CaUC09G173440 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTCGTCCTAGGTGGATTCAAATCTTTATTGATTTAGATTTCCTAGTAAAATCTTTTCACATAAGGAAATCTAATTGGATTTGGATTCCATTGTCTTATCTTTCTTTACCCTAAATTCATACTATTAAACTTTCATCTCCAAGCCAAATTAAATTGTGAATAAAATTTTTAAATTTATCCCAAATTAAAATTTGGTCGTATTTCAAATTTTACCCTAATTTCAAATCATCAAGTTTAGACTTTTATCTCCAAGTCAGAATCGTGGATAATCCCTCAAATTTATCTCAAATTAAAATTTGGTCATATTCCAAATTTTATCTCAACTTAAAAACATCCAAATTCTTTTATCCTTAAGTCAAATTAAATTGAAGATATGACCCAAATTTCTCTCACATTAAAATTTGATCATATTCCAAATTTTATCCCAAATTCAAATCAACCAAATTTAGGCTTCTATCCTCCATCCAAATCAAATTGAGGGTAAAATCTCAAATTTCTCCCAAATTAAAATTTGGTCATCTTCCAAGTTTTATCCCAAATTTCAAAACAAACTTATGTATCAAATTCATAATTTGATTAAATTGACACGTCAAATAGAGCCAAATTCAAGAATATATAGCCTGTATTTTGACTCCAACTTTATCTTCTTTAAGATTCACCCCACTCATATATGTGCATAAATCTTGAAAATGGGCATTTGCTGTGGAGAAATTTTGGATCAATCACAAATTGCCACATCATTTCCCAAATCAATGACAAAATTACAAATCATCACATTTAGGACAAATTGGAAGTCGACATGTGTCCCAAATTGAAGTTGAAGACTTAAGTTGGCAAATCCTAATGATGCCACATGTTTTCGTTGTGACCATTGGATCAAATAAAATAATTTGATCTAATTTGGTATTAAATTTGAGCTAAAATCCAATTGAGCCCGAAAATAAACTTAATTTGGCCCAAAGGCCAAATAAGATCTAGATCCAGTTAGTTGGACCCCTGGGTTGTTTATGGACCAATTAAACCCAAGCCTATAAAGTCCACCTTAGAAGTCTATAAATAGAGTTCTCCTCCATTTGAAAGGTTCATAAATTTTACACTCCAAAGAGCTTAGATAGAATTTGACGGACCCTTTTGGTGTCGCTCCTAAAAGAGTCAATCAAATAAACTTATAAACTCCGAACTATACGACCTATACTACAAAGATGCAGTATAGATGGCAAGATCAGGTAGTCTCCACAGGGAACCTTGAAATGTTTAAGCCAATTGATGAATTTGTATGATCACGGGGGTTGTGTGTTGTTGATTGCAATTGAAATTAACGTGCATGAATGTAAAAGTGTAATTAAAGTGAGAATTGAATCGATTAAAAAGGGTCTAGCTTAGGAATTCGAAATCCATTCATTTGTTTGGTTGCTCATCAAACACAAAGGACTAATTGCAGGCTCAATTTATTCTTGGCTCGTTAGTTTGACTATGAGATATAAACTAACGTCCTATTAAACTAATTCATTTCTTAATTAGACTAAATGCTTAATTAACAGGTTCTAATTAGAGGCCTAATTAATTAAACACCATATTGAGACAAGATAATCTAGCCAAGTTCATTAGCAACCGGGTTAGCCCTAAATTACTATTTACTTTGGATTCTTGAATAATTATTCATGCATTGTAGCAAAAAAGGGGACTATATAAGACTATCCACAAATCACATACAAACATGCTCTAATTTGTGCTCTATTGAAATTCACACCCAAAGATGCATTCCTCTCTAACAAAGCAAAAAAAAAGATGATGGGTGATCAAGCCAAAATAAACTCTAAGTATAGAAGTGCAAATACATCAAGAATCCAAAGAAAAGGAGTAGTAAACTATGAGCTACAAGTTCTCACAATAAAGTCAAATAAAATTCAACCTACCTTAAGCTAGAAGAACTTACCTTAGCCACTCATAGTGTGGCAAGATGACTCTTGAAGAAGAAATAAATGAAAGATTATAAGAGTTCAATGCTAGGAGGGAGAAAATACAAAGAATTTGAGTGTGGAGACTAAAAAATCGAGCATGGTATGACCTAATTTGGAAAAACATTGTATTTATAATTTGCTGGAGTTCCTAGACACTTAGGAAGCGCTCTACCTTAGCAATCGAAGCGCCTACCCAGGTGCCTAGACACTTCACGTGTGAAAAGCGCATGGAAAGTGCTTTGTATTCTCTTAAATTAAGGGAGTTTATATTATATTTCGCTTGTTTGCTAGTGGTTTTCAGGTCAAAATAAAGAAAAGAAGAATCGAAAGCCAAAAGAACAAAACCGAGCCAAAATCAAGTGAAAAAGAAGAAAATCACCAAACTGCCAAAAATAGGACAGCGTCGCGGTGCTGGTTCGACACTGCCCCGACACTTTTTCCCGAGAGCATCACCTGACCTCAGCACAGTAGCACCGACCTAGCATTGTGACACGGCGCCGAGGGTAGGCTTTTATGACACATTGCCGCGGCGCCATCCTATAGGGCGGCGGTGCCACCTTTTGATGTCGGATAGTGCAGCGACGCCATTGAGCAATACCGCAGCGCCATGTTTCCTTATTTGAAAAATTTACATTTTTGAAAGCATTTTGGGCGGCCAACTCTATAAATTGGAGGGTTTCTAGCAAGCCTATCAGAAAACACACCAGAAGACATTAGAAAAAGAGTGAGTTGGTTGCAAGGAAGAGAGAAGAGAGTTTAAGAGAGATGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATTATAGCCTTTTTCATAGATAAATAGAGTTTAAATAAGAGAAGCATGCGATAGTTGATGATAAATTCCATTAATAAATCTTCCTTTGCATTATACTCTTGAATTTTGATGAAGATATTGATTTTACCACTTGTTAAGCCTAAAACACATGTTTTCACGCAGGAATGCAGACGTTGCGCTGATGACTTATTAACGCAGGACGATACGTTAGCAATCTATTCTTCATGGACGCATGATCTGAACGAAAGGCAAACAACCTGACGACGCGTTAACAACAACTCAACGCATAACTACGCATTAGCAACCTACGACGCGTTGATATAGGCCAAACTATGCATGGACGCGTAGACAACTGTAACGGCAAGGCGCTGAGAATCAGATCGGAATCTTGAGAGATTGACGGATGATTGACAGACATGATTTGCGGCTTGAGTGCCATCTTAATTAGCCCGACAATCACGCAATCAGGCGAGATGGACGCAGTATCAATCTCGCCACCAATCAAGCAGATCTGCCATTAACTGCGATTTCAGCATCTATAAAAGGGCAGCTCTGCGAGAGGAGAAAGGTTGTTGATTCTCGGAAGGACTCCATAAGTGACAGCAGAGTTCTCTCAGACTTCAGCCGGAGACAAATAGCTCGAGAGAGAAGAGTCTTCCTTTCCGCCGCACCACTTCACAGCAAATCATCACGCTTCCATCCGGGCGACTCAAGACATTGACGCCTTACCCTGCTTTCTTTCTTACTGTTCTTGCTTAAATTTTAGATCTGTATCAAGGAATTGAACTTATCAAAATTTGTATCTCACTTTCATCAATACAATTATCTTTCATGTCTATTCACTTTTCTCATCTGTCCACTTTATACTTTCAAGCCATGAGTAACTAATCACTCGAGGGTCTAGGGTTGCCTTAGCATCTAACTAGGGACCGTAGTGTAACTATTCTAACTTGTCAATTGCGAGCTTAATCCGATGCTTATATCCATCTGACAAATCGATATAAGTAGTAATAATCAGACTGCTCGAGAGGGTAAGTGATTGTGGAACTCAATTGACAAGGGCCAAGTAGTGTTACCTGTCTACAGGGACAACCTTGGTTCTTAACACTCTCCTATGCGTTATAGAGATATAACGCATAGCGGCTGACAACCGGGAGAAGAGTCGCAAGTATGAATAGAGTACTATTGTGCGTTTCTGATGTTAGATGTTAATCAACCCGAACCCTTTTCTTTATCCATACACACACATCTTAGCTGAACTTGCTGTGTCGCATGCTTCCCATATTCCACAACTGTTAGTTTAGTGTACAAACATCTGCTTTCTTTAGATTAAAAACACAAATTCAAACAATTGTTGGTTACCTCTGTAACGCATGCGATCCAATTAAAACCAAATCAATATAATCCCTGTGTTCGACCTCGGACTCACCGAGAACACCTATTACTTTACTTATACTTGGGTAGAGGAATAGGAAAACTTGACGAGACCAACTCATAATAATAGAACGCATTGCATGATCAAAACATGACATGTTAAACACATAACCATATATTTTAGCACCTTGCGTTAGGTTGTTTTACACATAAAAATACGCACAACGAGAGAGTTTGGTGTCGTTCGAATTCTCGACGTGAAGACTAAGGACATCTTCGCGGTTCCTCCTGAATCAAGAGCTTCTTTTCAATAGAGTTTCCCTTTCTTTACACTCTTTCTTTGCTCATATTGTTTGTGAACATGTTGCTTAAAGCTATAAGTGGATAAACTCTTTAGTTTTAGGGTATTGATGAATTGTTTATGAAGTTATGTTGATATTGTAGACTATTCATGGTTTTGTTGTAATGAATATACTTTTCATTGTTATTATGCTTAATTCTTGTTGATTGGCCATCCTTGGATATTAGATTAGATGTATGGTTGAAATAATTGTATGTCTAATTGGATCTATAACAAGGAATTGTTATTAATCTATCATGAAAATAGTTAGGTTAACAATGAAAGTTGCTAAAGACTATTCTTAATGTCATGTAATTTGTATTGGTTTCAAGAAATTAGTAATCAATTAAGTTGCAAAAAAATGTTGTCTTTTTTTTAATAGAAAATAACTTGGATTTATGTTTCTAGACTTAAGCATATGAATTGCAATAAAATCCACGAACCCTAGAATATTGCATAATGAAGTAAACAAGGATTCATTACCCTAGAACTCTCTTTGACTCTTGTGTTTCTTATTTATTTACTT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ATGGCTCGACTCTTAAACCATGAGGCTTCAAAAATCATTGTCATAGGATTCACAAGAGCTCTAAAATTATGGTGGGGACACTACCTTGATGTTGCTGAAAGAGATGCTATCCAAACCCATACAACTAGAATAAAGAAAATAAAGACATTAACAAGTGATGTCATAAGCCCAGATACAAAACAACCTTCAACTTCAACCCGACAAATAGAAGTAGAAGAAGAAAAAAAAAAAAAAACAAGATGCTATAGCAACACTAGTCTATGCGATATCAACCAACAAAATTGGAAAGAACAATTTGTTGGATTACCCAGTTTTATAGCAGAAAAGATTTATACATCATTAAACAAAACTCACAATTACAAAGTCCCTTGGAATGTTATGACTTACGAACACAAAACTTCTGTAATGATAGAATGTTCATTAGACATCTATAATGAAATCAAAGTCCAAAATAAAGTTCAGAAGCTTGTGCGGCTACCTTCGGGTGTTGAAAAACTCATTGATTCTCGATGCCGAGCTATGAAAAAGGGCCTCGAGTTATCCCGGAACCCTTCCTCCCTCACAGGACGAGCGAAACCTATAATTGCAGATCGACTTGGTATTCTCGACGAAGCCTATATATATACCCACATAAAGTGGGGAGACCCCTTAAAGCAGTATGAAAAGACGTATCGCGTAACCGTTCCTGTAAGCAGCTGA MARLLNHEASKIIVIGFTRALKLWWGHYLDVAERDAIQTHTTRIKKIKTLTSDVISPDTKQPSTSTRQIEVEEEKKKKTRCYSNTSLCDINQQNWKEQFVGLPSFIAEKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLVRLPSGVEKLIDSRCRAMKKGLELSRNPSSLTGRAKPIIADRLGILDEAYIYTHIKWGDPLKQYEKTYRVTVPVSS Homology
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: XP_016544249.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107844316 [Capsicum annuum]) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 5.4e-07 Identity = 46/165 (27.88%), Postives = 81/165 (49.09%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: XP_023522280.1 (uncharacterized protein LOC111786173, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 5.4e-07 Identity = 56/186 (30.11%), Postives = 81/186 (43.55%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: EYU18267.1 (hypothetical protein MIMGU_mgv1a021562mg [Erythranthe guttata]) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 9.2e-07 Identity = 58/199 (29.15%), Postives = 91/199 (45.73%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: KYP58927.1 (polyprotein [Cajanus cajan]) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 2.1e-06 Identity = 54/195 (27.69%), Postives = 95/195 (48.72%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: EYU18275.1 (hypothetical protein MIMGU_mgv1a018902mg [Erythranthe guttata]) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 3.5e-06 Identity = 57/199 (28.64%), Postives = 91/199 (45.73%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1U8EK43 (uncharacterized protein LOC107844316 OS=Capsicum annuum OX=4072 GN=LOC107844316 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 2.6e-07 Identity = 46/165 (27.88%), Postives = 81/165 (49.09%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A022PPM0 (CCHC-type domain-containing protein OS=Erythranthe guttata OX=4155 GN=MIMGU_mgv1a021562mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 4.5e-07 Identity = 58/199 (29.15%), Postives = 91/199 (45.73%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A151SVV4 (Polyprotein OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_014349 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 9.9e-07 Identity = 54/195 (27.69%), Postives = 95/195 (48.72%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251VET5 (Putative reverse transcriptase domain, Zinc finger, CCHC-type, Aspartic peptidase domain protein OS=Helianthus annuus OX=4232 GN=HannXRQ_Chr02g0042331 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 9.9e-07 Identity = 61/210 (29.05%), Postives = 95/210 (45.24%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251VEY4 (Putative reverse transcriptase domain, Zinc finger, CCHC-type, Aspartic peptidase domain protein OS=Helianthus annuus OX=4232 GN=HannXRQ_Chr02g0042351 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 9.9e-07 Identity = 61/210 (29.05%), Postives = 95/210 (45.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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