MELO3C019565.2 (gene) Melon (DHL92) v3.6.1
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAGAAACAAAATTGAGGCAAAAAGAAGAAAAAGAAAAGAGAAAGGAAAACGTTACTGACGAGCAGAACAAGACGAGGAGGAGAAGAAGAGAGATAGAGGGAGTGGGGGCATGGACGCACTGAAGTACATCTGGGAAGGTGCAATTCCATTACAGATTCATCTCCATGAGTCTGAAGTCACCACCGTCCCTCCTCCACCACCTGCAATGGTAAGTCTCTGCTTTTCCCCTTCTGCTGCACTTCCCCTTTTCGATCTATCTGATTTCTTCAACCGATGAACATCATGGGTTCATTCTGTTCATTTATCTCTTTTTCTCTGAGAAATTTGAGTTTGGGTACAAGGGTTGTTAGTACTTCCTGCTTCTTGTGTTTTCAATTTGGTGTTTTGAACGAGGGATGCTTTTTATGTGTCTAATGTACGCCCAAGTAGAACTTTGATTGAGCTTAATCGAATTGAATTGCTTTTCATATGGGATTTTGTTTTTTGATCTACTTTAGGTCTTAGCTCCTCGGATTGGCTACCTGCCTCTGTTGGCTTCTCAGATTAAACCTTACTTCGGTAGCACGCTTCCTCCTGGAGTTGACACCATCTGGTTTGAGTACCAGGGTTTGCCCCTTAAATGGTACGCTCTTCTTTGCTCTTTTAAATTTCATCTTTTGCTAATAGTTTGTTGCAATTTTGTAGATTAGTTTTAACTTTCTTTAACAATCTGCCAATTGATTCTCTCTTTTGGGGAAGTACTTGTGGCTGTCTAACATAATTATTCATGCTACTTTTTTGCTTTTGATCCAATTCTTTCTCCCTCTCATTTGTATGTCTCACAAGATACATGGTGCACCATCTCACAAGGTACACTCTGTAGAAGAAGCTGAAAATTGAAACATGTTAAGTTAAGATTATTGTTATGTATTCTTTTTAGTAGGAAGGACTTCAGTTAATATAGAAACTGGAAAAAAGAAAATAAGATGTGATAGTTATCTCAACCTGGGCAAGTATGATTACAAACAGTCATCATTTAGAAGGGAAGAAGATGGTTGACACTCATGAAAAAGGAAAATGTAGAAGGGAAACAATATCACTGGTAAAGTAAAATAAATGAGAGGAAAGAAGAGCCTTCACCAATCCTAATGGGAATTATAAAAGGATTGGTAGCAACTTAGCGTATGTATATCTGTTTAAGAATGATTACAAAAGGCTTTGTTAAGTCTACAACATGAATATGCTGTTTAAAGGATGCAATCCCCAAGAAAGGGGGAAGTTTTCTCCAACCACTGGAAACACATTGATTCCATTTTAACCAAAGATTCCATAAAAATGTTGATCAAACTAATCCATACAGCATACAAAATTAGCCTTTTCCTTGGAGGTTGGTTTTGTAAGAGGTGAGCAGTCGAACTGGTTAACGCATATGCCCTGGATCAAGAAGTTTGAGGTTTCAATCCCTCCACCTGCACATGTTATTGAACTAAAAAAGGGGGCAGTGAAGATTGGAAATAATGTCTTTATCTCGTGGATGGGCCTAGCAAAAAACAGGTTGTACAAGTAACAAGATTACACATAGTGGAAACAAACTTGCAATGAACAAAAATGTGATATTGTTGTTTTGAGCTCCTCTTGCAAAGAGCAAACCAGTTAGGGGAGAGGATGCAAATTACTCTTCTGAATTTGTCATGGCTATTGGTGTTGTATAGACTATTTATGCCATTTACAAAATGAAAACCTCCCAATTGCCTTGCAAGAATCAGAATGTAATAAGTTCCTATTGACGTTTAGGTCTTGGGAAGAGACTTGCTCATTAAATATTCTGAAAGATCAAAAGTCCAAGATCGTGAATCTGGAAAACTAGAGGAGAATCCTTTCATACGTCACAAGGGAGAGAATCATTCTGCAAACATTAGTCTTTCTTGTGAACAAATTCCAAATCAAAAGTTTATTGACCAAATTTGGGTGACTGCGTTATTTGAATAAACGTAAAGGGAATAAAGTTCTGGGCAGAGGAAGCAAGGGAACCTCGTCAAGAGTCTTGATACATTCAACACTAAGAACTTTGGTTTAGGCTATCCTTTGCAATTCTTTGGTTGTGTGGACCTCCCGGCCATAACTTAAGGAAAATATCAGAAACGGATAATTTTATCAAGAGATCCAAGAATTCATTCTTATCATGGGTTGAAACACTCCACAAGTTTGGTAACTAAACTTGAATATCTCAAGATTTGCAATCTAGACACAAGGCTTGTACGGGGAGTTCACTCTCTAATATAAAAAACAATCAAAGATTCATCATCAGTGCTTTAGAAGAATATGACACTCCTTGAGTGTATATAGTCAATGGTGGAAAAAAAAGAGAATCTAAAAACCCTAGGTCTTGAAAATTCTTGAGGAGTTGTTTGGGAGGATGGAATGTAATCAAGATTATTGGGAATCTTAGGGATGTTGAAATGAGTGGGGAATTGAGGGAGGAACATGAATGGGATGATGAAGCTTCTACACGGTAGGAAAGAGTGTTGGATTGAAAACTATAGGAAGAGAATGAGTTTGGTATTACAAACAAGATCCAAAATGCTTTGAAATCTAAACCCATTACAAGCTCATTCCATTCCATCCTCCCAAACGTGCCCGAAATAATTTGGGGTGGTTCAAAATTTGTTGTAAGAATATGAATTTCAAAATAATTGAAAATTGTTCCATCTAACCTTCACTCCTAAAAATCATATAGTGTTAAAATAGCAAAATTTGAAACAAGCAAAATTCTTTTGGAAGGAGGCAAGGGACAATGGTGTAGGGGTGATGCTTAATAAGCCGCTGGTGGGCGTGCACCTAGGTGATTGTTGAGTAGCATGGGCGTTATGGGCAACATGGCTATCAACACACTATGCAAAGCAGGGCCATAAGGTAGGGTCCAAATGCACGGCATATGGTTGTGAGCGCATGTAGACTTGTGCTGATGGGGTTGGCTGTGTATGTGGGGTTCCTCCATGGATGCACGTTGATGGCTACATGAAGAAATTGCTAATGGGCTGTGGAAATCAGTCGTGCATACCCATGCACAAGTTGTCTGTGCAATGGGCCATGCAGATTTGTTGTTGGGCATTAATGGTGTGAGTGTGTGGATGGAAATGGACGGATGATTATTTAAATCAAAAAATGGACTGATGATTAAGTGGTGTGAGGAATTGAGCTTCCTCCTTAGAGTTTTTTGACGAGCTTACTTGAGCTTCTTGTGCAATGTCGTATTCAGCTTATTAGGTGGCTTCCAACTCTTAGGTCAGGTACATGCAATCTTGGATCTTCTTGGACTTGGTCCAGATTGTCATCACATCAGGTGGTGGCTCATAAAATGGTGCAAGACCATTTTCAAGAGAATGGATAACTCGGCAAGAGGTTAGCTTGTTTGTTTTTTAAATATCCTTCCAAGGGCATTGGAGTGCTTTGTTGTGTCATTCTGCCACTACCCCCCAGGAGAAGACCCAAATTTAGCTTCAATTATTTTCCTCGAAAGAGAGCATTTTTTTTGAGAGCATATAGCTGTGCCAACTACTAATAGACTAACACTCTTGAAATGACATAAAAAAAGTGAAGGATTCATTACAACAAGCTCTATAAACATCACTTCAATTAGAGCCACCAAAATAAATAAGCTCTCAAGATTTCAGAAAGTATTTTGAATCTTTCCTCTCCTTGAAAAACTATTTATCTATTTTTCTCAAGTCAAATATGTCTAATTGTGGGGGCAAAAAAGAAAACAAAAGGTAGTAATTCTTTAAGATCGTTGGGCTGTTTTCAATTATTATATTTTTCTGTTCTTAGTGGAGAAGCAGAATTTATAACTTATGATTTTCTAGATATTTGTTTCAAATTATCTATAATTTAGTAGGGGTGCAAGGGCAAATGGAAAAACCGATAAAACCGGGCGAAACCGTTGTTGGCTTGGTTTACTACCTGTTCGGTTTTCACATTTCAAAGAACTGTTTAAAATGGGTTGGTTTCAGTTTTGGAATTGAACAAGGATAATATAACCAAGCCGGCCGAACAACTATATCTATATTAAAAACAATTGTGTAAGCAACTTAAAGAGGCGGCTCTAGTGGCAACGTGTCTCAATTGAATGTTCTAGTGCACGAATTCAAGCTAGAATGAACGCAGAACTTCTATTTTGAATATGTTTAACACCCGAGTGCCACAAATTTCTTGACTTGCTTTGGGCTTGATCCAATAATACGTAATGGACTTGAATTGCATCATATATCCCTTCATGGGCTCGTGTTTGGAGAGACAATCGTCATTAATGATGTGAACCGAAACCGAACCGAGTAAACTGGTTTTCACCGGTTTGGAGCGGTACAGTTAATATTCCTACATGGTTCGGCACAGTTTTCTCATTCTCATTGTAATATATGGCAGTTCAGTTTTTGTTCGAGGCTAGAACCGAGCCGAACTGAACTGATTACAGGCCTATTATTTAGTACTATATCTGGAAGAACATAAGTGTTTAAGATGGTAATAAATAATACTTCAAGACCAGACTGTTATACAACTGAATTCTTTGAAAAGCATTGGAACATCCTTAAAAATGTATCAAAAGGGTGTTCCGAGACTTTCTTGAGAAAGCCATTATTGATGCCAACCTCAATCAGACTCATATTTGCTTGACTTCTAAAAAGATTGATGGGTTGGTGATTATTATAGATTGATCAGCCATACCACGTTTATACAAAATTAGTGCGCAAGTTATAACAGAAACTCTGAAGGGAGTTGTCCCCCATACACTCTGAAGGGAGTTGTCCCCCATACACTTTCCAAGAATAAATTTGCTTTTGTAGCTAATCGCCGAATCATTGATGCCTCCTTAATTGCTAATGAACTGATTGATCCCTACTTCCTTTCCAAGACTAAAGGTATGGTGAAAAGCTTGACATTGAGAAGGCATTTGATATGGCTGATTGGGAATTTTTTAACATCATGATTTTCAAAGGTTTTGGTGACACATGGAGGA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Match: XP_004140815.1 (PREDICTED: autophagy protein 5 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 661.4 bits (1705), Expect = 1.7e-186 Identity = 333/350 (95.14%), Postives = 338/350 (96.57%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. NCBI nr
Match: XP_008456194.1 (PREDICTED: autophagy protein 5 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 619.0 bits (1595), Expect = 9.8e-174 Identity = 319/349 (91.40%), Postives = 319/349 (91.40%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. NCBI nr
Match: XP_023528056.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 610.1 bits (1572), Expect = 4.6e-171 Identity = 303/351 (86.32%), Postives = 326/351 (92.88%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. NCBI nr
Match: XP_023528055.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 5.0e-170 Identity = 303/352 (86.08%), Postives = 326/352 (92.61%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. TAIR10
Match: AT5G17290.1 (autophagy protein Apg5 family) HSP 1 Score: 428.7 bits (1101), Expect = 3.4e-120 Identity = 210/350 (60.00%), Postives = 258/350 (73.71%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9FFI2|ATG5_ARATH (Autophagy protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 428.7 bits (1101), Expect = 6.2e-119 Identity = 210/350 (60.00%), Postives = 258/350 (73.71%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. Swiss-Prot
Match: sp|A2X052|ATG5_ORYSI (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=ATG5 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 1.4e-99 Identity = 181/359 (50.42%), Postives = 250/359 (69.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q6ZGL4|ATG5_ORYSJ (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 2.1e-98 Identity = 180/359 (50.14%), Postives = 249/359 (69.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9H1Y0|ATG5_HUMAN (Autophagy protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATG5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 136.7 bits (343), Expect = 4.8e-31 Identity = 92/347 (26.51%), Postives = 149/347 (42.94%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q99J83|ATG5_MOUSE (Autophagy protein 5 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Atg5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 136.0 bits (341), Expect = 8.2e-31 Identity = 91/347 (26.22%), Postives = 148/347 (42.65%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C294|A0A1S3C294_CUCME (Autophagy protein 5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496203 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 700.7 bits (1807), Expect = 1.7e-198 Identity = 349/349 (100.00%), Postives = 349/349 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C2S2|A0A1S3C2S2_CUCME (Autophagy protein 5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496203 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 619.0 bits (1595), Expect = 6.5e-174 Identity = 319/349 (91.40%), Postives = 319/349 (91.40%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4E862|A0A2I4E862_9ROSI (Autophagy protein 5 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108987175 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 472.6 bits (1215), Expect = 7.5e-130 Identity = 230/352 (65.34%), Postives = 276/352 (78.41%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4E868|A0A2I4E868_9ROSI (Autophagy protein 5 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108987175 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 469.2 bits (1206), Expect = 8.3e-129 Identity = 230/353 (65.16%), Postives = 276/353 (78.19%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C019565.2 vs. TrEMBL
Match: tr|V4U4U7|V4U4U7_9ROSI (Autophagy protein 5 OS=Citrus clementina OX=85681 GN=CICLE_v10005246mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 468.4 bits (1204), Expect = 1.4e-128 Identity = 237/353 (67.14%), Postives = 286/353 (81.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of melon v3.6.1
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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