Sed0012447 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0012447
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG08: 26464956 .. 26472612 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0012447
SyntenySed0012447
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

ATGAAGACCGATGGAAATCCAGAGAAAGACCATAACCCCTCCAATGGCACCCGACCGCGGCCCGGAGGCCGCCTTGTAAAGAGCGCCAGTCCCCAATCCGGCAGCGATGCTATTCAAAACATCATCAGATCCTCTAAGGTGGACGACCCCGCTTTCCAAACCCGCCGAGAAACGGTGGGGGCTGGCGTCGGCGGCCTCCTCGAAGAAGAGGTGGTCGGGGGAGGTTGGCGATCGGAACGTGGAGGTGTTGGTAGGGATGGTACAAGCGGGTGTTCCGGTCGCCGGCGGATGATTTGGAGGAATTATGTTCCATCGGAGAATCAAGAATTAGGGTTCGGAAGAGAAGATGGGATTTGGGAATTCAGGGTTTGTGACGAACGGCACAACCCAAAACTTGCCCTCAATGACACCAAACAAATGGAGGCCCTCTCCAACAAGCCCTCCATGGCAATAGGCATCAAGCAGACTTGTGAAAGTAGTGGCTTTACACCATGA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGACCGATGGAAATCCAGAGAAAGACCATAACCCCTCCAATGGCACCCGACCGCGGCCCGGAGGCCGCCTTGTAAAGAGCGCCAGTCCCCAATCCGGCAGCGATGCTATTCAAAACATCATCAGATCCTCTAAGGTGGACGACCCCGCTTTCCAAACCCGCCGAGAAACGGTGGGGGCTGGCGTCGGCGGCCTCCTCGAAGAAGAGGTGGTCGGGGGAGGTTGGCGATCGGAACGTGGAGGTGTTGGTAGGGATGGTACAAGCGGGTGTTCCGGTCGCCGGCGGATGATTTGGAGGAATTATGTTCCATCGGAGAATCAAGAATTAGGGTTCGGAAGAGAAGATGGGATTTGGGAATTCAGGGTTTGTGACGAACGGCACAACCCAAAACTTGCCCTCAATGACACCAAACAAATGGAGGCCCTCTCCAACAAGCCCTCCATGGCAATAGGCATCAAGCAGACTTGTGAAAGTAGTGGCTTTACACCATGA

Protein sequence

MKTDGNPEKDHNPSNGTRPRPGGRLVKSASPQSGSDAIQNIIRSSKVDDPAFQTRRETVGAGVGGLLEEEVVGGGWRSERGGVGRDGTSGCSGRRRMIWRNYVPSENQELGFGREDGIWEFRVCDERHNPKLALNDTKQMEALSNKPSMAIGIKQTCESSGFTP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 28..42
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..49
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..15

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0012447.1Sed0012447.1mRNA