAGAAGATGCCTCATATTTAGTTTATGTTTGTGTGATTAAAGGGTGATAGAGTAACATGTTAATTAGTTTGTCTTTATTTAGGAGAAGGCGAGCAATATGATGGACAAGGCTGTTGATGTAGCCCAATCAGCTAAGGAATCAGTGCAAGAAGCAGGACAACAGGTGAAAGTTAAGGCACAAGAAACTGCCGATGCTGTTAAAAATGCAATTAACAAATGAAAATACCATCCCCTTACTCTCTTCTTTTAGAATTTTTCAATAACTCTCGTCAATTTTGTTCTTGCTTAGAAATTTTCCCTTTTTTTTACTAAATAAAGCCAAGCATTATGTAAGAGCCTTAGCCTTGACAAAAAGGTCTCATATTGTATGGCTCATGAGCCTTTTCAACCAATAAGAATCATGACTAGTTGACAATTGACATGGGCCAAAACCTAGTTTGTTTTTGTAACGACCCGACTAATACATCCTAATCAGACCATTACTCAATGCATGCAAATTTCAAGAAAAGACACGATGCTGAGTAGTAAGAAAGAAACAGATGCTACTCATGGATATTTTTATTTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCAAGATAAAATCATCCTTTTCTAAATCCCAAAAATTTCCTTAACTCAAATTTTGAAATTTCCATCTTAGCTTAAATAAATGCATGAATGAATAATCATATTTATTTATTTATATTTTTTTTTTTCCTTTTCATTCATGATAACTTAAATTTATTTAATAGATTTGGGATTGTTACAGTTTTCCTCGTCTGATTAAATATTATAATCATGCCACAAAACATATGAATAAAATTGAATAGAAAAAAATAGAATAATTGTTTTGAATAGTGAATGCTGATATAAATATTTTTAAATATAATAAAATATCATTTGCTATTCGTCATTTGCTATTCGTGATAGTTAGTGATAGACGTTAATAGACTATACTATCATCTATCACTGCTTAACAATAATAAACATTATATCACATTTTGTTATATAAAGTTCCAAAAAAATATCAATTTATACCTTCAGATTTTGAATTTTTTTTTATAATATATTTTAAAAAAATATTTAAAATATGAGGTTGTTTTGAACCTTATTATTAAAATATTGTAGTTTTACTCATTCTCTCTATAAGAGATGATTCAATCCACGATAACCATTTACCTAGGATTTAATATCCTACGAATTTTCTTGACACACAAATATTGTAGGGTCAGATGGATTGTCTTGAAATTAGTCGATGTGCGTGTAAGTTAGTCGGAACACTCACATATATACAAAAAGAAATTCGACGTATATCTTTTTACTTATCCTCATCATGATTAAATTTATTAAAAAAAATTGGAACAAAACACGAGATGTAGAATAATATCAAATTGAGAGTTTGGGTAAAATTGGTTTCCATACATACTTATTAACTAGAGGCTCCCCCTAAACGTGCACCTCTCGCTCTCTCTCTTTGTTTTTTTTAATACCTAAATTAAAGAAAAACATCAATTTATACCTTGAGCTTTGAAAATCATATCAATTTTTACCATCACTTATATTTCGTTTGAATCAACATTATGTAAGACATATAATTTTATTAATTAAATCCATAAACTTCGAGAAAATCAATTTAGTCTTTTGTTTGAACTTTTGTTTTAACCTAAATCAATTTTCCATTATAATTTCCACTAATTTTTTTTTCAAGTATACCTTAAGACTCCACTACCACAAATAAAATGTGATATTTTGCTATTAGTTATAAATACTTTTAATAATTTTGCTATTTAAAATAATTTTCTTTACTAAAATGTTAGATATGCATTTCTATATCTATAGATAATTTTGGAATAGTGACAGCAAGTCATTTGAGCTCGAGTATACCTCTAAATAATATAATGTGCCTTTTATCCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTGAAATTTGAATTTTTTTAAAAAATATTTAGAATTTGAACTACATTTAGTCAAATTATAATTTTTGTGAAGAATAAAATATTAGATTGGTTCTTAAAAAAAAGGAAAATTATCTTAAATGACAAAACTACTGAAAATATTTATAATTAATAGCAAAATACATAGTCTATTTGTGATAGACCGAGATAGATCGCTATAGACTACTATCTGTGTCTAGTCTATCACGATCTATCACGGACTATCATAGATAGACAGTGAAATTTTATTATATTTGTAAATATTTTAGTTTTTTTTGCTATATTTGAAAATAATCTTAAAAGATGAATTCAAAAAATAAAAATTTAACTATTGTAATATTAAATAAAACTTATAAAGCATCTTGATATATTCATTATAGAATTTTTAAGATCAGTGGGATTTTTTTTACATAAATAAAGAGAATTAATTTTTGCAAAGAATAAAAAGTTAATGTGATTGTTATTTTCTAAATTAAATCTATGTGATTACTACTAAAAACTTTCTAATATTACTATGTCATTGCTAAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAGTTTAGAGATGTTTTAAACTTGTTTTTAAAAATTTAGACTAGAGAAAACTTTTTGAGAATTTAGGGACCAATTGTATCTATACTAAAAACTTTTAAGAACTAAAAGGTATGTTTTGAAAACTTAGATCAAACGACCCTATTTTTCAAAAGAAAAGATAATAACATAATTTTTAAAGATTAAGCAAATTTAAATTGAATTTAAAGTGGAAGATTTGAACATTTGGCTTTTTAGTCAAAGACATATACTTTAACCAATTAAACTATGCTCGCACACAAAAATTAGCTCAATATAGCATTATGCTTATGTTTTAACTATTATGATTTGCTTTGGTTGTCAAATAAAAACATAATCTAAATTTATGAACTTTTATTTCATTTAGTTAAGGTATTAGATACACATTAAACTTAAAAAGTAATTTGTAGTTTAAAGGTTTTTTTGCTAAAGGAAAAAAAAAAAGAGGCTCATGCATTACTAATATGCTTTCGGTTAAAATACAAATTTAGCTCCTAAAGTTTTGAGGATTTATTTATTTTGTCAACTTTAAAAAGTGTTTAAATTCTAATAATTTCTTAAACTCTTAGATTTGTGTCTATTTGGACATTGAACTATAAAAATTGTCTAATAAATTTTTTATCTTTTAACTTTATGTTTAGCAAATTCTTTCATTTCAATTTTGAGTCGGCATTTAACATATTCAACGTTTTCTTTTTTGAATGCATGGACATACAATTACAAAGTTGAAAGTTTATGGGCCTATGAATTGAAAGTTATTAAACAAAATTTAAAACTTATAGGCCAAATAGACATAAACTTGTAATGTAACTGTATGATGTCAATCCATTTATAACTTCAAGTTTTACATCAACTACTCGTTGATTATGATGTTAGTACATTTCTTTTAAAAAGAACGTCCGAATCTCTATTAAATCGTTAATCATTATACAATGTTGTTTTAATACATATATCATTATATATTGTTGTTTTAATACATTTATCCCAAGTGACCTTATTTTAATTAAATTTGACACGAAAGAAAAGGAAACCAATGACATGGAATTTGATTTGATCTCTAAAGTTCTTAAATAAGAGATTAGCAAAGATGACGTGGGAGATTACTTATATGCCACGTGGGTTCTTATGAAAGAACGTGTTGCTTCGGATAAAGTTTTATTTATTTATTTTATTTTATTTTAAATTATTTTTATTATTATTTTGCCCTTGTGTCAAGAAAACTCAATATTTTTAAAAAAATTATTTTAAATGACAAAACTGCTGAAAATATTTACAACTAATAGTAAAATATAACGGTCTGTAGACAGACCGTGATAGATCGCGATAAATATATTACTATCTGTGTCTATCGTAACACGTATAGTAGTTTATCGCTATTTATTGTAGATAGACAGTAAAATTTTGCTATATTTATAAATATTTTGGTTCGTTTTGCTATATTTGAAAAGAGCCCCTATTTTTGTTTAACCTCGTAATTATGAGTCGTTTTCAAATATAGCAAAATAAGTCAATTTATTTATAAATATGAAAAAAATTTATTTTTAATTAGTGTAATAAACCCAGCTAAACATTTATCATAGAAAATGTAATTTTGCTATATTTTGTAAATATTTTTAATAGTTTTGTCATTTAAAACAATTTTTTTAAATAATATATTTTAAAGACTCAACTAGATGATATAATTTGTTAAATGCTACCATATGATAAATAATTAATCAAGGTAAAATGTAGTACTAGAATTTTTGCCTAAGTGTCACCTTGAAAATTTTCCCATAATGTAGATGTACCTAACATCTATGTTTACTAGATGTGTGTTTCTTTCTTCGAAGAACAAGAAAACCAAACAATTACATAGACGAAGAGACAAAAAAAATTTGGCTCTATGAAAAGACATAAGGCAATTAGAAAAAAATTCCCCACCACACATACAAATGAGACCCATCCTTTACTAAATGTGTTTGGTTTGGTTTCATCCCAACATTTAATTTTTATGGGCTTCCAAATAATCTCTTCCTTTGTATGGTTCATAAAGTTCCCATTACAATCCATCTAAAT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ACTCAAACTATATTCACCAAGTCTTTCTCAAGTTCTAAGCTCCTAATTTTGTGTTTTTAAAATTCATTAAAAAAAAAAAAATGGATAACTCTCAAAAGATGAGCTACCATGCTGGAGAAGCCAAGGGTCAAGCTCAGGAGAAGGCGAGCAATATGATGGACAAGGCTGTTGATGTAGCCCAATCAGCTAAGGAATCAGTGCAAGAAGCAGGACAACAGGTGAAAGTTAAGGCACAAGAAACTGCCGATGCTGAAAAGGCGAGCAATTTGATGGACAAGGCAAGTGATGCAGCGCAATCAACTAAAGAATCAATACAAGAAACAGGACAACAGGTGAAGGAGAAGGCGCAAGGGGCCGCTGATGCGGTTAAGGATGCAATTAACAAATGAAAATGTCTCCAGTTTCATGTTTTTTGAGATTTTTTTCAAAGGCTCCCCTCAATTTTGTTTTTCCCTTAGATTTTTTCTTTTCTCTCTATTGAATAAAGCTAGCATTATGTAAGAGCCTTAAAAAAAAAAAAGGTCTCACATGGCTCATTAGCCTTTTTTGCCAATAAAAATGGGTTGCTTTTGTAATGTATCGATTTACATCTTTATTATGTTTTTATTCCTATAATTTTACCAATTAAATTCTTACATTTACGTAATCAAAT ATGGATAACTCTCAAAAGATGAGCTACCATGCTGGAGAAGCCAAGGGTCAAGCTCAGGAGAAGGCGAGCAATATGATGGACAAGGCTGTTGATGTAGCCCAATCAGCTAAGGAATCAGTGCAAGAAGCAGGACAACAGGTGAAAGTTAAGGCACAAGAAACTGCCGATGCTGAAAAGGCGAGCAATTTGATGGACAAGGCAAGTGATGCAGCGCAATCAACTAAAGAATCAATACAAGAAACAGGACAACAGGTGAAGGAGAAGGCGCAAGGGGCCGCTGATGCGGTTAAGGATGCAATTAACAAATGA 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BLAST of CcUC11G213630 vs. NCBI nr
Match: KAF7822332.1 (stress-induced protein KIN2-like [Senna tora]) HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 5.3e-23 Identity = 67/99 (67.68%), Postives = 85/99 (85.86%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. NCBI nr
Match: RXH68262.1 (hypothetical protein DVH24_028409 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 4.2e-20 Identity = 70/120 (58.33%), Postives = 85/120 (70.83%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. NCBI nr
Match: XP_011011268.1 (PREDICTED: late embryogenesis abundant protein 1-like [Populus euphratica]) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 1.3e-16 Identity = 61/98 (62.24%), Postives = 71/98 (72.45%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. NCBI nr
Match: KAG5247471.1 (late embryogenesis abundant protein [Salix suchowensis]) HSP 1 Score: 94.4 bits (233), Expect = 6.2e-16 Identity = 61/98 (62.24%), Postives = 70/98 (71.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. NCBI nr
Match: XP_022159706.1 (stress-induced protein KIN2-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 4.0e-15 Identity = 54/65 (83.08%), Postives = 56/65 (86.15%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49817 (Late embryogenesis abundant protein 2 OS=Cicer arietinum OX=3827 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 3.2e-07 Identity = 40/95 (42.11%), Postives = 52/95 (54.74%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96270 (Late embryogenesis abundant protein 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LEA7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 5.5e-07 Identity = 44/109 (40.37%), Postives = 58/109 (53.21%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49816 (Late embryogenesis abundant protein 1 OS=Cicer arietinum OX=3827 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 54.3 bits (129), Expect = 9.4e-07 Identity = 39/95 (41.05%), Postives = 51/95 (53.68%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P13934 (Late embryogenesis abundant protein 76 OS=Brassica napus OX=3708 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 2.1e-06 Identity = 38/94 (40.43%), Postives = 51/94 (54.26%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LW12 (Late embryogenesis abundant protein 29 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LEA29 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 47.0 bits (110), Expect = 1.5e-04 Identity = 40/116 (34.48%), Postives = 55/116 (47.41%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498HEG5 (Uncharacterized protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_028409 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 2.0e-20 Identity = 70/120 (58.33%), Postives = 85/120 (70.83%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E4Q8 (stress-induced protein KIN2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111026049 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 2.0e-15 Identity = 54/65 (83.08%), Postives = 56/65 (86.15%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E4S0 (stress-induced protein KIN2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111026055 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 4.4e-15 Identity = 53/65 (81.54%), Postives = 56/65 (86.15%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P6S3G4 (Uncharacterized protein OS=Rosa chinensis OX=74649 GN=RchiOBHm_Chr2g0163981 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 89.4 bits (220), Expect = 9.7e-15 Identity = 59/99 (59.60%), Postives = 71/99 (71.72%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6NKI2 (Uncharacterized protein OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_033303 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 89.4 bits (220), Expect = 9.7e-15 Identity = 52/65 (80.00%), Postives = 57/65 (87.69%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. TAIR 10
Match: AT5G53820.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 2.2e-11 Identity = 38/65 (58.46%), Postives = 50/65 (76.92%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. TAIR 10
Match: AT5G38760.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 4.9e-11 Identity = 38/64 (59.38%), Postives = 49/64 (76.56%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. TAIR 10
Match: AT3G02480.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 3.2e-10 Identity = 37/67 (55.22%), Postives = 46/67 (68.66%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. TAIR 10
Match: AT1G52690.1 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 3.9e-08 Identity = 44/109 (40.37%), Postives = 58/109 (53.21%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G213630 vs. TAIR 10
Match: AT1G52690.2 (Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein ) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 3.9e-08 Identity = 44/109 (40.37%), Postives = 58/109 (53.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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