Lsi04G010490.1 (mRNA) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTGGTATATAGATTGATGCAGTGAAGGGCAAAATGACAAACAAACGTACAAAATATGAGAACAATGAGAATGAGTCATCCTTTGACCTTCACATAAAAAAATATCAACTATAATGAAATATGAACTCTTTTGGACTAACATTGTCTGAAACTTAAACTTCTGCATTTATTTTTTTAGTGTACACCGACCTCTCTATGTTTTATTTGAGTTTTTACTTGCAGTTAATGTAGATCAATGGTTGTTTTATTTGGGTCTTATATTAACTCTCCTATGAATCAAGCATACTGAGGCGTCTAACTTTATTTGGATAAGTAGTTATTCCCATAGATTGATAACAACTTAATTTGGATGAATAACTGATACGCGCAAGCGTACATATCGAGTAATAATATAGCTTAAAACGGCCTGGACCGAGTATCGTCCTCAGGAAATTAGTTTGACAAACTCTTAGCTACTTAGAGACACTCTTCTAGTTTTATTTAGGGGACCCAACTATGATGAAAATCTAATTTAAACTAGTCCTAGAAAGCAATTAAAGATTTACACCAGGGTGGAACCAAGCAAAGACACGTCCTAGAGTAATGATTTCATTGATGGATTAACTAAATTAATTGCCTTAGATTCATTTTATGCTAACCATAAACCTAAGAGTCTTTCATTCTGGTATCCTCATTCGAGCTCAACCCTTTCTAATACCTAATTATCAATTCAATTTCATGCAATTAATTAATTAAGTGCAGCACTAAGTTCCTTTATTATCGATTTCTATCATTTTCATGCATATTTGATTAACAATTTAACAGCCTAAATCTAATTTAATGCCCTCTCTCTCAAATAAAATTCATTCAAACAGCGGTCAACTGTTCGAAAGCAATTACCATAAGCATGCCAAAATAGTTCATGCATTGATCAAATTTAAGAAACAATTAACAAAGTTTTGCAACAATCCAACAATTACATAAAAAACCTAAGGGCACAATTCAGTCACTCATGACTACAGTACAAACTTAGACCATTCATAATGTATCCAAAAATTCAAAGAAACAGAAAACTAAAGAAGGAACAAAAGCAAGTCGCTCTATCGACTATCGTCATCAAGCTCGAGATTGCCCTCCAACAACCTCTTCGATCACCCACTCCTTTGAAAGCTCCAAAATGTCGTCTCTGCACAGAAAATAGCCCTTGGTGGAGGCCTTAACGAACCCTAATTTAACCCTAAGAACCAACCTCTCCTTAAACTGACGACAAGACGTTTATTTATAAAATCAGTCGAAGCGCCGCAACGTTGTCCAATAAAAATCGAAGACACGCGCTAGAAAAGTCGTAGCGCCGCGACGCTACCCTGTTTTGATGCCACTGCCTTAGAGCACCATAGACAGTTCCGAGACACGCCGTGCACACCTTTTATTGCCCTAGATCAACCTTTGACCTTCTATGGGGGTATTTTGGTCATTTTGCACTCAAATTAGCTCTTTCCGATCCAAATGCTCGATTTCCAACAATTTAACAAATAAAGCATCAAATAACTCATTTTAAGCAATAAAACTAACCAAATTCTAAGCCCAAGAAAATACTTTTCGAGTATTTTTCAATAACATTTAGTTACAAATGATAATAAAATGACAAAAATAAAGGTCCACAAGTAACATGTATTGTCGAAATTTAGATTGAAAACCAGGACATAACGCAAATGTTTTATAACTTTGCACAAATTTAAAATATTATGTACCATATACAATACACAAATGCCCAACATGTTGCAATCAGTGAGCAAAAACATAGACCCATTGGAAAAAGATAAGCTCTATTTTATACAACCCATGCTAGAAACCAATATACAAATACAATTTTATTTTTGAATCATTGACTTAGGTATAAGCCAAGAAGCATGATAGATCAAGTTGTACAAAGACTACATACATTTTCCACACACCTAGATAGGATTATATTCTTACAAAGAGTTATGCAAATGTTAAGTTAAAAATTAACACATTAATTGTAACTAAAACTGCAAACCAACCATAAATGTTCATAAAGAAAAATGTGTGGTGTAAAAGTGCCAACATAAAAATTTAGAGCCCTAAAATTCACACTCAATCAAATATGAGATAATATTTACATGACCTACGATTATGATCCATCCTCCCACAACACCCACAACAAATTGTGACTCTATTTTCTAAGCAAGACGGAATCCTTTTTTTCCTAAGTCTTCCGGTCAGACGTTTGACTTAAGGAGGATGAATGCAATCGTCGTTCAAATCACGATAAGGTTTGAAAATTGTTGCACATTACCAATAGAATGGGTTTCATTGCTATATAATGAAACTAAATTGGAAACACGGTAGAAATAATGTGTGTTTGACCCCAATTCAAGGTTCCTACGAGACAAAGCAATGTAAGCATGGGGACATGGAGTCATGTCTAAATCCAAATGCCAACACAAACAATTACGGTTAAGGATGTTGACCTCGAATTGTTTGGTACAGTCATGAACTTCAAACTCATGTTGGTTAATAGGATGGGAAATTTGTACGGGTGGCCCATTTGGGTGGGCCCAAATGAAATTTGGCCTCTCCCCAAAAATCTAATGACATTTGGCCTTCTGCTGGCGTCAGCGTAACGTGAAATGACCACAATGCCCCCATGAACGAGACACAGACCCAATCCGCGCCTCACCCTCTCGATTATCGCTCTCGACTCTCGCATCCCAATCTCGGTCCACGTCAGCCACTTCCATCTCGACATATTAGCCCTCGATGCTCGACTCTCGAATCTCGCATCTCTCTCTCGGACCTCGTAAGCTGGCAATGATCCGCAATTAATGAGCGTCGCACGTCAATCAATCTGCCAGTCTACAATTGCTTTCAAATCAATTTTACTATAGATTAAGTGCATTGTTTATCAAGTTTCATGCTTTAGGCGTAATTTGTGCACTTTCCCTCCCAAAAAACCAACAAAGCAAAGTAATTTGGTTGCCTTCCCTTCACCAACATCACGATTTTGCGAGAAACCTATACAACCAAAACTGAAAATTTTCATTTCCAGGGGGCTGCAAATGCGTGAATCCAAGTTTTAGTTAATCAACTTCAAACTCCAAGTAAGTAAACAATGAACTTCACAAATTTTTTCTTATTTTGAACATAGTATTTTCATGAAAATGGTTGGCGTGAGATTGCATGATACCAAGCGAGATAACAAACGAGTGTGATATAGAATGATTAACGACTTAGTGCGAGAGACGAGAGCAAGACTCGTGGTCAGGGGGAGAGATAAACGTCGAGAGAGATGATGATCGAGAGCGCATATCAAGAGTAGCGAGAGCCGTGAGCGAGAACCGAGATTTACATGTCGAGGGTTTGATATATCGAGAAGCGAGAGTTTACTAAGTAGCGAGAGTGAGAGTCGGTAGCGAGAGCCACTAACGAGATTTTAACAGAATGCAATTTTTTGTGACTGTCTGTTCTTGTTTAATTTTTTGAAGGATGAATGGGAAACAATTATTTATTCGACATGATGGGACATGGGATGACATCAAACAGAGCTATGATGGACGTGTTATAAAAGGTATCATTGTGCCGATGACGTTGACCTACCAAAAATTGAGAGACCGGATATACAAAATTGTGAAGGTTGATTCATCAGAATTCAACATTGTAATGAGGGTTCAGTATAAGATGGACTCGAATGGACCTGCGGTATGTCTAATCGATGACGATGACATCAGTTTTCTGTTGGTTGAGTTGGACCGCAATAGACCTCAAATTTTTGTGAGTGTTGAGAGGAATGGTCAAGTCTCCACTGAAACCCAGGCAGAAATCAAGGCAAAACCCACTGTTATTGAGTCTGACATTTTCCCTTCGGTCGTTTCTATGGGAAATGATGACACTAATCCATGGGTTGAGATAGGTAGTACATAAGATCCTTCTTACCGGAAGAGGGTTCGTAATTTCCAATTGGATTCACTTACCGATTATGATCTCAATGAATATGGTAGGGGTGATTGGGACGAGAATATTAATGAGGGTGATGGGTGTGATCCTACTGTACATGCAACCAACACCAATGATCTCATGCCTACTTCAGTGTCTGAGATGCAACCAACACCAATTGTGCATCCCAGTTCAGTGTCATTGGAAACCCCAATTTCGCATCCCAGTAGAGTTGACGTACTTGTTGGGCGTGGTATGACAAGAGCTGGACCATCTGTTGTGCAGCCACATTCCTCATCTGGTATGAATGTGGAGGTAGGGCAAATATTCTTCTCAAAGGAAGATGTGAAGATGAGGTTGTCCATGCTAGCTATTAAGGAGAATTTTGAGATGCGGGTTCGGAAGTCAAATAAGAAATTGTATAGTGTGTGGTGTATCCACGATACGTGTAAGTGGGCAGTACGTGCGGTGAAGATGGAGGGGTATGACATATTTAAGATTACAAAATATACAGCTGTCCACACATGCACCATTGAAGTATTGAACCACGATCATCGACAAGCCAGCGCGTTCGTAGTTGGCCAACTGATAAAGGACAAGTTTGGGGTTGGTCGGGCTGAAAAACCTCGCAACATAATCGCAGATATACGGCAAGAGTATGGAGTGAATATAAGCTACGATAAGGCGTGGCATGCAAGGGAAATTGCTTTCGGGATTGCGAGGGGTACTCCAGAGGAATCGTACGGTATTTTGCACGCGTACGGTGAAGCTCTGAAGATTGAATATCCTGGTATGTATTTCGAGATTGAACTTGATGCTGGTCAGTATTTCAAGTATTGTTTCATGGCATTAGGGCCTTGCATTCGAGGGTTTAAAAACTGTCGTCCAGTTATTATTGTAGATGGTACTCACCTCAAGGGTAAATATCAGGGCACGATGTAGGTTGCAGTAGCCATGGACGGTAACAATCAGTTGTACCCATTGGCTTATACTGTAGTCGACACTGAGACTAATGCATCATGGACATGGTTCATGAGTCATTTGAAAAGAGCTATTGG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MTALEYRSRNQALGFISANLDGFLDATSLPSELSWRYQFRIPVLPYTSCSNFHGLKLAVAVSPTANFMPGVGVSCSEIRDGKCFSDLPTPRFDMSVSFTSWMMLHLLSFLSVRTEILERGKVNWESDYLDHWHQERIENGKEHDKFG Homology
BLAST of Lsi04G010490.1 vs. NCBI nr
Match: KAG7030640.1 (hypothetical protein SDJN02_04677, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 191.0 bits (484), Expect = 7.1e-45 Identity = 100/140 (71.43%), Postives = 111/140 (79.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010490.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6600899.1 (hypothetical protein SDJN03_06132, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 4.8e-25 Identity = 58/74 (78.38%), Postives = 62/74 (83.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010490.1 vs. NCBI nr
Match: KAG7031533.1 (hypothetical protein SDJN02_05574, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 4.2e-05 Identity = 25/40 (62.50%), Postives = 30/40 (75.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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