CcUC03G053720 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGTTCAATGAATGGTCAGTCCAAAAACACATCAAACAATTGAAGCCTCTTCTATTTTCAAGCGTGGCAAGAAGAAGTGACTTGTTGTTGATTTGTGTTGTTTCTGTATGAGAAAATAACAATATTCTACTATTGCAAGGCTGAAGTGAGGTATAATTTACTAAAGTTGTTGACGTAAAAAATTGGAACTCTACCTTCACGGAATAATTAAAATATAACAATATTTAAAGTTTTAAAAATAACAACCCACTAACAGAGTGCTCCAAAATTTGCTCCACAATTAAAGAGCATCAATAACAACTAACTAATTCCTATAAAGTAGGAACAAACTTTGATATAGTTATCCTAAGAAAAAAGGAAACAAACATGGACTTGTTTCAGTCTTGAAGCAGTTTCTTAACACTCCTCCTTGCTTTAGGAGCTGCAAACACCAAGTCTTAACCTCATAGCAGGCAATGGTTTTGTTAAAATGTCTGCAACTTGATTTTCTGTTTTGCTGCTGAAAATAATCACATCTCCATTTTTCTGTACTTCCCTTAAGAAGAATAACTTGATGTTAAAATGTTTAGTCTTCCCATGAAACACAGGATTATGAGAAATAGTAATAGTAGCTTGGTTATCAACTAAAATCTCTGTGCTTTCCTTCTGCTCCAAGTCAAGATCAAATCAAATAAAATTTTCCTTAGCCATAAAGCTTGATTGACAATAGCTGTTGCAGCAATAAACTCTGCTTCGGTAGTGGACTATGGTACGGTTTCTTGCTTCTTCGAGCTTCATGAGAAAACACTAGAGCCAAGAGTAAAATAGTAGCCTGAAGTGCTCCTCATATCATCAATGGAACCTCCCCAGTCACTGTCAGAAAAACCATCCAGCTTGAACTCCTTGCTCCTTGTGAACTTAATACTGAAATCACTTGTGCCTTTTACATATTGTATCACTGTTTTGGGAGCCTTGAGATGTAATTCACTTGCACAATGCATGAATCAAGACAAGATACTTACAGCATTCAAAATATCTGGCCTTGTTGCTGTGAGATACATCAAGCAACCAATCAAACTCCTGAAATATCCTTCATCAACTTTGTCAGCACCATCTTCTTTGCATAGCTTTTTTTTTTTTTTATTATTCATTGGAGTTCTTGCTGCCTTGCACTCATCCATCTGAAACTTCTTCAGTATTTTCTTTGCATACTTTCTGGCATATGAAAACTTCATCTTTCCCTTGCTTAATCTCCACGCCAAGAAAGTAGGACATGGACCCAAGATTGGTCTTTTCAAACATCTTCATCATCTTTTGTTTGAAATTTTGAATCTGATCTGTACTGTTTCATGTAACTAATAAGTCATCAACATACAATGAATAATGTCAGTACCATTGCGCTTAATGTACAAAGTTGTTTCTGATAAACCTTTCACAAAACCCAAGTTCAGCAAATATTCATCAATTTTGCTCTGTGGAACATGAGTGAAACACAAGCAACCAAATACTTTAAGAAATTTCAATGAAGGTTTGTAACCATACCAAGCCTCAAATGGTGTTTGATCCTTCACTGCCTCTGTGGGAAGCCTGTTTTGAAAAAACACAACTGTATTTGCTGCTTCTGCCCAAAACTTTTTGGCAATTTTTTTTTCATGCAGCATGCATCTTGCCATCTCCATGATGTATCTATTTCTTCTTTCAATAACTCCGTTTTGTTGAAATGTGTAACGGGCATATTGTACTCCTTCCCAATGTCAAACCTTACAATTTGAATTTTGCAGCCACTTTCATTCTCAACTCTTGCCTTGAACTTCCAAAAGACTTGGGCTAATTCTGCCTTAAACTTCAAGAGAAAAAATCCAGCACATTCTAGTGAAGTCATCAATAAAGGCAATATAACATAGACTACCTTTTAAAGAAGGTGTTCTTTCAGGGCCAGCAACATATGTGTGGATGAGCTGCAATTTGCGAGTGGCTCTCCAGGTTGACTTTAAGAACGGTTTCTTAATTTGCTTTCCAAACTGACATGCTTTGCAGCTTGAGATTGCTTCATTGAGTTTGGAAACATCAAGTGTCAGCTCCTTTTCTTTTAGTTGCAGTAAACCTTGGTGATGATAGTGTCCGACTCTCTTGTGCCAAATCTGTGTAACATCTTCTTTAAGATGAAAAGCAGGTTGCTCCTCCTTTAAAGGATGGAGTGAAAAACTCTTCCCTTTCATTTTTACTTTGAAAATATCTTGATCAGCTGCATCCTTAATCAAACAATACTTATCTTCAAAAGTAACTTTAAAGTCTTTTTCAATAAGTTGTCCACACTCAACAAAGTTTGGTCAATATCAGGAAGAAAGAGAACATCTTGCATATGTTTTCGACCTGTACAGCTTGTCATTGTTGGCTTTGTGGCCCTTAATCTCAAAGTAATTAATTTTAATTAATTAAATAATTAATATTTTAATGATAAAAATCTGCTTTTATTTATTAACTATTTGAGTGTTTTGAAGTGTCTATTATGTGGAGCTTGGAACAACGGTTCAAACGCAATTTGAGTCACTCCAATTAGAGTTCAAATGAATAAGATATGATCGAATTAAGCTTAACAGAAAAATCCCGAGCGGATGACGTGGCACTTGGTGATTTTTTTTTATTTTTGGAATGATGTTAAAAAGAAAATGATTTTAAAAATAAAATAAATTTAAAAAGAAGATGATTTAATATTATTATATATGTTTGTGTCTAACGGCTAATTGCTTTTAAAAAAAATGAATTTAATATTATTTTATATTTGTGTCTAACCGCTGGTTGAGTTTAAATATCTCCCATTCAATTTTCTTTTACAAATATCAAGAGCCCAAATTGAATTTGGTTTTCACCTACTTTTCTCCATTTTTAAACCTTTCATCTTCTCAAAATTTTAACAACTTTTATTATTTGCAATCCTCCATAATTCACCAAGCCACCATTGTCGCTCTCTCTTCAGGCTTCAATTTTTCTTCTTTTCATCTAATTATTGAGAGAGATTTATGTATGGTGACGGTTGATTTGTTGTAAACTCAAAACTTGTAAACCTACTTTTTGAGAGTTTTCTCATTTTGTTCTTCATTTTCAAATTTTTGTGAGGATTCCTCTTGATCCCAAAAAGGAGTGATTGTAACAATTTGATCGTTATCCCTGGAAACGATTGAGTTTTCGCTTGAGTCAGCAAGATTTCTAGTGACATACCCAAGAGAAGCTTGGGAAGTGGACGTAAGTCAGTTGTGCCGAACCACTATAAGTCATTTTCTTTATCTCTCTCTTAATTTATTTTTGCAATTAATTTGATATTATATTTTATTGCATGAAATTAATTGTAATTTTTAATTCTTGAAATCAATTGCTCATATTTGTTTACGTTGATTGGTAGTTTTTAGAATTCCTATACTCATTACCAATCTTTTTATAAGAATTAAATATGGTGGTTTAAGGTGTGATTGTTAATTTCCTGTTTAATTGAAAGTGAATTTATTTGCATAAAACTATTGTTTAAACTACTTATTTGCAAATAGTTTGTTAACTTGCTTAATTGGGTCCACATCTTTAAAAGTTTGAATTGGTTTTAATAAACCTTATTCACCCCATCTAGGGTTGCCATACCGATCCTACAGTCCCTTTCCTAGATGTAATCCCCATTGCCAATTCTTACTTGGGTGATGTTAGTTGGCCCCAAATCTCTAAACAGCTCCTTGTAATGAGCCATATGGTTGGTGCAACCACTATCAATCAACCAGCTTTCATTTGTTTCACTACCCACGAAACATGTAGCCACAAACAGTTAATTCTCCTCCCCTGATCAGCAACCTTAGCCACTTCATCTTGCTGTTGATTCTTGCTCCTGCAAATTACAGCTTCATGTCCCATTTGGTTACATTTGGTGCACTTGGTGTCTGGTTTTCTCCAACATTTGAAAGGAGGATGACCCTTTCTATTGCAATGTTGACATGGAGGGTAGGACCCCTTCTTGCCTCCTGCCTTGTTGTTGGAGGATTCTCCATTAGGATTTTGTTTCCTCTTGAAAAACTTCTTCTTGTTATTGTTCCTTGCATTCTCGTTATGCTTGGTTGGCAAGGCTCCTTCAGCACCACCTTCTTGCCTCATGGCTCTTATTTGCTCATGTGCTTGTAAAGCATTGAGAATCTCTACAAGAGTAATTTGAGTTAGATCCTTGGTATCTTCCAAGGTTGAAATAGATGCCTCAAATTTTTTGGGCACTATTTACAAGAATTTTTTTCAACAATTCTTGAGTGTCCCTAAACCGGAACCAAGTAATCTGATTCAGTTTGCAATGTCCAATAACCTATCAAAATACTCTTTAATCTATGTTTCCTTCATCCTCTGTAACTCAAAATTCTCCAATCACATTTAGCACACGCATTCCTTTGATTGTTCCATCTCCCTCATACTCAGACTTGAGATAATTCCATATCTCATATGCTGACTTTAGGGTCATAATTCGAGTGAATATAGTAGAAGCAAACAAGCAAGCCTTTGCGTTGAATTTCTTTGTCTTTTTCTCCTTATGCAATTTGATCTCCGCCATGGTTGGATTGTTTGGGAGATCAGGAATTTCATAATCCTGTTCCACAGCTTCCTAAATATCCAAAGCTTCCATATATGCCTCCATATGAACAGCCCAAACCTGGTAGTTGTCTCCATCAAACACTGGTGCAGAAATTGAAGAGAAACTGGAACTTGCTTGGATGTCCATGACACAGCAACCTCACACACTCACAGATCCTTTAAGAATGCGCCTCTGATACCAATTGTTGTTTCTCAATATGAGAAATAACAATATTATATCATTGTAAGGCTGGAGCAAGGTATATGATGTAGGAAATAATGTAAAAAAGTCATTTCTAAGTCTTAACTTCACGTTTTTAATTAATTTCTATTTTTATTTTAAGTTTGTTATGTATTAACGGAATAACTATTTTAAATAGTTAAGATCCTTCTATGTATAAAGGATGATGTTGGCGCA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TGGCAACCTGTGGATGCGTTGGCAACTCTTCAACGCAGGTTGATGCGTTAGCAACCCAGGGATGCGTTGGCATAATTGAACACGTGAACCCAAGTTATCCGTGGACGCATATCAAGAAGGCAGCAGAGAATCAAATAAGAATCTTAAGAGATTGTCGAGAGATTGATATGCTTGATATGCGGTGAGAGTGGTGGATCAAAATTAAACCGAAAATCACACGATTAGGCGAGATGGACGCAAGGCAGAAATTAAGCCTCCAATAATGCAGATTTGCCAGCGATTGCAATGCAACATCTATAAAAGGGCAGACTTGAAGACGAAAAGGTTGTTGAACCTCTCGGAAGAATTCCTAAGTGACAGCAGTGTTCTTTCCAAATGACAACCGGAGACAAATAGCTCAAAAGAGAAGAGTCTTCCCTCCGCCTAACCACTTCGCAGTAGAACTCACGCTACCATCCCGGCGAGCTCAAGACATTGAGAAGTCATTCCATGCTTTCTACCTCTTTTCTTACTTTTGTTTTAGTCTATTAGCAAGGAATTGTATTTTCTAAAATAGTTATTCCGTTCATCAATCTATACATCTTCCATGGCTATTCATTTCTCATCACTTTTCATTTGCTGTTTATCGTCCATGATTAACTAACTCTCTCAAGGGTCACGGGTTGCGTTATCGTCTAAATAAGAACCGTAGAAGACTATTTCATCTTGTCAATTGTACTTTTAATCAAATGCTTATGTCCATCTAGCTAATTGATATAAGTAGTAATAATCAGACTGCTTAGGAGAGTAAGTGATTGTGGAACTCAGTTGACAAGGCTAAAAAGTGTTACCTAGGGATAGGAATAACCTTAGCACTTAACACTCTCCTATGCGTTATAGACATCTAATGCATAGCGGCTGACAACCGAGAGAAGAGTCGCTGGTATGAAATAGATCTCACTATGCGTTTCCGAATTTAGATGATAACCAACACCAACCCTGTTTCTTTTACCATTCATACAATTCAATTAGCTGCTTTTGCTGTGTCGCATACCTCCATCAACTCACATTAGCTTAGGTTTACTGCTTTGTAGTTAGCTAAACGCATCACTTCTCATCACCTTCTTTAAATGCATGAACCAAATAATCCGACTAATTATAGAATCTGCATAGTCCCTGTGTTCGACCTCGGGCTCACCCAGAAAATCTCATTCTTTGCTTATACTTAGGTGAAGACTAGGAAAACTTGACCGATTAGTAACGCATAGTATTAAGCATGTTGAACGCATTGTTGAACGCATAATAAGAAGCTTAATAAATATACGCACAACAAGTTTTTGGCGTCGTTGTCGGGGACTTTAGATCTGTCAACAATAGCTTCCTTTTCAAAAGTGGCACTCTCTACATCCCACACACTTCACTTAGAAAGTCACTCTTAAAGGAAGCCACTCTGGAGGTTTAGTCGGATACTTTGGTAGGGACAAAACTGTAGCACTCCTTTCTTCTAAATTTATTTTCCACAATTGAAAAAAGATGTTGGAAATTTTGTCAAAAGATGTTTTATATGTCAAACTTCAAAAGGCTCTAGTTCAAACCAAGGGCTTTATTCTCCATTACCTATACCAAATAATATTTGGGAATACCTCTCAATGGACTTTATCCTTGGATTGCCTAGAACCCAACGTGGCTATGACTCTATTTTAGTTGTTGTCGACAAATTTAGCAAAATGACACATTTTTTAGCCTGCAAAAACACTAATGATGCTTTGAATATTGCAAACTTATTTTTTAGGGAAATCATGAGACTCCATGGCATCCCTAAAAGCATAGTTTTGGACAAAGATGTAAAATTCATGAGTTATTTCTCGAGATCAGTATGGAAAAAATTGAGTACTGATCTCCTTTTCTGCTCTACAAGCCATCCACAAACAGACGGACAAATAAAAGTTACTAATCGCACTTTTGGTAATCACCTAAGATGTTTAAATGGAGACAAACCCCACCAGTGGGACCTAGTACTTGCATAAGCCGAATTTGCCTTTAATAACATGGTGAATCTCTCCACAGGGAAGTGTCTCTTTGAAATTGTCTACACTCATGTTCCTAAATTAACATTAGATCTTGCTAACTTACCTGTTTATGTTGATCTTAGTGCTGAAGCAAATATCATGGCTAATCAGATCAAGAACATCCATGAAGAAGTTAGAGTTCACTTGGAAAGCGCTAACAACTCTTATAAGCATCAAGCTAATAAGCACAAAAGAACAACAAACTTCAAGATTGGTGACATAGTTATGGTTCATCTAAAGAAATCAAGACTACCTACTGGACTAGACTCTAAACTTACAAACAAAAATGTGGACCAAATGCTTATCAAATCAACTTACCACCTACTATGAAAATAAGCTCCACATTTAACATCTCTGACATATACCATTATCAACCATCAGACTAGTTTGAGCTTACTTAACCAAACTTAGAGTCGAGTTTGCTTTTTTTTTTTTAGGGGATGGAGTTGATGTAGGAAATAATGTACAAAAATCCTTTTAAGTCTTAACTTCATGTTTTTAATTAATTTCTATTTTTATTTTAAGTTTGTTATGTATTAATTGAATAACTATTTTAAATAGTTAAGATCCTTCTCTGTATAAATACGCCTTTAGCCTCCCCTTCTATTCATTATTAAAAAGATTGTCTTGAAGTCTTCTTGGAGCTTCTTCATTAGTATAATTTACTAAAGCTATCGAGTTAAAAAAGTGGAACTCTACATTCGTTGAATAATTAAAATATAAAATATTTAAAGCTTTAAAAATAACAATCCACCGGCATAGTTCTCTTAAACTTGCTCCACAATTAAAGAGCATGAATAACAACCAACTAATTCCTAAAAAGTAGGAGGGCTCTCTCACTGTCCTCTAAGAAGGTGAGTGTATAGGCATTTGGGGCAACCTCAGAGTTGTGTTTGGGATTGGAGGATCGCTTCTGGTGGCCAAGTTTCTAGGTGCTAGGTTTTTCCTAGAAGCAGAAGACGAGGATCACTAATGCATGAAGAGAAATCGAACAAGTATCTAGAGAATCTGATATCTCAACTGTGTGCAAACTCCTATCACACAAGATTATCCATGCAGAAACCTTCAAAACATTAATGCCTAAAATATGGAATATGGAAGATCAAGTGAAACTAAAAAATGTTGGATGAAATGTCTTTATCTACTATTTTAAGAAAGAAAGAGATAAGAAACGAGTAATGGAGAGTGGACCATGGTTCTTTGATAAAGCTCTAATTCTATTCGAAGATCTCAAAGGAAACAAAAGCATCTCTAATCTGGATTTCAAGTACGCATCCTTTTGGATTCACTTTAACAATCTTCCCCTTGTAGGATTCACAAGAAAAATAGCAGGAGTGCTCTAA ATGGCGAAAGAAAGAGATAAGAAACGAGTAATGGAGAGTGGACCATGGTTCTTTGATAAAGCTCTAATTCTATTCGAAGATCTCAAAGGAAACAAAAGCATCTCTAATCTGGATTTCAAGTACGCATCCTTTTGGATTCACTTTAACAATCTTCCCCTTGTAGGATTCACAAGAAAAATAGCAGGAGTGCTCTAA ATGGCGAAAGAAAGAGATAAGAAACGAGTAATGGAGAGTGGACCATGGTTCTTTGATAAAGCTCTAATTCTATTCGAAGATCTCAAAGGAAACAAAAGCATCTCTAATCTGGATTTCAAGTACGCATCCTTTTGGATTCACTTTAACAATCTTCCCCTTGTAGGATTCACAAGAAAAATAGCAGGAGTGCTCTAA MAKERDKKRVMESGPWFFDKALILFEDLKGNKSISNLDFKYASFWIHFNNLPLVGFTRKIAGVL Homology
BLAST of CcUC03G053720 vs. NCBI nr
Match: XP_021808570.1 (uncharacterized protein At4g02000-like [Prunus avium]) HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 3.9e-08 Identity = 28/56 (50.00%), Postives = 40/56 (71.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. NCBI nr
Match: TXG54013.1 (hypothetical protein EZV62_019269 [Acer yangbiense]) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 8.7e-08 Identity = 24/55 (43.64%), Postives = 38/55 (69.09%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. NCBI nr
Match: TXG64850.1 (hypothetical protein EZV62_011844 [Acer yangbiense]) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.1e-07 Identity = 25/57 (43.86%), Postives = 38/57 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. NCBI nr
Match: PQQ12378.1 (hypothetical protein Pyn_32588 [Prunus yedoensis var. nudiflora]) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.9e-07 Identity = 27/56 (48.21%), Postives = 39/56 (69.64%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. NCBI nr
Match: TXG70236.1 (hypothetical protein EZV62_005171 [Acer yangbiense]) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.5e-07 Identity = 26/59 (44.07%), Postives = 39/59 (66.10%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5RUR1 (uncharacterized protein At4g02000-like OS=Prunus avium OX=42229 GN=LOC110752262 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 1.9e-08 Identity = 28/56 (50.00%), Postives = 40/56 (71.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7H9Y2 (CCHC-type domain-containing protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_019269 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 4.2e-08 Identity = 24/55 (43.64%), Postives = 38/55 (69.09%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7I6E5 (CCHC-type domain-containing protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_011844 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 5.5e-08 Identity = 25/57 (43.86%), Postives = 38/57 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A314Z5A5 (DUF4283 domain-containing protein OS=Prunus yedoensis var. nudiflora OX=2094558 GN=Pyn_32588 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 9.4e-08 Identity = 27/56 (48.21%), Postives = 39/56 (69.64%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC03G053720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7IP31 (Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_005171 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 1.2e-07 Identity = 26/59 (44.07%), Postives = 39/59 (66.10%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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