Carg12713 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2

Overview
NameCarg12713
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCarg_Chr07: 7640084 .. 7648317 (-)
RNA-Seq ExpressionCarg12713
SyntenyCarg12713
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCTAAGGAATCAGAGGATGAACACCTGGAACTCATGGAGTTCGCTGTGTCAAGCAAGGGTTACCTTCAATCATGTCTCTTTACAAAATCTGGAGTTATTTAAAGGTTCATGTTTCTATTAACTTCCTTTATTGTTTAAATTCATTGACTATCAAGAATGTTCTTCCCCTTGCACGAAGTGACCGAGAATAACTTGTTTACCTTTTTACACGTGATTACTTGTGGCCTTTAATTTAGGTGTTCTATTTGTTTTCGTTCTTTTAGCATTGATTGAGAGTGGAATTTGCGAGATTGTTTTGCTGCCAATTTAAGTTACCTTTTTTGTAGTTATTTGATTTTCTATTTTGAAGTTAACTTACTTGAGAAAATTGACCTGAAGAAACCGTTCAGAAAAATGAATATTTGTGTAGGAAATGATCTATGATATGAATGTTGAACTGCTATGTGTATTTCTAGGCGTGGTAGTTCTTGGCCTTTGGCCTTTTACTCTTGATGAGTTTCTTCAGCTTTTCACGATCACGTAAGTTCTTGTCTTAAAATTTTCTTTATCTGTAACCTGACTTTTGAATCTGCCTTGTGATACTTATCATTTATTGCCCCTACAATGTTTCACTTGATGTGCTCGTTATCCGTTTTGCGTTTTACTCTTGATGTTCTCGTTATTCGTTTGGATCATCTTATATGCCTCGGTCTGCAAGTTGTGTCTAAGTGGGTGCACGACCATGAGGGTACTTGAACTATAAGTAGATGGATGCATTTTTTAGGAAATGAATTATGTACGAAATCGAGGTGGTGTACAATTTTTTTTTTTTATATAGAAAATAGTTCATACAAAGAATGGATGTTCTTTGCATGCTTTCAGTTGACAGGTAATGAATAACTTCTAATTCATTTCATCTGTCTGTTTATTTCCTCGGTCATGGGATACAACTCCAATATCATTGACTGCTGGCTGTGATTTGTTCATGCGGTATGTAACTGGAACATCGGCTTTGGAAAATGAGGATTTCAAGTCTGCTAAGTCTCACCTGATTGAACGTGCAGAAAAGTTCGGAGAGATATCTGGTAAGGTAGAGCTACCATGATGATCATTTGTAATGGCCGAACACCGTGTAATTTTTCAAGGTATTTTGAAGCTAAAACTGGTATTGCATTGCAGGCACGGAGAATTATTGCAATGCTCAGCCAATACTTCATTTTTTATGGTTGTTATGGAAGTTCTGAGATTATTGGGTGAAGTACACGTTGTTGTTCTAGAACATAAACTCCTTTACAGGCACGGAGAATTGTTGGCCATCTGCGAATAATTGAAGGGGTGAGGCTCGTTGGTGGTTATTACTGCTCTTAAAGTTTATCCATGTTTCTTATATGGTTCTTTATTCACCATCAAGCTGTGTTGTTGGCACTCTTTATCAGGCATATGCTTCGGGTTTTGACATATGCATCTGACAGCAACAATTAAATCCTTTAACATGGCCTGAGATACTTAGACAGTTGGCCTTATCAGCAGGGTTTGGTCCGAAACAGGGGAAAGGGGGGAATGCTGAACCCAACATATCATCATGTTGGAAATGAGGTGAAATCCTTTTGCCCGGCTTTTAAGTTTTCATCAAGATTTTCATTCTTGCTTGTGATAGGGAAGATGATGTGAATATACAGTTGAATGCTTTTGCTATTTATGACAGGGGAGATCATGTGAATTTCTTGTTCCTCAGATTTTAATTTCTATTGCTTTCGATTCTGCTTGGGCTGCTTAAATTTTGGACATCAATTTCTGGAAACTGCTCGACATTGAATTGAATTATTGGTACGTCTTTCATTGCTTCTTCAGATTAATGCCCCTTGTTTTATTTTGCTGATTTTTTATTGGGGTATTTTTCTTCTGATATAATGAATGAGAGAATTGCAGAAGTTCATCTCTGTGATATTTTTAATTTCCATGGAATTCCCTTATTTTCTTGCCATTTTTCTTAAACTTAAGAAGGTACATGATTATTGTGAATTTGAAATATTTTTGTTTTAACCTCAACAATATACAAACAGGAGTATATTGGAATGTGCTATAATATATAAATGTTGCTCTCTATCGTTCATGTCTTAGGCTTTTGGAAAATAGCTATTACCAATGTCTAACCTACCTTTTAAATAATGTTGATTGGATTGATACAGAGGAAACTCTTCAAGTCTCCTAGATATGAATTTCCAGTTAGCATTCTGTGTGTATTTTTATTCTCTGGACAAGTTTTTCACATTCAATAGAGATATGATATATCGTGGATAACAATATAAACAATTTCATAAAATATTAATTGGTTAGACGTCGATAATATTGTCTCATGCACTTTGTAGTAAATTGATTTCATTGCATAGAAAAATTATCTAATTTTCTAGATGGAACATATTGTTTTTCCTAACTTATCTAAAATTTTGTAATAGTTTTGTTTGTATTTTGATTACTTGTGATGTTTTAGTTTGGTGATTGTTTCTTTGTATTTTAATATCTAGTGATGTTTGTGGTTTCTTTTTTATATATTTTGATTTTAAATGTTTTGACATTATTTGTTTAAATTTTGATTATTTATGATGCTTCTGCTCGTACAATATTGTTTAGTATTGAATTTGAAGTGTTGTTTGTTTTTTGTTTTTTGTGCTCTGATGACTTCTACTATGAATTCTTTCCTTTGCAATGTGAGTGATTTTTTTTTTTAATTTATTAGTTTGCTACTTTATTTAATACATTTTTTTCATTTAGTTTTAATGGTTTGCTACTTTATTTCATACTTTATCGTGGTTGGTAAAATATTTGTGATGGAATTGTTTGTTTGTGTTTAATTACTTGTGATGTTTTTTCTTGATGATTATTTGTATTTTGATTACTTGTGATGTTTATGGATTCTTTTTATATATTTTGATTTTAAATGTTTAACATAACAATTCTTGTTTGAACTTTGATTGTTTGACATTTCTTGTTTGAATTTAGTTTGTTTGTATTTAATTACTTGTGATATTTTTACTTGATGTTTGTTTGTATTTTGATTTCTTATGATATTTGTGGGTTTTTTTTATATATATATTGATTATTGATTTTGACATTTGTTTGATGTTTGTTTAATTTATTTTGTTTGAGTTTTGATTGTTTGCTGTTGCTATTTTGTTTAATATTCATGCTATGAGTTCTTTAATTTGTAATCTTAGTGGAGTTTCATTAATTCAATGATTTGCTACTTTCTTTGATACTTCATTTTTTTCTTTAATTGTTTTGTTTGTATTTTGATTACTTGTGATATTTTTGCTCGGACATTATTTGTTTGTTTGCATTTTGATTTCTTATGATATTTGTGGTTTTTTTTAATTTTATATATTTTTTGAATTTAAATGTTTGATATTGTTTGTTAAATTTTGATTGAGTATGATGCTTTTGGTCAATAAAGTTTAGTATTATTAAATTTGAAATGTTTTTTTTTTGTTCGTGACCTTTGCTATTAGTTATTTAATGTATAATCTCAGTGAGTTTCATTCTTGGTTATTATTTAATACTTTATTTTTTAAAAAAAATTTATAAATTTATTGTGGTTTATTTTAATATTTATAGATTAATTCTAAATCTTTGTCGTTTGTTTGTATTTTATATTAATTGTGCTTGGTACAGTCTTGTTTAGTATTTTGATATCTTGTGATGTTTATTATGATTCTGCTTGTGACTTTTGTTTGTGAATTCTTTGGTTTAGTGTTTTGATATTTCTATTTTTTTTTTCTAAGTTTTTTTTTCTCTATAAATATCTTGAAAATGGTTTTTGTTTGTTTGGTTATTGATAGTTTCTATCTTTTATTTTTATGATGATCAAGAAAACAATCAACATTTAGTGTGCTTGAAGGGTCTTGGACGAATTGTTACAACTTTGTATAATTTTGTAAATATGATGGTGCTAGGATGTCTTTCATTGTATTGATGTTTTGTTTGCCACATATAGCCTTGTTTGTTCATGTCATATGTTCAACTCGAATCTGTTACTCTTGCTATTAAAAACGGATTTGCAAAGTCACAACCGCCGTAAGAAATTCAAAGATGGACCATCTATATTATCTGTGAGTGCCAACTTTACCCACTACTGAAATCTATGTAGATTATGTTATTCGAAGCTTGCTTAAAATCTCTTTTACCTACTTTGTTGTAAATTTTTAGAGAAAATGGTATTATTTAGTAATTAAATAGTTATAATTATAGTTGACATTTTGTAAATAGCAGTATGCTATAAAATATTTTAGTTCTTTTTAATGGTTAATGTTAGTTCCTCGATATTATGTTAATTTAACTGTGTTCTAATTGCAGGTTATATCCACTGAATATGGACCACCACACAACTCATCACTCGATATTGGTTTAGTGATATCAACATTTTTTTATATTGTTTTTCTATTCGTGATCTTATGTTTATTGTGTTTTTTCTGATTCTTAAAGAGCCCAGGATTTGATACTTCAAGTTTTGTTTGCTTGATCCTAGTTTTCTTTGGTACATTCGAACCTTTGTTTTTGTCTGTATTCTCCAATGTAAATTAGATTATTGCTCCTCTTCTTGTTATACTAATTATTAAGTTTTTGTGGTTTATATACAGAATAGTATCTTGTTTCTACAATACTGAAGAATGATAAGGTAATGATCTTGTCGTGCACTAATCTTTTCAAACAAGTAATTGTTTTATTTAATTATTAAACTTTGATCTTGTGATATTAATTATTAAGCTTGTGTGGTTTATACACAGAATAATATTTTCCCTTAAGGTTCACGTCTTGTTACTACAATACTGAAGGATGATAAGGTAATAATGATCTTGTCGTGCACTAATCTTTTCAAACAAGTGTTTTATTTAATCATTAAACTTTGATCTTTCTTCTTATATTAATTATTAAACTTTTGTGGATTATATACAGAACATTATCTTCCCTTAAGGTTTACGCTTGTTTCTACAACACTGAAGGAAGATAAGGTAATGATCTTGTCGAGCACTAATGTTTTCAAACAAGTGTTTTATTTAATCATTAAACTTAAATCTTTCTTGTTATACTAATTATTAAGCTTTTGTGGTTTATATACAAAAATAATACCCTTAAGATTCACGTCTTGTTTAATAGTTTGTTGTTTCGTGTTTCCTTTTTCCTTCTTTCATTTCATAAATTAGTATTTTGATTCTAAATCTTTGTGATTGTTTGTTTGAATTTTGATTACTTGTGATATAAGTGGTTGTTATCGTCTTTTCTAGTATATTTGTATTTTGATTTTAAATTTTTGTGTTTGTTTGTTTGAATATCGATTTCTTGTGTGCTCATACTTGGTACGTTCTCATTTAATATTGAATTTTTAGTGTTTAATTTTTCTCTCTTGTGACTCTTGTTTCTAAGTTCTTTAATTTATAATTCTAGTTAATTTTTGTGTGTTTTGAATGGGTTCTTTAATTTATAATTCTAGTGAATTTTTGTGTGTTTTGAATGGGTTTTGTGTTTAAATGTATTTTGATTTTAGCTTGTTTCTTTGAAATTTGATTTCTGTGATACTTCCTTTTAGTATTATTATTATTATTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCTTATGACTTTAGTGTGTAATATTTGCGGTATTATTTTTACTATTTGTAGTATGGGATGTAAATTTTTTTTTTTTTCTCTTATGACTTTTGTGTGTGCGTTCTTTATTGTGGTTTATTTTTATATTTGTATATGGATTGTAAATCCTTATGATTGTTTGTGTTTGTTTGAATTTTAATTCTATATGATTCTTTTGTTTGGTATGATCTCGTTTAATATTAAATTTTAAGTGTTTTATTTATGTTTGTGAGTATATTCTGATGGTTTATTCTTTTGAAGGTTGATTACTTATAATATTTGACGTGATTAGTATTTTGGTTCTTTTTGATATTTAAATTTTTGCTTTTGAGATGGTTGTTCTTTAATCTATAAGATAATGATGGATAAGATATACATTTTTTTTTTCTTTTGCATCTTGGTGATTTTTTTATGTAATTTCAATAGAATTTGAGTGGTTTTATGGTTTGCTATTCTTTTTTTTTTTTACTTCATTTTGATATTTATATTTTTATCCTAAATTTTTATAATTGTTCATTTGAATTTTGATTTTATTTAATGTTACATTTTTATTAAGTATTATATTTGATATGGTTTATTGATTTTTGTTTTTTTGTTTTTTAATTTTATTTATATTGATTTGTTTTTTTATTGTATGTGCATGTATTTTTATCAAAGGAATGGTATTTTCTCTTTTTCCTTTTTTTTCTTTAATTTTATAAAAATTTGTTGCACGTTTTGATATTTGTAATTTGCTTGTTTATGATTCTATAATTCTCATTTAATATAGAATTTGAAGTGTTTGTTTTTCTTCTTTCATTTTTCTTTTCGTACATATTTTTTAGTGTTTGATTTGTCCATCATATTTTTGTTTGTTAATTTTTTAATCTATATTTTCAATAGAATTTTTTTATGATATTCTAATATTTTTAATGGTTGATTAAAAAGAAAGTTTGTCCTTCTCATTTCGGCCTACGTGTTCTCTTTACTGAGTCTTCTATCGGCCGAATCCTCTGGAGATTGATAAATACTTGTTTACTATAATATTAAATTTGTTTTATAGTTATTTGAATTTTGATTACGTATGATGGTACGATTTTGTTTTGTAGTACTTCGATATGCTTATTTGTTTTTTTGCTTTTGTTACTTTTGTTTGTGTGTTCTTTGATTTGTGGGTTTCATTTTTTTATAATTTATTTTGGTTGGTTTTTTATTGTATGTGAATTTCGTTAATTGCTAGTTTGTCTTGTCCTTCCCATTTTTTCTTTCGTTTTATAAATTTATTATAGTTTACTTTAATATTTATATTTTTATTTTAATTCTTTGATTTGTGAATTTTGATTGTTGTGATGGTTTTGCTAAGAACAATCTCATTTATTATTGAATTCGAAATATTTTATTTTTTTCTTTCGTTTTTTTTTTCATGTTATTTGTGATATTTATGTATTGGTTATGAATTTTGATTTTAAATCTTTGAAATTGTTTGTTTGGATTTTGATTGTTATTGATTTTTTTGCTCGATACAATTTTGTTTACTAAGAATTTGAAGTATTGTTTGCTTTTTGCCTTTTGTGCTCTTGTGACTTTTGTCTGTAAGTTCTTTAATCGGTAATTTTAGTGGAATTTCATTAATTCAATAGTTCTCTATTCATTAATTCTAAATATGTGATTGTTTGTTTCAATTTCGATCATTTGTGATGTTCTTACTTGATAGGGTCTTGTTTAGTATTTTGATTTCTTATGAAAATTATAGATTATTTTTTATGACTTTTGTCTATGACATTTTTATGTGAGTTTTTATTTTATTTATTATGTATCCTCAAATGAAAACTAGATTATTGTTCTTGCATATATGGAAGGCAACTCAAATGTTGCATCAATAACAAACAATCAAATTTCAGTTATACTAGTTAATAAGTTGTGGTATATATTGATAATACAGGACAGTATCTCATATCTCATCTTTTAGCACTTACGGCTTGTTTGTACAATATTGAAGGAAGAAAAGGCAATGATCCAATCGTGTGCTGATTTTTTCAAAACACATACTGCCTTTTCATTTTATTATTAAACTTTTATTTTCCCTTTTATTTTTCCCATTTTATTATCTCCACTTGTATGAGTTGGAAGATGGTGGGATGCTTTTCAATTACAGTTTGTTCAATTTGTATATTGATTCTACATATGTGTGATTTGTTTGCATTTTGATTACTTATGAATTTTGATTCTAAATCTTTAAAATTGTTTGTTTGAATTTTGATTATTTGTGATGCATCTGCCCGATGCAATTTTGTTTAGTGTTGTTTTTGAAGTATTGTTTGCCTTTTGCTTTATGTGGTCTGCCAAATTTTGTATGTGTTCTTTAATCAGTCATCTCAGTGGAGTTTAATATTCCCTTTTTCTTTATTTTATTAATTTATTGTGATTTGTTTTGATATTTGTATATTGACATTAAATATTTGTGATTGTTTGTTTGCATTTTGGTTACTTGTGATGTTTTTGCTTGATACTGTCCCGTTTAATGTTTTGATTCCTTGTGATGTATTTGCTTGATACTGTCCCATTTAATGTTTTGATTCCTTGTGATGTATATGCTTAAAATTGATTCTTGTCAGATTAGATATTAG

mRNA sequence

ATGGCTAAGGAATCAGAGGATGAACACCTGGAACTCATGGAGTTCGCTGTGTCAAGCAAGGGCGTGGTAGTTCTTGGCCTTTGGCCTTTTACTCTTGATGAGTTTCTTCAGCTTTTCACGATCACGGAAGATGATGTGAATATACAGTTGAATGCTTTTGCTATTTATGACAGGGGAGATCATGTTATATCCACTGAATATGGACCACCACACAACTCATCACTCGATATTGAACATTATCTTCCCTTAAGGTTTACGCTTGTTTCTACAACACTGAAGGAAGATAAGATTAGATATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCTAAGGAATCAGAGGATGAACACCTGGAACTCATGGAGTTCGCTGTGTCAAGCAAGGGCGTGGTAGTTCTTGGCCTTTGGCCTTTTACTCTTGATGAGTTTCTTCAGCTTTTCACGATCACGGAAGATGATGTGAATATACAGTTGAATGCTTTTGCTATTTATGACAGGGGAGATCATGTTATATCCACTGAATATGGACCACCACACAACTCATCACTCGATATTGAACATTATCTTCCCTTAAGGTTTACGCTTGTTTCTACAACACTGAAGGAAGATAAGATTAGATATTAG

Protein sequence

MAKESEDEHLELMEFAVSSKGVVVLGLWPFTLDEFLQLFTITEDDVNIQLNAFAIYDRGDHVISTEYGPPHNSSLDIEHYLPLRFTLVSTTLKEDKIRY
Homology
[Close]
BLAST of Carg12713 vs. NCBI nr
Match: KAG7027594.1 (hypothetical protein SDJN02_11608, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 203.0 bits (515), Expect = 1.2e-48
Identity = 99/99 (100.00%), Postives = 99/99 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MAKESEDEHLELMEFAVSSKGVVVLGLWPFTLDEFLQLFTITEDDVNIQLNAFAIYDRGD 60
           MAKESEDEHLELMEFAVSSKGVVVLGLWPFTLDEFLQLFTITEDDVNIQLNAFAIYDRGD
Sbjct: 1   MAKESEDEHLELMEFAVSSKGVVVLGLWPFTLDEFLQLFTITEDDVNIQLNAFAIYDRGD 60

Query: 61  HVISTEYGPPHNSSLDIEHYLPLRFTLVSTTLKEDKIRY 100
           HVISTEYGPPHNSSLDIEHYLPLRFTLVSTTLKEDKIRY
Sbjct: 61  HVISTEYGPPHNSSLDIEHYLPLRFTLVSTTLKEDKIRY 99

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Carg12713 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7027594.11.2e-48100.00hypothetical protein SDJN02_11608, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of Carg12713 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Carg12713 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Carg12713 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Carg12713-RACarg12713-RAmRNA