CmUC06G114890 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC06G114890
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr06: 7797737 .. 7802946 (+)
RNA-Seq ExpressionCmUC06G114890
SyntenyCmUC06G114890
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGAGCCAACTTCTTTGATCCCGTTCATGAACGGAGCACCTGAGGTAAATGTGACCCTCTCTAATACCAATTGAAAAATCAATTAAATGACTCGCCAATCAAATACAAATGTTAAACAAAAAACACTGACAATCACTTGTAACAACGAACAAATTAACAAGTAAAAGAGAGATTACACACAAGAATTGGTAACCCAGTTCTGCGATAACCACCTATGTCTGGGGGAGTTGTGCCCAAAAAAGATTATCCACTAATATTGAATAGTTAAGTATTTACAATAAAGTACTTATTTGTAAAGTTTCGACTTCTACAGTGACTCCTGCAGAACTTAACTTGCTAAACACCTAGGCTCCTCCTAGCTCCCTCTCAATTGTACTTTGGCTCCCCCTAAGTGTGATAATATTAGTGAAAGACACTTCGACTTTTGATAGTGTGTGAGACTCACTACAAGAAAAATGACATTCTATGACACAAGAGGTCAACAAATTGGGATGAAAATTGAGTGGGAAGGAGAATAAAGTGTCATAAATGGCTCAAAACACGGGTTTTTGGCGGGAAAAAACACTATTTTTGGATTTCGCATGTTTTATGAAAGTTTTTAAATGTCATCGATTTATGACACTTTATAAATGTCATTAGAAAAAACCAATTATTTAATTTAATATAAAAAATATAATATTTAAAAAAAAATTTCCTCAAAAGTGAAAAGGAAAAGAAAAAGTGAAAAGGAAAAGGAAAAAAAAAAAAACAAGAAATTTTTCTTTCCTATCTCTCCTCAATCCCCTCCTTTCCGTCAACACCCTCTCCTTCTCTTCTTCATCTTCTTTCTCTTCTTCATCTTGTCGATCAGCAGGTCACCCTGTCGTTGCGCTGCCAGCCAGTGCATAGCCACGGCACCGTTCCACCTGTTCCGACGATCCCAGCGCACCATACGTGTAGCACTAGCGGTAGCGAGCGCAGCAGCCAGTCGTCGTCTTCGTTGTCTGCACTGTCGCCGCCACTGCTGCGTCGTTCATCGTCGGCCAAACCTCACCCCACCGACAGCTTCATCATCTGTATCGTCGTTCATTACTCATCGCGTCTAGCTGTCGCCAGTCTCAGACGGCGGTCTCTGAGGCTTCAGATCTCGCTGGAAAAGTCGCATCCAGCTCTCCCCACTCTCGTCTGGTCTAGATCTCGCGGGAAAAGTGGCATCCAGATCTCGCCGCCGGTGGATCTCGCTACTCTTGTCTCGCTGCTAGTTGCTACTATTGTCACCGGGACTTCTTCGAAAAATGGGAAAGGTATTGATGTTTCTTTATAGCATATTGGTTTTATTGTATAATAACGTTTTAGGAAAAAATGGGGAAGGGACGTTAAACACAACAAGCCATAACCAAATAAATTTTAATATTTGAGGTCTAGATTTGCAAGTTTGGACGTTTTTAGACACCAACCAGCAAGATTTAGAGCCTTTTTGGTAAGATTCGGTAAGGATTATTTAAATCTTCTTCGAATTTGATTTAAGAGGTTGTATTAGTTTATAAGCCCATGGAGTTCTTCTATTGTTATGTTTGTTTAAATTTATATGGGTTCAATTAAGGTTTGGTAAGTTTGAACTCAGTTCGAGCTATTTCGAACTCAAATAGAGTGTGTTAAACCACTTTCTTACATGAGGAAAGCTTGTTGTTTGTAGTTTTTGACTAGCTCGAATTGATCAACTAAGGTTTATTGTTGGTTTTGGTTGGTTTTGGGTAATATTATCTCTCTTAAACATTCTCTCAATGTTGGTTAAGGTTTTCGAACTATATTGTAACACCTAAACATTATTTTTGTTGTTTAGACCTCTAGGAAGTGAGCATTTGTTCAAAGAAGTGGATTTTGTTTTTGCTTGTGAGATAGACATATTGTTTCTGCTTGTGCACTAGAGGTAAATTCACTTAATGGAAATTTTGTTTTTAGCATAGAAGAGTGTGTTATACTTGTAGTACTTTTAAATTAATGTATATCTTTTTTATCCTTGATGTATATCTGCAAGCTCACCAACTTTTGATGAATTTCAAAGAACCTTGAAAGATCATTGTTCGTACAGTGCAATCTATTGAGGTAATTTCCCCTGCTCCCTTTGAGTTGATATTGAAATGAACTTGTCTGACTTGCAAGTTGTGTGGTGTTAGTTTCACAATCTTTGTACTTATTTTTATAAGTTTAATTAGACTTGGTTACCATAAATAACGATATATAGGTTTGTTTACTTTTCACTACTATGTTGGTGGGATTCTGTATAGGATAACTAATAACCTATAGGTTCCTTGGGCTTTAAAAATGGAATATTATGTTCATTAATTTCATCTATTTGTTTTCACTATTAGCTTGATCGGATTTTGGTTTTGCTAAAAGTTTTTATTTAGTCTTTATAAAAGTTCACACCAATTATGACTATCCTACAGTTATGGTAGTCACAGATTAGTTGTATTGATAATTTGTTTAGGTATTTATGGTGCTTCTTGCTTGTTCAAAACATTAACTTGTTGAGTTTGTTCTTTTAGGTATAGTTAAGTTGTTTACATGGGAGTTCTCATCTATTTTAAGTACTTGAACTACTTGCTTCATTCAAACAATAACTACATGTAGCTTAAGTCACTTTAACATGTTGTAATGTAGTTACTCGTGGTAATGCCTTGTTGTATTTAGTTTCTTTGTAAAATTAGCTTTACCAAATTTGGTTATTAGTTTGCTTGTATTGTAGACATTCGATAGTTTCCTGATATATATTTAGTTTCTTTGCAAAAATATTATCCACTTTATTCTTATATAAAAAGGTTCTTATTTATGTTTGTACCGATTTTGTGTTAGAATAGGATTAATTGTGTTTACAACCCCCTAAAAGAAATGAAGTTTCATTGTTTGTGGATTAGATTAAGTGTTGAAGTATTTTGAATATCCTATAGTTATGGTAGTATTAGTTGTATTTGATAGATTGTTTAATTGATTGTGTGTTTGATAAGTCATGTTGGAATGTTAATTAGAAGTTATTATTAGTCTTTTTCCTTCCTTTTGACAACCTTGGTTGCTTGGGTTGATAAGTTATTGTTTATGGTGCTTCTTGGGTGTCAAAGTAAGACCTTAATCATTTTTTAGTTTGTTTCAAGATTGAAATTGTCACTTAGATATATCTTAAGAACATTTACATGGTTTTCATAGACAAAGTGTGACTTAGCACCTTTTAGGAGCATTTTAGGTGGTTTTGAGGGCAAAAGGGAGAGGTAGGCACTTTTTAGTTTATTTGAGAGTGAAAATTTCACTAACACTTTTGAGAAACTTTTATTGTGATTATGGGTCTTCATATTTGTGGGCATAGGTTATGACATCAATATTTTGGGCAATATCGATTGAGGTGGATAAGTTGTTGACATTGGAAAGATAAAACCTTCTTTCATTATTATCATTGTCAATATTGATGTGTAGAGTTGAACTCTAAAATGATTTTTTTGTTTTCTTACTAGGTTTTGCAAGAATGCATTGGAGTAGTGAAGCAATGGAGTGCAATTGATATGTTTATTAGATTTTTTTATAGGGTTAGTGCCAAAAATTTGGGTGCAATGCACTTATTGTACCTAAATATAGCTATAGTTTCTTGTAAAACCTTCACTAATTGTAATTAGTCGATCTTTTTGTAAAAGTATTATCAACTTTATGATACCTATATTAAGGTATTTTACAATTGTGTTCTTATTTTTGGATTTAATTAGGATTACTTGATTATGGAAATCATGTGTAATAACAGGATTGAAAGAAATAACAAATATAAAAAAAGATGTTTTTTATTGACAATACAATATTGTCGTAATATTAAATTGGGTGACAAAAAAAAACGTGTCATTATAGAACGTCTATTGACAAAAAACATTTGTCATAGTTCATAAAATGTCATGGTTCAGATATTATTGACACTTGAAAAATGTCGATATTTATTTTATGACATTTAGTAAGTGTCGTTAATATGCATAACATTACAGAAAATATGAAATCTTTAGTCTATTGGCGACAAAGATAAAAAGTCATTATATGCTAAAAATGACAAATAATGATTGTCATTATTTGTTCAATGTTGACAATTAATTATTGTCATAAAAAAACCATTTATGACATTTTTCAACAAATGTCATTGAAGCTTCTACCTTTACAAGCGATTCAATGATTGAAAATAAATGTCACTAATTTTAAATCCGACAGTTTTTAAATGTCATTGAATCCCAATTTTCTTCTAGTGACTGCTTTCAGCTTAATTGTCTTCCTCGTGACTCAGTGAACTCTCTTCATTGATAAATCTTAGGTCACCCTAAGATGGAGAAACCCTTATCAAGAATGAAGTCATAGGCTCTTCCTAAAACTGAGAATCCCTTCTTTGTAGAGATGTCTTAGGCTCCCCTAAGACAAAGATTATCTGCTCTCGTTGAATAATGAAGATGCAAAACGAAATAAAGTGAGCAAAGAGCAAAATGTAATGATGCACAACTCGACCACCAAGAACACAAATTCTCTCTTCACAATAAACAATTGCGGCAACCCTAAAAGGTCACCATAAATCTCCTTAAAAAAACGAGGCCAAGTAAGGAAATAAATTTCGTCAACGGAAATAATAATCAGTGCCTCCAATAAGGATAAATATTGGGCAGGAAAATTCCAAATAAGAAAAGAAAATATTCTACATAAATTTCTATTGTCATAGTCAGATGTTAGGACTACAATTATGATAACAACAAAACCTCCACAAACTGGTTGAAATAAATTGAGGGCGGATAATCAAATCTCCAACTACTACATTTCAAAGTTATTGATTGAAGTACATCACCTTCATTTGGTAAAATAAAGAAGAAATTGAAAATCATGCATATTGGTTAATTTTATAGAAATGTTCCTGGGGTTAGAGAGAGAAGAGAGTGAAATGCCTGGGGTGAGGGAGAAGAGAGAGAGATCGAGAGACCAAGATTGCAGTTGAGGAAGGTCCTTTGAGAGC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mRNA sequence

ATGGAGCCAACTTCTTTGATCCCGTTCATGAACGGAGCACCTGAGGTCACCCTGTCGTTGCGCTGCCAGCCAGTGCATAGCCACGGCACCGTTCCACCTGTTCCGACGATCCCAGCGCACCATACGTGTAGCACTAGCGGTAGCGAGCGCAGCAGCCAGTCGTCGTCTTCGTTGTCTGCACTGTCGCCGCCACTGCTGCGTCGTTCATCGTCGGCCAAACCTCACCCCACCGACAGCTTCATCATCTGTATCGTCGTTCATTACTCATCGCGTCTAGCTGTCGCCAGTCTCAGACGGCGGTCTCTGAGGCTTCAGATCTCGCTGGAAAAGTCGCATCCAGCTCTCCCCACTCTCGTCTGGTCTAGATCTCGCGGGAAAAGTGGCATCCAGATCTCGCCGCCGGTGGATCTCGCTACTCTTGTCTCGCTGCTAGTTGCTACTATTGTCACCGGGACTTCTTCGAAAAATGGGAAAGATTCAATCCCTCATTCTCCATGTTCTCTGAGCCATGAGATGAAGTCCAACGGTGGACGAAACTGGAACACAAAGCTCGTGAGTCGTGAGATGAAGTCGAGCGGATCGTGGACGAATCTCAGAGCTGATTGTTTTGAGTACTCAATGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGCCAACTTCTTTGATCCCGTTCATGAACGGAGCACCTGAGGTCACCCTGTCGTTGCGCTGCCAGCCAGTGCATAGCCACGGCACCGTTCCACCTGTTCCGACGATCCCAGCGCACCATACGTGTAGCACTAGCGGTAGCGAGCGCAGCAGCCAGTCGTCGTCTTCGTTGTCTGCACTGTCGCCGCCACTGCTGCGTCGTTCATCGTCGGCCAAACCTCACCCCACCGACAGCTTCATCATCTGTATCGTCGTTCATTACTCATCGCGTCTAGCTGTCGCCAGTCTCAGACGGCGGTCTCTGAGGCTTCAGATCTCGCTGGAAAAGTCGCATCCAGCTCTCCCCACTCTCGTCTGGTCTAGATCTCGCGGGAAAAGTGGCATCCAGATCTCGCCGCCGGTGGATCTCGCTACTCTTGTCTCGCTGCTAGTTGCTACTATTGTCACCGGGACTTCTTCGAAAAATGGGAAAGATTCAATCCCTCATTCTCCATGTTCTCTGAGCCATGAGATGAAGTCCAACGGTGGACGAAACTGGAACACAAAGCTCGTGAGTCGTGAGATGAAGTCGAGCGGATCGTGGACGAATCTCAGAGCTGATTGTTTTGAGTACTCAATGTGA

Protein sequence

MEPTSLIPFMNGAPEVTLSLRCQPVHSHGTVPPVPTIPAHHTCSTSGSERSSQSSSSLSALSPPLLRRSSSAKPHPTDSFIICIVVHYSSRLAVASLRRRSLRLQISLEKSHPALPTLVWSRSRGKSGIQISPPVDLATLVSLLVATIVTGTSSKNGKDSIPHSPCSLSHEMKSNGGRNWNTKLVSREMKSSGSWTNLRADCFEYSM
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 29..74
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 39..74

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC06G114890.1CmUC06G114890.1mRNA