Sed0012956 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTCAACCGGATAGGTCAATCACGCAATGATTTCGTTGTTTGGTTGAGAACTAGTTCAACACAAGCATCACAGGTTCAACACAAGCATTCCCTCCCTCATTATATACTAAAAAAAAAATAATATAAATTTCAAATAATATTTTTCTAGTCCCAACACTATTTTCCAAACCTAATCTATAATTCTATTCCACTTGGTGACAGACGGCCTGACGTACGGAACAGGAAAAAAAGAAGCAATTTTCACCCATCTTTTACAAAAATAATTTGGAAGCAGGAGCAGCTTTCTACGCAAGACCGACCAAGAAAATAAGGCGGAAAATTATTTATTGAAATAAACAGAAATTCTATTCCCTCGTTTTATTGAAGCATTCCATTTGGATCGAAAGCAACTGTGCGCGTCCATTTCCATGTCTTTCTGTTAGGGTCAAGCTTTCCTCTCTACAAATCAGCGAGCTTTCGAACGAGGTTGGTTAATCTATCTCCCAATTTATCGCCTTCATTTTAGGGATTTTCATGTTCTTCATCCAATAATTTGCAAGTATTTGTAACCATACTCCATCGCGGTTTTCGATTTCAGCATGTCAGCTGATTCAAGGAGTCGAGTTACCATTACACTCGGCCGTAGCGGAGGACAGGTTGCTTCTCACTTTTTCGACCGTATGTTGTTTCAGGTTTTGCTGGGAATGGTTTCTCTTCATGTTTTATACCTTTAGCAATCACTTTGTAGGTAGTCAAAAAGGCTGGACCAGGAACCGATGCTTCCGTTTCTGATTCTTGGCCTGTTTCTGGAACTAAGAGGTCTGTAAGAGATAGATTGGGAAATACCCCTGATACTGATCTCTTTTATGGAACCCAACTCAATAACAAACGGTATATTGCCCTTTCCTTTATTGGCTTCGGTTAGTTGTAACTTACAATTGTGGCGTTTGCTCCACTTTTGGTGCTTTGATCACTTTGGTAATTGGTAATCATGATGAATGAATGTGTCTTAAAACTATTTGCAAACTATTTGCAACTAATGGTGTGTGGAAGAACAGCTTTGGGTCGTTCAGATTAGACTCTTGACAACCACTTTGTACAAACAAGTTGTGAGACTGATGGGCCTATAGTTGTAGTCTGTCCTTGCGATGACACAGATGTAGGTCTCATTCGGACTAGCATTAATAATATCATTTTTGAAAAAGAAGTTGAACACTATCTTGACATAATCCTTAATGTTGTTCCACAAGTTTTCAAAAAATTTGGCTGTGAATACGTCTTGTCCATGTGTTTTATTATCTCTTTTAGTAAAATGAGCTTCAAGGGAGAGTTACTGCCCAAAAGATATGGGGCTCCAATCTTGAATATTAGGCAATGGTTGACGGTTCTTTTTTTTTTTTATTGTGTATAAATCATTGAAGAATGCAACAAATTTTGCTTTGATATAATGATAAAAAACCAAGCTATTTGCACTCTCGGATAGAATTTGGACAATGGTACTTTTTCTTCAGTTGGCTGCCACACTTCTATGAAAGAAACTAGTATTCTCATTCTCTAATTCAAGCCACTGAGCTTTACATCGTTGCCTCCACAATGTCTTTTCCCTTGCACTTAGATGAATGATGTTTTCCTTTAATTCAACTCCTCTATTGAGAAGTAGCAAACAAGGGAACTACTTCTTCTTTCAAGTCAGGAAGGTTTAACTCGTCTTTGATCTCCCGACTATTGGCTTTATAATTGCCAAATGTATCGTGATTTCAAAGTTGAACCTCTATTTCTTTATGAATGCATGGCCTGACCAACCATAAAGTGGACTATTAATCCACCAATTCTCCCAAAACTTTGGGAATGATTTATGCTCCAACCAAGCATCGAAGAAATGGAGAGTAGGACCGCAAGTCTCTTTCCCAAGGATAAGACATATAGGGAAATGACTCTCCAATCTTCTAGCTTTCATGGACATAAACTTGTCGATCATGCTATCGGTTAAGAGAAATTTGTCGATAAGAGTCAATCTGGGGTGCTCTCTACCACTTGACCATGTGAATTTCCCTTCGGCTAAAGGAACATCAGTTAATTCATTAGAAGAGATAAAAGGAGTTAAATTCCTCATTCCAGAGGTGGTGTGATTGGGATTGAATTTCTCCCAAGTGCTCCTAGTGATGTTGAAGTTGCCTCCAATCAACCAGTCAGACTACCTTTGGCCTTAAGAGTGTTTAGTTCAATCCAAAATTGATCTCTCTCTCTTTGTAGTTATTTGTACCATAAACCCTTGTAATTCAGAAATCAAACCTATCAGATAAAGCAAGATGTAATGTAGGGGTAAGGAGTATGTACCTTGAACCGCCTCTAAGAAAAAAAGACTCGTTCCATAGGATAGCAATGCCACCAACAATTCCAATCAAAGCTAGAGTGGTCCAAGCTAAGTTTTAAGATTTAACGAAGTTTGCCCATGGCACTCCTTTTTGTTTCTTTTTTGATAAATGATAATGAACTAAATATTTATCTGGAAAAGAAGGAAAGAATAATATAAAATTAAGGGGCATGCAAAAAACAGCTAAAAAAAGCTAGAGAGACTCTACAAAATCTGTCTCAAATCAAGAGAAATAACTCCTAAATGTTCAGCTATTTATATGCGTCTTCATTTTTTTGAGTGTAGACAGTAGATTAGTTTTTTTTTCAGTTTTACGTTTTATGTATCTTTCTATTTTCTTAAATTCTTTTGCACTCTTTGAAAATTTACACGCCTTATTTATCTTCTTGTTAGATTACGAGGAGATGGTGGCATGTCAAATAGGAGTTCTAATGGGTTGGACGGTATTGAATTTAATCAATCTAATTTTATTTTTCTTCGTGCTAATGAAATTCTAATACACCCTCTGTTTTCTGTTATCCTTAAAATCAGTGTCACACATTGGTAAAGATGACCTTCGGTTTAAACTCTTGCAAAAAGATGCATCTAGGCGTGCTCAAAGTGACAATAAAAGGTGCTTAGATCTTCGGGAGAAGCTACCTAAGGCAGATCAATCCCCTATTCGTCATCTCGATTCACGACATCGAGATCCACCATTGCATAATACAAATATCTTACGCCAAAGCCCCTTGACTAGAAAGACAGATGGGTTTTCTCAAAAGGAATCATTAGGAAGTTCTTATTCCACATGGACCATGGATAATTTGAGACAAGGATCACCTGCTAAAATGGTAGAATCTTCAAGGCGGTACTCTCTACAAAGAGATGATGAGAAACTACAGAGAAGACCAACAAACCTTTCATTTGAGAACCCGAGATCAATGAGCTATGTAGCCAAAGATGTTCACAATGCTTCTGGTTCTGTTAGTAATGCAACTTTTTCAACTAATTCTCTATTGCCTCCTACGTCAGCAAAGCGTGTGGCACCTATCGCTTCTCTACATCCTCCGCTGAGTGGCATTACACACAAAGCTCTTTATCCAGTATGATCTTTTTATTTATCCTCCCTATTAAATCTTTCAGTGTTTTGGCTTTGTCTTTCTGTAACTTGATTTTTCCAACCTGATTTAGAAGTAGCTTCTTCCTCCTGTTTTAAATTATTTGGTTTGTTACCATGTTTCTAATTTGTTAATTTTTAATAACGGTAAATGTTGTATGCCATTATAGGCTGTTGATCTATTGAAGAAAGTTTTTTTTTTTTTGATTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTGGGAAAAGGACAAGCTTTCATTGAGGAATAGACTATAAGCTATTGATATTCTGTAGTTACACATTTTTAATTAAAATTTAATTTCTTATTAAAGGAATAGAGTTGGCAGCTTTATATGCATTCTGTTTGATGATGGATGAGGAAATTATTATCTTGTTCTTATTCTTTTGGATTGAAGTTATACTATGCAGTTGGTTTTGGCTTGTTTTGTTTGGGCTTTTTTTTTCATAAGCCCCCACATTCCTTCATTTTTCTAAATGAAAGCTTGGTTTTTTGACCAAGTGTGATGATAGATGAGGTAATTAGACATCAAAAAGCTTAGGGGAAGTTACAAGCACTAGCAGTCGAGGCAAATCTTGCTCATTGACAAGCTAGGACATGAGTAAAGGTTTTTGTTCTAGTTAATGTCTAAATAATCATGTGAAATGAAATTTTATGTAATGTATCATATGATAGAAAAAAAAGAAGAAAATAAAAGAAATTGTCATTGTATTCAATTGATGGAAAGGATTGGAGAACTGATTGGATCAAGTTTGCTGTCCCCTTTTCTGCCTTTCTTCATCGTGTCTGGGTCAAGTTTTCCCCTAGTTTTTGCTTTCATCGTTTCTTTTTTAGAGCTATTCTCCTAGTTCTTATCTCGGCGTCAGCTTTTTTGCAATGGAAAGAAGTTGTTTGTATTAACAACACTTCTTTCTCCATATGGTTTGATAATGAAATTATTTATTTGAAAAATATTTCTTATGACCTACATATCCTTTTGTCCCATTTCCATCTTCTCTGGTTTGTCAATTGGTTCGAGGTTTTACTCAAGAGAACTCATTCTTTTTTTTTTCATCAATAACAATATAGGGGCAGAGATGGTTTTATTGGTCTTCAAAAATTTCGATTTCGAGATGGTTGGTATGCTGAATGTATTGTTTGACCCAAATCTGGTGGGCATGTTTTGATCAAAGTTCCTTTGAGCAATCAGAGTTTAGGTTGGCTGATTTTCCATGAAATGCTTTTGAACGGTTTGAAGGATCTACAGTCGGTTTCTGCTAAATCTCCCGAGCAGCACACATCCGGCTTGGCTTTTCCGTCCAGCCCTAAGCTTGTTTATACCTCCCCTCAAATCAACTCGTGTTGGATCAGGAAACACCAAGAGGTTCTTGAGAGAGATTTTGATAACATTTGGGTGGTTACTAAATTGTTGCTCACAATGATTGGAAAGCTATTGCTGCTACTCTTAGTCGCCTTTTTTTGTCAAATGTTGTGATCAATCATTTATATGCAGACAAGGCTTTGGTCATGGTTCCTACATGGATCTTG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ATGTCAGCTGATTCAAGGAGTCGAGTTACCATTACACTCGGCCGTAGCGGAGGACAGGTAGTCAAAAAGGCTGGACCAGGAACCGATGCTTCCGTTTCTGATTCTTGGCCTGTTTCTGGAACTAAGAGGTCTGTAAGAGATAGATTGGGAAATACCCCTGATACTGATCTCTTTTATGGAACCCAACTCAATAACAAACGATTACGAGGAGATGGTGGCATGTCAAATAGGAGTTCTAATGGGTTGGACGTGTCACACATTGGTAAAGATGACCTTCGGTTTAAACTCTTGCAAAAAGATGCATCTAGGCGTGCTCAAAGTGACAATAAAAGGTGCTTAGATCTTCGGGAGAAGCTACCTAAGGCAGATCAATCCCCTATTCGTCATCTCGATTCACGACATCGAGATCCACCATTGCATAATACAAATATCTTACGCCAAAGCCCCTTGACTAGAAAGACAGATGGGTTTTCTCAAAAGGAATCATTAGGAAGTTCTTATTCCACATGGACCATGGATAATTTGAGACAAGGATCACCTGCTAAAATGGTAGAATCTTCAAGGCGGTACTCTCTACAAAGAGATGATGAGAAACTACAGAGAAGACCAACAAACCTTTCATTTGAGAACCCGAGATCAATGAGCTATGTAGCCAAAGATGTTCACAATGCTTCTGGTTCTGTTAGTAATGCAACTTTTTCAACTAATTCTCTATTGCCTCCTACGTCAGCAAAGCGTGTGGCACCTATCGCTTCTCTACATCCTCCGCTGAGTGGCATTACACACAAAGCTCTTTATCCAGGTGACGAACTTCAAAGCATTGATGGCATGTTGCAGTCTCTAGGATTGGGAAAATATTCCATTCTTTTTAAGGCCGAGGAAGTTGATATGACTGCCTTGAAGCAAATGGGGGAGAATGATCTCAAAGAGCTTGGAATACCTATGGTATGGCATGGGATTCTAATAAAATCATGCATCATTTTATCCCAACTTTCTATCTTCAATATGGTATCAGAAGATCAACCTCCAAATATGCAGCCTCGACGATCAACTCGTCCAAGCCGACAACCCAAATACCTACAAGCATATCATTGTAGCTTGAAGAAAATACTTCTTGCAATCGCTCCACGTTTCAAGCGACAACCGTGA MSADSRSRVTITLGRSGGQVVKKAGPGTDASVSDSWPVSGTKRSVRDRLGNTPDTDLFYGTQLNNKRLRGDGGMSNRSSNGLDVSHIGKDDLRFKLLQKDASRRAQSDNKRCLDLREKLPKADQSPIRHLDSRHRDPPLHNTNILRQSPLTRKTDGFSQKESLGSSYSTWTMDNLRQGSPAKMVESSRRYSLQRDDEKLQRRPTNLSFENPRSMSYVAKDVHNASGSVSNATFSTNSLLPPTSAKRVAPIASLHPPLSGITHKALYPGDELQSIDGMLQSLGLGKYSILFKAEEVDMTALKQMGENDLKELGIPMVWHGILIKSCIILSQLSIFNMVSEDQPPNMQPRRSTRPSRQPKYLQAYHCSLKKILLAIAPRFKRQP Homology
BLAST of Sed0012956 vs. NCBI nr
Match: XP_038890159.1 (uncharacterized protein LOC120079818 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 506.9 bits (1304), Expect = 1.5e-139 Identity = 260/315 (82.54%), Postives = 284/315 (90.16%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. NCBI nr
Match: XP_008465721.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503334 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.0e-137 Identity = 278/383 (72.58%), Postives = 295/383 (77.02%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. NCBI nr
Match: XP_023545921.1 (protein bicaudal C homolog 1-A-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 1.3e-135 Identity = 274/384 (71.35%), Postives = 295/384 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. NCBI nr
Match: XP_022946530.1 (protein bicaudal C homolog 1-B-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 1.3e-135 Identity = 274/384 (71.35%), Postives = 295/384 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. NCBI nr
Match: KAG7029996.1 (hypothetical protein SDJN02_08340 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 1.3e-135 Identity = 274/384 (71.35%), Postives = 294/384 (76.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPI7 (uncharacterized protein LOC103503334 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503334 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 3.4e-137 Identity = 278/383 (72.58%), Postives = 295/383 (77.02%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G443 (protein bicaudal C homolog 1-B-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450567 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 6.4e-136 Identity = 274/384 (71.35%), Postives = 295/384 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPG7 (uncharacterized protein LOC103503334 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503334 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 493.4 bits (1269), Expect = 8.4e-136 Identity = 278/384 (72.40%), Postives = 295/384 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DIL1 (Protein bicaudal C-like protein 1-A-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold278G00450 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 493.0 bits (1268), Expect = 1.1e-135 Identity = 261/316 (82.59%), Postives = 278/316 (87.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KGR5 (uncharacterized protein LOC111493741 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493741 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 1.2e-134 Identity = 273/384 (71.09%), Postives = 295/384 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. TAIR 10
Match: AT1G70180.1 (Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 142.9 bits (359), Expect = 5.3e-34 Identity = 139/458 (30.35%), Postives = 187/458 (40.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. TAIR 10
Match: AT1G70180.2 (Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 141.4 bits (355), Expect = 1.6e-33 Identity = 138/457 (30.20%), Postives = 186/457 (40.70%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. TAIR 10
Match: AT5G48680.1 (Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 3.3e-07 Identity = 26/43 (60.47%), Postives = 32/43 (74.42%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0012956 vs. TAIR 10
Match: AT3G07170.1 (Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 4.3e-07 Identity = 33/73 (45.21%), Postives = 39/73 (53.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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