CcUC02G025660 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC02G025660
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr02: 10595119 .. 10604807 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC02G025660
SyntenyCcUC02G025660
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide
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CATTTACAAACAAACCCCACCACAATAACAACACCAACAACATTAACAACAACAACATTATGAGGCATCTTTGCCTCCTCTCTCTGCTCCTCTTGCCCTTGCTTCTTCCCGTCACCTCCAATTTTTTAGTCCACGGGAGAGCACTCTGGCCCGACGCCACAGCCGAGATCGGGCAGCGGGATGGGTCCGATGCCCATGAATTCAAATTGAAACCAAAGGATAGTAGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTTCCAACGCTGAGTCGAATCAGCGAGTGTTTACGTTGGCGTCAGGACCCAGCAGGAGGGGAGATGGGCACAAGTGAAAGTTGGGAAAAGTTTGTTGTTGGTTTAATTTGGTTTGGTGTTTTAATTGTTTTACTCGGCGGTTGTAATCTGTAAGAAAGAGTACGCTTTCCATAGATTGTACAAAAATTCTTTTCACAGATTATAAGTTACGACTGTCATAATATTGTCATACTATGTCATCCTAGATTGAGTTTGTTGTCATTTCCAGCATTTGGAAATTATATGAGCCTATTGCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCTTTTTTAAATTTTACATTCCTACACTTTTAATAATTAGGAGAGTGGAGCTATGGATGATTCCTTTCAAGTCCCCATGCCTATAGGGAAATTTGAAGCCTCAATATAATCTTCCTACCTAATCTCGAATTCAAGGAATTGGTGTTGAGTTTGGAAGTTCTAAGATCAAAATTTTCACTGCTTTTTAACTTTACTTGATATATATATACATATATATCTTTTTTCAATTTTTATTTCAGTTAAACGTATTATAAAGTGTAAAAGTCTAAATCAAATTTATCTAAATAAAATTTGGTAAAGAAAATTGCATCGAGGAAAATAAATTTGCAAACCTAACCATGATTTTCTAATTTAAAAATATAGAAAAATATTTAGAAATCTTTTCAAATATAGTAAAAAGAACCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATTTCATTGTCTATCTGCAATAGACTGCGATAGACTACTCGTGACACAGATAGTAATCTATCACGATCTATCGTGGTCTATCACAGATAGACTGTGTATTTTGCTATTAGTCGTAAATATTTTCAGCAATTTTACCATTTAAGATAATTTCTCAAAAAATTAAATATGTTTTTTCGACTTTTTTTTATCATATTCCAGGTTTTATCCTCATATGTGTATCAACAATGTCTATCTCAAATACTTTGTTTTTGTAATATCGATCAACTAATAAACTATACTTGTTATATAAGTCCACTGATTTGTCATTTATTCAACTAATATAACATGATGTTAAGGGTCAGGTGTAGAGATGACAAAAACTTTTATCAAATTTAGGCGCATAGACCATGTTTAATAATTTTGCAAAAATAGCAAAATCTTTAAGCCTAACCCAATTTCATTGATGGACTGAATAGAAAAAGTCGAAAATATTCCTATAGATATTTGAATCACTTTGTACTCTCCGCTTTTTCACATAACTTATGGTTTGATATCTTCTCCTCCTCCTTCACGGTAGTTTCTTCCTTCTTCAACGCCAATTTGTTCCTCTTCCATCACCAATTTATTTATTTGCTTCTTCTCACTTCTTCAACCTGATTTCTTCGCTTCTCCTACCCATTTTGATTTTCTCAAAAATACCCACTCAAAAATCACCGTGACGTTTCTTTCTCTTCCTCTGATCTCTTCCTCTTGCCTATCTGACACCCACGGTCAAATTTCACTTCGAGTATACTTCTCTCCACGCATATAATTAGGGTTGTTGTTTTTGCTTCAAGTGGTAGAGAAGGATGAGGTGAGATTTTTAGATAAGTACCTTACCTTTAGTTTTTGTACACATCATTGGAATAGTTTGTTGCATGTGACTTTGTGCTTTTGAAAAAATGTCTGGCAAATACTATTTTAGATTTAAGTTGTCATATGATTACTTTCTATTATATGTCACATAGAAGTTACTAAGGTTGTCATCTAATTACCATATGATTGACACATCTGATTATCTTTTAGTTTTTTCAATAAATTAGTAGTCATTTGATTGCCTACTAATTTCCATATGATTACCTTATATTGTTTGTCACATAGTTCGTGCTTTGTGATATTACTATTTGATTGCTTCAATTACGATTCAATTATCTTCTTGTTTTTCCAATTAGTTAATACTTTCTGTCAACAAAATTTGAGAATGTATGGCAATCATATTTGTGATATAGACATTTGAAAACTATCAAATAATTGTCTTCCAATGACCTTCTTATTGATTTCTTATGTTCTTTGTCAATTACTTAATATTTTTTTGATAGTCATACCTTCTAACTACCATATAAATATATTATATTCTTTGTCACATAGTTCATAGTTCCTAATGTTGTCATCTGGTTATCATCCAATTACTATCTTATTACCTTCTATTTTTTCTCAACTAGTTAATAGTTTCACATAGTCGATTGATTGCCTTATGATCGTTATACAATGACTTTATGATTGTCATTTAATTGGCTTCTAATTGCTTCTTTTCATTTTTTGTGCAATGCCATCTAATTGCTAAGAACAAGGAAGATGAAAAAGAGGACCAAGGAAATTTGAGAAGGAAAAATCTTTAACAAAAAACAAAAGATACCGATTGCTATCACATGTCAATCAGATAGAAATTGGATAGCAATCACATGAAAATAAAATAGAAATCACAAAGTACTTAATATCTAATTATACTATCTAATGTCGGTTGTCAATGATGTATTGGTTGTTAATTGATTGTTGTATGAATACTATTTAATAATAGTTGTGAAAGATAACGATATTTGGTTGTTATCTGATACTAATTGCTGAAGATACCGATTTCTATCTGATTATTGCTTGATTACTATTTGATACTAATTGTCAATGATGTCAATTATTATCTGGTTGTCTGATTACTATCTAGCACTGATTGCTAGTAATACTTATTGCTATTTGATTGTTGTATAATTGCTATTTAATACTGGTTGTCAATTATACTAATTGTTACTTGATTGTTATTTGATTACTATTTGACGATGATTATTATTAATAATACTGAAAATTTATTTCTGATGGCAAGCAAATTACTTTCTGTTTACATATTTAGCATCTGATAGTCATCCAATTACCTTCTGATAGCTATCTGATTGCTGTTAATACTAAGTAGCTATCTAATACACTTTGATTAATATACTTTGAATTGTTTGTTTTGATGGCAGGTTGGAGAACATAAAACCCAAGAAGACATAACAATAAAAGAAGAAAATGAAGACAAAAGGACAAAGGAAAAGCATGACAAAGGGAAAAATCGATAACAATATTTTCTTTACTATAATCATTTTTTGATTACCGTGTGATTGTTATCAGGTTGTTGTTTGATTGCTATGTGATTTTTTTTCAATTACCTTCTAATTACTATCTTATACTTATTTCTAATTCGTTCTCTATTTTTTAAAGGTTGTTGAGAATAGAATGGACACAAGAAAATCTTCACAAGATAAGTCTGAAGTGGAGAATGAACGACAAAGAAGAAAATTGAAACCTACAGCAAAGGTTGTTGATTTGAAAATGGCGAAAAGACGCAAATCTCCAAAGAAGACACGAAATACATATACTGTCATTGAAGCACCTACTTTTGAGATTTTGAACATTTCACAACAAAATTGAGACAATTTTCTTTGATATTAGCACATATATTTTGCTTAATAGTGAAATAGTTGTAAAGCCTTCAGGAAGGGAAAGTTTTTAATTACCAAATTTGTGTGATTGTATTTGTGATCGTTATAAAGTTATTCAGTTACCTTAAATTCCTTGTCAGATAGTGATATTGCTTTTTGATTACTATATGTTCAAAAGCAACATCATTTATATATATAATCTGCAAAATCAAACTGTATGAAACTTAAGATTATGGATTTAAAGCTTGGAAGGTAAAGTTTTGCGAAGTACTAGAAAAACTAAAGAATTTAATGATTTCAAATGCTAAAGTTGACAAAATATTAGGCCAAGACAAGGATTTATATGAAGAAGACATTCCTCTAGAGAAAAGGGAGTCGAAAACTCGACTAATGTTCATTTATAGAAACTAAAACTTGCTCTTCTTTCCTTCATGCTTCTGTTTCTAAATCATCAGATTATCTTCGGATTGCTATATGATTTCCTTTTGTATGAAGTTAATAAAGGAGTAAAAAAGCATTGCCTCATCCAACTAAAATACCAATAGTTTTGTAATCTACATAGCACTATCGATAATCCCACTGACCACTATGAAAAACAACGATTGAAAGATTAACCATAACTACAAAATATTGCATAAATATAAAAACGAAGTATAAGATAACTATCAAATAAAAATGAAATAGAAATCACATAGCAATCTGGCATTAAATTTCATCTCCTTTAATTGTTGTTTGAATTATTTTTATGCAATTTAATTTTTCTGCAAACAACCCTCTCACAACCCCCCTTCAGTTATTTAGAACTGTAAACTGCTTAATTGTGAAATTGAAGTGCTCTTTATGTTCAACCTGGCTTGCCACTACTAAGGTTAGGTAACTTTCGTAAATTATTTGGCATGGAATTGGGCGACGAATTCCGTTCGCCAGTATGAATTTTGGGAGGAAATTCTATTTGGTCTCTGTTTTTGGGGATGCTTGTTATTGTTCTATTTGACCTCTGTATTTTTGCAGTTCAAGATGGTGGTAAATGAACAGGGATGTTTGTTATTGTTCTACTTGACGAGAATGTTGTAAGAGCCTATTTGGAACTCATTTTGCTCTTATTGATGAGATGTTTTTGTTTGAAGATTTTGAGAGTTGTAGATTTCTTCCATCCAAGCTTTGTTACATTTAAGTGGTCATCTTTGCTTTCTTTGGTTTTTTGTGTTTGGAACTCTATATTGTTTATTATGTTTATGTATTTTGTTTAATATATTCGATTTTCATTAATCTTTTCTCTCCCTTTAATAAGTC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mRNA sequence

CATTTACAAACAAACCCCACCACAATAACAACACCAACAACATTAACAACAACAACATTATGAGGCATCTTTGCCTCCTCTCTCTGCTCCTCTTGCCCTTGCTTCTTCCCGTCACCTCCAATTTTTTAGTCCACGGGAGAGCACTCTGGCCCGACGCCACAGCCGAGATCGGGCAGCGGGATGGGTCCGATGCCCATGAATTCAAATTGAAACCAAAGGATAGTAGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTTCCAACGCTGAGTCGAATCAGCGAGTGTTTACGTTGGCGTCAGGACCCAGCAGGAGGGGAGATGGGCACAAGTGAAAGTTGGGAAAAGTTTGTTGTTGGTTTAATTTGGTTTGGTGTTTTAATTGTTTTACTCGGCGGTTGTAATCTGTAAGAAAGAGTACGCTTTCCATAGATTGTACAAAAATTCTTTTCACAGATTATAAGTTACGACTGTCATAATATTGTCATACTATGTCATCCTAGATTGAGTTTGTTGTCATTTCCAGCATTTGGAAATTATATGAGCCTATTGCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCTTTTTTAAATTTTACATTCCTACACTTTTAATAATTAGGAGAGTGGAGCTATGGATGATTCCTTTCAAGTCCCCATGCCTATAGGGAAATTTGAAGCCTCAATATAATCTTCCTACCTAATCTCGAATTCAAGGAATTGGTGTTGAGTTTGGAAGTTCTAAGATCAAAATTTTCACTGCTTTTTAACTTTACTTGATATATATATACATATATATCTTTTTTCAATTTTTATTTCAGTTAAACGTATTATAAAGTGTAAAAGTCTAAATCAAATTTATCTAAATAAAATTTGGTAAAGAAAATTGCATCGAGGAAAATAAATTTGCAAACCTAACCATGATTTTCTAATTTAAAAATATAGAAAAATATTTAGAAATCTTTTCAAATATAGTAAAAAGAACCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATTTCATTGTCTATCTGCAATAGACTGCGATAGACTACTCGTGACACAGATAGTAATCTATCACGATCTATCGTGGTCTATCACAGATAGACTGTGTATTTTGCTATTAGTCGTAAATATTTTCAGCAATTTTACCATTTAAGATAATTTCTCAAAAAATTAAATATGTTTTTTCGACTTTTTTTTATCATATTCCAGGTTTTATCCTCATATGTGTATCAACAATGTCTATCTCAAATACTTTGTTTTTGTAATATCGATCAACTAATAAACTATACTTGTTATATAAGTCCACTGATTTGTCATTTATTCAACTAATATAACATGATGTTAAGGGTCAGGTGTAGAGATGACAAAAACTTTTATCAAATTTAGGCGCATAGACCATGTTTAATAATTTTGCAAAAATAGCAAAATCTTTAAGCCTAACCCAATTTCATTGATGGACTGAATAGAAAAAGTCGAAAATATTCCTATAGATATTTGAATCACTTTGTACTCTCCGCTTTTTCACATAACTTATGGTTTGATATCTTCTCCTCCTCCTTCACGGTAGTTTCTTCCTTCTTCAACGCCAATTTGTTCCTCTTCCATCACCAATTTATTTATTTGCTTCTTCTCACTTCTTCAACCTGATTTCTTCGCTTCTCCTACCCATTTTGATTTTCTCAAAAATACCCACTCAAAAATCACCGTGACGTTTCTTTCTCTTCCTCTGATCTCTTCCTCTTGCCTATCTGACACCCACGGTCAAATTTCACTTCGAGTATACTTCTCTCCACGCATATAATTAGGGTTGTTGTTTTTGCTTCAAGTGGTAGAGAAGGATGAGGAATCCGATCAAGAATCCAGGAATCGATCTCCCATGGAGCTTCAACAATGGTGGTGCTCATCCCTTCATATCCTTTCCCATCTCCCATAGGCGTGAATTGAAACTGCAAAGCCAATTCCAAATCATAAACCACGTCAGAGCTGCCCAGTCCACTAAGTTCGTCTCTTCACTTGGAACGGTCTTGTCGATTGGCGCTCTGGCCGAGAGAACTTCGAAAAGCACGACCCCGAACGAGTACACATCGGATTTCTCGGTCAGCTGTCCGGTGTTGAAGCTCACTTCGCTTCACAGCAACATCCTTCTCCCTAATTCTCCCAACATAAACCTTCCCAAATCCTCCAATACCAATCATTTTGTTTGGATGAAAGCCATCAGTTGCATCATTTATTTCCGCAAATGGGATCTTCAGTTCAAGATTCAAATTAGGAGCAAGATCAGCAATAGACACAATCTTCTCCGATGGGTCATTTTGAGGAAGAAGCAAAGGACGATGCTTTCTTGCTTTCCGAGCTCTAACAAACAAAAACAGAGCCAACCCAATTATGAAACCAACAATCACAACCCCACCAACACAAACCCCAACAATAATCATCTTTTGACTCTGTTTCTCCTCTTTCAAGCTCAAATCAATAGGACCCACAAACGATTTCTCAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGAATCCGATCAAGAATCCAGGAATCGATCTCCCATGGAGCTTCAACAATGGTGGTGCTCATCCCTTCATATCCTTTCCCATCTCCCATAGGCGTGAATTGAAACTGCAAAGCCAATTCCAAATCATAAACCACGTCAGAGCTGCCCAGTCCACTAAGTTCGTCTCTTCACTTGGAACGGTCTTGTCGATTGGCGCTCTGGCCGAGAGAACTTCGAAAAGCACGACCCCGAACGAGTACACATCGGATTTCTCGGTCAGCTGTCCGGTGTTGAAGCTCACTTCGCTTCACAGCAACATCCTTCTCCCTAATTCTCCCAACATAAACCTTCCCAAATCCTCCAATACCAATCATTTTGTTTGGATGAAAGCCATCAGTTGCATCATTTATTTCCGCAAATGGGATCTTCAGTTCAAGATTCAAATTAGGAGCAAGATCAGCAATAGACACAATCTTCTCCGATGGGTCATTTTGAGGAAGAAGCAAAGGACGATGCTTTCTTGCTTTCCGAGCTCTAACAAACAAAAACAGAGCCAACCCAATTATGAAACCAACAATCACAACCCCACCAACACAAACCCCAACAATAATCATCTTTTGACTCTGTTTCTCCTCTTTCAAGCTCAAATCAATAGGACCCACAAACGATTTCTCAATTAA

Protein sequence

MRNPIKNPGIDLPWSFNNGGAHPFISFPISHRRELKLQSQFQIINHVRAAQSTKFVSSLGTVLSIGALAERTSKSTTPNEYTSDFSVSCPVLKLTSLHSNILLPNSPNINLPKSSNTNHFVWMKAISCIIYFRKWDLQFKIQIRSKISNRHNLLRWVILRKKQRTMLSCFPSSNKQKQSQPNYETNNHNPTNTNPNNNHLLTLFLLFQAQINRTHKRFLN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 170..194

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC02G025660.1CcUC02G025660.1mRNA