CcUC02G033500 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAGATACTAATTTGGAAGTATAAATACTAAAAACACTCTGCTTAGTGTTCCTCATCTTTGCTCATTTCTCCTAGAAAAATCTTGCCAACGAGTTACAGTATTGCTTTTTGTCCTGAAATCTGACTTTAAGCCATGGACGGCTCTTGATTTCTTTTCCTGATTTGCTTCAACTCAGGTTCCTCCTCTTCTTCGAGCTTCAGCAGATTAATCAGTCGTTTTCAGATTGTTTTTGACGAAGCCCTACTTCGCCTGCGCTTCGGCGATGTCTGCATCCAGGTACACTCAATTTCTCCATTATTGTGCTTCCATTTGTATCTATAGAGATTCACCGACTACTTGATCTTCTATTTTCCATAGATTATCGTTGAAATTCCTGTTTATTTCTCTGCTGTTCGTTGTTATTTTTCTGAATAATTTCCGTTGTCTTCTTCACTCGTAGAAATGGCAAAAGAAAAGTTTGTGCTCTTTTCGAATGATTATCTCTAATCACATTAGGTTTATTCCATTGAAGAGGAAGATTGTCACATCTGTGCAATCGCTTCTTCTCGATGACTGATTTTCAGGCCTCTACTTTTGGGTTTCCTTTGATTTTATTATTATTTATCATTTTAACAAATTGCAAAAGTCACCTTATACTATAGTGGTAGTTTTAACTTTAACTCAAAGTTTTCATTGTAAAAACCAATAACTCTCAAATTTATGCAAGAGAAAAAAGTGCAACAATTATATAAATTTGAGGGTTCAATTTTTATCCTTTGGAGTTCAACTTTTACTCTATAAGTTTAAGAGTCTGATTTCAACCTTTGTTTGAGTTTAAGGGCCAAATTTTTTCGATTGAAGGTTGAAGGGTGTAATTACCACTCCCACCATAAATTTAGGTAGTTTTTAAAATTTGTCAGTTATTTTTTTAATCTAGTTCCTTTCCACTTTCCTTGATAAAAGAATTAAAGAAGGAAAAAACGTCTCTTATCTGCCTTATCTTGGAAAGTAGCTTCTTGTCCAAATGTTAAATTCTCTAATTTTAAATGCATCTCTTTATCAATGTTTACTTATTTAATGCTTAAATTAGTAAATGATGTGTTGTTTTAAAAGATTTTCAACCTGGGTAAAGGTTTTGTTTTTCATACTGGAATTTGGAATTGTCTTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTAATACTTTTTTAATATGGTCTTTTTTTTTTCTAATTTTTTTATACTTTTGAACATGTCAATTAATTTAGCAACGTTTTTTTATCGAAAGAGTTTTGAAGGTTTTGGATTTCTTTTAAAAAAGAAATTTAATTATATATTTTAAAATATGTTAATTAATCTTTTCAAATTTCATAAAAAAAAAGAAAATTACCTTTTTAGTCTCTAAGTTTTAAATAATGTGTACGTTCGATCCTTGAGTTTTAAAAATATACTTTTTTATTCTCCAAATTTATAAGAATAGCTCTATTTGGTCCCTATGTTTTCAAAATCCACCTTTTTTATCACTAGGTTTTTAATAATAAGATTAAAAGGTCCCTCAAATAATTTTTTTATTATTATTTAAAATAATTATATGACATTTCAAATTAGAAGAATAATTTTTAAAAACCATTTCTTTTCAAAAACTATTTTTTTCTAATTTTTTTATACTTTTGAACATGTCAATTAATTTAGCAACGTTTTTTTATCGAAAGAGTTTTGAAGGTTTTGGATTTCTTTTAAAAAAGAAATTTAATTATATATTTTAAAATATGTTAATTAATCTTTTCAAATTTCATAAAAAAAAAAGAAAATTACCTTTTTAGTCTCTAAGTTTTAAATAATGTGTACGTTCGATCCTTGAGTTTTAAAAATGTACCTTTTTAATCTAAAAATTTATAAGAATAGGTCCATTTGATCCTTGAATTTTCAAAAAATATCTTTTCAATCCTAAGTTTTTAAAAATAGATTGAGAAGGTCCTTCAAGTTTTTTTTATTTGATTTTTAAAAAATAATTATATGATATTTAAAATTAGAAAAAAATAGTTTTTGAAAAGAAATGGTTTTTAAAAATTATTCTTCTAATTTGAAATGTCATATAATTATTTTAAATAATAATAAAAAAATTATTTGAGGGACCTTTTAATCTTATTATTAAAAACCTAGTGATAAAAAAGGTGGATTTTGAAAACATAGGGACCAAATAGAGCTATTCTTATAAATTTGGAGAATAAAAAAGTATATTTTTAAAACTCAAAGACCAAACATGCATGTTGTTCATAACTTAGGGACTAAAAAGATCATTTTCCCAAAAAAAAAAATTAATGATTCATTACTATATATCTCTATCTCTAGCATTTCTTATAAACATTTCCATACATTTAGAAAGAAGCTCATTGGTAAGTGAAGAACACTGACTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGAATAATTTATGGCAATTTGATATTGATTCAATGTATATCTCAACATTTTTTCTTTGCTTTCGATTTTATTTTACGATTTAAATTGACATGGCATTGCATTTGTAAAGTTGTTTTTCTAAAAAATTATAGACCACAATTGGAACTGTAATAATTTGTTTAGTTTCATGTTAAAGTTACTCCTAATGATATGTATTATTGTATAACTGTAATGACCTAACCTTCTAACGGACAAAACGCTACTCTAGCATGCATAATTTTGTAAAGCACTTTGAAACTTATTGCACATCTGTCCATAATAAAAATTGATCTGAATGATTTATTTACGTCAAATAAGATATTAAAACTGTTTTAACGGGGTCCCCTCAAAACATGAAATCAAAATCAGTCATAAGTTACATGAAACAAAGAATTAAAAGAACGATTAAATAAACAAATAGTCAAATACTTTAATTTGCCTAACAACAACAGACCCTATACCCTAGGAAGAGAAAACATGAGCCTATACGCGGAAGCAACAAACAGTCCCATGGCGTGGTCACGGATTCCTCTTGTCATGCGCCTGTCTGTCCCGACCCTTACTTGAGAAAAAGATCATAGAAAAGGGTGAGTATTAATACTCAGTAAGTGACCTACTACTGTATCCACTAGGTGAAATTGTTATCCTCTTATCATATGCACCAATATATCAAATATAGGCATAGGCATAAGTAGCGAACCTAGAGGCACGCATTGATCACGAATGTCATAGTCATAAACATAGGTGGTGATCCTGAGGGATACCGAGTTATAATCATAATCATAGTCACTGAACTACTGACCCAAAAGTTCACGTCAATAGGGGTACATGGCTTGATAAATATGATAACAATCACCGTTAACATAAACAATCATCATTAACATAATCAACTAGAGTTTCCAGTCCATAGCAGTTAGTTTAACATAATCAACCCGAGTTTCCAGTCCATAGCAGTTAGGCAGTAAGTCCAGTAACCATAAATACAATAACCATAATCTAGTCAATACATTCCAGCAATAGAGTAACCATCATTCCAGTAAGTAGTGCAACTAGGCATCGACGCAGACATCAGTAGTAAGTCCCTTACCTCGGGGATACGCCTAAAAGCAACCAAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCAAAGTCTTGGATTCCCAACCTAGGTACAAATCCAGATGTTACTGTAACCTTTTGGGCAAAAAGTCAAAATAATTTACATTGATTACACAGTAACCTTAACTCACCACTAACTCCTCCAATTTTGACCTTCCTTCTGATTCCAAAGTCCCTTCGAAAACGGATATAAGAACCACCGGGGTATCAAAGGCTACACCAACAAGGTGGATAAACAGACAAAACCAAAGGAGCCAACATTCTTACCCAAAAGAAATTCCACAAAGTCAAGATTTCGACGTGAACCACCCAAACAGTAGTAGCGGCTGGCGAACGGCGGTACTTCGAACCACCCACGTGGTGGCGGCTGTTGGCTCTACCCGAGGCGATGGCGATGGTATTGAAGCAGTAGCGGACGGCCGACACAACAAACGAGCTTCCACGCTAGTGGCGACGATTGAAGCAACAATGGTCGGAACCCACACGACGGACGAGACGATGGCGAAGACGCGTGCGTTGCCGGTGGAAAAAGGAGGTTGCAAAGGGAGATGGTTGCTACTGTCGACGGGAAGAAGGGAGCAAAGAGGGAAGGTGGTGGCAAACGAAGGAGAAGGAGAAGGAAAGGAATTTCTTTTTAACATGGCACGCAATCGAGACCCTACTTTAATATATAATAATAATCCCTCCTCCCTAATCCTTTGACAAAGCCTAATTCCAAAATATATATATTTTATTTCCCCCTTTTTTTTCCTTTTTCTTCTCCTCAAATAAAACTCAACTTAATTAATGTTTTTCCCTCACCCCAAATCGAGTGTTTTTTTTTTTTCCTTTTTCGTTTTCTTCTCCTAAAATAAAACTTAACTTAATTAATGTTTTTTCCTCACCCCAAATCGAGTGTTTTTTTTTCTTTCCTTTTCCAACCACTCCTTTAAACCACTTTATTAAAACCAAAATCTCCTAATAAATAATTTCACCACCCAAAATCAATTTCTTCAACAACTTACCCAATTTCTCTAAATTAACCTATTAACCTCAAAATTCAAACAATTATCCAATTAATTCAAGGGACTTAATAAGGAGAAATACCTGAAAATTTACGGCGTCGCACTCTCCCCTCCTTGAGAAACTTTCGTCCTTGAAAGTTCTAATTCTGAAAAAGCTCAGGATGTCTCGATCTCATCTCATCCTCTCACTCCCACGTTGCTTCCTTGATTTTGCCATAGGACCATCACGAGTGCTATCTCTTTGTTGTGCAAGGTCTTTACTTCCTTTGCCAGGATTTAGATAGGCTCCTCCTCATAGCTTAACTCCACCCATAATTGTAGAGGCTTATAGTCCACTATGTGAGAAGGAGCTGCCACGTACTTCCTCAACATCGAGACATGAAATACATTGTGAACTGCATCAA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BLAST of CcUC02G033500 vs. NCBI nr
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BLAST of CcUC02G033500 vs. NCBI nr
Match: KAF2294487.1 (hypothetical protein GH714_011871 [Hevea brasiliensis]) HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 5.9e-65 Identity = 171/462 (37.01%), Postives = 257/462 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. NCBI nr
Match: XP_037496093.1 (probable disease resistance protein At4g27220 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 257.7 bits (657), Expect = 2.2e-64 Identity = 173/491 (35.23%), Postives = 269/491 (54.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. NCBI nr
Match: XP_023872136.1 (uncharacterized protein LOC111984752 [Quercus suber]) HSP 1 Score: 253.1 bits (645), Expect = 5.5e-63 Identity = 165/497 (33.20%), Postives = 261/497 (52.52%), Query Frame = 0
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BLAST of CcUC02G033500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6MWL4 (NB-ARC domain-containing protein OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_004620 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 3.3e-69 Identity = 176/460 (38.26%), Postives = 268/460 (58.26%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9IHJ5 (AAA domain-containing protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS51810 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 268.5 bits (685), Expect = 6.1e-68 Identity = 180/523 (34.42%), Postives = 281/523 (53.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6L174 (Uncharacterized protein OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_011871 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 2.9e-65 Identity = 171/462 (37.01%), Postives = 257/462 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7N2L2P0 (AAA domain-containing protein OS=Quercus lobata OX=97700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 252.3 bits (643), Expect = 4.6e-63 Identity = 160/455 (35.16%), Postives = 254/455 (55.82%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. TAIR 10
Match: AT4G26090.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 2.8e-12 Identity = 49/178 (27.53%), Postives = 84/178 (47.19%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. TAIR 10
Match: AT4G16960.1 (Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 44.3 bits (103), Expect = 3.6e-04 Identity = 63/252 (25.00%), Postives = 103/252 (40.87%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G033500 vs. TAIR 10
Match: AT4G27190.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 6.2e-04 Identity = 26/86 (30.23%), Postives = 44/86 (51.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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