Moc10g03420 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview


Name	Moc10g03420
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	Unknown protein
Location	chr10: 2406350 .. 2419657 (-)
RNA-Seq Expression	Moc10g03420
Synteny	Moc10g03420

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGGTTGATCATTACAAACTCCGATCGCCTCTCCACTCTCTTCTCCCTCCGACTACGGAGCCCTGGATGATCATTACGTCTAGGGTTTCACGAATCGGAATGAAATCAAGTACGGCTCGGAATGAAATCAAGGTTTTTAGTGGGTGCGGACCGTGTAGCTCTTCTATTCTTTGCGTCTGCTGTGCTGTTCTTATTGGGGATGAAAGAGCTATCAGAATGAAGTCGACGAGGAACGTTTCCACTCAGATTCTCATGGCCAAACCTGAAGCCACCTGGATGAAGAGAGGTCAATCTTTTCTTGAAAGTGAGATGGTGAATGTCCTTGGCTTCGGTTTATGGTTGTCTTACAGACTTGACTTGTCTTTCCTAGTTTCCACCAAGTACAAAGAATGGCATGACCCTCTTGAATTGGTTATCAACCAAGACTTCCCTAATTGCACATATCACCTACAAACCATTGTTGCTCTCCATTTGCCATATTCGGTCGTGGCAAATTTTGGAGCTCTCCTCGCAGCCATGAGCACTGAGCAGAAAGCAAGAATCTTTCAGTTCCTAGTGGAATTAGTCAAGTTGCTGAAAATAAATTTAATGGATGTGGGTATGGGTATTCTCTTAGGAGGTCAAGTTTGGCAATGGCTTGGGTCTCTTGGTCATAACGGCTTAGAGGTCTCAAATTCGAATCTTCTGGTGGGTTCAATACCAAAAGACTTTGGGGTTAGATTCTTTATATACCATTGGTTAATTCAAGAATTGGAGATGAGATACTTCGGAGGGAATCGACAAGAGAAAATAGAGGAACCTCTTCTTCCAAGGGGTTCGCGGTTTACTCAAATGTTCGTTGCTCTCCCTCTCTTTGGCGCATCTTCAGTTCATGGAGTCAACCATCCAGGCTCTTATCGCATTCTGGGTACCACCGTCCCTCTGTTTCACCCCATTCTCAATCTCGCTCTTTCAATTTTGCGATCGTCATTCCAAGTTTCTGGATGGCTTAGCATGCCAGTATTTTGGCTCTGGAAATGTAACCGATGGCTTGAAGTTGTTGATTTACAAGACGTGTGGGGGCCATGGATGAGTCAGATGGCGAGATTAGAAGCTTCGAGGGAGGGCTTTTACTACATACAGTATTTGATTGAGAAACATAGAGGAATAAATCAGCTTGCTAAGCGGAGGGGTGATCTATGCATTGGATCTTTGATAAAATGCCTCAGCTTCTTCTGCACGCACGCTCCAACGGCTATAAGTACGGAGTCGCTTCTGGTTGGATTAAGAAACGACCCCTCGAACATTTCCCGCCTTCTTATTTCTCCTTCTCCTCCTCCTCCCTTTGCCATCGCTATCGTGATCGCTCGATGCATGCCACCAGTTCCACCGCTTCGATCATCTCTTCCTTCTTCTTCATCCCGTCGACGGGAGCCGTTGTTTCTCCGTCCTCTGTCTATGGCCTCCGATTCAAACTGTGGTGGTCGGAGGGATGTTAGGGTTCGACAACCGAGGGAGAGGCGCCACAAAAGTTCCCATCCCTAG

Protein sequence

MVDHYKLRSPLHSLLPPTTEPWMIITSRVSRIGMKSSTARNEIKVFSGCGPCSSSILCVCCAVLIGDERAIRMKSTRNVSTQILMAKPEATWMKRGQSFLESEMVNVLGFGLWLSYRLDLSFLVSTKYKEWHDPLELVINQDFPNCTYHLQTIVALHLPYSVVANFGALLAAMSTEQKARIFQFLVELVKLLKINLMDVGMGILLGGQVWQWLGSLGHNGLEVSNSNLLVGSIPKDFGVRFFIYHWLIQELEMRYFGGNRQEKIEEPLLPRGSRFTQMFVALPLFGASSVHGVNHPGSYRILGTTVPLFHPILNLALSILRSSFQVSGWLSMPVFWLWKCNRWLEVVDLQDVWGPWMSQMARLEASREGFYYIQYLIEKHRGINQLAKRRGDLCIGSLIKCLSFFCTHAPTAISTESLLVGLRNDPSNISRLLISPSPPPPFAIAIVIARCMPPVPPLRSSLPSSSSRRREPLFLRPLSMASDSNCGGRRDVRVRQPRERRHKSSHP

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Moc10g03420 vs.


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InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 458..507

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Moc10g03420.1	Moc10g03420.1	mRNA