CcUC08G161060 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC08G161060
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr08: 28691449 .. 28695627 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC08G161060
SyntenyCcUC08G161060
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAAAATATTCTTTGGAGTGTTCCACTGTCTTCTCCAGCTAAGCAACAGCTCGCAGAGAGTGTGATACACGCGCTGTGGTGGCGTAGGGTGAGAGAGCGGAGGGAAGGCGGCGTTGTAATTGTAATGTAGAAACTGGAAGGATAGAAATAGAATAAATAGGAAAAATACAAGAGCATGCTATACCCCCCCCCCCACAATCTATAACTATAATCCCTCCATTCCACTCCACACTTTTCTATTCTATCACTTTTCTTTCTCTTCTATTTACATCCAACCATTCCTTCTCTATTTTAAATAATTATATTGTTGCCCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCATCTAGTGTCAACCATGGACAATTTGTACTTCAAATACAAGGTGATTTGTATTAAATCACCGATGAATCTAAAAGCTAAATATATGGTATTAGAACAAGTGGTTCAAGATGTCCTATGTTCAAACTTTTGCAATACCATTTCCTCTCCAATTAATATTGATTTTCATTTGATGGATCTTATACATGTTTCAAACGGTCTACAAGTGAGGGCAGTGTCAAATAATACAATATTAAATTAACAAAGTAAAGTAATAATTTAAGAACTTGCAAAACAAAGTAAAGTAACACATCTATGTGTTGTCTGTTGGATATATATAGTGAAAGAAAGTTAAAATTTGGTGAATATTTGAAAGTTTATGCATTGAAAGTCTGTTGGACATGTATCATTTTCCCTTAACAATTTGCCATAGAAACTCTAATGCTTAACTCAATTCATAGTGCTCTATACCAAACTTTTAGCGAAGACGACAAGGTCAGGATAGACAATTGGGTTGAATGGCCTAGTCGCCTCTTTTGATGGACTCTCTTCCAATCTTAGTTAAGCCTCTAATTTCATCTTCGGCAAATTTCTAGTTTGGATAGAGTTTAACTATTTTTATCCCAGTTTTATCCTCGATGTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTATCAAAATTTCCACAACATATATATTTATTAGTAGCACTTGCAAAATAAACTAGATCAATTTTATTAATATACACAAGAATATTAATATATATATGTATATAAAGAGTAATGTAGGTGAGTCCAAACAAGATTGAAGATTTGATCAGCCTCACACTATCCCACATTTGTTAAGATATAATTTAATCGAAGGGTATTTTGAATAGTCCAAGAGTAAGGTAATAAGTAAAACTTTGACGGTGTGTGTTAAAAAGTGTGTCTACAAATTTAGAGTATCAAAAAGATGTTGGAATAATATTGAATGTGTTTTTTTGTAAGGTGGGGTGGGGGGAAACCGCGAGGATGTCATTGCCATTAGGTTTACGACAAATAAGATTACACAACCAATGCGACCAATATGCTTAAAAGCTGCATGCCCCATAGACAAAATTAAAATTTTAAAATTAAATAAATATATAAAATAAAATAAAATAAAAAACACCTTTTATTATATAAACAAAACTAAACAAAAAGACATTTTATGTAACCTCAACGCACATCTTACAAAATATTGCAAAAAAAGGGGAGAGATTTTTCTGTTTAGTGTTGGTCCTCATTTCGTACCAATTATCTTCAAATGTTTTCCTCAACAATGGGAGACATTGCCAGAATTTATTAACCATCTGACTCTACGTACTTCCAATACCGTCATGAAAACATAAAAAAGAATATAATCCCCCATTTCCAACTTTTTATTCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAATATATACATACACATACAAACAAATTAATATCAAATTAAAAAAATGCAACTTATATAAATGATCATCAGACATTAATACTCATATTTTCCTTGAACATTTTCAAACAAAGATTAGATGTAGGCATGGAACTATTCGATTTCCTATTTAGCTAAGTCACTGTCAATTTTATTTATTTATTATCTAGTGGGTTCCACGTGAGCAGAAGATTTACATGGAGGGTTATTTCAAAATTGAGCTGAAAATTAAAAGTCCAACATGTTTGCATTTTTGCAAAGGAATTTAAGGCAGGGACCGTAAATGAAATATATATATATATATATATATATATATGGTAGATAATAATTGAATAAAGAAAAGTAATAAGCATGCGGCCAACGGGTGATGGCAATTAAAAAGGGTCAGAAGAATGGTAATTACATAGTTAATGCGAAGGAGAGTTTTGTCTGCAAATTGAGTGGCAACCATATCTTTTGCTATTATTATTATTATTATTATTATTATTACTATTACTATTTTTCTCTTTTGCATTTTGGGTTTAAAAGATGAGTAATAAAAACAGTGTACCAAATATTTTGGGCCCTTTGTTTCTTACTCAGAATTTGAAATATTTATGACAAAAATCTTACCTTAAAGGTTGGAGCAGCTGCCCACTTCTAATTGAATTTATTTGTGTGTCTTTGGTGGCATGTGCCACAGTTGTGGTTATTGGTCAATGCAATGTTATTTCAACTCTCTATACTAAAAGGGAAGATGGGGATAATATATGACTGCTAACATTAACAACGTCTTTCTCCATCATCACATGGGGACTATGGTAAACACTTCACTTTTTATTACCTTGTTTGGGACTTTGAGACTTACATCTATTACTTACTCTTACCACAATCCCCAATGGTGAAAATGACATCTCCTCAATTTAAAACGCGTTCGAGATGCTTTCTTTCCTATTCTTGTAATGGCAAATGACAGTTTTACTAAAATGACATGTCTCGTAAAGTTGCAAAACCATATATAAAAAAATATTCTCTTATGTTGTTTTGTTGTTAGAAGCAAATAATGCTTAAAATCTGGTTCACTAACAGTGTCTCACCAATCCTCTAACGCTATAGGCACCTCTGCAATTTGTATAATCTTATATTTTCTCTCTAATAGTAAACTAATCTCTCTATCTGCCAGTGGACGCAGTTAACACACTGTTAATAAACCACGTAAATTTACAGTGTACATATTTATTGTTTACTTTTTCTCACCTTCTTTATTTATCAATTTCATAATAGTTGTGCATGAAAGTAAACATTTTTCCATGAGAAGCTTGAGGCCATTGTTTTAAAGAATTAGTCCATATACTTTCCATGAATAAAAATGGTAATCTAATTATATGATATATATGATGTAAAAAGTAACATAGTAATTTGATCACAAACTTATGTAAAGGAACGATGACAAAATGTGTGTCGATTAGAAACCAAAGGGAACGTAGATTTGACCCATTGGGAGAATGAGGTTGTCTCCTAAAAAAGGATATATAGGGCACAATGAAAAGAAGAAGAGTTGTAGGTCGACTATGAAAAAAAGTTGGGGATTAGGGTGACATGAAGGATCAAAGTTTCATACTCGTTATTTGTAGGGTCATGTCCTAAAACCATTGGCCAAGGGGGTGTCACATATCGTCGGAGATTTCAAATAAGGACGAATAATCTTTGTTCTATATGCACGTTTGGACTTTCATTTTAACATATATGTATCCATATATATAAATTATTAGCTAGACTTGTTTAATAATTGAAGTATCACCATATGGCACATATTAAATCCGTGCTTTCGATTTCATATACATTGTACCTTGCATGAGGGATATACGTACATAATTTTTTTTTTTTTAGATATTTGTGAGTGTTTGGACCAACTTACGCACACATCGACTAATCTCACTGGATAACCTGCCTAACCCTACGACATTTGGGTGATGAGGAAACTCGATATTAAATCCTAGGTAGGTGGTCACTATGAATTGAACCCATGACCTCTTAGGTCTATGACTTTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTATTTATGTTTTCGCTACTACTAGGACAACTCAGGATGGTTATACGTACATAATTTATTCATTTATTATTTTTTTAATTTATCAAAAAATTATGCTTTTAAATATTTGAAAACTCGTTCCAAACATGCTTTTAAGTTACTATTTTTTTTAAAAAAATTTAATTAGGTAATAATTGGTCATGTAAGCATAGACAGCTTGATTAGGATTATAGTCAATTGTACTTTTAGAAAAAAGTGTCAATATAATATAGTGTCGAGTAAATTTCAATTTTAAATTAGACAATGCAAGCAAAAATCGAATTTTTTTATGAATTTATTAGATGGCACAATTAATCATTTTTTAAAAAAAGAATCTCAGTAA

mRNA sequence

ATGAAAAATATTCTTTGGAGTGTTCCACTGTCTTCTCCAGCTAAGCAACAGCTCGCAGAGAGTGTGATACACGCGCTGTGGTGGCGTAGGTGGGTTCCACGTGAGCAGAAGATTTACATGGAGGGTTATTTCAAAATTGAGCTGAAAATTAAAAGTCCAACATAAACCAAAGGGAACGTAGATTTGACCCATTGGGAGAATGAGGGTCATGTCCTAAAACCATTGGCCAAGGGGGTGTCACATATCGTAATAATTGGTCATGTAAGCATAGACAGCTTGATTAGGATTATAGTCAATTGTACTTTTAGAAAAAAGTGTCAATATAATATAGTGTCGAAATCTCAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAAAATATTCTTTGGAGTGTTCCACTGTCTTCTCCAGCTAAGCAACAGCTCGCAGAGAGTGTGATACACGCGCTGTGGTGGCGTAGGTGGGTTCCACGTGAGCAGAAGATTTACATGGAGGGTTATTTCAAAATTGAGCTGAAAATTAAAAGTCCAACATAA

Protein sequence

MKNILWSVPLSSPAKQQLAESVIHALWWRRWVPREQKIYMEGYFKIELKIKSPT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC08G161060.1CcUC08G161060.1mRNA