CcUC04G077290 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview


Name	CcUC04G077290
Type	gene
Organism	Citrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
Description	Unknown protein
Location	CicolChr04: 32158565 .. 32165909 (-)
RNA-Seq Expression	CcUC04G077290
Synteny	CcUC04G077290

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGCTTTTGTATCCCATTGACGAAAATAAAATGAAAAACATGTTCAAAATCAAATAGCTTCCAATAAAAAATTAAAAAATAAAGAGAGTGGCCCGGTAGAGGTTCTCCTGACCCACACCTATTGGGCCTCCATTCACCTGAACCACATGGCACCTCTTCCGCCCATACCAGCAGGCGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTATTAATATTTTAATTTAAATTCAATTTTTAATTTAATTGTTTTTCTTTTCTGCGGAAAGAAGGAAGTGATATACAGTGACTTATTGTAATAACTGAGGCGCCGCCGCCGGGGTATTGTGGTTGCGGAAATGGAATTGGGGGAGGTTTTTTTCTAGTACTATTTACAGTATGTAAAATTTCTTATATTACTTTCATATAGTGGACTGTAGCACTAGAAGTTTCTCTAGGAAGGTTCGTGTATTTTACTTAGGCAATCACTAGGTGTAGTGTAACTTTGCTACACTTCCTTCCTATAAACCCTTCATTAATCATATCACATACAAAAATAGATGCCGCCCAATCAACGCTTAAAGTATTTTCTTTTACTTATTAAATAGAATTGTTTTTAAATATATTCAAATTTAAAAAATAAGCCAAAGTATTTGTAAATATAGCAAAATATTATAAAACTTATTATATTTGTAAATATTTTCAATAGTTTTGTCCTTTAAAATAATTATTTTATTAAATATAATTTTTCAATTTATTTTTTATAATATAATAATTTACTAGGTTTCATTCATTTATTCATATAAAATATGCGGATCATGCTTCTAGAAACTGCTTCTAGAAGTTCTATTAGTGATAATTTAGAAGATTCAGTTCATCTTATTTGGTGGGAGATGAGATTCAAGATTTTATTCACTCTAAGGGAAATTTATTTTAATTTGAACAGTATAATTTCTCAAATGTGCGCTCTCAAAAATTTATAATAATTTAGGAAAGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTATATTTCAAAAAGTGATATGATATGCTACGAAGTTTGAGAAATGTTCTAGTTTGCATGCATCAAAATTTATGAAGTTTTGTTCTAGTTTGTATGCATTTGTGGTTTTGCAGACCAACTAGCCATTAGAAAAGAAATTAGATGCCTCAAAACTAAGAACAGTTGAGGGAGGGTGCAATACATAGAAAAACTATTAGACAATCATAATCTTTTGTTTGAAGATTTTTGGGCATGGGATTGAGTCCTAATTCAAAAATACAAAAAGAAAGATATAAGACGAAATTATTAACATTCACTATAATAGATTTACTTTTGTAATCTTTAGTTTTCTTTTAATATCCACAATCACATAATCCTCAGATTAAAAACCTTTTTTGAAAAAAAAAAAAATATTGATACATATTAATTGGAGATTTTTACACAGATATGCACCACATATTTCATAAATATCCTACATTTTAAATTATTTTTATATAGAACTTTTGACGCTAATTTTGGAACAAACTAACATTTTTCGCTATTAAATTTAAATTTTCGAAATTTATAACTACTTCCTTATTTACATTATTTTAATTTCGATTAATTAGCTTTTAATACATAACATTTTGTTCAATATTCTCCACTTTTAAATTTAAATTTTCGAAATTTATAATTATTTCCTTAATTACATAATTTTGGACTACTTGGCTTTTAATGGAGGATATTTGTGAGTTTAGTAATTTTTTAAATAGAGGACATTGTTGTTTCTTCCCCAAATTGTTAGTTATATAATAATATATAACTAACTAAAGAATTTGTACAAAATCATACCGCTAAATATTTAATCTCTAATTAACATCTCTCCAATTAACGAGATTAATATTTTATAGATAATCATATGCGAATCAATGAACTGTGAGGTCTTGTCCCGTGTCTGAATCGCTTGGCTAAATGAAGGAGCTGAAATAAATTCACACTATGAATTCACCCCATCTTCCAAAGGCTCCTGGTGGACGGTATATCTGTAATAAGGTTGACAATTCCATAACCACTGTTCTCTTCAAGACTGTGTACAATGGCTTGTTGTGTGAAACATGATTGGTGTGGATGGATGGATGCAAGTTCCTTCTGTGGAAGATGATTTTGCACTTGGAGATTTTGTTGGTTTTTCTTGAACATAAACAGGAAAACCAGTTCTTCCTAGCTCAGGTATGCAACAAAGACCTGCAATCCCTGCAATATTCATTGCAGTTGTTTTGTACCTAAGATAATGGGATTTCTGATTTAAGTCATACCATCATATCATACACCAGTTTCGTGACAAACTGTTTGAAACAGGTTGCAGAAAGGGAGGGGAAGTATCTTGTAGAGCTGTTTAACAGTATTGGAAAACAGAATATAGGCAAGGCTTTAAGTGCAAAACACATTCCATTGGGCTACCACTCTTGTTTTCGGCAGAGACAACTCCCGGATTGGTTAAACTCATCAATGGCCAACCACGAAATTTTTTATTTTTTTTTCTTACCCATTACTTAGAATTAGACAAGTTTGATTGTTTCTCCCCCAATTACCAGAGGAGAAAAGTTGAAGGATTGGAAGAGATAGTTGAAAAGGAATAAATTGATATTGATATCACTACAAATTTACAACCTCAAAATTACAGAGAAGCTATCTATGTGATGTACAATGTTGTTGTTGAGTAGTGGGACTGTGAGAGAAGATGGAAGTGACAGTTTGGGCCAACCCCACCATGATTCCCATCTTCACTTGCCCTCTCTTTGGGATCAAACGCCCAGACATCCTCCTTCCCAGTCTCTGACCGTTGACGCCGTTCATCATCTTAGCTTCTCCACCCATTTTCCAGAGAGATGACTTAAGAGGAAGTAAAAGGAAATTTGTTGTTGTTGAAGTTTTGGATGCTCTGAAAGGGGCTACATAAGGTGGATTTATATACAGAGCCAATTCAAAATTTATAATTTAATAATTGTTTGAAGATAAGCACTTGTGACGAAGTTGCTTACTTGCTATACACTGCTTACGGCCTCTATTTCAAAATTGTTAGTAGGTGGTCTTGGCTTTTGCACAACAGCTGTCTTTTTTTGCATTTTATATTTATATTTTGTGAAATTACCACTTTCTCCACACAGGGGGTGTCAGCTCTGGCCTACAATTTTGAGAATTTTTCTAAAGGCCAAGGGTGGTTTTGGTTTTTGGAAAAACGGAATGGGATTCGATTCGACCGTGGGGAACAAGATAAAGGCAAACACAATCATGTAATTGAAAAAAAAATTGAAAGTGGAGTTTGATGCCTTTGAATCCATTGACGAAAATAAAAAAATGAAAAACGTGTTCAAAATCAAATAACTTCCCATAAAAAAAGATTAAAAATAAACTAAATGGCCAGGTGGAGGTTCTCCTGACCCACATCTGCTGGGCCACGGTGGCTTTTTGTTCGATTCACCTGAACCACATGGCATCTCTTCCGGCAATACGAGCCGGCGGTTTTATCTATTTATTTATTTATAATATTTAATTTAATTTAAATTTTTTTATTTGATATATTTTTTTTCCTCCGTAGACGGAAGTGATATAAGTGACTGATTGTAACAACTAAGGGGCCGCCGCCGGGGTATTGTGGTTGCGGAATTGGAATGGAGGAGGTTCATGTATGTTATTTATTAAATATAATTTTTCGATTTGTTATCTATAATATACTAATTTACTGAACGTCCCGTTCATCTATTGATATAAAATATGGTGATCATGCTTCTAGAAGTTCTATTATTGATAATTTAAAAATTTTCAGTTCATCTTATTTTGTGGCAGATGAGATTCAATATTTTATTCACTCTACATCTTTTTAAAGGAAATGTAGTTGATCGTTATAATTTATCAATGTGTGTTCTAAAGAATTTAGAATAATTTAGGAAATTAATCTAAAAAAAAGTGGTATTTTGTGCTATGAAGTTTGAAAAATTGTACATCGAATTTGTTTTACAGTCATTCATGATGTAATAATTTTGCTACTCTACTTTGTAAATTCTTGAATTGTTTAATATGTTTATGAATATTTAGTTTTTTGTCCAATGAACTCTTGAATTTGTAATTTTTGTCTAATAGAATTTGAGTATATTTAATATTTTCTAAATTCTCTTAGACATAAAATCAAAGTTGGTGTCTACTCTCATTATAATAAAAGAAAAAAAAAATCTACTAAGATTTTGAACTTTTAATTTTATGTTTAATAAGATTTTGAACTTTTAATTTTATGTTTAATAGGTATATGAATGTTAAATTGTTGTCAAAATGAATTTAGCTCAATTAACACAGTATTTAAACTATCAATCTTAAAATGTTAGTTCAAAGAACCAAAAACCATGAACGAACTTTATTTCATTAGACATTTTAAAATCTATAAAGCTGTTAAAACAAAATTATAAGTTTTGAGACATATATTAGAGGTTTTTCGAGGAATATAAAAAATACATCCTTCGAAGTTTCTTGAGATTTAATCCATACAATTTAAGAAAATTATTTTAAATAACAAAACTGCTAAAAATATTTATAACTAATAGCAAAATATATCGTGATACTATATCGAAAATTTTGTTATATTTTGATTATTTTTGCTATATTTGAAAAGAGTTTTATAATTTATAAAATTATTATTTTTAGTAATTTAAAATAATTATAAAGTAAATTTTTAAATTTTATTGAAAATGACATTGTTCAATTCAATCCAATGCACTGAGCCTGATCCTGACTTCCGGAGCCTACCCAACACACACCTTTCAAAACTAATATTATATTTAGTTTTCTAAATCAAATTTATTTGACAGAGTGTTGGATTGTTCTAAAGGGCAAAGGATTCGCATCCAACTTGTGGGATTTTGTCGCTATTTCTTATCTGGTGAGTGCTTTTATATATATATATCATTTTTTCTTTGGGTATTTTCTGAGTGAGATTGTCACTGTTAACTTTATATTCTCTATAAGAAAAACTTTAGATAGATTTTGCTATTCCAAA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mRNA sequence

ATGCTTTTAGAGTGGCCCGGTAGAGGTTCTCCTGACCCACACCTATTGGGCCTCCATTCACCTGAACCACATGGCACCTCTTCCGCCCATACCAGCAGGCGGCGCCGCCGCCGGGGTATTGTGGTTGCGGAAATGGAATTGGGGGAGGAAAACCAGTTCTTCCTAGCTCAGGGGGTGTCAGCTCTGGCCTACAATTTTGAGAATTTTTCTAAAGGCCAAGGGTGGTTTTGGTTTTTGGAAAAACGGAATGGGATTCGATTCGACCGTGGGGAACAAGATAAAGGCAAACACAATCATGGGCCGCCGCCGGGGTATTGTGGTTGCGGAATTGGAATGGAGGAGGTTCATAGTGTTGGATTGTTCTAAAGGGCAAAGGATTCGCATCCAACTTGTGGGATTTTGTCGCTATTTCTTATCTGGTGAGTGCTTTTATATATATATATCATTTTTTCTTTGGGTATTTTCTGAGTGAGATTGTCACTGTTAACTTTATATTCTCTATAAGAAAAACTTTAGATAGATTTTGCTATTCCAAAGTTCTAATAGATATTAATCGTACTCAAAAACCAAAAAAGAAAAATGAAAATCGATGTACAAATTCATTTCATGTTAAAATATCATTTTAGGCCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATTGTTTAAATTTAGGTTTTATGCGTTCAATATACCTCAAAGTCAAGTCAATCTAATTACTCCCGAATTTAATCTGTCCTCTTAGTAAAATCTATATCCTCATTCCCTTTCTCTTGTACACATTTTGAAAAATTCTATCCCACAAGTTGCTAAAATGGATAGTTATTTGATTTGGTGTTTAAAAAATTGTACTTAATTTCAACCATCTATTTATCATGTTTTTATGTAGTTTTAATTCTTAACTAAATTTAATGAATAGTTAATACGCCAAATAGTAATTAAAAACTTAGTTTTCTAGTTGCCCTGCTCAATTCAATAACCAAAAGAAAAGAAAACGAGAATTGCAAATTTCTTCAAAGAGTTACTCTATTTGTACATTAAAACCAAATAATAATTTAATTACCAACCTAATCAAACTCCAATTGGTCGAGGATTTATAGCCTCTACATTAATCTTCCTTCTTCTATACGCTTAAAAAGAAAATATAATCTCGAGTTCATAACTCCCTATGATCATTATCTCTTTTAATTCAACTAAAATTTCAATTGAAAAGTCCCATATGTAATTGAATTAAGCACAAGCAGTAATCAGGAAGAAAAAACATTTATACATCTCGGTGCAAAATCAACAAGAAGAAGAATATTGTTATTTTACAGTAAATTAAGCAATTCGCTAATTTACAGACATCTCACACCATAAATCCTCCAATTAACAACTTCAACAAAAAAAATTAAAAAAAAGAAAATCACACATAGAAGTTGATTGACGCCATGGGGGAAAAGGCCATCTTAGTTTCTTCCTCGTCTTTCAATTAATAATTCGGAAGATCTCAGCGTCTAATCTGTGACGTTCGATAAAATTTGAACAGCTCACAATCGTAAAATCAGGACCGTGGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACTCAACGCTCCCGATTAACCCGTTCGCTTCCTCGGCCACCACAGTCATTTCCGGCCGCCGTGAGAGAAGATCGAAGTCACTGAGTGAGCAATACCCACTATGATCGCCATTTTCACCTGACCCCGTTTTGGAATCAGACGGTCAGAATATTTCCTCGAAAGATTTCCACCGTTGATTGCATTGATCCTGGTACCGGCCATTACTGCAGCTAAAAGTTGTGATTCAGTGAGGAAAGAAGAAGAAGATGGTTGTGATGCTTCGAATCAATTCGGAATTCATATATATAAAGGGAAAAGAAAGCCCAAAAAAAGAAGGCAAGATGACGAAAATGCCCTAGTGAAAGTTGACGATTTTGACCCTGCCTAACTGGCGTCTTGGTTTTCGTATTCCCGTTGCTTTCTAATGAATATGCTTTTGAGTTTGACCCCACCGTTCTCTGGTCAATTTTCAAATCAAAATCAATTCAACTTATTCCTAATCACAAATTTGACCTTTTCTCTTTAGTAGAGCCAGTGACGTCATCTGCCAAATCCATGGATAAGGTCAGTTTGAATTCAGCTTCAAATTCAAATTACTTGATGCACAAGGGCAAGTTGGATTTTGAAGAATAATTCAAATGTAAGAGTTGAGTACAGCACCAATCAATTAATTAAGATTAAATTACAAATTTAATCTATTATATGAATTAAATAAGTATTACAAATTTAATCTATTATATGAATTAAATAAGTATTACGTATGAAAATTTGAATTGAATAGTAAAAGCGAAAGGTGAGAATTGAAAGTTTAATATTGGTGGGAGTAGTGAGGTGGCAACAGGAGGAGACTTGTAGGAACTGAAGGGTAATTTTGAGTTTTCAAATTGAGAATCAAATAAAGTGGCATTGATGTAATAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAATTGAAAATGGAATCAATAATAACACGAGAAATGTAGTAGCAAACAGAAGAAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAACGTGGTCATATGGCTTCCACTAGAAAAAGAAAAAGGGATTAATGATAATGATAACGATAATGGGGTATCTGGAGCTCTAATAAAGCCAAAGGCTGCCCCGCCACTAACAGTGGCCTTTTCTCCATTTTTTGAGGTGGTCGGATTCACTTAACCTTAGCCAAATCATATCACTGTCTATATTAATGCTTCAAAATCACCTCTTTTTTAAAATGGAACTTATCCCACATATTTGGAAACAGTCACTTCTTTTTCTACACCTTAAAATGCTGCAAATATAATTAAGTTTCAATCCAAC

Coding sequence (CDS)

ATGCTTTTAGAGTGGCCCGGTAGAGGTTCTCCTGACCCACACCTATTGGGCCTCCATTCACCTGAACCACATGGCACCTCTTCCGCCCATACCAGCAGGCGGCGCCGCCGCCGGGGTATTGTGGTTGCGGAAATGGAATTGGGGGAGGAAAACCAGTTCTTCCTAGCTCAGGGGGTGTCAGCTCTGGCCTACAATTTTGAGAATTTTTCTAAAGGCCAAGGGTGGTTTTGGTTTTTGGAAAAACGGAATGGGATTCGATTCGACCGTGGGGAACAAGATAAAGGCAAACACAATCATGGGCCGCCGCCGGGGTATTGTGGTTGCGGAATTGGAATGGAGGAGGTTCATAGTGTTGGATTGTTCTAA

Protein sequence

MLLEWPGRGSPDPHLLGLHSPEPHGTSSAHTSRRRRRRGIVVAEMELGEENQFFLAQGVSALAYNFENFSKGQGWFWFLEKRNGIRFDRGEQDKGKHNHGPPPGYCGCGIGMEEVHSVGLF

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CcUC04G077290 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CcUC04G077290 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CcUC04G077290 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CcUC04G077290 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..36

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CcUC04G077290.1	CcUC04G077290.1	mRNA