CaUC03G060400 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGTTAATTTTTTTTTTCCTCTCTCTCTCTCTAACACTTCTTCTCTCCTTCATGAAACAAGCAGCCAGGACCCCATTCTTGAACTTTCTCCCTCATCTTCCTCGTGCTCATGTAGCCTCGCCTTCATAGGTCATGGGCTCTTAGCGATCGATCGTGGATGTCTCTTAGCCATAGCCCCTTTCCTTCGTTCGTGGGTCTCTTAGCCACCCCGTCGTCTTTTTCTTTACCTTCTCTCATTGACATCATACCAAATTTCTCTCTTTCCTTCTAAATATGGCCCAAGAATCCTCCAATTCCATTTTTGATTTCACTGTCAAGGTAGTGACCTTCATGCCTTCTTAATTTATTCTGTTTGGTTTCTAAGAAACCCTCAATTTCTAATCTGAGATACAAAATCCTCCATGTTGTTATTCTTCATTTTGTTGACTTAGGTTTTGATATTGTTGAATTGGTTTGTTTGTTTATTTCATTTCATTTCTTCTAATGTATATCTTTGATCAGTTGGCCATGATTTTAGAATGTTTATTTTAGAATGTTATTCTAGAAAGTTCATTTCAGTTTTTTTTTTAGGATTGCAATTTAAAAAAGCAAGTCATATTGTTGTTGAATATAAAAATCAGCATTGAGTGATTGGTTGCAATGTGGACAGGTTTTGCCCTCACTTCTAGATTTCTCGACATCTTTTTCCACTCAATCTTATGGATTTTTGTCTTTGTATTGGGAAGATTCCATTTGGTCAATTAGAAACCCCGTTATATTCAAATCTTAGTTGTATTTACCAATTACTATCCATGGTGGTTGTTTTCATGGTTCATATCATCGCTTTATTTTGATTCTTAACCTAAAAAAAGAAAATGAATAAAGCAAGTGTGTGTGAGTTTTTTTTTCTCTTTAAACAAGTTACTAAAGGAGGTGTGTGAGTACCAAATATAAACACATCAAATTGACCAAAAGCATCTTGTTCTAGTTGCATTGTGTATTACCAAAACTAGTTAAACCAAAGTGGGTTATTTGGTTTAATCTTGAAATGGAACTGAGAAATGATATCTTGATAAGGTTTGTAATCCTAGTTTATTTATTTATTTACTTTTAAATTTGTGCTTGCGTTGGTGTGTAATTCTTATTTAATTTTGAAATAGAATTGAGAAATAAGATATTAAAATATAGAAGAAGCTCTGCTACAAAGGATCCCTCTAATTCTATCATGTGGAAGAACACTGTCGTGAGTTGGTCCTCAATCAAGGTCTCAAGCTAGTTCAGGTCTGTGATTTTTTAATTGTATACATAACCAAAATGGGCATTACTATAACACTTGGTATGTTAGTCTTTATATGCTTCTACAATTCTATTATTGTGTTTACATATTCTTATCTTTGCTCTACGAAGCACTTGGATTTGATATATTTCAGGTTTAATCCAAGATTTGTTGCAAATGTAATGTCAATATGGGAGAATATGTTTGCACTCTGATATGTTCTTATTCTTTGTTTTGTTTCACTTTCTTTAAGAACTAATTTATTAAACTTCGGCTTTTTGTGTTAAGTTTCTAATTATAAGTATTCTTTATTATATCATTTTCAGGGTTAGTGGTCGTGAAAATGTCTTTTATGCCTTTTTACTTTTTATTCTTAGTTGGTTCTGAGATAAGAACCTCTCTTTTTATAGAAATTAAATCTAGTAGGATTACTCACTCCCTAATGATTCTAATTATACAGGTTTAAGCTTATTAAAACACTAGTCAATAAGGTTTCAAAGTTGTTTTGGGACGTTCAATAGATAAAATTATTCTTTGAACTCTTGAACTCTTAGTAATTGCTATAAATTAGTTTAGAAGTCTTGGAAATGTTTTGCTTGTAGGTCTAGATTGATCTGGAGTGTTTGAATTCAAATTTAACTTTGTTTTTGGATAAGAACATATCTCCAAAATGCTCTTTCAATTTAAATTTAGGACTTTGAACTCAATTGTAATCTCCAAATTTAAGTTTATCTGGAAGTTTATGCGTAAATATTTAGTAAGTAAAATTCTACTTTGGGTTTGTTTGTTTTATGTTAGTACGTTGTGTATTTTACTTAATTAATTATAATATGTTGCATGAATATCTTTATGAATAATATTTTCCTTCTAATTAAATTTGATTGTAGATTGAGATTTCTAATTAAGTCTTGAACTCTTTGTTTGTAGTCCTAGATTGTTTCAAAGTGTTCGAACTAAGTTTTAAGGCTCTTGTCAAGGTTAGAATATCACCTTTGAGCATGATGAATATTTTATACTATGTATTTTGTGTGATGTTTTGACTACATGGCATGGATGGGACTTTTTGTGTGTTATGTTTTGAACATTTACCTCATTTGACTATATTCTTTCCAAAAGATTGTGAGTGTTCTTACTTTGTGGAAGTGAGTTTTGATATCAATATTTTGAGCAAGATTGATATTTAATGAGTTGGGAAGATTGTGAACCTTAAGAATGTATAACTTATGAATATTGTTATTATTGTCCACATTGATGTATATTGAGTCGAGTTTTGAAATGAACGTTGTTTTTTTACTAGGTATTGGACAGACCCATTGGAGCAAGGAAACCACCAAGGAAAGTTATTTATATGTTTTTTTTTTCTTTTTTTATTATTGTTTGTATAGTCCTAACACTTTTTTGGCAGCTCTTAGTTGTATTTAGTTTCTTTGTAAATAACTTAACCAAAGTTTGGTTACTAGTTTCCTTGTAATAACATTACCAACTTTTATTAGTATATATGAAGTTTCATATTTATGTTTGTACATATTATGTCAAAATTGGTGGAAATATATTTGTAATGATAGGTATGAAATAAATAATTATCCATCAGCATAAGCATTTCTTTGACATTTCACAAATGTCATAAAATGTATTTTTATGACATTGAAATTTCGTCATCGATTGAACTTCAATGACTATAAATGTCAATATAAAAGTTTAGTTCACAGAAAAAAGTCAATTTTTTAGTTATTTATTGATAATGAAAAGTAGTCATAGATAATGTTTATTGTTGACTATATTGAAAAGTCATGAAACAACAATTAGTGACAAATTTTTCTTGTGTCATCTATGCACTTTCCTTGATTATGGATTCACAAACTAAAAAAAAGAGTCAAGAAATGTGCTAATGACTACTTTTTAGAGTCATAAAAATCCATTTTTGTTGTATTGTTCTTTTAAAGTTCAAACAACAAGCCTTGATCAGTTGCATTTTTCAATCTATAATTATCAAAGATCTCTAATCAAGAACCTATTGTTTCATCTAGTTGCTCAATCATATTCCTGCTTTATTGCTTGATGATTTTATCAATTGTGGGAACAAATTTGTTATGTTCCCTAATTTGGGCGTGAGCTGAGAGTAACCAATTCTCCACCTATGAATGAAATTCATTCTCACAAACAAATGTGGTATGCTTTCATCCTCTCTCAAAGTTTTGATGTGGGTGCATTGATGAAAAATGGGAAAAGGAGAGTCACACTTGACTTTTACATGTGTCAAGGTTGAATTTCTTCATTCGAAAAAAAAGAGATGACATATGTTGATGTCAAAAATTTGGATAGAGAAAATGCAGTTGACCTTCACACATGTGACAACAATAGTAAATTTGTAATTTGGAGAGAAGATAATATATAAAACAAAGAAAAAAAACTCAGATGTCAAAGTCAAAGATACGAACTCTAGGATGGCAAACCAGCAGAAGTTAGAAGCTTAAGTTTCCGATTTAGATGAGTTAAATTTAACTCATATAGAGTTATAATAATGTACCTATAGGATTAAGATAATATGGATCTTTCCTTATCCTACATATATAAGTTAGAATTAGATCTGCTTGAATAAATGATTAGTTGACATCTGGACTTATTTGATTCCATATCCATTTTATCTTGGAATTATCTTCTCTAATCTTTTTCAGCCTTTGATGTATTTTATCTAGTCCAAATCATCCATAACAACATGCAAAATTGATAAAAGAGTAACCAATGTGCCCGCTCCAATGTCTTTGTTAAATATCGATAGCTAGTGTATAGGTATTTCGAATTCCCAATTAATTTCGTTAGGGATTTCAACCCAACAAGAACTTGCCATGTGGAACCGATTTGGTGAACATATCAGCAAGATTATCACATCCCCCATAGCAGCAAGTTACTAAGCAAACTCACTACACGAAACATGTTCTTTATAGGTGGATGAATCATGAGGATCCACCTCTTTAGCATCCTCTAGTCCATAATTCACCATATCTTCAAAACCATACCTCTTTGGAGGCCGATACCAACTCTTATAGTACTATCACAAATTATACTGGGTGATCTGTTTGTCGACTAGAATTCTCAGGCACAACATTTTCTGAAATTTCAGTCATCTCAGTTTCTGGCAGCATAATAGTTTCTGTAGTAACATGTTGATCTTCTCCACCTTGGTGTTATAATTCATTAACAACTGAAATGAATTGCATCTCCACCTGTTTATCAACATTACTACTCTTTCCACACCATTAGACGTGACAATAAACTTTACATTTGAGTTAAGCATGGAATTCTCATCAAAGGTCACATTCCTACTAACTATAACTTTACTCTCAGAAGGTGACCAAACTCCATATCCCTTTACTCCATCTCCAAAACCCACAAATATACCATTTTTAGCTCTCGGTTCTAAATTTACCCTCATTAATATGATAGTAGACAATATAACCAACAACTCTTAATAAATAATAATTTGCAAGCTCACCAGACCACACTTCTTAAGGTGTTTTCCTATTAATACCTGTGTGAAGTCTACGGTTGATCAAATAACATGTTGTATTTACTGCCTTTGCCCAAAACCTTCGAGTCAACCCAACATTAGAGAGCATGTACCTCACTCTCTCCAACAATATCTGATTCATACGTTTTGCAACTCCATTCTGCTGCGGAGTATCCCTGACAGTATGGTAACGAGAAATTCCCTCAACATTACAGAACTCATTGAACT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MKRIMGFYGINSYFPVFIVFLIINFVKINVVCQEVKFDQNYVVTYGQDHFFRLGGGTEVQLSLDRASGTGFKSKIGYGSGYFHMKLKLPSRHSPGVVTTYYLHSSPDNNGGVHDEVDFEFLGTDGPLYILQTNVFADDNGGREQRLRLWFDPTLAFHDYAILWNSHQIVFFIDGIPIRVFKNYTSIGGRYPSKAMFVLGSIWNGEEWASGGKKVDWSQAPFQANYKVFRILGCPFGNHCDSQAFLWNKADTWQLNPKQQKMYQLVKTKYVYYSYCSNPKAHQLYKECQFE Homology
BLAST of CaUC03G060400 vs. NCBI nr
Match: XP_038877581.1 (LOW QUALITY PROTEIN: xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 506.1 bits (1302), Expect = 2.0e-139 Identity = 236/288 (81.94%), Postives = 254/288 (88.19%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. NCBI nr
Match: KAE8653589.1 (hypothetical protein Csa_007107 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 490.7 bits (1262), Expect = 8.5e-135 Identity = 225/287 (78.40%), Postives = 255/287 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. NCBI nr
Match: XP_022987397.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 453.4 bits (1165), Expect = 1.5e-123 Identity = 210/286 (73.43%), Postives = 241/286 (84.27%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. NCBI nr
Match: XP_022961348.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 451.1 bits (1159), Expect = 7.5e-123 Identity = 208/286 (72.73%), Postives = 240/286 (83.92%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. NCBI nr
Match: CCH26640.1 (putative xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 447.6 bits (1150), Expect = 8.3e-122 Identity = 212/291 (72.85%), Postives = 243/291 (83.51%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SV60 (Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=XTH2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 9.9e-70 Identity = 135/265 (50.94%), Postives = 174/265 (65.66%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SV61 (Putative xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=XTH1 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 260.4 bits (664), Expect = 2.5e-68 Identity = 139/285 (48.77%), Postives = 187/285 (65.61%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LJR7 (Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=XTH3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 244.2 bits (622), Expect = 1.8e-63 Identity = 126/283 (44.52%), Postives = 179/283 (63.25%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q41638 (Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein A OS=Phaseolus angularis OX=3914 GN=XTHA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 6.1e-59 Identity = 120/263 (45.63%), Postives = 165/263 (62.74%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6YDN9 (Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase OS=Brassica oleracea var. botrytis OX=3715 GN=XET16A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 3.9e-58 Identity = 116/252 (46.03%), Postives = 168/252 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JA91 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484959 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 453.4 bits (1165), Expect = 7.3e-124 Identity = 210/286 (73.43%), Postives = 241/286 (84.27%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HBJ0 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461864 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 451.1 bits (1159), Expect = 3.6e-123 Identity = 208/286 (72.73%), Postives = 240/286 (83.92%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: N0DX90 (Putative xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=xth30 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 447.6 bits (1150), Expect = 4.0e-122 Identity = 212/291 (72.85%), Postives = 243/291 (83.51%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: N0DX41 (Putative xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=xth26 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 386.7 bits (992), Expect = 8.4e-104 Identity = 183/271 (67.53%), Postives = 211/271 (77.86%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KXI7 (GH16 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G308600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 4.8e-99 Identity = 179/271 (66.05%), Postives = 208/271 (76.75%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. TAIR 10
Match: AT4G13090.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 2 ) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 7.1e-71 Identity = 135/265 (50.94%), Postives = 174/265 (65.66%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. TAIR 10
Match: AT4G13080.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 1 ) HSP 1 Score: 260.4 bits (664), Expect = 1.7e-69 Identity = 139/285 (48.77%), Postives = 187/285 (65.61%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. TAIR 10
Match: AT3G25050.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 3 ) HSP 1 Score: 244.2 bits (622), Expect = 1.3e-64 Identity = 126/283 (44.52%), Postives = 179/283 (63.25%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. TAIR 10
Match: AT2G06850.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 4 ) HSP 1 Score: 222.6 bits (566), Expect = 4.0e-58 Identity = 119/279 (42.65%), Postives = 178/279 (63.80%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC03G060400 vs. TAIR 10
Match: AT5G13870.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 5 ) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 7.6e-57 Identity = 114/271 (42.07%), Postives = 166/271 (61.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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