Moc10g00060 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTGCTTTCTGCTGCTGTTTTCGGCGATCCCCTGACCTCGATTATCTCTGCCATACTGCCGGTTAAAAACATCACTTCTGTTAGATTCCAGAATCGGCCCGTATCCCTACGCCTACGATTCTCCCTCTCTGCAACCAACTCCGTCAGCAATGACATTACAGACGACAGAAACAAACACTCGATTCACCTTGATAGCCTCAGAGCGCTGGAATGGGATAAACTCTGCGATTCCGTTGCTTCATTTGCCCGCACTTCTCTGGGCCGTCAAGCAATCAAGGTCTCTTCTATATCGCACCTAAATTATTATATTCCATTCTATTACACCTAACGTTTTTGTTTCTCCTACGTACCACTACTGCTTCACTTTTTGATTCATTGGAATAAATATATTTTACCAAGCATGGGTCAAACTAATTCCTGAAAGCTTTGTAACAGCAGAACCAACCGACAAAAAGTCTAAATTTAAAAATATTAACTGCAACAACGTTACAACCAAGCAATTGCTCTGTTATACCCCCTCAAATTGGATCCTCGGGGGTGATTTTGATATTGTATTTGAGAAGAAATATAGGAGGAAGTGGCTTGGTTAGAGCATCAGCTAGTTGTTCAACGGAAAAAAAAACAGGTTCAACTTGAATGAGAACCTCTGTGGACTTGACCACAAACCTGCTGTAACATTTTAAAATTTAACAAAAGGAGTTTTCATATTTAGGTACATTAGTTCGACTTAAGTTTCTTGATTAAATACGGAGGAGAGTTGTTTTGTAAGTTTAATGTTTTGGAAGGCTATTTTTCATGAGTAATATTTTAGAAACTAATTTTGTATTTAAGACCCTAGATAATTTTTTTTTTTTGAGTTCAACAGTATCTCGGGGTGGAGATTTGAACCTCCAACATTTTGGTCGAGGATATATGTCTTAGCGAGCTATGCTCGGGGCTGACAACTCCGTAGATATTTGAATCCTATAAATATCTCCACCCACTTCAATTTCACTCCACAAAGGTATTATTTGAGGTAGAGCTTTTGAGTTCAACCTCTTAAATTAGTACACAGTAGTTCAAGCTATACAAAGTTTTAGTTGGTATTTGTAGGGGATAAATGAAGAGAAGTTCCGTGGCATTGGTTGCAGATAAAAAATTCATATCATTAAATTAACCGAAAATATTACTCTTCCGTCGGTCCTTCATGTCCTTAAATTAGCCTACAATCTTTTATTAGTTAGTAAAATTGGACCAACAATAGAGAATTAACATTTGCCAAAGCATCAAACTCGAAAGCCACAAAACATTAAATAACTCAAATAGGAGCCTCAAACACTGAAGCAAAAGGGTAGTGGAAGAATAGATGCTGCGAAGTTTCACTAGAATTAGTGCATAAGAAATAAACAGATGGCTGGATGATCATTGAAGGAAGCTTCTTTTGTAGGACTTCCTCCGTATTTACTTTACCATGAATAAGAATCCAAATGAAAACATTAACTTTCTTTGGACTTTTGGATTTCCAAAGAGGAGCATCATGCTCTTTCGGCAAAGGAGCATATGAACCAATTGGCTTGCATAATTATCTTACCGAGAAAACTTTAGAAGATTCCAACAGCCAACCTATTTGATCTAGCTTCATTTGGCAGATGAGCATGGAAGGTGGGCCACGGGTGCCAAGCCGACCAAAATTTGATGGAGGTTTTCAAAGTTAAATGGTATTGGTTGAACTTGCTGGGCAAGTAGGAGCAGGAAAACTAGATGGCAGAGATTTATTACCTTGAATCGATGCTTCAGAAGTTAAAAAGTTTTTCATGAAGTTTCCACTCCTGACGGAGTTTGTATTTTTTACATTATTGTTCCTTTTCATGAATCAATGAAAAGTTCGTATCTTGTTCAAGAAAAAAAATGAAGTTCCTCAAATGAAGTTGGGTTATCTTGGGCTTGGACAGCATGTACTTGCTCTTTGGATCTATCTCCTTATTACTTGTCCATCAAGAACTTTACAAACTGAATCTTCAGCATCATCTGGTGCTCTAAAATAGCCAATAGTTGGCACAAGCCTTTACAATTTGAAGAAACTTAGTGATCCTTTGGGGTCCTCTTAAAGTTTTAAGATGAATTTTTACTTTGATGTGTCTTCGACATGATGTAGCATAAGTATGTTGGGGGTTGTCTAGGCTTCTTGTGAGGTTTTAGCTGTGAATGAAATGATGGATGGTGAAATGAGATCCTACAAGGGCATTCGGGTGTCAAATTTATCTGAGCAGTAATTTTTGTTTCTTATCACAAGTTATCATTCTTGTCTGACCCAGAGTGTGCATGCAAGATTTGGTATGATGATGCGTTTCTAGAGAAGCTAGGCGTGGTTTTGTACCATCAACATAACCAGTGAGATCATAGCCCACAAAAGGAGCGTGAAACTAGAGCTTTTATGTGACGCAATTGATGGAGATGAGTTTGAGTGGGGCTTGAGTTGAAACTTAGTGGCAACCATTGTGTTGTTTGGTCCATTGGTCTCATGAATCAATGGATTGGAAATGGAAGTTAGGGTTGAGGGAGCTGGCAATTAGAATTGATCTGGTTCCATCATAGCGTTGCTGATATGAAAAGTACTGCTTCGGTTTTTAATTGATAGGATTTAATATTTATTACAAAGCATGAATAAAACTAATTCCTAAGAGGTAGGTAACAGCATAACTAAACGATACCAAATTCAAGTTAAAAAATAATTCAAACAGTATTATAAACAAGTGATTGATAGTAATTACTTAAAAACTTTCTTTATGTTCTATTTAAGCCTGTTTTAATCACTTTATTGTTAATTGGTCGGTGTAATGGACAGGCCCAACTTTGGTCTTTGAACCGGACATATGAAGAAAGTTTGAGACTTCTGAATGAGACTAATGCGGCTGTAGAAATGCAGAAGCATGGTGGATGCAGTTTGGATTTAAGTGGCATCGACCTTCTTCTGGTTAATGTCCTGTCACTGATTTTCTGTCTTCTATCTTGGTCGACTGAATGAATTTAATTGCCAAAATATAGAATTTAGGAGACGCACTAAGCTGTTTGAACTTTGAATGAATTTGTCTCAGGCAAAATGTTGGGAACAATCACGATACTTGCCTTCCACAACTAGAGGGGAGTTTAATTCTTTATTTTGTCTTAAGGAAACAAAATTGTATATTTTTTTTAACAAGATACGGACTTTTCATTGATGTTGACGTATGAAAATGAACAAAAATTGTTCAAAAATACAAACTCTCAGGGAGTGAGGAAAGTAAATACAAATAAATATAAGAAACAAAGAAAATTAACCTGGAGTTATAAAAGCCTCCTAATTAAAACACATCATGCTAGGGGAATAATTAGAGAATAAATTGGAAAGACCACATTAAATTTGGCAATGTTGAGAATTTCTAGAGCTGGTTTATTTTTTCGGTTTCTTTCAAACCATAGCTTAAATATAGACGCTTTCACTCAATTAACCCAAAGCAGATTTGCTTTTGAAGGCAAACGTAGTCAAAATAGTAGCTGCTGTACATTTGTAGAAACTTCTGAAATGGACACAAGATAGGTTGAAGAGCTGCAGCAAAGAATTCCAACATCCAGCAGCATAGTTGCAAAGAAAAAAAAATATGCATCTGATTTTCACACAAAGCTTCACAAAAGATACAAATATATGGCTGAAGAGACATAAAAGGCATCTTATTTTGAAGTACCTCCACGGTATTATAAACAAAAATGTATTAAATTAGGGATTTATTTATTTAAACCTTAAAATGGCTTTAGGTTCGCAGGCATAGCTAAGGATAATGAGCAATAAATCTGTGACAAATTTTAGATGTTTAGAATAGTAAATAAAAAGTTTCTAATTATGTTTTTCATCTTTATAGTACTCATTTGCTAGCCTTCTATTTCATGTATTTTTTTGAACAAGAAACAAACTTTTTATTGATAATATGAAAAGGAAGAAAAAGTTCAAGGATACAAGCTTCCAAAGGAAGCGAAAAAGAAAGAAGAAAAGCAACCAAACCTAAGAACCAAAATACAAGGAAATAGACGAGATCTGAAGCCCAAGAAATATCAAATAGACTACATCATTGATAGGCGTCTATCACTAATAGACTAATCAGTGATAGAAGTTTGATAGACTATGTCATTGGTAGACGTCTAACATTGATAGACTATTCCTGAGGCAGACATCTATCAGTGATAGACTATATTAGTGATAGATGTTAGATGTTTATCAATGTTATAGTCTATTAGTGATAGATGTCAATAAGTTATATACAAAGGTAAAAAGAGAATTATGTACAAACGTCTAAATAGGTTCGCAAAAAATTACCATATTTGTAAAATCGTAATCATGTTGCTATATTTGCAAATATAGCACCGTTAATTGCCACACATTGAAATTTCCCTAGTGTTTATTCGGGGCAAGTTTTTGTAAACTCTAGTGGGAGTGGTTGTTTTATTGTAGTTAATTTTCGGTTCTTTGAATTATTCAACTTTTCACCTTGTTTCAGAAGAAAAAAAAAAGAACTCAAAGTGGTTACTGATGCCACTGTCTTATTTACCAAGAGTGTAATTATTTCATTACACTTCAAAGTGCTCTGTCTTGTTGTTGAAGGTGAAATCTGCAATAGAACATGCTCAAAGAAGTCTGCCAATGGATGGAAATGAAGCAAGGGCTGTTGCAGCTCTTCTACAGTTTTCTGATATGTTGCAATTTAATTTAAAAACTGCAATCGAAGAGGATGCAGACTGGTTCACCCGTTTTATGCCCCTAACGGAAGTGGTAAATGAAGCATCTTTGGGTGTGACCTTAAGCCACTGCTATATTCTATAATATTATGTAACCTTTTATTTAAATCTTGATTGTAGGTAATGGGAATGGTTGTAAATCAATCACTGATTAAACTGATACTGAAAGTTGTAGATGAAGATGGCTCAGTTAAAGATTCTGCGGTTTGATCTTTATAAACTTACCGATTTTGATTTTGTTACTTA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BLAST of Moc10g00060 vs. NCBI nr
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BLAST of Moc10g00060 vs. NCBI nr
Match: XP_022141292.1 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1596.6 bits (4133), Expect = 0.0e+00 Identity = 841/842 (99.88%), Postives = 841/842 (99.88%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. NCBI nr
Match: XP_022141293.1 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1588.2 bits (4111), Expect = 0.0e+00 Identity = 837/842 (99.41%), Postives = 837/842 (99.41%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. NCBI nr
Match: XP_022141294.1 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1497.6 bits (3876), Expect = 0.0e+00 Identity = 799/842 (94.89%), Postives = 799/842 (94.89%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. NCBI nr
Match: XP_022141295.1 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X5 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1320.1 bits (3415), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/693 (100.00%), Postives = 693/693 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P73625 (Endonuclease MutS2 OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 313.5 bits (802), Expect = 7.1e-84 Identity = 247/804 (30.72%), Postives = 383/804 (47.64%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A9VJL2 (Endonuclease MutS2 OS=Bacillus mycoides (strain KBAB4) OX=315730 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 288.9 bits (738), Expect = 1.9e-76 Identity = 240/786 (30.53%), Postives = 395/786 (50.25%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0RJF2 (Endonuclease MutS2 OS=Bacillus thuringiensis (strain Al Hakam) OX=412694 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 284.3 bits (726), Expect = 4.6e-75 Identity = 243/786 (30.92%), Postives = 393/786 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q72ZJ0 (Endonuclease MutS2 OS=Bacillus cereus (strain ATCC 10987 / NRS 248) OX=222523 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 284.3 bits (726), Expect = 4.6e-75 Identity = 238/786 (30.28%), Postives = 393/786 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C1ETZ0 (Endonuclease MutS2 OS=Bacillus cereus (strain 03BB102) OX=572264 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 284.3 bits (726), Expect = 4.6e-75 Identity = 243/786 (30.92%), Postives = 393/786 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CIQ4 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011726 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1602.8 bits (4149), Expect = 0.0e+00 Identity = 842/842 (100.00%), Postives = 842/842 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CJG8 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011726 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1596.6 bits (4133), Expect = 0.0e+00 Identity = 841/842 (99.88%), Postives = 841/842 (99.88%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CK29 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011726 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1588.2 bits (4111), Expect = 0.0e+00 Identity = 837/842 (99.41%), Postives = 837/842 (99.41%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CI69 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011726 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1497.6 bits (3876), Expect = 0.0e+00 Identity = 799/842 (94.89%), Postives = 799/842 (94.89%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CHN4 (uncharacterized protein LOC111011726 isoform X5 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011726 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1320.1 bits (3415), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/693 (100.00%), Postives = 693/693 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. TAIR 10
Match: AT5G54090.1 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 765.8 bits (1976), Expect = 3.7e-221 Identity = 422/825 (51.15%), Postives = 581/825 (70.42%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. TAIR 10
Match: AT1G65070.1 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 246.5 bits (628), Expect = 7.6e-65 Identity = 234/840 (27.86%), Postives = 393/840 (46.79%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. TAIR 10
Match: AT1G65070.2 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 246.5 bits (628), Expect = 7.6e-65 Identity = 234/840 (27.86%), Postives = 393/840 (46.79%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. TAIR 10
Match: AT3G24320.1 (MUTL protein homolog 1 ) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 3.7e-19 Identity = 73/215 (33.95%), Postives = 109/215 (50.70%), Query Frame = 0
BLAST of Moc10g00060 vs. TAIR 10
Match: AT3G18524.1 (MUTS homolog 2 ) HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 1.2e-14 Identity = 60/215 (27.91%), Postives = 106/215 (49.30%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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