Spg036826 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACTGATGCTGATTGTGGCCAAAATATGACATGGTCTAAAAACAAAAACAAATCACAAATATCAAATATCACTATCCTTTATCTTTGGATAGGATAACCTCTCCAACAAATACATTGGTCCTTTCTTAGTCGTAATACAGTTCTGGGATATTTTCGCATAACCCTCGTCTCCCCATCCTTTACCCCACGAATTCTTAATTATCCAATACTTTTCACCATTTTCATTTCCAAAACCTACTATCAAAATGGCATGCAGAGGTTTTACGATCAAATCATTCTTGTTTGTTGGACCATGGTATATTATTCCCTTTCCCTACAACAATGGAATGAGAAAAAAAGTTAGATTGACTCTGACTAATTAAAATAGATTTAAATTTAATACTAATCATTATAATGTTTTAGACTTTAATTGACCAAGGGTCATAATAAAAATTGTTTACCTATCTTACTTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATCTATCAGTAAGAACTATGCAATTAGTTCACTTACCTTGCTCAACAATCTTAGCTCATCAGTAATTCTTATAGCACCGGCTATAGGTTGTTGTTGAATCTTCGAATTTAGAACATGAATATTACTTATCTCCTCATATGATTTAATTTTCACCCAGGTCTATCATCGATGAATTAAACATTATCATAAAAAAATTTATATATTATTGCATAAAAAACACCAAACTAATAACATATAAAGTAAATTTATCTTTTACCTTTTTAATTTGTTGGCAGACTTCTTTCTTCGCGATGAATGGATAATCTCTCTCTCTCGCTATTCCTCCATTATATATGACCCACTGGAAAGCTCTCACAATGTTTAATAAATAACAATCGTTTGCACCAATTTTGAGCTTACGTGGTCGAAGGTGAGGGCATTCAATAAGACAGTCAAGGATATGTTGGGGTGCTACATGAAATAATGTCTGATTTACTGATTTACGATATCTTATATTATGTATAGCTTCAATAGCACCAGCTGCCGTAATTGCCCAACAACAATCTAATTATAAAGACAATGTTATTTATCAAATAACAAATATAACACAAGACATTCTCAAGATATTTTCAGGAAAAATGCAATGAATCAGAAAAATCTAAATATGCATAATAAAAAGTGAAATCTACCAATACTAATCAAATAAATAAAAATTTTAAATTATGTAGTTGACAATTCGGAACCATTGCATTAAATTTTTTAGTGAACTTAATTATTATTGAATTGTTCATGATAATTTTTCACATTCATTGATACAAAAATTCAATTTCTTATCATGTTAAGATTAGTCCTAATTTGTTCTACACCATCAAAGCAATATTTTTGTAAAAACGCAATGTACTTTTTTTTTTACAACACTTGATAGTACTTTTTTTTTTGTCAATACAAAAGGCTAAGTTTGTTTCGACAATTTTAATTAATATTGTAATTTTCTAAACTTTTTATTCAAATATAGTACATTTGAAACTTATTATATAAATATTGTTGTTTTAATTTACATTGTCAGATGACTTTTATGTATTAAAAGTATTATGAAGCGCAATTTTGTTGTATTTATGTGTTTGCTCAAGTGGCCAACTGCATCGTTTTTGAACTAGAGGTTCCGGGTTCAAGTCTTGATTTTTACTTTTTTTTTTTCCTTTCTTTATTTCTTTTTTAGAACAAAACCTGTTTTTTCTTTTTCTTTATTTTTTTAAATCTCATTTCTCCATTTATAATTGTTTTCTATTTTATTTCTTGTTTACATGTTTTGTTATTTCTTCTTTTTTTAGAAAGATAGAATATTAGATGGTATTCTTCTTCTTCCTAGATTTTAAAAGTTAACTAAATATTTTATTTTATCTATTTTCTTTAAAATCCTAATTTTTTATTTAAAAATTAAAATTTAACTTAGTTTAAAAAAAACAAACAAAAGGAATATTGTGTTGCATTTTTTTTTCATTTTTCAAAGTAATTAAAATCTAATTTAAATAAATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATTTTAATTGACTTGAATAAATATAAGCTTTAACTTCTAAATATAATTAATAGAAATTATTTGAATAATTAGTATTTATTTTAATTAAAATTTTTTGAAATAAAAAAGAGGACTCTACAGAAAATATATAAAATAAAAAGTTTTATAAAAAAATAATTTAGTTACCTTTTTAAGTTTTTTGAGGGATATTGTCAAAAAAAAAAAAGTATTTTTGAGGGTGGAAAAGAAATAAAGAAAGAAAATAAATAAAACAGGACAAAAAAGTGAAAAGTGAAAAACGAAAAAAAAAAACGAAAAATGAAAAAGTTACGTCTAAAATGATTCGAACCTGGCAACTCTGGTTCATAAAGTGTGCAGCCATCCATTGTAGCAAAAATGAAATTGTTATTTCAGAGCATTTGGTAATATATTTATTAAATAAAAGTCGTCTGACAAGGGGAATTAAAACAACAATATTTATATAATAAGTTTCAAATGTACTATATTTTAATAAAAAGTTTAAAGAATCGCAATATTTCAAATATTTTACTGATAAATATTAATATTCATATACTGTGTTATTGTATAAATATCAAGACATACAACTAAATATTAGCCATAATGGGATGTAAATAAGATTTCCCGAATTTAATTAATATATAAGAAAATGTAAAATACTAATTTGAATGAGAGAAATTAGGTAAGTCAAACTTGTTTAAAAAAAAACAACACAAGCTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAGAAGAAGCACAATACAATGAAATGCTGGAAAAAAGAAAAATTATACTTACTACAATGTTCTTGATCTCGGACTGGAGTAAGTACGCCGATCTCATGATCTCTCCAATCAAAAGCTTCTACCTTCCATTCGGATAATGATATTATTATTATATATATTCTTTTTTTTTTTGAAAAATAATGATATTATTATTTAGATTAAAGTCACCACAATCCGTAAATATGACTTACTATTCTTGAGAGAAAAAAATATAATAAAAATAAATATATGAATGAGAAAATGTATTAAAAGAGATGAAGAAGGGAAATATACCTCCATTTTTTTTTTGGTTCTGTGTGAGAGAAATAGAAGAAGGAGAAGAAAAAGAAAAGAGAAAGGGAGAAAGGAACTTTTTTTTGAAAGATGAGAGAAACAAACTTATGTTTATGTGTGGTGGTTTTGGTGTTTATAGAGAAACTTCATCTCCCGAGTGGCCATGGAAATTAAAAGAAGACAAAATACTGTTATTCCTGATTTTTCTTCGGAGAATATCTTTAATTTCTAGAAAATGATACTGAAAATTTGCAGCAAATAAAAAAAGGTCTGCTACCTACTCATTTTGGAGAGCCATATGTAGTATTTGAAAAAAAAACCATGGAAATATGTACGATTTTCTGTTTTAAAACAAACAGTACTGTGAAGAATCAATTTAATAATAATGCATTTCTTTTGAATCAGAATGAATATGTTTGATTCTTCCCTCGCTGAGTAACTCAATGTAACAGTATCCAAAAATTATGTTTATGTGTCTCGTGTTTTCTGTTTTCAAGCAAAATTGAAACAATTGAAGAGAAAAAAAGGATTTTGCAGAGGGCAGTAGCGTTATTTGGAAAATTTTGTGGGTGAATTTTATTTCATGTAATTTTTGGGAAGAGAGTTTATATTGAATCTAATCATGAGAATTAATGTCTAAATAATATATATATATATCATACTTTTCCTAGACGTATATTATAATGTTGCAAATAGTAGTATTTTTTTTCTTTGACAACAGCAAATATAATAGGTAGTATTACTTACATCCTTGGAATTCATTGAGAAATATAGTCCAAAAAAGCTTTTTATTAAAATAGAAATTCATTTTTTTCCCATACATTTAAATATTAGGGTTCAAAATTGTAGTTATATATGACATATTTTAAATATTAGTATCTTGTCCACTTATTACCATTTTAAAATAGAAGTATTTTTGGACATGACAAAAGTGATTTTTCCATTCCAAACTCACTCTCAAACGTGTCTTTAGAAACGACATTCTAAAATAAATTTCAAACATGACACGAATGGATACTATTAGAATCTAGAGAGTTGATTCTCTGTTTCAAAACTTTGCAAATATTAAGAAGCTAGCCATCCTCTTCTACATTTTCTGAATATGAGATTTGGTGGAAGATTTTGAATTCAAACTAAGCAGTATTTTAGAATTATCCTAAGCAGGGCTCTTCTAACGAAGGAATCAAGACCGGTTTCAGGTTCTTGGAGATTGTCCCACTGAGAAGTTGGGGTTTTCCGTCAGCGAGTCTTGCTGCCTTCCATCATCCACCTAAATCAAAGCAGTAGAGTGTAGTTAGTAAAGTCTTCAATTCAGAGTCATTTAGCAAAAGAGCCGAACGATCTAGAATGGAAGTGGAGGAATTAATACATGAATGGCAGAAGTTCAGGCTTATGGAAGACGAGAAGGATGCGTTTATCTCTTTAAACGCTGAAGAAACTGGTGTTATCAAGGGACAAGTGGATCAATACCTTGTAGGAAAGTTGCTCTCGAACCGTAATATTTCAAAGCTAGCGATCAAGAATGCATTGCAAGGAGCGTGGAAAACAAGAAGAGATTTTTGCGTTGATATTCTGAGCAAAAACGTCTTCTTGTTCAATTTTGAGAGCAAGGATGACAGGGACTGGATTTGGAAAAATGGGTCGTGGATGTTTGATCGAAGCCTGGTCGTTCTTGAAGCGCCTGAAAAAAATCAAAGAGTAGCAGACCTGAATTTCAAAAGATCAGATTTTTGGGTAAGAATCTTTAATCTGCCAATTGGGTATCGAAATGAAATAATAGCCAAGAAGGTTGGTAATATGATAGGAGAATTTATGGAAATGGACAAAAATGAGAATCGCGGAATGTGGGGAAATAATATTCGAATTAAGGTTAAGCTGGAC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Match: XP_022137488.1 (uncharacterized protein LOC111008920 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 3.5e-27 Identity = 68/124 (54.84%), Postives = 91/124 (73.39%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. NCBI nr
Match: XP_023525925.1 (uncharacterized protein LOC111789396 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 6.6e-26 Identity = 71/143 (49.65%), Postives = 96/143 (67.13%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. NCBI nr
Match: XP_022975633.1 (uncharacterized protein LOC111475320 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 2.1e-24 Identity = 67/124 (54.03%), Postives = 89/124 (71.77%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. NCBI nr
Match: XP_022975599.1 (uncharacterized protein LOC111475178 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 1.8e-23 Identity = 68/124 (54.84%), Postives = 86/124 (69.35%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. NCBI nr
Match: XP_023548353.1 (UPF0725 protein At1g02770-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023548361.1 UPF0725 protein At1g02770-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023548367.1 UPF0725 protein At1g02770-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 6.8e-23 Identity = 66/124 (53.23%), Postives = 82/124 (66.13%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CAH1 (uncharacterized protein LOC111008920 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 1.7e-27 Identity = 68/124 (54.84%), Postives = 91/124 (73.39%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IJT3 (uncharacterized protein LOC111475320 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111475320 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 1.0e-24 Identity = 67/124 (54.03%), Postives = 89/124 (71.77%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IL21 (uncharacterized protein LOC111475178 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111475178 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 8.6e-24 Identity = 68/124 (54.84%), Postives = 86/124 (69.35%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FN74 (uncharacterized protein LOC111447330 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 5.6e-23 Identity = 67/124 (54.03%), Postives = 82/124 (66.13%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G9T9 (uncharacterized protein LOC111452100 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 9.9e-20 Identity = 60/120 (50.00%), Postives = 79/120 (65.83%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. TAIR 10
Match: AT2G37435.1 (Cystatin/monellin superfamily protein ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 1.4e-05 Identity = 24/71 (33.80%), Postives = 44/71 (61.97%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. TAIR 10
Match: AT1G63200.1 (Cystatin/monellin superfamily protein ) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 6.8e-05 Identity = 36/117 (30.77%), Postives = 59/117 (50.43%), Query Frame = 0
BLAST of Spg036826 vs. TAIR 10
Match: AT1G63190.1 (Cystatin/monellin superfamily protein ) HSP 1 Score: 44.3 bits (103), Expect = 2.6e-04 Identity = 36/116 (31.03%), Postives = 58/116 (50.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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