CaUC09G172720 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATAATAAGGCTTCTTCCTCTCACCGGCTCGAGAGGGATTGTGTTTATGGTAAGATCATAAACAAGTTGTTCATTAGAAGATCAATGGGACTTAAGTAGTAAAAAGTAATTATAGGGGTAAAACAGTAATTTGACCCAGGTGTAGTTATAAGCAATTCGTGAAGGATCAACTTATCAATAATAGTTATATCCATGGATACAAAAATATTCTACAGTGCGAAGAGTGCAATTGTGGGTTTTTAGTCGAGTGACCCACAATTAATGAATGTTGATTAATTTAATTAAAGAGTTTAATAAATTAACCTCGAATCATTGAAGCTTTTAATCTGTAGGTCCATAAGGTCCCTTTGCTATGTCACTAAGGATAAAACAAGGAATAAGTAGTTTTGGAACAATTTGAATTGTTCAAATTATTTAAGTGAAATATATGTTTTTATATATATTATATGATTAATATAAAGTGTAATATATATATATATTTATTTATTTATTTATTTAAAAATATGATTTATAATTAAAATTATATTATATATGAGATATTTGAATAATATTCAAATATTAATTATATGAATGAGATTCATATAAATATTATAGGTTAAAACTAACGTGTATATGATTCATATTAAAATTATAGGTTATGAGAGAGTTATGCATTTTAATTTGATTCAAATGCATATTTAATTAAATATGTGATATTTAATTAAGTTTATAATTAATTATTAAGGAAAACTATTATAAATAGAAAAAATATCAAACTATTTACAAATATAGCAAAATTTTATTTTCTATCTGCGATAGATCTAAATAGACATTTATCTGTGTCTATCTGATAAAGTGATAGAGGTTTATCTAGGTCTATCACGGTCTATCATAGATAGAAAGTAAAATTTTGCAAATTATTTTTAACTGTTTTTCTATTTTTAAAAATATCCCATTAATTAATTATTATTATTATTTAATTAAAATTAAATTCGACTTGGTTTTTAATAATAATAATAATAATGATGATAAATTCCCATGTGTATTGTAGGGGAGTGGGGGAGTTGGAGGGTTTAGGGCTATTCTCCTCCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTACGTGAAAAAACAGGCACACTCCCACACTCAAATTTTCTCTCAATATCTCTCACACCAAAAATACACAGAGAAGAGTTATCTCACAAAAAAGGATTTCCTTCTCCCAAACAATTGGTTCTCACAAACTTATTTCTTGCTTGAGAATAGCAAGGTAACAAAGTGAGAATAGCAAGGTAACAAAGTGGTGGTTTTCGCTATTCTGTTCGTGGGAATTCGTGCAAAGAGGAAACAACTTAAGACACTCTACAAGGGTGAGTTTTCATTCCTTTATTTAAAATGTAAATATTTTCATTCATTTTATTCCTTTTTTATTGGGTAATTATTTTAAATGGCAAAATTGTTATAAATATTTACAAATATAGTAAAATGTTATTGTCTATTAGTGTGTCTGATAGACACTAATAGATAGTGACATTTTGCTATAATTATAAATATTTTGACTCATTTTACTATATTTGTAAACAACCCTTTTTTTATTACAGTTGTTTTCAAATATAGCAACATAAAATAATATAAACTATATTAATTTACAAAGAAATTCAAATTGGTAAAAATAAATATGTTATATAAGTTCAAATTATATTAAATTAATCATGAATTAATGAATAGCCACAAGAGCATTCATAGTGCATTACGTAAATTTAAGACATTTTCAAATAAAAATACTATGAAACAAGCACAATTATCCAGCATTTCAATCTACTAAAAATATTTCTATTAGAAAAATATGATTATTGAAATTTTTCAAACAACTATAAGATGGAGAGCACTTATAATTTAAGTTTTGATTATCTACATTCTAAAAAAAACAAATGGTTCCTAATATATGAAATTTATGCTTATTCTTTGACTATTTGACAAAATGTTTTTATTGCACATTTTTTTCTTCAAAGTTAATCTTAAACGTGGTTTTTGTGTTAAACGCTTTTTTCCTTCTAAACATGCACTATAAATAACTTATTCCATTGTTTCATAAGTTATCAGTTAATCACCAAAAGATCAATTAAAGCAATAACTTAATTAGTACATATATCCTTGACTAATAAAGGTAGTTCGAATTCTCACGTCCACGTAACTCTATTTTCTTCATTCGATGTTTTAGAATCTTAAATCTTAACCTATTTTTGTGAAACAAATACACTTAGACCATAATTTTTTATTGTAAGGTTTAGTAGGAGGTACCTAGCTACCTCTTTAAGAATATTTTTTAAATGTGCTTTCAAAATATAAGTTTTTTTATTTTAACACTTAAAGATTTGTTTCAATCCTCAACTTTATTTCGTTTGATAACTTTTTGTTTTTTTTTTTTATTGAAAAAATTAAGTTTATAAACACAAATTTCACCTATAACTTTCTATCTTTTATTATCCATTTTATGTCATGTTTTCAAAAACTAAATAAGTCTTGAAAACTAAAAATAGTAGTTTTCAATAAACTTTCTTTTGTTTTTAGTATTTTTACTAGAAATTCAAGTGTTTATTTAAGTTAGGTGAAAATATAATAGAGTAGTTGAGAGGAAACAAGCATAAATATAAACCACACGGCAAAAAAAAAAAAATGAAAGCATTAGAAAACATAGCCTTATTTATGTTTGATTATCTCACATTGAAAAGGTGGAAGGAAATGATGTACTCCAAGCACTATGAAAGTAGCCAATGCCTTTGGTTTCAAATTGTCTTAGTTAGAAACACTTTAAGTTTGAGTGTGCTAACTCTAGTTAAATTCTCTTTTTATTCTCTAGTTTGAGAGTAGAGAAAAAGGCATGAGCGGTATAAAAACTTTGAGAGCTTGCTCTTGTAATTGGGATCGGAGAGATAATTATTTTGTTTGATTGTAACAATATAGTAAATCTCTTTCTTGTGGGTCATGTTTTTCTCGAGGTTGGGAGTTTTCCACATAAATTCTTATGTTTCCTAGTTTGTTGTTTTCTTTTTACTTTTCTGCTTATTCTCATGGTAGTAATGAGAGGTTTCTCTCAGGAATTCCCTTGCGATTATTCCTTAACTTATAATTAATTTAATATAATTTGAACTTATAGACCATATTTTTTTATATATTAATATAGTTTATATCATTTTTGTCACACCCCCTCCCGGATTATCCTCCATAACCCGAGAAGAGATGTGAAGACAGCAGTTACCGACTACCCTGTCACGTAACCCACTGTCAACCTCTCCATCCACGTGCTCTTGACAAACCTCGACTTCGATCGGCAACGGGAACTGTCATGCTACCTGAAAATGGAAAACATATGAAAACATGAGCTAACAGCTCAGTGAGTAACAGTTTCTGAAAAACATTATACTTTAAGTGTAAAACTGATTGAACTCGTATGAAATATCACACTGAAAATCAGTATATAACATGATCAATTCTTTGCTATATCATGTATGCATATCTGTTTGGAACAAATAATATAAATCTCATTCATTTCAAATACTTTTTCCTAGTTGAGGCGGAGCAATGCTCAATGCTCTCAACGTCGATTTTCCTTAGCTGTGTGGAGTAATCTCAACACATCAGCGTCGTATATATGTATATATTCTATATATATTCTTCTATGTGCACAAAGATATTACTACACGGGCTGCCCATATGCCTTCCTTTTATCCTTGAGCATTGAGTCCCATTTCTATTTTCCGGTTACCCATTTGCCTTCATCTAGTCCTTGAGCATTGGGTACCTTTTATAACTCGGGCTGCCCACAATGCCTTCTACGAGTCCTTGAGCATTGGGGTCCCTTTTCAAAGCTTTATAAAACACCATACATATTTTGGAAACATTATATTAATAGCTCATAACTTAACCGTTTCCAAACCTAATATCAACCAACATGCTTTTCATACAAGTCTATCTTCAAGTCTTTCTGGAAATCATATAACACCATGCTTTTTAGAAAAACCATGAATACAAGTTTCAATCAATCACCATGCGTTACTCAGCATTTTCAAAGTTACCATGTAAAACGCAGCTTCTTAGCTGGCTCATATTCCTTTATATATATATAAACGCATGCTCTTAGTTTTATAAACAACATGTTCACATACTTCGTATATGAAAACGCATGCATTGTTTCATTAGAAACCCATAAAAATATATTCATAAAGAACTCATTTATATTTTGTAAAACGCAGGTGTTACTCACCTGTACTTGCCAAAAAATACTTCTTCTTCCTTTTCTCTATTTCCTTTTCCCGAGCTTTCTGGACGCAACGTTCTTACTCCAGAACGCAAGGCTCCATTTTCCTCTGTCAGCTCGATTGAATGCAACCCTGCCCTTCAACGCAAGGTTGGTAGCGCAAGGCTGATTATTTCCGCACGTGCATCCCAACTCTTCTTACTTCTCTTTCGGATGCGTCACCCTCACTTAGACGCAAGGTCCAACTTGAACGCATCAAACTTGAATGCATCACCTAACTTTTGGATGCCGCGTTCACCTTGGACATTATGTTTGTCCTCAACGCAAGGCCGACCCCTTTTAACGCAATACAACTTTACATAAATAAGTTAGGTTGTCAAATACCTTCTTTCTTGGCCACATACTCCTACAATGGACGTCTTTGCTGCCTTCTCTTTCTCTCCAGATTTCTTCTCTGAGAGTCATCAGTCGCTCCTTTTCCTTCAAAGTTCTATTTATAGGGAGCTTGCCATCCAACTTTTCCTCTCTTTTGCCACTTGTTTGCCACATGTCACGCTGCATGCTTAATTAACCATGCATTAGTCTAAATGTCACCTTGCATGAGACACTTACCATACCTTTTTAACACCTCCTACTTTAAGGTGTCAAATCTATATGAAGACACCTAGCCTTTATAAGCTTATCTTAGACGTCCAACATTTTCCAATGAACAACTTTTATTCAACACAACGCCCTCATGCGTTCATTGAGTTTC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ATGAATAATAAGGCTTCTTCCTCTCACCGGCTCGAGAGGGATTGTGTTTATGGTAACAAAGTGGTGGTTTTCGCTATTCTGTTCGTGGGAATTCGTGCAAAGAGGAAACAACTTAAGACACTCTACAAGGGTGTCGGGACGTTGCGGAGGAGACGAAACACGAGTCGAGATGATGAATCGAGAGCAGAAATGGCCCTCTTGCCATCACCGTCTCCGAATAGAAGCCTCTCGTCTGCCTCCTCGAACGGCCAGCGGACAAAGCGTGCTCTCCTTTGTGGGGTGACTTACAAGAACTGGAAACATAGGCTACATGGGACTGTGAATGATGTTCTGAATATGCAAGATTTGTTGATCAATCATTTTGGATATTCCAAACAAAACATTCGTGTACTTACAGAGGACGAAACAAAGCCAGAGCGGCTACCAACAAAGAAGAACATCCAAAACAGTCTAAAATGGCTAGTTGAAGGTTGCACCGGTGGCGAAAGCCTCGTGTTCTACTTCTCCGGCCATGGATTACGACAGCCAGATTTCGATATGGACGAGCTCGATGGCTACGACGAGACCATATGTCCAGTTGACTTCATGGAGGAAGGGATGATAAGCGATAATGAGATCAATGCCACCATTGTTTCCCCTCTAAAGGACGGTGTCATCCTCCACGCCATCGTCGACGCCTGCCATAGCGGAACAATTCTCGACCTCGCCTATGTTTACGACCGCAACAGGGATGAGTGGCTGGATAATAGACCGCCGTCGGGAGCAAGGAAGGCGACTAGTGGTGGATTGGCGATTTCTTTGAGTGCTTGTGAAGATGATCAATTTGCTGCTGATACTTCTATATTAACAGGGAAGACAATGAATGGAGCAATGACATTCATTCTCATTCATATGGTTAAGACTTTTGGAAATCTAACGTACGGACGCTTGCTTGAATACATGCATGATGCTGTTCAAAGGGCCAACAAACAAGGCTGTTTCTCCTGTTCTTTTTTAAGAAAATTGCTTCGTTACAAACAAATTCAGGAACCACAACTCTCATCATCAGAGGTGTTTGATGTACACAAGAAAATATTTACGTTGTAA MNNKASSSHRLERDCVYGNKVVVFAILFVGIRAKRKQLKTLYKGVGTLRRRRNTSRDDESRAEMALLPSPSPNRSLSSASSNGQRTKRALLCGVTYKNWKHRLHGTVNDVLNMQDLLINHFGYSKQNIRVLTEDETKPERLPTKKNIQNSLKWLVEGCTGGESLVFYFSGHGLRQPDFDMDELDGYDETICPVDFMEEGMISDNEINATIVSPLKDGVILHAIVDACHSGTILDLAYVYDRNRDEWLDNRPPSGARKATSGGLAISLSACEDDQFAADTSILTGKTMNGAMTFILIHMVKTFGNLTYGRLLEYMHDAVQRANKQGCFSCSFLRKLLRYKQIQEPQLSSSEVFDVHKKIFTL Homology
BLAST of CaUC09G172720 vs. NCBI nr
Match: XP_038888839.1 (metacaspase-1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 589.0 bits (1517), Expect = 2.9e-164 Identity = 290/319 (90.91%), Postives = 302/319 (94.67%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. NCBI nr
Match: XP_008455197.1 (PREDICTED: metacaspase-1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 2.0e-157 Identity = 282/319 (88.40%), Postives = 298/319 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. NCBI nr
Match: XP_004136878.1 (metacaspase-1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 562.8 bits (1449), Expect = 2.2e-156 Identity = 280/318 (88.05%), Postives = 299/318 (94.03%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. NCBI nr
Match: KGN43776.2 (hypothetical protein Csa_017238 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 562.8 bits (1449), Expect = 2.2e-156 Identity = 280/318 (88.05%), Postives = 299/318 (94.03%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. NCBI nr
Match: XP_023553943.1 (metacaspase-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 522.3 bits (1344), Expect = 3.3e-144 Identity = 257/318 (80.82%), Postives = 281/318 (88.36%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XJE6 (Metacaspase-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AMC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 270.0 bits (689), Expect = 3.9e-71 Identity = 145/308 (47.08%), Postives = 198/308 (64.29%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XJE5 (Metacaspase-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AMC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 234.6 bits (597), Expect = 1.8e-60 Identity = 133/303 (43.89%), Postives = 176/303 (58.09%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMG1 (Metacaspase-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AMC3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 2.3e-60 Identity = 134/322 (41.61%), Postives = 186/322 (57.76%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5D9W7 (Metacaspase-1 OS=Meyerozyma guilliermondii (strain ATCC 6260 / CBS 566 / DSM 6381 / JCM 1539 / NBRC 10279 / NRRL Y-324) OX=294746 GN=MCA1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 172.6 bits (436), Expect = 8.4e-42 Identity = 116/344 (33.72%), Postives = 169/344 (49.13%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6C2Y6 (Metacaspase-1 OS=Yarrowia lipolytica (strain CLIB 122 / E 150) OX=284591 GN=MCA1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 169.1 bits (427), Expect = 9.2e-41 Identity = 114/317 (35.96%), Postives = 154/317 (48.58%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZX6 (metacaspase-1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495419 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 9.6e-158 Identity = 282/319 (88.40%), Postives = 298/319 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K220 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G062910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 562.8 bits (1449), Expect = 1.1e-156 Identity = 280/318 (88.05%), Postives = 299/318 (94.03%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HUB0 (metacaspase-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466792 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 522.3 bits (1344), Expect = 1.6e-144 Identity = 256/318 (80.50%), Postives = 281/318 (88.36%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JNG9 (metacaspase-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486063 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 520.0 bits (1338), Expect = 7.9e-144 Identity = 252/309 (81.55%), Postives = 279/309 (90.29%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJD3 (metacaspase-1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434681 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 517.7 bits (1332), Expect = 3.9e-143 Identity = 252/309 (81.55%), Postives = 277/309 (89.64%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. TAIR 10
Match: AT1G02170.1 (metacaspase 1 ) HSP 1 Score: 270.0 bits (689), Expect = 2.7e-72 Identity = 145/308 (47.08%), Postives = 198/308 (64.29%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. TAIR 10
Match: AT4G25110.1 (metacaspase 2 ) HSP 1 Score: 234.6 bits (597), Expect = 1.3e-61 Identity = 133/303 (43.89%), Postives = 176/303 (58.09%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. TAIR 10
Match: AT5G64240.2 (metacaspase 3 ) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 1.7e-61 Identity = 134/322 (41.61%), Postives = 186/322 (57.76%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. TAIR 10
Match: AT4G25110.2 (metacaspase 2 ) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 5.4e-60 Identity = 133/303 (43.89%), Postives = 175/303 (57.76%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC09G172720 vs. TAIR 10
Match: AT5G64240.1 (metacaspase 3 ) HSP 1 Score: 195.7 bits (496), Expect = 6.6e-50 Identity = 102/241 (42.32%), Postives = 146/241 (60.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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