ClCG06G009130 (gene) Watermelon (Charleston Gray)

Overview
NameClCG06G009130
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionCalcium ion binding protein, putative
LocationCG_Chr06 : 14776775 .. 14785290 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATCCTATGGACGATTTGTCTGAGGTTGTTTGTCATAAGTTCCATGTGGAGAAAAATGGTGGAATTGATGAGAAAGAGTTTAAGTCTGTAATAAGGGACATTCTTCTTGCCATGGCCCAAGGGATCGGAAACTTTCCTCTCCAAGTTGCACTTCAGCAAGATAGTTTTCTTATGAAGGCCGTTGAACATGAAAAGGCCAAAAATCAAAAATAGGAAATAGAATTCCAAGAAAATATATCATTTTTATATAAATTATTAATTTACTTTCGATTTAAGTACTTCAATTTTTCTGTCAGTTGGATTTGGACTTTGTGATTGAACATATTTGATTATTAAAAGGTATAATATTTTGTTTTTTTTTCCTTAACTGAGATTAATAGCATATCAAGACACAAGTAAGATTTAAACATATAACTTCGATCAAAACGTGGGGAAAGGTTTGAATTCCCACTCTGAAAAAAAAAAGTTCTGGAAATTCAAGGTATCATTACTATATTGTAAGGAATAAGGTATGAGAATCATTTTGGACGATGTTACTCAAGTCTTAGGTATGAAAAAAAGATGTGTTTGTTATGATGGATAGTGTTGGTAAGGCAACGGTTTCTTGGACGAATATTTGTCTTTCTTTTGTCACGATGGTTTAGGTATCCGTCATATCATAAAGCTATCGTGGCTTATCCTAATCCATTTTAGATCCTTGTGGATGGCCTGGATAAAGTCCTACACTTTGTGGAGTCGGGCGGTTCATTTCTTTAGTTCTTCATTTTGGTATTGGCGGGATATATTTCATGTTCTGAGCGTCCAAATTGATCATAGCAAATGCAACTATTTTTATTTTTATTTTTTCACAAATCTCATTCTTTTGATATAGTTTTTACTCATTCAATCTTTTGTGCACAATTATTTTGGGCAAGTACAACTCTTTTTCTTTCCCTTAGATAGTACATTCAGGGGGATTCTCTATTTATAGAGAATTCAAAAAGGAATAATCTTAAAAGGATAGCTAAAAGGAAACTAATTTCTAATGTAGAAAAAAAGGAATTAATCAAGGATATTAAACCAAACCAAGTTAGTCTAAGTCATATTACATCAAAGTGTTTGTGATTCTTGAATGTCTTTGACTTTTTATGCTTTGGATTATGTTTGGAATGATCAACCTTGCATATTTTCATTCCTTTGCTAATATTGACAATAATCCATGACATTTCATTGTTTGTTAATCTTTTGTAGAACAAATCAAAGCATGCATGTATGTAAATTCATTAGCTATTCATAATTACCCTTTTACAACATTACATGATTGGTTAAATTTAAAAATAAAACTAGGTAGACTACTAAATCAGTACTTAATATAATTAATCGCCTTGTTTTTCCCCTTAGATTTATGATGATAATTGTATTTTGAGTCTTGTGTCTTTTTGTAAACTTCTCAAATGCATTATAGAATATCTAGGGTCTTGCTTTGAAGCTTTATAATCTATGTAATTTGTTGATATAATGAGAAAATTTTGTAAGGTAGAACTTTGGGGTTTAAACTTTGAAAGCATTTTAGCTTCGTTTCTTGTCTATTCTTGTGATAAAATACATGAATATTTGGAACATATTCAAGTGAGAATTGATCTACCTTGCTTGTGGAGTGCTTTGAAGATCAAGGTTTATGGGAGTTTCAACTTTGTGCAATCATTGGTTCATTAGATCATCTAAGTAATCTAAATTTAGCCTATCTTAGGGGTTGAGATCAAATTAGTTTTGGGATTGTTGGGGTTCAAATTTGAATTTAGCCTCTCTCTCTCTTAGTGTGTATTTTTGTTTGATGAGTTGGATTGGTTTTGTCATGTTAGTGCAAGCAAGTGACAACATCATGGGGTGCGAGGGTTGCATGGTGTTTTGTGTGATCTATCAGATTTAGAGGGGGAAAAATATTCTTGTGCATAGGGCGTGACCTCAGCCTCCTCAAGTTGTGATTGCATTATTTTAGTATCTCGTTCTTCTTCGATACTCTTCCCAAACTAGTAAGCTAAGTGATAGTCAAAAGCTTGTCAAAGGCCTTAGCTATCAAATGATTTTCGTGCCTATTTAGCTTAATATAGTGGTAGTACGAGTCGAGTCCTCAGGGAGGCGAGCATTTCTCAATCCAACCACTAGTCATTCTTAAGTAATCGAAGGGGAGGGGGGAGTTTGTGTTTGTAGATGCAAATGAATGTAAGTTACAAAAATAAAATTGTACAAAATAGAATTGGTAGCTGCAATACTGAATAACAAATGAAGTGAAATTATAAATGAACAAAACGTCTAGCTTGGGTCTTAATTAGGTTCTTCCTACTCCTTGCCCCTCAATCAATTTCTAGAAAGACAACATGCAAACTCCCTATTCATGCTTAGCCAATCTCATTTAATGTCACACCCCCTCCCGAGTTACTTTCCTAACCCAAAAAGAGGCGTGAAGAAAGCAGACATTGACTCCTTATGACATCTACTGTCACTTAACTTCCCAAGCACAACTCAACAAAGCATAAAAGTATAACTCACATCTAGGGCACAAATGATAATCTCAAAATAAACCTTTATAAAATTAACAACAAAGTTTTATACACAACACAACTCTCTTAGATCCCAATATGTACAATGCTAGGTCTAAGTACAATATATTTACAAAGCCCAAACTAAACAGCAGATCCAGACGAGTTTGACGAGTAGGCTAAGCACCCCTACCTGAAAAGTAAAAAACAATTGAAAGCATGAGCTAAATAGCCCAGTGAGTAATAAGTTTTGAAAAACTATTTTTGGCTTAAAAGCTTAAGGAAATCATGTTTGTCATTCAAATAGTGAGGCACTGAAAGCTTAAAATATTTGTATATGCTTAAAAGATTTTCCTTAGTTGAGGCGGAGTCATCTCTACGCTGCTCAACATCGAAATTAACCTCATCATATCCAATGTCGAATAATCTCAATACCAAAGCGTCAAATCTCCCTCTGTGCACATAGAAATTATAATTCAAGCTGCCCATATGCCTTCACCAAGTCCATCAGCATTGGGAACCAATTCAGGTTGTCTAAATGTCTTCTCCCAGTTCTTCGACATTAAGGACCATATTCAGACTACCCATATACTTCACCAAGTCTATCAACATTGGGGACCAATTCAGGCTGCCTAGATGCCTTCTCCTAGTTCTTCAATATTCGGGACCATATTCAGGTTGTCCAAATGTCTTCTCCTAGTACTTTGGCATTGGACACCATATTCAAGCTGTTCAGATGCCTTCACCAAGTCTATCGGCATTCGGGACCAATTTTGGCTGCCCAGCTACCTTCTCCCAGTTCTTTGACATTGGAGATCATATTCTTCTGCTCAGATGCTTTCACCAAGTCCATCGGCATTAGGGACCAATTCAAGTTGCCTAGATGTTTTCTCCTAGTTCTTTGACAATGGAAATCATATTTAGGTTGCCCAAATGTCTTCTCCCAATATTTCGGCATTGAGGATCATTTTTAAATAAAATCATGTTAAATCATCCACAAACACGAGTTTAATCAATTTCTCAAAATTTCCAGAATAATTTCAAACAACATGCTTTTTCACAAATTTCAGCATTCCAGAGCATCATGGTCAAAACTATGCAAAAACATGTTTAAAATCGTATTCAGGAAATACATGTTTATCAAATTCAACACATGCCAAAAATCTCATATTTTCAAGATAAACCAAACATTTATAAATATTGTGAGTACAAATCATTTAAAACGAATTTATGTTACTCACAACTTGTCCTGAGCTCTTAATGGGTTATACTCTTCCCCGAGCTCTTCCTGGCCTGGAATAAATAATTCCTTTGTCAAAATTTCTCAAAATTTTCTTCATAGTATATCTCAAGTCATTTTTAGCTTAAAAAGGCTTACTGACAAGTAAAAATTAGCCAAAATGTCCAAAAATGGATAGTTGTCCTTAGGCGTGTCCAACAGCCCTACAACACACTCACCCAGCCGAAAATAACCTCAAATGAGTGGCAAACCTTGCATAGCATGCTGCCCACACGTGCCTCGCACACACTACCCCTCGTGGGCGGCAATCCCCACACACCAACCACCAAATAGCCTCAAGACAGGTAGGGCGTGCGCGCATCTGCGTTGCTCGCGTCATTGGTCTGCGTAGCGTGTGTTTGCTTGGTTAGCGTGACACGTCTCGCTCAACACTTGCGCACACGCAACGCCACTCTCCACACACCAGCGACACCTACCACGCCCTAACAGCCTTTGGCCACAACCCATGCCTAACTGCATGCACATGTTGGAATTATGGTATGGGCAACGGAAGAAAAACGGATACAAAGCACTCTAATTTGCTTTAATTTGAAAGAAAAAAAAAACGTGATATTTTAAAACTATAAAACATAGGGTTTGAAATAGAACCTTTGTAGTAACAAACTCTTGCAAGTTTCACCTTCCAATTGATCAAGAACAAGACGTAGACCACTAAAAGTGTCTCCTTGCTATTCTCTGGTCTTAAAACTTGATTGTGGGATCAAATTAGTGATGAATTGGAGAGAATATTGGTTTTGTGAATTGACAGAATTTTTCAAGTCCTTTTGTTTTTGTTCTTCCAAATCCAACAAAAACTAAGCGTCTATTTTTCAATTTCTCCATCTCTTTTGAAAGAGATTAGCATACAAATTCATTATCATATCAAATTGACACCTTACTATTAAGTAATAAGTGTTAATTTGACAGGAAGACACATAGCATGCAAAAATTGAAAATTGATTTCATGTTGACACCTAATTTGAATATAATTAGTGTCAAAATGTGAAGCTTACACCAAGCATGCATAATAGCTTAGTCATAATATCATTAAAATGGGGTTTTTAAAAATCCACTAATTTTGGTCAACATTTGACATTTTGATTTCAAAAATTTCCAATTTAATGAATTATTTATAAAATTTAATATCATATATTAAATTATATATAAATCTCAATTTAACTATCTTGATTTGAATCTCTATTTATATGCACAATATTTAAATTGTATTTAAATATTTTTATCTCTCTTTACTGTTCAATTCGAAATTAAACAATAAATTGTTAAACCCTTTCAACGCTTTATTCTCCAAATTGAATTCAAACGATTTGAATTCATTCATCACACTGTTCTAAGATTTGGTCCAATATGAGCTAGCAAGGGGACCTAATAGACCTACAGATCATGAGCTCCAACGATCCAAAATTAATCGGTTTAAACTCTTTAACCTAGTTAATTAACATTCGTTGACTACCGGGTCACTCCACTAAAACCCAGTTGCTGCACTCTTCTCACTATAGATATATTTCTGTCCATTTGATATAACTATAATTAGTAAGTCAATTTTTCACAAGTTGTTCGTAATTACAACTGGGTCAAAATATCGTTTTACCCCTGTAATTACTTATTGTTCCTTAAGTCCCGCTGATCCTCTAATGAACAATTAGTTTGTGGTCCAACAAACAAACCGAGTCCCTTTCGGGCCAATGAGAGGGTGGGGCCCCTTGTTCAAGAACTGAATTCAGTACTTAAGGGAACAACTTATCTACTATCCTTTTCAATAAGGTAGGAGCGAATTCCATCTTGTAAGGCTATGTCCCCAACCATCTGTCTGATCTTATCTCTAAAATGGGAGGCATATTGAGTCGGAAAACTGGCCACTCTCACCCATACAGATTAAAGGATAATCTCAAACAAACAAGAGTTCATAGTTAGCTCAAGATTAAGATTGAGTTACTTAAGTCATCGGGTTGAAATAATCAATTTTAATAGTAAATGGTGTTATAATGTCACACCCTACTTTTTAATAAACGATGCGTTGAAGAATTTATGAAGAAAAGAGGTAAAAGACCATGTTGGACGCATGGTCAGGGCTAGGTAGCGCATAGTAAGGGTGGACGCATGGAAGTAAACTGAGAATGGAAAGAAGAGAAGCGAATATGCAAGAAAGAAATAAAGTTAAGTTGCGAAGTGTTGAAGAAGGTTGTGAAGTAAACATAAAAACTGGTGTATGTGGTGGACGTATGCTAATCTATCCTTAAGAGAAGTAATCTAAGTTCAAGGATAGGAAGATGGTCATTGAGCGCAGGATGAAGGTAAACGCGATAGGACCAACGCGTAGAGAAAGAACTTGAGAAGGAGTTGTTATGAACATAAGGAAGAAGTTGGACGCATGGTATGATGCGATGAGATACAAACACAGTATTGGGCGTTTGTCATTAACTCCTAGTAGCATTGTGTAAGCACTGGTTTATAATAGTGCAGTTATGCATTGAGGGTGATCACGAACGGTAGTGAACTAAAGTAGTCGCTGCGTTGGCAGAGGAAGAAACGTACTCGGCTTACCATGCGTTAGTAAGAATGTTAAGCATTGAGGTCCCTATGTGTTGAAGACAATTATCCTTACGCGTCAAAGAGTAGTATGGTTGACTGTGAGTTAGAAAAATGAGTAGTGAAGCTCAAACTTTAAAAGAAACTTAATGAACGCATGAGGGCGTTGTGTTGAATAAATGGTTATCTATTGGAAATGTTGGACGCATAAGATAAGTTTATAAGGCCAGGTGGCTATGTATAGATTTGACACCTTATTAGTAGGAGGTGTTAAAGGCATGTTAAGTAAATCATGCAAGGTGACACTTGGACTAATGCATGGTTAATTAAGCATGCAGTGTGACATGTGGCAAACAAGTGGCAAAAGGAGAGGAAAAGGTGGATGGCAAGCTCCCTATAAATAGAATTTTGAGGGAAGAGGAGCGACTGATGACTCCCAAAGAAGAATTCTGGAGAGAAAAGAGAAGAAGGCAACAAGGACGTCTGTGGTAGAAGTATGCAGCCAAGAAAGAAGGTATTTGACAACTTTGTTATTTTATGTAAAGAAGTTGTCTGGTGTTAAAAAGGGTCGGCTATGCGTTGAGGACAAACATAATGACCAAGGTGAACGCGGCGCCCAAAGTTAGAAGATGCGTTCATGATAAATGAGTTCATTATGAATATGATTATATGGTTTCTAATGAAATAAAGCATGCGTTTTCATATATACATAAAGCATATGAATATGTTGTCTATAGAAATAAGAGCATGCGTTTTATTTGAAGACTTTGAGAATGCTGGGTATTCGCTATGAGATATAAAATGCATGGTGATTGGTTGATACATGTTTTCATGAAATTCCTGAAGAGTATGGTGTTATATGTTTTCATTGAAAATTTGGAGATACACTTGTATGATAAGCAAGATGTTTGATAATTAAAGTTTTGTATTGAGTATTAGAAGTGGTTACTCATAGCATGGTATAACTATTGAACGTTTGTGTTGTGTTAATGAGTTTAAAGATTATGATATGTAATAACTTAAGGTAACCCATGGCTGAGGGACCTCGTGTGAAGGCCTATGGGAGATATGTTATTTGATACTTAATGTTGAGGGACCACATGAGAAGGCATTTGACTAGTTGAATGAGACGGATTCCAATGCTGAGGTACCCTGTGTGAAGGCATATGGAAATCTAAAACATGATAGCCAAGTGCTGAGGGACCACGAGTGAAGGCACTTGAACAGTGGTTGACAATGAAACACAGTGCTGAGGGACGATATGTGAAGGCACTTAAAGGATTGGATATGCCGAGGGACGAAGTGTGAAGGCATTTGANCATGAAATTACTGAAGAGTATGGTGTTATATGTTTTCATTGAAAATTTGGAGATACACTTGTATGATAAGCAAGATGTTTGATAATTAAAGTTTTGTATTGAGTATTAGAAGTGGTTACTCATAGCATGGTATAACTATTGAACGTTTGTGTTGTGTTAATGAGTTTAAAGATTATGATATGTAATAACTTAAGGTAACCCATGGCTGAGGGACCTCGTGTGAAGGCCTATGGGAGATATGTTATTTGATACTCAATGTTGAGGGACCACATGAGAAGGCATTTGACTAGTTGAATGAGACGGATTCCAATGCTGAGGTACCCTGTGTGAAGGCATATGGAAATCTAAAACATGATAGCCAAGTGCTGAGGGACCACGAGTGAAGGCACTTGAACAGTGGTTGACAATGAAACACAGTGCTGAGGGACGATATGTGAAGGCACTTAAAGGATTGGATATGCCGAGGGACGAAGTGTGAAGGCATTTGACTATGTGATTGCGGAAATTCGACGTTGAGAAGTGTAGAGCACCGCTCCGCCTCAATTAGGGAAAGTGATTATGGAATGAGTGAAGTTTTGAGCATTTACCCTAAAACAGATAGGAATATGTTATGATGAAGTTGGAACATTAACTAATATGATCTGAAGCGTTATATTCTATGTGAGATTTACCAATTTTATAGTTGTATATATTGTTTTTTAATAACTGTTACTCACTGAGCCGTTAGCTCATTCTTTCAAATGTTTTCCATTTTCAGGTAGCATGACAGTTCTCGTTGCCGATCGAAGTCGAGGTTTGTCAAGAGCATGTGGATTGGTGAGGTTGACAGTGGGTTACGTGACAGGGTAG

mRNA sequence

ATGGATCCTATGGACGATTTGTCTGAGGTTGTTTGTCATAAGTTCCATGTGGAGAAAAATGGTGGAATTGATGAGAAAGAGTTTAAGTCTGTAATAAGGGACATTCTTCTTGCCATGGCCCAAGGGATCGGAAACTTTCCTCTCCAAGTTGCACTTCAGCAAGATAGTAGCATGACAGTTCTCGTTGCCGATCGAAGTCGAGGTTTGTCAAGAGCATGTGGATTGGTGAGGTTGACAGTGGGTTACGTGACAGGGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGATCCTATGGACGATTTGTCTGAGGTTGTTTGTCATAAGTTCCATGTGGAGAAAAATGGTGGAATTGATGAGAAAGAGTTTAAGTCTGTAATAAGGGACATTCTTCTTGCCATGGCCCAAGGGATCGGAAACTTTCCTCTCCAAGTTGCACTTCAGCAAGATAGTAGCATGACAGTTCTCGTTGCCGATCGAAGTCGAGGTTTGTCAAGAGCATGTGGATTGGTGAGGTTGACAGTGGGTTACGTGACAGGGTAG

Protein sequence

MDPMDDLSEVVCHKFHVEKNGGIDEKEFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDSSMTVLVADRSRGLSRACGLVRLTVGYVTG
Homology
[Close]
BLAST of ClCG06G009130 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LYD8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G695380 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 6.4e-21
Identity = 52/56 (92.86%), Postives = 55/56 (98.21%), Query Frame = 1 

Query: 1   MDPMDDLSEVVCHKFHVEKNGGIDEKEFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDS 57
           MDP+DDLSEVVCHKF VEK+GGIDE+EFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDS
Sbjct: 59  MDPVDDLSEVVCHKFQVEKSGGIDEEEFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDS 114

[Close]
BLAST of ClCG06G009130 vs. NCBI nr
Match: gi|449449633|ref|XP_004142569.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101222885 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 9.2e-21
Identity = 52/56 (92.86%), Postives = 55/56 (98.21%), Query Frame = 1 

Query: 1   MDPMDDLSEVVCHKFHVEKNGGIDEKEFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDS 57
           MDP+DDLSEVVCHKF VEK+GGIDE+EFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDS
Sbjct: 59  MDPVDDLSEVVCHKFQVEKSGGIDEEEFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDS 114

[Close]
BLAST of ClCG06G009130 vs. NCBI nr
Match: gi|659125605|ref|XP_008462771.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501058 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 105.1 bits (261), Expect = 6.0e-20
Identity = 51/56 (91.07%), Postives = 54/56 (96.43%), Query Frame = 1 

Query: 1   MDPMDDLSEVVCHKFHVEKNGGIDEKEFKSVIRDILLAMAQGIGNFPLQVALQQDS 57
           MDP+DDL EVVCHKF+VEK+GGIDEKEFKSVIRDILLAMA GIGNFPLQVALQQDS
Sbjct: 59  MDPVDDLCEVVCHKFNVEKSGGIDEKEFKSVIRDILLAMALGIGNFPLQVALQQDS 114

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of ClCG06G009130 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LYD8_CUCSA6.4e-2192.86Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G695380 PE=4 SV=1[more]
BLAST of ClCG06G009130 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|449449633|ref|XP_004142569.1|9.2e-2192.86PREDICTED: uncharacterized protein LOC101222885 [Cucumis sativus][more]
gi|659125605|ref|XP_008462771.1|6.0e-2091.07PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501058 [Cucumis melo][more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
biological_process GO:0055074 calcium ion homeostasis
biological_process GO:0035725 sodium ion transmembrane transport
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0005509 calcium ion binding
molecular_function GO:0005432 calcium:sodium antiporter activity
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG06G009130.1ClCG06G009130.1mRNA