CaUC02G026250 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTTAATAATTATTCGTTACAGAATTGAGAGATTTGGTTGAGTTTACTGAAAACCGAACCGATTCAAATTGCATCCCTACCCCTTCATCAGCAAATTCAAGATTGGTCGGTGAAAGTTGAGATTTCTAAAAGCAGCGTTACAATAAAACAAACAACAAATTAAGAGAAAAAGAGAGTGGAATCATATCAGAACAGATTATTCGTTTGAGTGGATTGAAGTTTGGATTGAATAATTAGGCAGAGAAAAGTCGAAGTGCGCATTAACCCACCCTTCAAATGCGTTACTTTATAAGAGTTTCAACCAATATTCTGACGCAAATTCCACATTTCATAATATGAAATTTCCAAGTTCCCACATTTTTCTTTTGGGTATTAAAATAGCAACAAAATTCCTTTCCCTTTTACCCTATAAGTTTGATTTGATTCAATCCGGACGTTGTACAACTTTTGATTTCTCCCTGCTCCCGCTTTCAACTTCACCCTCAATTCTTTCCTTCTACAAGTTTCCTGTTTCATTCGTGGGGAAGACGAGTCAACCGATTTCTATAAGTTTATTTCGATTTTGAAGTTGTGGGTTCTTTGTGTTTCGCTTATTTTTGCTGATGCTCGTGACATTTCTTTCACATTCTCCACAAGTGCCGCCATGCCATAGTTTATCGTCTATGAGTTTTCTGTAATCGAGAGGTTGATCGCCTTTGTTCTGCGGAATTGCTGAGTTTCTGAGTCTGATGATTCACAGGTGATTTTGTTTATTATTTATTCTCCAGCATGATTTCTGTTTCAGCCTTAATTTGGTATCATGAACGTCTCTGTGTCCTTTTGGGTGTTCAGATATTGTGATGTCTTAGAAGGAAAGAAGGATACTTAGGAAGTTTAGAAAGAAGCTTTAGAAGCTTTACTTTTGAACAATGGGAACTTCTGGAGCTAATGTTACTCTTTCTTGCAATAAGATGTGGAATATTGGAAGTTAAAAGTACCTTTATAGGGAAAGGGACAAATTGGGGCATTGGATTTGTAGCCAAAACGTATCTGAAGTTATTGGCATGCCCCATGTATAAATTCATAAGTTTTCACTATTCACAAGGTGCACAAGGAATTTTTTTTCTAAGTTAATACCTAAACTAGAATGATTACTTGAAAAATTAGGGAGAGAACACCATGAAAAAAGGTCTGGAATTTCACAAGGTTGGCCACCTCTTCCATGTCTTTTTTCTTGCCAGAAATTCGGGAGGTCCCCTAGTTTTAATACAACCATTGGAGTGCTTTTATTGCATTTATCCAAAGACTCTTCCTGTTCCTTCTTAAACTACAGTCACACAAAAGTTGGGACTTATTTTCCTTTGCCTTTTGCCCATAAATTCAACTTATATGAACTTGCTTCAGAAAGATTCCCATCATCTCCTACTAAAATCACTAGGAAAGAACAAATGTTTAATGTTTTACTCTGCTTCTTGATAATGAATAGAGCAACTTGATTGGAGAAGAGAACTGGGGCACCCCTTCTGCATTTTTTCTGCTGTATTCAAACCTTCATAGTGGATGGACCTCATAAATTTGTTTTTGATTTTCTTCTTATTCATGCCTTTCCACATTGCATACTGCACTCTTTTGCTCACTGTAATAATATGTCACAGATGATGTTTATACTTCTGTTAGGGATTTCTTTATTTGTTTTTTTTTCCTCCCTTTCATTTCTGTCCATACTTGTAGTTAATCACAATGAATTATGAACTTTATTATGGTCTCCTCATTTATTACTTTGTTATTGTTTCTCAAGATATTCTTGCAAAATGGTGTACTTCTGTATCTTACATGGCACCTTGGCAGTTTGTGAGAATGAGAATTAATTGTCTAGCTAAGGCACGTCCCTTTCTTTTGTTTTGCACCCCTTGGTGTTCCTAATACTCAATTGCCCGTATGATTGAGCAGTAGAAAATTGGCAGGTAATTTCACTGTGGTTTTACGTGGATGCGTTTGTAATACATAATCATCAGTTAGCATTCTTTATGGAATTGATTCCTGTATCTACTTGGGGTTCTGCTCTTTAGACCTCTGCCTTTAGGATCGCCTCTTGAGTCTTTGAATTCTCTATTAACAAAACCACTGTCTATCTGAAATACAACTAAAACTTTCGTGGTGGGAAAAAGAGCATCAGATTGCAAGAGACAAGAATTGTATAAAACAACAGATTAGAGATTTATTGCAGCAATAGGAGTAGTTAGCAGTGTTCTTTTTCATAAGAATTGCTTTGTTTCTGTTCAATACTGCACTTCTTTTGTTCTTCATATTCGGCATATTTGGGGTTCTAGGTTCATCCTTTCTGTGTACCATATTTTCCCCCCTGTAAACATATAAAACTAAAGTTGAAATCAATTTTGCCTAATTTTTCTTGTTGGCTTCCATTAACGTAATAGTTGGAGATGAAGCATTTTGGAAATAAACCATTTTCAATCTGAATGACTCCACTACAACTTTAGCGGTGGGGAAAAGAGTGTTGGAATAGTCATATTGAATAACATATCAGACATTTTGACTGCAGCAAAAGGAGAAGTAGTTAACAGGTTTTCTTTTCACAATAATTACTTCTATTCAATATTACATTTCTTATGTTCTTCATATTCAGCATTTCTCTGGATTCGAGATTCATTCATTCTTTCTGTCTCAAGTAGTTTTATTATTTCCCCCCTTTAAATATATGGTAATGTATAAAATTAAATTTGAGATCCATATGTATCATTATTTTTGCTTGTTGGCTCTCAAGTAGGTAATAAGTAGAGATGAAGCATTTTGAGAATGGTGAATCTGACTTGGAAGAGGGTAAAATGGGAAAGGACAGAGACAAAGCATTACGCAATAACAGGGTATTGAGATTACATAACCAGGCCTTATTGTCTGGCCTTGCATACTGCATTTCTTCGTGCAGCATGATCCTAGTAAACAAGTTTGTGCTTTCCAGTTATGATTTCAATGCTGGGATATCATTGATGGTCTATCAGGTGATTTCTCATTATTGAAAATATGTTAAGAAGTTAACATTTATTTTCCCCTCGTAGCGGCTTAATATTCTCTAATGTAAACCATAACTTCTGACAGTTAATTGGAAGACTAACAAGTTGTTGCTCTGTTTATTGATGCAGAATTTTATATCAGTGAGTATTGTAACCATAATGAGGTTTATGGGGATAATATCCACAGAACCACTCACTTGGAGACTGGTTAAAGTGTGGTTGCCTGTTAATGTTATCTTTGTTGGGATGCTCATTACAAGTATCTTCAGGTATGGTCCTTCTTTTCCTTGTTGTTTAATTACAGAATGTAAATATGTGTTTACTGAAAGGAAGTTTTGAAGATTTCAGACCCGACATTTTTCTCTGTTCTTTATTGAAAACACGTGCATAATCTTTTATCAATCAACACATGCAAAATTGTTATTTTTCTAAGGTCGATCGTGGAACATAGTAAGTGCATGTTTGGGGTGATTTTGAAATTGTTAAAATTACTTTTGTCATGTTTAAAATCACAATAAAATATAAATTTAATAACTCAAAATTAATTTAATAACTCAAAATTAATTTAATATTTAATTTTATACTTTTAAATGCAATTTTCATATGATCAAATTTGGTTTTGAATGATTAAAAGCAAATTTTAGAATGATTTTGAAAATGACAAGAGTCATTTTAACCTTTTCAGAATCACTCCCAAAGATGCCCTAGATAATTTGATTTCTACCTAAACATTGGTGCACGAAACCATCTTGTGTGCCTCAAAGCTTAAAAAAATGGATTCAATATTGCTTGTCATCCACAAAGCTAACAAACATAGGATTTCCCAGTGGGCATCAGTTTAGCCAAACTTTTGTGAGTTTTTTTTGTACCATATCTTAGTGCAGAAAATAGTTTTCTGCCTTTGGAAGTCCAAGATCTTAACAAGATGGTATATTCTTTGTACACTAATTTGGCTGCTAAAGTTTAATCTGAATTTTTTGCTATTATCCACACCAATTCTTCTAAAACGAATCAATTATGCAAAAGAAGTCATATTCCCATTTCCTCACCTACCAATATGGTTCCACTTTTGTCTATTATACAGTCTCATTTTTGTGCCCGGTGCATTGTGGATGCCATACATAATCATTGTTCACCAATCTCTTGAATTTTTATTACGTTTATGAGTCTATGTTTCTGTCTGTAACTTATCTGTAGGTTTGTGTTTCATGTACTTTCTTAAACAATGTTTACTTCTCCTGCAGTTTGAAATACATTAATGTTGCTATGGTCACAGTTTTGAAGAATGTTACCAATGTAATAACTGCAGTTGGTGAAATGTATCTATTCGGCAAGCATCATGACAACAGGGTCTGGGCTGCACTGTTCCTCATGGTATATAGCATATTTGAGTATTGTTATAAGGACTAGTTGCAAAAGGCACAGTTTATGTTATTTTGTTGCATGCAATAGCTATGTAAAAGAAGGGGAAGAAAAACAAAAATAAAAAAAAATCCACAAAGAGGTAATCTAAAAGTTCTTCCCTTTACGTGTTCTAGCAAATCAACTAAAACGTCTACATGAAGATAAGGAATGGCAGGAAACAATCATGTTGTGAAAAATAGGACACAACATGTAGAAACCAGTTCAATCAAATATTTTTTCACTTTGACATTTTTTTTCAAATATATTTGGAAGATTTTAAACTAATTAAGATTTGAGACTCATCATGGACTGGGACCATGTCCATGTTTGGCATTGACCTTCTCAATTAGAGTGTGCATGCTTCCTAGCTAATTAAAGAATGCAAGGAGTCATTTATTTAATTCCTTGGATATATATTGATTTATTAATGATCTCATCCAATTTTGAGAGTTCATTTTAATAAGCTCTGTGCTTAGTCCAACCAGCTGGTTCCAAGTATTTGATTTTCATTGCGTAAAACTCATATGATTAAATACCTATTATACCTGTCACCATTTGTTAATCACCCATAAAGTGGAAAGG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MKHFENGESDLEEGKMGKDRDKALRNNRVLRLHNQALLSGLAYCISSCSMILVNKFVLSSYDFNAGISLMVYQNFISVSIVTIMRFMGIISTEPLTWRLVKVWLPVNVIFVGMLITSIFSLKYINVAMVTVLKNVTNVITAVGEMYLFGKHHDNRVWAALFLMIISAITGGLTDLSFHAVGYAWQIINCFLTASYSLTLRRVMDTAKQLTKSGNLNEFSMVLLNNTLSLPLGIFLVFVFNEIDYLSRTPLLRLPMFWLVITFSGVLGLGISFTSMWFLHQTGATTYSLVGSLNKIPLSIAGIFLFKVPTSVENSASIFFGLLAGVFFARAKIRERIECNLKWKMEPSLIAAVHFLLAEVGFSFVIGMKLKRILLKSNFDLALVIETRFGFAMESSQNPNTNTNSNPNPNRNQNPVSSPIAVLWPTIDGSLGLSEEESVSYARRFYKFGFALLPFLWAVNCFYFWPVLRSGSFPRIRPYIVGSAIGFGVFMAIISSWALTFSIGGERLFGPVWDKLVMYNLADKLGLTGWS Homology
BLAST of CaUC02G026250 vs. NCBI nr
Match: RDX87289.1 (GDP-mannose transporter GONST1 [Mucuna pruriens]) HSP 1 Score: 675.2 bits (1741), Expect = 4.4e-190 Identity = 364/522 (69.73%), Postives = 409/522 (78.35%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. NCBI nr
Match: OIV98087.1 (hypothetical protein TanjilG_25952 [Lupinus angustifolius]) HSP 1 Score: 664.8 bits (1714), Expect = 6.0e-187 Identity = 362/534 (67.79%), Postives = 405/534 (75.84%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. NCBI nr
Match: XP_038902566.1 (GDP-mannose transporter GONST1 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038902567.1 GDP-mannose transporter GONST1 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038902568.1 GDP-mannose transporter GONST1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 3.7e-176 Identity = 329/335 (98.21%), Postives = 331/335 (98.81%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. NCBI nr
Match: XP_008460892.1 (PREDICTED: GDP-mannose transporter GONST1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 626.7 bits (1615), Expect = 1.8e-175 Identity = 329/335 (98.21%), Postives = 331/335 (98.81%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. NCBI nr
Match: XP_011649404.1 (GDP-mannose transporter GONST1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011649405.1 GDP-mannose transporter GONST1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN62162.1 hypothetical protein Csa_006550 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 625.5 bits (1612), Expect = 4.0e-175 Identity = 328/335 (97.91%), Postives = 330/335 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q941R4 (GDP-mannose transporter GONST1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GONST1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 495.7 bits (1275), Expect = 6.3e-139 Identity = 263/336 (78.27%), Postives = 297/336 (88.39%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84L09 (GDP-mannose transporter GONST2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GONST2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 1.5e-108 Identity = 196/296 (66.22%), Postives = 243/296 (82.09%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FY84 (Probable gamma-secretase subunit PEN-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g09310 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 195.7 bits (496), Expect = 1.4e-48 Identity = 98/139 (70.50%), Postives = 117/139 (84.17%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UTK8 (GDP-mannose transporter OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=vrg4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 157.1 bits (396), Expect = 5.3e-37 Identity = 98/322 (30.43%), Postives = 176/322 (54.66%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2AAF6 (GDP-mannose transporter OS=Komagataella pastoris OX=4922 GN=VIG4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 156.4 bits (394), Expect = 9.1e-37 Identity = 101/328 (30.79%), Postives = 177/328 (53.96%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A371G9U6 (GDP-mannose transporter GONST1 OS=Mucuna pruriens OX=157652 GN=GONST1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 675.2 bits (1741), Expect = 2.2e-190 Identity = 364/522 (69.73%), Postives = 409/522 (78.35%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4P1QZ28 (TPT domain-containing protein OS=Lupinus angustifolius OX=3871 GN=TanjilG_25952 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 664.8 bits (1714), Expect = 2.9e-187 Identity = 362/534 (67.79%), Postives = 405/534 (75.84%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CDG7 (GDP-mannose transporter GONST1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499634 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 626.7 bits (1615), Expect = 8.8e-176 Identity = 329/335 (98.21%), Postives = 331/335 (98.81%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LN00 (TPT domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G302280 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 625.5 bits (1612), Expect = 2.0e-175 Identity = 328/335 (97.91%), Postives = 330/335 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVN4 (GDP-mannose transporter GONST1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023528 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 598.2 bits (1541), Expect = 3.3e-167 Identity = 313/335 (93.43%), Postives = 324/335 (96.72%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. TAIR 10
Match: AT2G13650.1 (golgi nucleotide sugar transporter 1 ) HSP 1 Score: 495.7 bits (1275), Expect = 4.5e-140 Identity = 263/336 (78.27%), Postives = 297/336 (88.39%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. TAIR 10
Match: AT2G13650.3 (golgi nucleotide sugar transporter 1 ) HSP 1 Score: 495.7 bits (1275), Expect = 4.5e-140 Identity = 263/336 (78.27%), Postives = 297/336 (88.39%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. TAIR 10
Match: AT2G13650.2 (golgi nucleotide sugar transporter 1 ) HSP 1 Score: 421.0 bits (1081), Expect = 1.4e-117 Identity = 223/287 (77.70%), Postives = 252/287 (87.80%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. TAIR 10
Match: AT1G07290.1 (golgi nucleotide sugar transporter 2 ) HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 1.1e-109 Identity = 196/296 (66.22%), Postives = 243/296 (82.09%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC02G026250 vs. TAIR 10
Match: AT5G09310.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Gamma-secretase aspartyl protease complex, presenilin enhancer-2 subunit (InterPro:IPR019379); Has 168 Blast hits to 168 proteins in 71 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 126; Fungi - 0; Plants - 36; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 195.7 bits (496), Expect = 9.6e-50 Identity = 98/139 (70.50%), Postives = 117/139 (84.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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