CaUC09G173440 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC09G173440
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionCCHC-type domain-containing protein
LocationCiama_Chr09: 31434029 .. 31472022 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC09G173440
SyntenyCaUC09G173440
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGCTCGACTCTTAAACCATGAGGCTTCAAAAATCATTGTCATAGGATTCACAAGAGCTCTAAAATTATGGTGGGGACACTACCTTGATGTTGCTGAAAGAGATGCTATCCAAACCCATACAACTAGAATAAAGAAAATAAAGACATTAACAAGTGATGTCATAAGCCCAGATACAAAACAACCTTCAACTTCAACCCGACAAATAGAAGTAGAAGAAGAAAAAAAAAAAAAAACAAGATGCTATAGCAACACTAGTCTATGCGATATCAACCAACAAAATTGGAAAGAACAATTTGTTGGATTACCCAGTTTTATAGCAGAAAAGATTTATACATCATTAAACAAAACTCACAATTACAAAGTCCCTTGGAATGTTATGACTTACGAACACAAAACTTCTGTAATGATAGAATGTTCATTAGACATCTATAATGAAATCAAAGTCCAAAATAAAGTTCAGAAGCTTGTGCGGCTACCTTCGGGTGTTGAAAAACTCATTGATTCTCGATGCCGAGCTATGAAAAAGGGCCTCGAGTTATCCCGGAACCCTTCCTCCCTCACAGGACGAGCGAAACCTATAATTGCAGATCGACTTGGTATTCTCGACGAAGCCTATATATATACCCACATAAAGTGGGGAGACCCCTTAAAGCAGTATGAAAAGACGTATCGCGTAACCGTTCCTGTAAGCAGCTGA

Protein sequence

MARLLNHEASKIIVIGFTRALKLWWGHYLDVAERDAIQTHTTRIKKIKTLTSDVISPDTKQPSTSTRQIEVEEEKKKKTRCYSNTSLCDINQQNWKEQFVGLPSFIAEKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLVRLPSGVEKLIDSRCRAMKKGLELSRNPSSLTGRAKPIIADRLGILDEAYIYTHIKWGDPLKQYEKTYRVTVPVSS
Homology
[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: XP_016544249.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107844316 [Capsicum annuum])

HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 5.4e-07
Identity = 46/165 (27.88%), Postives = 81/165 (49.09%), Query Frame = 0 

Query: 8   EASKIIVIGFTRALKLWWGHYLDVAERDAIQTHTTRIKKIKTLT-SDVISPDTKQPSTST 67
           EA+ +IV GFT  +K WW +Y     ++ I   TT    +K+    +V+    K+ + +T
Sbjct: 17  EAASMIVSGFTGMIKHWWDNYFTDEIKNLIYGATTIETVVKSENGQEVLEQVAKEDACAT 76

Query: 68  RQIEVE-----EEKKKKTRCYS--NTSLC--------DINQQNWKEQFV-GLPSFIAEKI 127
               +      E K  + R +   N   C        D N   WKE+F+ GLPS  AEK+
Sbjct: 77  LLYHIARHFIGEPKLFQDRSFEILNNLTCKDLVMIRPDCNNDFWKERFISGLPSLFAEKV 136

Query: 128 YTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQK 156
            T +      K+P++++TY    S +    +D+Y ++K++ +++K
Sbjct: 137 RTKIKDRFEGKIPYDILTYGDLISFITTVGIDLYTDLKLKKQLKK 181

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: XP_023522280.1 (uncharacterized protein LOC111786173, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 5.4e-07
Identity = 56/186 (30.11%), Postives = 81/186 (43.55%), Query Frame = 0 

Query: 6   NHEASKIIVIGFTRALKLWWGHYLDVAERDAIQTH-----TTRIKK-------------- 65
           +H+ ++++V GFT  LK WW  YLD A R  I +H     TT+I K              
Sbjct: 22  DHQIAQVLVTGFTGQLKDWWDKYLDEATRQQILSHYVIRPTTQIIKEEGPSTRTEVQHER 81

Query: 66  ----IKTLTSDVISPDTKQP-STSTRQIEVEEEKKKKT----RCYSNTSL------CDIN 125
               + TL   +I      P     R  E+    K  T    R Y +  L       D +
Sbjct: 82  VEDAVNTLIYTLIEFFVGNPLKYQERSAEILMNLKCPTLGDFRWYKHMYLSKVLIRTDSS 141

Query: 126 QQNWKEQFV-GLPSFIAEKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQ 157
            + WKE FV GLP   + +I   L   +N  +PW  ++Y    S +IE  L + NE K+Q
Sbjct: 142 LEFWKENFVNGLPKHFSRRIKDGLKTKYNGTIPWQTLSYGSIASFIIEEGLRLCNESKIQ 201

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: EYU18267.1 (hypothetical protein MIMGU_mgv1a021562mg [Erythranthe guttata])

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 9.2e-07
Identity = 58/199 (29.15%), Postives = 91/199 (45.73%), Query Frame = 0 

Query: 10  SKIIVIGFTRALKLWWGHYL--------------------DVAERDAIQTHTTRIKKIKT 69
           +KII+ GFT  LK WW  YL                     +   D++ T    I K   
Sbjct: 521 AKIIIQGFTGQLKGWWDFYLPEEAKAHILQAVKTEMVNNQPINTNDSVNTLLYTIAKHFI 580

Query: 70  LTSDVISPDTKQPSTSTRQIEVEEEKKKKTRCYSNT-SLCDINQQNWKEQFV-GLPSFIA 129
            T+ ++   T++   + R   + + K  K   +S   +  D  Q  WKE+F+ GLP F A
Sbjct: 581 GTTSLLLEKTQEQLMNLRCHNLSQFKWYKDVFFSKVFTRADSQQDFWKEKFLSGLPHFFA 640

Query: 130 EKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLVRLPSGVEKLI 187
           EKI   + K HN  +P+++ TY    S +    +++ NEIK+  ++QK   L    +K+I
Sbjct: 641 EKIRNRIKKKHNGVIPYSLYTYGDLASEITSEGINLCNEIKLHRQIQKDKILG---KKII 700

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: KYP58927.1 (polyprotein [Cajanus cajan])

HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 2.1e-06
Identity = 54/195 (27.69%), Postives = 95/195 (48.72%), Query Frame = 0 

Query: 12  IIVIGFTRALKLWWGHY-----LDVAERDAIQTHTTRIKKIKTLTSDVI-SPDTKQPSTS 71
           IIV GFT  LK WW ++     L+  E+DA+ T       I T+    I  P+T +   +
Sbjct: 455 IIVQGFTGQLKGWWDNFWTPVKLETGEKDAVAT------LIYTIIQHFIGDPNTFKDRAT 514

Query: 72  TRQIEVEEEKKKKTRCYSNTSLCDIN------QQNWKEQFV-GLPSFIAEKIYTSLNKTH 131
           ++   +        R Y +  +  I       Q  WKE+F+ GLP   +EK+   L    
Sbjct: 515 SQLANLYCPTMSDYRWYKDIFMSKITLREDDFQGFWKERFIAGLPKLFSEKVKIKLESHF 574

Query: 132 NYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLVRLPSGV-EKLIDSRCRAMKKG 191
              +P+N++TY+   +++I+  + + N+ K+QNK++K     +G   K I + C   +  
Sbjct: 575 GKPIPFNILTYDQIHNIIIDTGIQVCNDFKLQNKLRK----EAGTNRKEIGNFCEQYR-- 634

Query: 192 LELSRNPSSLTGRAK 193
           +E  R PS++  +A+
Sbjct: 635 VEPIRTPSAIKKKAQ 637

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match: EYU18275.1 (hypothetical protein MIMGU_mgv1a018902mg [Erythranthe guttata])

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 3.5e-06
Identity = 57/199 (28.64%), Postives = 91/199 (45.73%), Query Frame = 0 

Query: 10  SKIIVIGFTRALKLWWGHYL--------------------DVAERDAIQTHTTRIKKIKT 69
           +KII+ GFT  LK WW  YL                     +   D++ T    I K   
Sbjct: 529 AKIIIQGFTGQLKGWWDFYLPEEAKAHILQAVKTEMVNNQPINTNDSVNTLLYTIAKHFI 588

Query: 70  LTSDVISPDTKQPSTSTRQIEVEEEKKKKTRCYSNT-SLCDINQQNWKEQFV-GLPSFIA 129
            T+ ++   T++   + R   + + K  K   +S   +  D  Q  WKE+F+ GLP F A
Sbjct: 589 GTTSLLLDKTQEQLMNLRCHNLSQFKWYKDVFFSKKFTRADSQQDFWKEKFLSGLPHFFA 648

Query: 130 EKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLVRLPSGVEKLI 187
           EKI   + + HN  +P+++ TY    S +    +++ NEIK+  ++QK   L    +K+I
Sbjct: 649 EKIRNRIKQKHNGVIPYSLYTYGDLASEITSEGINLCNEIKLHRQIQKDKILG---KKII 708

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1U8EK43 (uncharacterized protein LOC107844316 OS=Capsicum annuum OX=4072 GN=LOC107844316 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 2.6e-07
Identity = 46/165 (27.88%), Postives = 81/165 (49.09%), Query Frame = 0 

Query: 8   EASKIIVIGFTRALKLWWGHYLDVAERDAIQTHTTRIKKIKTLT-SDVISPDTKQPSTST 67
           EA+ +IV GFT  +K WW +Y     ++ I   TT    +K+    +V+    K+ + +T
Sbjct: 17  EAASMIVSGFTGMIKHWWDNYFTDEIKNLIYGATTIETVVKSENGQEVLEQVAKEDACAT 76

Query: 68  RQIEVE-----EEKKKKTRCYS--NTSLC--------DINQQNWKEQFV-GLPSFIAEKI 127
               +      E K  + R +   N   C        D N   WKE+F+ GLPS  AEK+
Sbjct: 77  LLYHIARHFIGEPKLFQDRSFEILNNLTCKDLVMIRPDCNNDFWKERFISGLPSLFAEKV 136

Query: 128 YTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQK 156
            T +      K+P++++TY    S +    +D+Y ++K++ +++K
Sbjct: 137 RTKIKDRFEGKIPYDILTYGDLISFITTVGIDLYTDLKLKKQLKK 181

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A022PPM0 (CCHC-type domain-containing protein OS=Erythranthe guttata OX=4155 GN=MIMGU_mgv1a021562mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 4.5e-07
Identity = 58/199 (29.15%), Postives = 91/199 (45.73%), Query Frame = 0 

Query: 10  SKIIVIGFTRALKLWWGHYL--------------------DVAERDAIQTHTTRIKKIKT 69
           +KII+ GFT  LK WW  YL                     +   D++ T    I K   
Sbjct: 521 AKIIIQGFTGQLKGWWDFYLPEEAKAHILQAVKTEMVNNQPINTNDSVNTLLYTIAKHFI 580

Query: 70  LTSDVISPDTKQPSTSTRQIEVEEEKKKKTRCYSNT-SLCDINQQNWKEQFV-GLPSFIA 129
            T+ ++   T++   + R   + + K  K   +S   +  D  Q  WKE+F+ GLP F A
Sbjct: 581 GTTSLLLEKTQEQLMNLRCHNLSQFKWYKDVFFSKVFTRADSQQDFWKEKFLSGLPHFFA 640

Query: 130 EKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLVRLPSGVEKLI 187
           EKI   + K HN  +P+++ TY    S +    +++ NEIK+  ++QK   L    +K+I
Sbjct: 641 EKIRNRIKKKHNGVIPYSLYTYGDLASEITSEGINLCNEIKLHRQIQKDKILG---KKII 700

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A151SVV4 (Polyprotein OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_014349 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 9.9e-07
Identity = 54/195 (27.69%), Postives = 95/195 (48.72%), Query Frame = 0 

Query: 12  IIVIGFTRALKLWWGHY-----LDVAERDAIQTHTTRIKKIKTLTSDVI-SPDTKQPSTS 71
           IIV GFT  LK WW ++     L+  E+DA+ T       I T+    I  P+T +   +
Sbjct: 455 IIVQGFTGQLKGWWDNFWTPVKLETGEKDAVAT------LIYTIIQHFIGDPNTFKDRAT 514

Query: 72  TRQIEVEEEKKKKTRCYSNTSLCDIN------QQNWKEQFV-GLPSFIAEKIYTSLNKTH 131
           ++   +        R Y +  +  I       Q  WKE+F+ GLP   +EK+   L    
Sbjct: 515 SQLANLYCPTMSDYRWYKDIFMSKITLREDDFQGFWKERFIAGLPKLFSEKVKIKLESHF 574

Query: 132 NYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLVRLPSGV-EKLIDSRCRAMKKG 191
              +P+N++TY+   +++I+  + + N+ K+QNK++K     +G   K I + C   +  
Sbjct: 575 GKPIPFNILTYDQIHNIIIDTGIQVCNDFKLQNKLRK----EAGTNRKEIGNFCEQYR-- 634

Query: 192 LELSRNPSSLTGRAK 193
           +E  R PS++  +A+
Sbjct: 635 VEPIRTPSAIKKKAQ 637

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251VET5 (Putative reverse transcriptase domain, Zinc finger, CCHC-type, Aspartic peptidase domain protein OS=Helianthus annuus OX=4232 GN=HannXRQ_Chr02g0042331 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 9.9e-07
Identity = 61/210 (29.05%), Postives = 95/210 (45.24%), Query Frame = 0 

Query: 6   NHEAS--KIIVIGFTRALKLWWGHYLDVAERDAIQTHTTRIKK------IKTLTSDVI-- 65
           N+EA    +IV GFT  LK WW  YL   E+  IQ     I K      I T T D+I  
Sbjct: 320 NNEAQILTMIVSGFTGILKGWWDKYLTEEEKHIIQNAKKLIIKTENNVQIPTETPDIINT 379

Query: 66  -----------SPDTKQPSTSTRQIEVEEEKKKKTRCYSNTSLC------DINQQNWKEQ 125
                      +P   Q   S   + +   K +  R Y +  L       D  +  WKE+
Sbjct: 380 LIFAIIKHFIGNPTDYQERNSLILLNLTCRKLQDFRWYKDVFLSKVMTRDDCKESYWKER 439

Query: 126 FV-GLPSFIAEKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLV 185
           F+ GLP   AE+I   + K  N  +P+  ++Y    + + +  L I N++K++ K+++  
Sbjct: 440 FIAGLPKLFAERIREKIKKDFNNNIPYRDLSYGQIINYINQEGLKICNDLKLKEKIKR-- 499

[Close]
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251VEY4 (Putative reverse transcriptase domain, Zinc finger, CCHC-type, Aspartic peptidase domain protein OS=Helianthus annuus OX=4232 GN=HannXRQ_Chr02g0042351 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 9.9e-07
Identity = 61/210 (29.05%), Postives = 95/210 (45.24%), Query Frame = 0 

Query: 6   NHEAS--KIIVIGFTRALKLWWGHYLDVAERDAIQTHTTRIKK------IKTLTSDVI-- 65
           N+EA    +IV GFT  LK WW  YL   E+  IQ     I K      I T T D+I  
Sbjct: 13  NNEAQILTMIVSGFTGILKGWWDKYLTEEEKHIIQNAKKLIIKTENNVQIPTETPDIINT 72

Query: 66  -----------SPDTKQPSTSTRQIEVEEEKKKKTRCYSNTSLC------DINQQNWKEQ 125
                      +P   Q   S   + +   K +  R Y +  L       D  +  WKE+
Sbjct: 73  LIFAIIKHFIGNPTDYQERNSLILLNLTCRKLQDFRWYKDVFLSKVMTRDDCKESYWKER 132

Query: 126 FV-GLPSFIAEKIYTSLNKTHNYKVPWNVMTYEHKTSVMIECSLDIYNEIKVQNKVQKLV 185
           F+ GLP   AE+I   + K  N  +P+  ++Y    + + +  L I N++K++ K+++  
Sbjct: 133 FIAGLPKLFAERIREKIKKDFNNNIPYRDLSYGQIINYINQEGLKICNDLKLKEKIKR-- 192

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_016544249.15.4e-0727.88PREDICTED: uncharacterized protein LOC107844316 [Capsicum annuum][more]
XP_023522280.15.4e-0730.11uncharacterized protein LOC111786173, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
EYU18267.19.2e-0729.15hypothetical protein MIMGU_mgv1a021562mg [Erythranthe guttata][more]
KYP58927.12.1e-0627.69polyprotein [Cajanus cajan][more]
EYU18275.13.5e-0628.64hypothetical protein MIMGU_mgv1a018902mg [Erythranthe guttata][more]
BLAST of CaUC09G173440 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1U8EK432.6e-0727.88uncharacterized protein LOC107844316 OS=Capsicum annuum OX=4072 GN=LOC107844316 ... [more]
A0A022PPM04.5e-0729.15CCHC-type domain-containing protein OS=Erythranthe guttata OX=4155 GN=MIMGU_mgv1... [more]
A0A151SVV49.9e-0727.69Polyprotein OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_014349 PE=4 SV=1[more]
A0A251VET59.9e-0729.05Putative reverse transcriptase domain, Zinc finger, CCHC-type, Aspartic peptidas... [more]
A0A251VEY49.9e-0729.05Putative reverse transcriptase domain, Zinc finger, CCHC-type, Aspartic peptidas... [more]
BLAST of CaUC09G173440 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC09G173440.1CaUC09G173440.1mRNA