CaUC08G152050 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC08G152050
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr08: 23821642 .. 23824350 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC08G152050
SyntenyCaUC08G152050
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAACGTATGGTTTCACTCTGGGGCGAGCACTGAATATAAAAGGCTTTCACTAATCCACACAGTATAACTGTTTGACTCCTACCAGTCAACATAGTCCAACATTCCCTGGTTTTCAACTCCTTTGAGTTCATGGACTTCAGAGACAAATTGTCCTCCAACTGTTTGCCCTTGTTAACAAGATAGGGGAAGTTTTTTTCTCACTATCTAAATCCTGTACTATTTTGTAAAAATTAGGGTTTCTTTACAGCGGCAACGATGTTCGATTAATTTAGGGTTAATCTATCTTCTTCCTTCCTTCTCAATCACTTGCTCGGAGGAGATTATTCGAGAAGATCTCTAATTTCATGGGACTGGAGTTTGGCTCTTTGGCCAATTTTATATGCCTTAGAGATGAATGCAGTTCCCTAAATCATCTCTTCAACCTCTTCACCCATATTCGCTACGGTTTTTTCCCTCCTTGTGAATATCTTTGTTGAGGCTGATACATAATTTATCATTCTTCAAATCACATATTTTTCCGTATTCTCTCTATTACATTGAATTTTGAATCTGTATTTTAAGGTTGATTTTTTTCGAAATGATTCCGAGTAGTAATTCAGGCAGCCCCTCTGCAATTTCTATGGCAAAGGAGGCGTTAAACTGCTCGTAGATCGAATCGCTTTTGCTCTTCAGACTTGCTGAGATTTCCTTTGAAGCTGGTCTAGTAAGCCTAAGTACATATGTTTTTAAGTTCTACCGATTTTTAGTCGCGTACTTGGTTGATTTCTGTTTTAATGTTCTTACCCTTCATAATCTGAGATCATTGGGTGATTAATGATTGGTAAATAAGAATGTACGGAAATTATTCAATGGTTTTTAATAAGTTGTTGCTGGGTCGACCATGGATTTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTCCTTTTTCTCTTCTTGGGTTGTGAAAGGGGTTAGATCATGGTTTGTCGAATCAATACCTGAATGCAAAATATAAAGAATATCAAACAATATGTTATTTTTAAAACACCCACACAACAAATTAAAATATCAAACCATGTGTTATTCACTCACTCACCATGGCCACACAAGTACCAGATTGAGGAACAAGCCATCCAATTGATCCTACGGAAGTTGTATTTTGGTGTCCATGGATCCTGCAGCATTCATGGCTTTCGGCCTGTTATGTCTCCTAAACAGGGAATAGAGGATATGTTGGTTTGTGATCTAATTACGGAAGCTGGTCGTTGGAATGTTCCTTGACTGAGACAACTATTATGGGATGAGGATGTTGCAATATCTGCTTGAATCCTATTTGCAAGACAGTGAGATTGGATCAACAATAAATGCAGATACATCATAAAGTGAAGATTATGATGTGGACATTGTGCAATAATATCCTTCAAATAAAAACCTCTATCAGAGACACATTACAGGTAACGGATGGTGTGTGTTGTGTTGTGGGAAGGAGGAAGTAAGTAACGGAAATACATTTCTAAGATTCCAGAAAGCAAAACATCTTTGGAAGCTGTTAAATCACCCCTTTTTGAGTTTGGTTCTTTGAAAATCCCCTTCCAAGAAGTGTGCTGCAAGGTGGTTTTGGGTCAAGTGAAAGAACATATTTTATTTAAAATATAAAACATAAAATTTAAATAAAATATGTTAATTTAGACTATCAACAACTAGAACTATCATTTCAACTACTGTGCCCACTGGGCAGTGATTCATATAAGTATATAATCGTATAGGCATGGGTAGTATAGTGATCCAAAGGAGTGCACAATCAAAGGCTTTATATCATATTTATATCCTTAAAATCCATTATAGTAATCATACAAAATGCATACATAAAACTGTCATTTTACATGATAATTCTGATAATTCAATTAATCAATGTCGATTAACATATTTTTGACTTACTAGGAAGCTCATGAGAGGAACAAATTTTACATAAACAGAGAATGTTAAGAAATTTTTAAAAATAGAAAACGTTAACAAATTTAAGCTTGCTTAAGCTAAGAGTACCTAAGATTTAAGGAAAAAAAGAAATTTCAAGAGTTGATTCGATTAACAATTTTTTAAAAATATATAAATTTATCACTAAAATCTCCAATGTGTCAACAATTTTTGAATTAAAAATATATAAATTTATCATTAAAATCTCATAAATATAAAGTAATCAAATTTTAAATGAAGAGGAATATATATATGCTGGAATGGGATGGGAACATATGACCGAGATGAGTCTTCGAATGTGATTAATTTGTGCTTACTGAGATTGGTTTTCTCACTTTAGTAGCTTTTGCTTGTGTTGTGAAGAGGAGGGAGGTTAGAGTATAGTTGGCCAAATAAATACCTCAATTATAAAGAATCTCTTAAAGCACCCACGCAACAAATTCTTAAAAAGATGATTGTTATTTTAGACTATCAAATAATATGTTATTCACCCCTCGCCTTGGGCACACAAAAGTTCCAAAACTGATCGAGGAGCAAGCAATCCGATTCTTCGAAAATAGTTGGGATGAGGACGTGCACAAGATTTGCTCGATTCCTATTTGCAAGACAGTGAGATCAAATAAAATGGCTTTGGTACTTTACAACAAATGGAATTTTTTTCCACAAAAAGTGCATATAGGTTGTTTGTTGATTGTAACCAGAATAGAACCTTCAAGATGGAGGCTGTTTGGGTGAGAATGCGTATAGAGGGTGGAATGGAAACGTGA

mRNA sequence

ATGAACTTCCCTAAATCATCTCTTCAACCTCTTCACCCATATTCGCTACGGTTGATTTTTTTCGAAATGATTCCGAGTAGTAATTCAGGCAGCCCCTCTGCAATTTCTATGGCAAAGGAGGCGTTAAACTGCTCACTTGCTGAGATTTCCTTTGAAGCTGGTCTAATACATCATAAAGTGAAGATTATGATGTGGACATTGTGCAATAATATCCTTCAAATAAAAACCTCTATCAGAGACACATTACAGGTAACGGATGGTGTGTGTTGTGTTGTGGGAAGGAGGAAACTATCAAATAATATGTTATTCACCCCTCGCCTTGGGCACACAAAAGTTCCAAAACTGATCGAGGAGCAAGCAATCCGATTCTTCGAAAATAGTTGGGATGAGGACGTGCACAAGATTTGCTCGATTCCTATTTGCAAGACAGTGAGATCAAATAAAATGGCTTTGAATAGAACCTTCAAGATGGAGGCTGTTTGGGTGAGAATGCGTATAGAGGGTGGAATGGAAACGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAACTTCCCTAAATCATCTCTTCAACCTCTTCACCCATATTCGCTACGGTTGATTTTTTTCGAAATGATTCCGAGTAGTAATTCAGGCAGCCCCTCTGCAATTTCTATGGCAAAGGAGGCGTTAAACTGCTCACTTGCTGAGATTTCCTTTGAAGCTGGTCTAATACATCATAAAGTGAAGATTATGATGTGGACATTGTGCAATAATATCCTTCAAATAAAAACCTCTATCAGAGACACATTACAGGTAACGGATGGTGTGTGTTGTGTTGTGGGAAGGAGGAAACTATCAAATAATATGTTATTCACCCCTCGCCTTGGGCACACAAAAGTTCCAAAACTGATCGAGGAGCAAGCAATCCGATTCTTCGAAAATAGTTGGGATGAGGACGTGCACAAGATTTGCTCGATTCCTATTTGCAAGACAGTGAGATCAAATAAAATGGCTTTGAATAGAACCTTCAAGATGGAGGCTGTTTGGGTGAGAATGCGTATAGAGGGTGGAATGGAAACGTGA

Protein sequence

MNFPKSSLQPLHPYSLRLIFFEMIPSSNSGSPSAISMAKEALNCSLAEISFEAGLIHHKVKIMMWTLCNNILQIKTSIRDTLQVTDGVCCVVGRRKLSNNMLFTPRLGHTKVPKLIEEQAIRFFENSWDEDVHKICSIPICKTVRSNKMALNRTFKMEAVWVRMRIEGGMET
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC08G152050.1CaUC08G152050.1mRNA