CmaCh04G010680 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTAAAATATAATTTAACTAAATTGTGAGAAAAAGTGTTCTAAAAAGAATTGTAATTGGAAAAAAAAATTGGGAGTTCCGTAAGGTTCTATTTCACCCTGGCGCACGGTCTGATGACAAGCACGGTTTGGCGGAACAGTGTAGCAGTGGGCAGCTCGATTTTCCGCCGGGTGTCGCCGTCGCAATTGCAGTCCTTCACCGTCTCTTCAAATCTCTCGTTTTCGCTTCCTCTCCGACGATCAACAGCCAAAATTTTGGCCATGGCAATGTCTAATGGATCGGGCAGTGGAGTGGTTCGCTTCAAAGTGTCTCCCTCAACCGCCTGCGTTATTCAGAAAGGTGACATCACAAAGTGGTTCATCGATGGTTCTTCTGATGCCATTGTCGGTGATCTTTCTATTTTTGCTCAGAATCGACTATTTTTATTTAGGGTTTATACTTATTTGCGTACTGGAAAGGGTGGTGGGAAGTAATCGGTTGAAAGCTCCTGTGTTTTTGAGTAATGATCAAAACCATATTTTGTTCAAATGATGGAATGGTTTGTTTTTGATGAATCGCTTTAAGTTTGTAGTTATGTAAGAAATGGGTAGATGCCGTAGGAATTGCTTCCCCATTGCTATGTTTCGCGACCTGGAGGTATCTAGAATCATCAATGATTGGGGACTTGTACAGATTTAGGTAGATGCTGTAGGAATTGCTTCCCCAATATATATATATATATATTGACTCCAAAAAGTGGTTGCATTATAAACTAAACCATTGCTCTAAGAAAGAAGATAAAGAAGTAGCTTATCAAACTAATCAACTACCTTGTGGGTTTAAGGCAAGGTGACCTTTTCTTTTTGTCTTGGTGGTTCATGACCTAAGTAGATTAGTGTTGTCAGGTGTGGAGAAAAGAGTGGATGGGGTGATTGAGGGGTTTAAGGTCGGGCAGGATTTGGTTCACATTTCGCATATTCAGTTTGTAGACGAAATCTATATGTATAGAAGATTTAACTCCACTTACTAAGTAAATTAATTGTGAGATCCCACATCGGTTGGGGAAGAGAACGAAACATTCTTTATAAGGATGTGGAAATCTCTTCATAGCAGACGCGTTTTAAAAACCTTGAGGGGAAGCCCGAAAGGGAAAGCCCAAAGAGGACAATGTCTGCTAGCGGTGAGCTTGGGCCGTCACATTAACAAACTCAAACTTAAAAATTACAAAACTATTACTAATTTTTCTGTATCGGTAAGAAAGATCCCTATGTTTTGTCCTGTATTTTCTTATTTTTCAGAGTTTCCAATCCCATGAAATCTATTAAACTTTGGTTTCTTTGGCTTAAATCTTATTTAGGTTAATCCAGCTAATGAAGTAATGCTTGGAGGTGGTGGTGCTGATGGAGGTATGGAGTTTCAACTGTGTTTTAGTTTTATAACTTGTTACACGAACTTGCCATCTTGAATATTCTTTCCTCATCGTTTTGTAGCGATACATAATGCTGCTGGACCTGATCTCGTGCAAGCGTGTTATTCTGTCCAAGAAGTCCAACCTGGAATCCGTTGTCCAACTGGAGAAGCTAGGATTACTCCGTAGGCTCTTTTAGTTCAGTAACTGATCACGACCATTAGTTTTGTTTGTAGATGCTAATGTGATCTTCAATTGCAGAGGTTTTCGGTTGCCAGCATCTCATGTAATCCACACCGTTGGACCTATCTACAACGTCAATAGTAACCCCCAGGCCTTACTTAGAAGCGCATATAGGTTCTTGTTATGTAATTGCACTTCCCTTTTCATTTTGATTTACCATTCAGGACTTATCTTTTTTTTATTGCCATATTGATTTAGAAATTCCTTGGCTGTGGCAAAGGAGAATAACATTCAATATATTGCCTTTCCCGCCATATCCTGCGGTGTATATCGGTAAGTTATCATATTGATTTAGAAATTTCAGTATTTGTTAGCTTTATACCGTTTTTTAATTATAAAAAATCAGTAGTTCCCTAATTGATTGATCAGGTTCCTCTTGATTTAGTTTTCGAATGGCATGGGTTTGTGTGTGTGTTAGTTTATACCATTTTTCTATTATAAAAAATTAGTTGGTTAATGATGGATTAATCCAGATTCCTCTTGAAAATATTTGTTTAGTGATTTTTATTATACACTTGCAGATATCCTTTTGATGAAGCTGCCACAATAGCCTTATCTACCGTTAAAGAGTTTTCCAATGGCTTGAAAGAGGTAAGGCATTGTTCTATGGTACTTAGGGAATGTATCCTTCTTTTTGTTACAGTATGTGAATATGTTCCTAAAGTATTTTTGACATGTTTAGATTATTCCATCACGGTCCTCTTTAGCGCCGACCTCTTATCTTTGATTGGGAAGTTTTCGGTTAGCCCTAGGAGATGAATTATCATCTTTGGGGGCACTGTCCTGTCAATGGGTTTTCTTGTAGTTCCTTCTTCTATTGCATGCTGATCTGCTTTCTGCTCATTCTTTCAAGTGTTTGAGACTTTCTTAGCTTTACTCGAGCCACTTTTGAAGTTCGGTGGCACTCCTTCTAACAGAGAGTGATCAATAAGATGAGGCATCATAGGTTGCTGACTACTAGTAACCTCGAGAGGACCCTTTTGAGTTTGGGAACTTTTTTGACAATGAAAACTAGACTGTGCCCCCATTAAGCGATTGGACCAAATTCTTTGAGAAAATGCTTTGAAATTCGGACAAGTCTTGGATGCCATTCTTGTTGTTTGCAAAGATGTGTGTTCATTACAAATAACAACTCAAGTCCACTTCTAGCCGATATTGTCCTTTTTAGGCTTTCACTTTCGAGCTTCTCTTATTGGTTTTTAAAACACATCTGATAGCTAGAGGTTTTCATATCCTTATAAAAAATGTTTTGTTCCCTTTTCCAACTGATTTGGGATCTCACAGTATTGATAGATTCTGGATGGTCTGATTTGGGATCTCACAGTATTGATGGATTATGGATGGTCTGATTTGGGATCTCACAGTATTGATGAATTATGGATTGCCTGATTTGGGATCTCACAATATCGATGGATTATGGATTGTCTTGTGGACTGTCTCTTTGCCAAAAGTATTATCGATGAGACATCAAGGAATAATTTGCAAGTAGCATAAACAATCTCTGAACGGAACACTTGGCATTATTTGCAATGACGTAATCTACATTATTTGCAGGTACACTTTGTCCTTTATTCTTCTGATATTTACAATGTTTGGTTGGAGACGGCAAATGAACTGCTCAAGAACTAACTATATAGTGCAGTCTGCTGCCTTGGAATGGTAATGGTATCAATCAATCAACCAATGATTCACCTTGGACATTTAAAGTCTTTGTGTTGCTTTCATCTGAACTCAGTCATGCCTTCTTATTAAACACTCTTAAAGGGGTTATTAGAGTAAACTTTGGCTCCTCTCTCCAATGGGTATAAGTGCGTCCTTGACTCGTCTCAATCATCAATCTATCTCTGGTAGCTTTTCTCAGTATGTTTAATGTTTGGAAATGCTTTCTTGATCAGACAATTATTCAACTGCGTAAAACTGTCTGCTACATTATGTTGAATCTATATCGGACTATTTACAACGATCTAATAATTTGATCAATTAGACGTGTTTGTGAGTTTTGTAATGAATTTTTGGTTTTACAAAGTTTTTAATTTTTAAAACTCATCGTTATTTACAATTTAAAATGCTATTTTAATATTTTATATGTTAGTATTTAATTTTAATTTCTATATGCAAGTTTGGTAGAAAAAATACAAACATTTAATCCCAAACATTATTTGCGATCCAAATGGGTAAGTTGTTTACATTCTTAAAATTCTTATAGTTTATGTATTTTGAAATATTTAAATTGTAAATTTTTATTAATTCGAGATAAATGAGATCAAATTGAATATTTGAGGGCGTCATTGTACAAATCTATATAGTTGGAGGGGTCTTTTTGCAATTTTTCTCTTCTCGGTGGTTTGGCTCGGCGGGACCGGAGATCTATATAAAGCGTTTACCGGTCAGACCTCTTGACTTTCGTAATCGGCATTTGCCCACCGAAAAACCCTAATCGTTGCATTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCGTCTGAAAGAAGATCTGCAGCTTTGAAACAATGGTAAGATCATTAGCCCGTCACCTTTTCCTCTGAATCTTCATGTTCTAAATCGTTCTCCCTTCATCTTTTTTCTGCTTTTGGTTCTGCCAGACTTTCAAGCGCAGGAACGGTGGACGTAACAAGCACGGACGTGGACACGTTAAGTTCATCAGGTGCTCCAACTGTGGCAAATGCTGCCCCAAGGTTATTGTTTTACTCATCTTTCTGCGTGATTTTTGCGTGCATTTTTTAGTTTAATGGCAGCGGTCAAATCTATACGTTGTGCTAATGTTTCCTTTACGGAATTCGGTCATTTTCTTTTTAATTAGTCTTTGTTTTGAGGCTTGATTGCTAGTATTGCTGGAGTACTTGTGATTTGATTGATCTAGAAATTTCGAGAGATGAGTATCCGCCATGTTCTGGGGATATGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTAGAATGTTAATATCTATATGAGTTTGTATTTGTATTGTTGTTAAAAGATTGTTTAGGTGTTTTTTTTTTCTAAGTTCAAGAGCTAGACTTTGACATTTAGCTACATTTTATATTTCTTTCCAATGAAACACATTGATAGCATTTTTTTCAGAACATTTTATAGGTATAGTTTTTTTTTTTTCTGTTTAAAAAATGGAATTCCCGTAAGCATTCCAAAACTCAATGCTTTATTAGGCTTGAGGCTTGCCTGGTGACAAGATTCGAACTTTTAGCCTCTAGACTTATGTCTTCTTTGGACCTTAAGAGGTTTATTCTCGTAGAGGAATTTTACGCTTCCCTGAAAATGCTTTAAGGCCTAGAAGTCATTACACCTCTTGAAAAGGTTAAAAGAATAACTGTAAGTTTCTAAAAAATATAACGG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MTSTVWRNSVAVGSSIFRRVSPSQLQSFTVSSNLSFSLPLRRSTAKILAMAMSNGSGSGVVRFKVSPSTACVIQKGDITKWFIDGSSDAIVNPANEVMLGGGGADGAIHNAAGPDLVQACYSVQEVQPGIRCPTGEARITPGFRLPASHVIHTVGPIYNVNSNPQALLRSAYRNSLAVAKENNIQYIAFPAISCGVYRYPFDEAATIALSTVKEFSNGLKETFKRRNGGRNKHGRGHVKFIRCSNCGKCCPKDKAIKRFLVRNIVEQAAVRDVQEACVYDQYTLPKLYAKMQYCVSCAIHSHVVRVRSRTDRRNRQPPQRFIRRRDDQPKPGQPGQAPRPAGAGIPARRVRMVSVFLLILLLSISTSHKRLFIEATEHTEKLAFHGFDKSILASKYLQIYNNSKYGTLQLDNGLGKTPPMGWNSWNHFGCSVDERVIKETADALVATGLAELGYVYVNIGIKALADYVHGKGLKLGIYGDAGQLTCQQRPGSLGFELLDAMVLASWEVDYLKYDNCYDMGISPQKRYPAMRDALNSTARSIFYSICEWGVDDPALWAPRVGNSWRTTIDISDSWESMTRIADINDKWAEYAGPGGWNDPDMLEVGNGGMTYQEYRSHFSIWALMKAPLLIGCDVRNMSPQTLEILSNKEVIDVNQDSLGLQGRKINVSGKDGCLQVWAGLLSSSAPEIRLAIVLWNRCSTASMISVSWLELGVIFDVIVSVRDLWEHKFLDSISRDSFGAEVDSHDCKMYIMTHIPLFHSES Homology
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VXZ7 (Alpha-galactosidase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGAL3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 522.7 bits (1345), Expect = 7.0e-147 Identity = 243/395 (61.52%), Postives = 296/395 (74.94%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P14749 (Alpha-galactosidase OS=Cyamopsis tetragonoloba OX=3832 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 454.9 bits (1169), Expect = 1.8e-126 Identity = 226/432 (52.31%), Postives = 283/432 (65.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42656 (Alpha-galactosidase OS=Coffea arabica OX=13443 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 445.3 bits (1144), Expect = 1.4e-123 Identity = 217/369 (58.81%), Postives = 258/369 (69.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX86 (Alpha-galactosidase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGAL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 3.8e-121 Identity = 210/369 (56.91%), Postives = 260/369 (70.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FXT4 (Alpha-galactosidase OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os10g0493600 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 433.0 bits (1112), Expect = 7.2e-120 Identity = 214/368 (58.15%), Postives = 255/368 (69.29%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JG86 (Alpha-galactosidase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484225 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 846.7 bits (2186), Expect = 7.8e-242 Identity = 415/443 (93.68%), Postives = 416/443 (93.91%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FS41 (Alpha-galactosidase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447939 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 805.1 bits (2078), Expect = 2.6e-229 Identity = 392/439 (89.29%), Postives = 403/439 (91.80%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQU0 (Alpha-galactosidase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447939 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 804.3 bits (2076), Expect = 4.4e-229 Identity = 392/441 (88.89%), Postives = 403/441 (91.38%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXE1 (Alpha-galactosidase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447939 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 803.9 bits (2075), Expect = 5.8e-229 Identity = 392/442 (88.69%), Postives = 403/442 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CZ60 (Alpha-galactosidase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015929 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 677.6 bits (1747), Expect = 6.2e-191 Identity = 332/436 (76.15%), Postives = 356/436 (81.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. NCBI nr
Match: XP_022986509.1 (alpha-galactosidase 3-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 846.7 bits (2186), Expect = 1.6e-241 Identity = 415/443 (93.68%), Postives = 416/443 (93.91%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. NCBI nr
Match: KAG6600882.1 (Alpha-galactosidase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 4.0e-232 Identity = 395/439 (89.98%), Postives = 407/439 (92.71%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. NCBI nr
Match: XP_023529356.1 (alpha-galactosidase 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 813.1 bits (2099), Expect = 2.0e-231 Identity = 399/443 (90.07%), Postives = 406/443 (91.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. NCBI nr
Match: XP_022943112.1 (alpha-galactosidase 3-like isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 805.1 bits (2078), Expect = 5.4e-229 Identity = 392/439 (89.29%), Postives = 403/439 (91.80%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. NCBI nr
Match: XP_022943111.1 (alpha-galactosidase 3-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 804.3 bits (2076), Expect = 9.1e-229 Identity = 392/441 (88.89%), Postives = 403/441 (91.38%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. TAIR 10
Match: AT3G56310.2 (Melibiase family protein ) HSP 1 Score: 536.2 bits (1380), Expect = 4.3e-152 Identity = 243/371 (65.50%), Postives = 296/371 (79.78%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. TAIR 10
Match: AT3G56310.1 (Melibiase family protein ) HSP 1 Score: 522.7 bits (1345), Expect = 4.9e-148 Identity = 243/395 (61.52%), Postives = 296/395 (74.94%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. TAIR 10
Match: AT5G08370.1 (alpha-galactosidase 2 ) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 2.7e-122 Identity = 210/369 (56.91%), Postives = 260/369 (70.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. TAIR 10
Match: AT5G08370.2 (alpha-galactosidase 2 ) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 2.7e-122 Identity = 210/369 (56.91%), Postives = 260/369 (70.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh04G010680 vs. TAIR 10
Match: AT5G08380.1 (alpha-galactosidase 1 ) HSP 1 Score: 414.1 bits (1063), Expect = 2.5e-115 Identity = 214/431 (49.65%), Postives = 277/431 (64.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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