CaUC08G147230 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTCAAAAATTGGGAAGAACTTTAACAGCCATTAACGAACTAGTCCCGAAGGCGCAAGCTTCTTCTTCTCTTTTGCAGAATTCTCCAATTGCTGCGTAGACTCCAGGAAAGTTCAATTACCAGATAATTACTTTGATCGATTATTTTACATACCTTTATCGCCATGGGTTGCTCCTCCTCTGTCCCAGGTATTTTCAATTCTTGAATTTCATTGCTTCTGCTTTGTTAGGGCTATCAGATTTTTTGTACGTTTATTTAAGTTTGATCAAAGAGGGTGTATTGAGAATTTAGGAGGTTGATTGTTTGGTCTGTTCTAGGTTGTTAATTTTGGAGTTTTCTGGGTTCCTTGATTTTCTTCAATGGGGTCATTAGGGTTTGGTGGGTTTTGCCTTAGGTATCTACTATTCAGTTTTTACTGTTACTCACAGGAGTTTTGTTGAGTTTCATTGATCTTTTGGGGGTTTATAATGCAGACAGGGCTTCTGGGCGATCGGGTGGGCTTAATCCAGAGAACAATGCAGCCGATTCCAAGAATTTGCGCGTCAAGGTATTTGAGGAGCAGCCAATTTATTTCTTTGTAGTCCTTTCCTCTTCCTTTTACTGTTAACGGACTCTATTTCAGTCTGATAATTGGTAATTTTGCTGACGTACAATTTTTTCCCGTAAGAAGACAATCATACCATGGCTAAGATGCAACAATGCTTTCCTCTCTCGGGAATTGATAATTGAGTTATATATGTTTTTGAATTTGATGATATTTGAAGTTAAAGATATGTTTATATGTCAAATATTGTGCTTGCTTAGAATGCTTAAATGTTTTTATGATATTTTATTTTTCCTTCGTCTATTTCTGTCTTTGTGCAGCTTGTCCTGCTAGGTGATTCTGGTGTCGGTAAAAGTTGTATTGTTCTTCGCTTTGTCCGTGGTCAGTTTGATCCAACATCTAAGGTTAGGACTATGTTACAGTCCATAAATTTTTAAAATAAATATATGCTTAATACAAATAAATTAACGTTGTTATTGTTTCATTCCCGAAGTAATTACAATTTTTTGATAAGACATGTTTATTGAGAAAATTCAGGTAACAGTTGGAGCATCATTCTTGTCGCAAACGATAGCTTTACAAGATTCCACGACAGTGAAGTTTGAAATATGGGATACCGCTGGGCAAGAGAGGTAGGATTATCAAAATCTTTAGTTGGTATCCTCGAACATGTGTTTTTAACTTCTTAGCAAGTAACCATGTTCTCATTGGAAGCCCTTTTCTGGTTTTTCATGTCCACAAGAGCCTTTTGTTGCATTAGGTTGTCACTATTGATTTGTCTTGATTTAGGTATGCTGCATTAGCTCCACTTTACTATCGAGGTGCTGCAGTTGCAGTTATTGTATATGATATAACAAGCTCAGATTCCTTCGCCAAAGCACAATATTGGGTTAAGGTATATTTTTAAGTGATTAAGTAGTTTCCGACTTCTGTTCTATATTTATTATGAGGCAATTCCTCATTAGTGGAGCATCCCACTCACTGTTTGGAACAAAATGGAATTTTTTGTAATCTATGGGCAGATTATCAGATAATCACATTCTTCACTATCTGTTATTCTCTTGTATCTTCTCCATAGTTTCTAGTTTACGTGCATGGTATATGGACTTTTTGCTTTTCTTTTTGGGGGAAGGAAACAAAACAGCAATTTTCTTTTCTGTGTTCATAACAATCAATGCCGATCATGTTAACACTTTTAGTTTTTTTTTATAAAATTTCCCCACCCACTCAAGGCCTTCACACAATTGGTTGTTAAAAACTTATTACTCTTTTGTGTTCATGTTGATTTGGTTATCCTTTGAGCTTTGACTAATTCACAATCTTCACAATTCATATTGGGCACTTACAGGAGCTACAGAAGCATGGCAGCCCTGATATCATTTTGGCATTGGTTGGTAACAAAGCTGATCTTCAAGAGAAAAGGAAAGTATCTGTTCAGGTACGTTCAGAGTTATTCAATCAAATGCATCCTCTTCTTCTCCTGTCTTCTTTATTTATTCTTAGTCCAATTTGTTTTTTTTTCAAAATGGGGAAAAGATATTTTAACTCACTAATAGGGGTGTTAAAAAAATCGATGACCCGAAAAACCTGACCAACCCAACCCAACCTGTACGGATTGGATTGGGTTATCAATTCATTTGGATTGTATTGAATTTAAATAAATGAAAATATTATGGGTTTCATTGGTTCATGGGTTCGCCTAAAATAACCCAAACCAACCCGAACTTATTATTAATTTTAAAATGTATACATATTTTTACTTATGATAAAATTATAGATACATATATTTATTTTAGTTTTATTTAATTTCATGTTTTTTTTTTTTTAATTTCTTCTCCAACAACTCCTAAAAACAATTTTTTAGGGGAAATAAAATTTTCATACTATAAAATTGAACTTGAGTTGTTAATTCTAATCCAATATATGAAAATAATTAAATAATTTTTTTTACATATTAACATTTTACTTCTTTTAGAATAAAAATCTGAATAAATAACTCAATTAACCTGAACCAACCCAACCCAAAAGTTTCATGGTTGGGTTGGGTTGGGTTAATTTTTTAATAAGAGTTATTCGGGTTGAAGAAATTTACAACCCGAATAATTGGGTTGGGCCTAAAAAGTCCTTCAACCCAACCCACGAATACCCCTACTCACTAATGTGAGATATTTATGTTTCACTTTTGAAGGATGGGACTGAGTATGCAGAGAAGAATGGAATGTTCTTTATTGAGACATCTGCAAAGACTGCAGATAATATAAACGAGCTGTTTGAGGTATTCCTGATTTTATCCTTTTTGTATGATTTTCATAGCTTCTGTTCATAAACAAGTAAGGTAGATAATTGTGCATAGTGACTTCTTATGATATTCCACTGTTCACTGAGCGGTAATAAACATTTGAATATTGCTGTTTACGGTTATAAGTTTAGAATCTGCTTAAGTCATTGTCATAGCGAGTAAACTTTATAATATTCGTTAGCGTTATGGAACTTTAGCAAACCAATTCTCTATTGGTGATAGTGTTGAACTCCAGAAGGTGTGAGGTTGGAACGTTCTTTCACCCCAGCTTTTTGTTGGTGGTTATCATTATGCTTTCTCATAAGGTGTCAAATCAAGTTGCATGCTGCCAGAACGTTCACCTCAGGTCTCTATTGGTGGTTCTATCATGATTGCTCAGCGCCACCCTTAAAATGTGGCCCGCAGGAGGACAATTTTGACTGAAAATTTTCTGGCTGTGAGCTCTTAGCGGATTTGTTGTTTGGATTGAAATGCATTTTTTTACCCCTAATTTGTCTGTAGTGCATGTTTTATTGAACGTCTCTCACTCTAGTTCATGCTTCTATTGTTGAAAGATTAGGATTTTAATTTTATTATTTTTTTCTTGGTCTATGCCCTTTTTTGTTGAAGGATGGACTACTAGTCCCTCTGTTAATTTGATAGTTAGTTTGTATATTGGTTAAACTACCATTTTGCTTCCTATACTTTCAGATTTGTTTAATTTTAGTCCCTGTACTTTCAATGAAATCTTAAATTTAGTCCCTCGGCTCAAAGTTAATTTGTACCAAAATTGGTCAAATAATAATAATAATTTTCATGCAAACAAATATGATGTGTGAATATATTTTCAAAATTTATAGTAAAAATGGTAATAGAAAACAAAAAAATTTTTTAAAAGTCAACAATAAATTAACATTAGAGACTAAATTTAAGATTTATTAAAAGTACAGGGACTTAAATTGGACAATTGAAAGTATAGAGACTAGAATTGAACAAATTCCATAGTATAAGGACCAAAATTGTATTTTAAGTTAACCTTGTATGTTTTATCTGAAAATTGAAATCTTTGAGCAACACATTTTGTGGCCTGAGTTACGTGAAGATGTTCGATAGTTGTCGTGATAACTTAGTGATGCGAGACCCTGTCTCCCTTTCGCATAAAGTTTCTCTAGAAAATGTATGTCAGTCACACTGAGATGGGCAGTTTAAGATCCATGGTTTTTTGATTTGCCAGATGTTTCATTTCAAATACATTTCGAGATCAACCATTTCTTCTCTATTTGATTTGGCAGGAGATTGCGAAGCGGTTGCCACGACCAACTTCCTCATGATCTTGCATGACATGAATGATGTTGTCAGCAGCTTATTTTACAGGAAATCAGCCTGCCCCCATGTGATCTTTGTATAGTTTGGTGAGACCTTTGTTATTTGATTTGACTTGTCGATATCTTCAGTCTAAAGTGTAACATTAAACAGATATGAAAATGGTGAAAGATTGATTCCCTCTTAAACCGTAAGCTGCATTTGTAAACTATATTTCCTGTGACTGATAGAAACATTACTTTGAGATGATATTCAATGGAGACATTTAAACTCTATTTGAGATCTTTAAATGCATTGAAGGGATCAAATAAAGCATCATGTAATGGCCTTTGGTTATTTTCTTTCCCTGGGGTTTTGATGGTTTCTTTTGCCATTTTCAATTAGATGTCCAATAATTTAGAGGGTGAAAAGTTGGTTGTGGTGGCCGTTGGACCGACCCATCACCGATTATTGATCAGAGGCATATGAATAAGAAAAAGAAGGGCAAGTTTAGGGTTTTAATGGGATAAATTGACTTTTTTTTTTCTTCTGAAAATTTAATGAGTGTGGGTGGTTTGGATGTTAGAGAGAAGAAAATAGTGGGAGGATAATAACAAAATAGGGTCTTTCTTGCATGTGAGAGAGTAGATTTGACCCTTAAAGATAGATGTATTTATAAAAGGGGAAAATACTAGGGAATCAATTGGAGGAAAAAGACTTACCTACTAGTTGACCAATATTAAGCCCTTCTTCTTCTTCTTCTAACAATGTCAAATAACACTCAATTTTATTGAAAGATTGTATAGAAACCAATTGTAAACTTCATTGACCAAATAAAAATGTACATTGAAACACTTTTGAGACTTAAAAG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MGCSSSVPDRASGRSGGLNPENNAADSKNLRVKLVLLGDSGVGKSCIVLRFVRGQFDPTSKVTVGASFLSQTIALQDSTTVKFEIWDTAGQERYAALAPLYYRGAAVAVIVYDITSSDSFAKAQYWVKELQKHGSPDIILALVGNKADLQEKRKVSVQTSAKTADNINELFELAVAAVATAAGGSILLQPSLSSNDRGTSGHAIESYRNKINDPTAVVPPRSVQESALIGASPVNPLDILVVGGGATGCGVALDAVTRGLRVGLVEREDFSSGTSSRSTKLIHGGVRYLEKAVFNLDYKQLKLVFHALEERKQFIENAPHLCHALPCMTPCFDWFEVIYYWIGLKMYDFVAGRRLLHLSRYYSAQESVELFPTLAKNGGGRNLKGTVVYYDGQMNDSRVNVGLACTAALAGAAVLNHAEVVGFLKDEASDRIIGARIRDKLSGREFDTYAKVIVNAAGPFCDSVRKMADKEAVSMICPSSGVHIVLPDYYSPEGMGLIVPKTKDGRVVFMLPWLGRTVAGTTDSNTGITMLPEPHEDEIQFILDAISDYLNVKVRRTDVLSAWSGIRPLAIDPSAKNTESISRDHVVCEDYPGLVTITGGKWTTYRSMAEDAVSAAIKSGKLKPTNECVTDKLRLAGGDGWEPAYFTVLAQQYLRMKKTHSGKVVPGVMDTAAARHLSQAYGVLAERVAAIAQNESLGKRLAHGYPFLEAEVAYCARHEYCESAVDFIARRSRLAFLDTDAANHALPRVIEILAAEHNWDKSRQKQELQQAKKFLETFKSSKNAQFHDGKHN Homology
BLAST of CaUC08G147230 vs. NCBI nr
Match: XP_038886269.1 (glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038886271.1 glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1228.0 bits (3176), Expect = 0.0e+00 Identity = 612/623 (98.23%), Postives = 619/623 (99.36%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. NCBI nr
Match: XP_008456517.1 (PREDICTED: glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X2 [Cucumis melo] >XP_016902020.1 PREDICTED: glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X1 [Cucumis melo] >TYJ99994.1 glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1224.2 bits (3166), Expect = 0.0e+00 Identity = 610/623 (97.91%), Postives = 620/623 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. NCBI nr
Match: KAA0036492.1 (glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1223.4 bits (3164), Expect = 0.0e+00 Identity = 609/623 (97.75%), Postives = 620/623 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. NCBI nr
Match: XP_031743894.1 (glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031743895.1 glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN47842.1 hypothetical protein Csa_003650 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1219.5 bits (3154), Expect = 0.0e+00 Identity = 606/623 (97.27%), Postives = 619/623 (99.36%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. NCBI nr
Match: XP_022134217.1 (glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022134218.1 glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1195.6 bits (3092), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/623 (95.51%), Postives = 609/623 (97.75%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SS48 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SDP6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1028.5 bits (2658), Expect = 4.1e-299 Identity = 504/617 (81.69%), Postives = 560/617 (90.76%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q64521 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial OS=Mus musculus OX=10090 GN=Gpd2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 534.3 bits (1375), Expect = 2.4e-150 Identity = 298/620 (48.06%), Postives = 392/620 (63.23%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4R755 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial OS=Macaca fascicularis OX=9541 GN=GPD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 531.9 bits (1369), Expect = 1.2e-149 Identity = 301/634 (47.48%), Postives = 397/634 (62.62%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P43304 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GPD2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 531.2 bits (1367), Expect = 2.0e-149 Identity = 300/634 (47.32%), Postives = 397/634 (62.62%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A6QLU1 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial OS=Bos taurus OX=9913 GN=GPD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 530.8 bits (1366), Expect = 2.7e-149 Identity = 297/634 (46.85%), Postives = 397/634 (62.62%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4P9 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496445 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1224.2 bits (3166), Expect = 0.0e+00 Identity = 610/623 (97.91%), Postives = 620/623 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BLS6 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold360G00390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1224.2 bits (3166), Expect = 0.0e+00 Identity = 610/623 (97.91%), Postives = 620/623 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SZ40 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold147G00610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1223.4 bits (3164), Expect = 0.0e+00 Identity = 609/623 (97.75%), Postives = 620/623 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KHI3 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G406540 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1219.5 bits (3154), Expect = 0.0e+00 Identity = 606/623 (97.27%), Postives = 619/623 (99.36%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BZ13 (Glycerol-3-phosphate dehydrogenase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006529 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1195.6 bits (3092), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/623 (95.51%), Postives = 609/623 (97.75%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. TAIR 10
Match: AT3G10370.1 (FAD-dependent oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 1028.5 bits (2658), Expect = 2.9e-300 Identity = 504/617 (81.69%), Postives = 560/617 (90.76%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. TAIR 10
Match: AT3G54840.1 (Ras-related small GTP-binding family protein ) HSP 1 Score: 276.9 bits (707), Expect = 4.9e-74 Identity = 147/189 (77.78%), Postives = 159/189 (84.13%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. TAIR 10
Match: AT3G54840.2 (Ras-related small GTP-binding family protein ) HSP 1 Score: 276.9 bits (707), Expect = 4.9e-74 Identity = 147/189 (77.78%), Postives = 159/189 (84.13%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. TAIR 10
Match: AT5G45130.1 (RAB homolog 1 ) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 2.6e-43 Identity = 89/163 (54.60%), Postives = 120/163 (73.62%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G147230 vs. TAIR 10
Match: AT4G19640.1 (Ras-related small GTP-binding family protein ) HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 5.9e-43 Identity = 88/163 (53.99%), Postives = 120/163 (73.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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