Lsi02G027300 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi02G027300
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr02: 33617590 .. 33623019 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi02G027300
SyntenyLsi02G027300
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGTAATTAAAGCTTCATGTTTTAAATTCTAGTGGATGGATTGTTGGTAGGGTTGTTGGTTGGATTGTTGGTGTTTGAAGTGTTATCAGTGTTCATCCCAAGTGTGTTTTTTACTGCCTCAGCTGCTCCTTGTGCTATGTTCTTCACTTGCTCCCCAGTCTATACATATTTCACCATAAAAGAAAAAAAATTGTAAATTATGATAATTTATGATCCATCAATCCTATAATATAAAATTTGTTTAATTTTTGTTCACTTTAAATAAATCTTAAATTCAATCCTTCAAAATTAAGCTTTAATCTCGAAGTCAATAATGTAAAGCTTTATGCCAGTCTCTTTGGCTTTTATAATTAAAAAAAAAAAAAAACTTTACAGTTTACATTTTTTTTTTTTCTAAAATGCTTTGGTGGCTCCGCCCTGAAATTTTTTCCCCTAAATAGTTAAAAAAAAAAATTTTAAATAAAACTAAAAAAAGAGGTATTAAATAATAATTAAAAAAAATGACCTGTTGAAGGAAATTTGCAGCTTGGTCCTTGAGGTCAGAGGCAGTTTGGGCGGCAGATTGGTCATGCGTAGAAGCCTTGTCTTTGGCATCATGAGCTGCATGAGATGCTTGGTTCATAATCTCGTCTTTCTTTACCTGATCATAAAATTAAAAATAATAAAAAAAAAACAATAAATTAATCTAATGTTAAATATATAATTATACACCAAACAAAACTAATTTGCTAATTAATTACCTGAGCTTGGCCAACAATCTCACCAGCCTTGTGGCTAATATCCTGATGGCTTGCCATTTCTGAATTGAATTTTTTGTTTTTTGTTTTAAACTCAAAAGATTAGAGAATAGAAAGAAGAAAAAAAAATGAATAAATGAAAGTATGAAAAGGGATGCTCTGAAAAGTTAATCAAAATCAGACATTATATAGAGGTTGAAAATGCTAATTTTAGTTGGTGAATTAGCCTATTTTGTTTTGCATTGGCTTGCATTTGGCTGTTTCTTGGTGAATCCCTAATTATGCGAGAGGGATTTGGGGTTGGATCGACTGTTTCAAATTAGTGGCCAAGTCAACAAACGAAATCATCCACAGAAATATATTTAAGATTAATATTATCATTTTCCATACATTTCCCTACTTATATAAAGGTTAATATATAGAGAAATTTTCTAATGGTTAATTCAAATGTAGCAACTCACTTTTGTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTAAGTAGCAATTTTAGGAATAATAATTAAGTGTATAGAAAAATTTTAAAAAAATTGCAAATATAGCCAAATCTATCAATGATAGACTTTTATCGCTAATAGAGTCTTATGATCTATCAGAATAGAACGCCTAAATTATAAAAGTCTATCACTGATAGATTTTGTTATATTTACAATTTTTTAAAATATTGTTATATATGATACTATTTTTGTAATTATCCTCTTCTTTTACTCAATTCTTTTCCACTCCATTAAAGACCGATCCCTCAAGTTAAAATTGTTGGTATATATATATAGAGGTCGCAAATTTTCTCTTTTTATTGTCTATTTTAGTCAAATGGATATATATTTAATAATGGACCAATTTTGTCATATATTGAATAATTTTCTAGATCACAAAAATCTCCAACAAAAAGCATAAATTCTAATGGTATCTTTTCTCTAAAGTTGCATTATTTTACTATTGTGTTTATTAGATGCACATACGAGAAAACAATTATTAAAGTTTAAATGAAAGATTGCACAATTTGTCTAAGCTTTAAGAGAAGTTTGATAATTTACTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAGAAAAAAGAAGGTTTGATAAAATTGAAAAGTTTGAGAGTAAAACTCCATACAACTTTATCAGATTGGGAGTGAAGTAGTGATACTTTTCCTAAAAATAAAAGATAACAAGATAAAGATGGATTTTAAATTAAATATTAATTATTTGATGTGTGGGTAATGGATGAGATTGCACCACCACGAAGAGAGCCCACAACATTTTTTTTTTATTTTTTTATTTTAAATACTAACTTCTTGTTAAACACTTTTTGGCTTTCGTTTATTTTCATCTTCATATTTTTAAAATGTCTCTTTTTATTCCATACTTTCAACTTTGATTTATGATAGTTTTTATATTTTAAATTTTGATTTATTTTAGTCTTTAAATTTTAAAAGTGATGATTTTGATTCTTTAAATATGAAATAAAAATAAAAATCAAGGAACTAAAATGAACATTTTGTAAAAGTGAAATAACTAAAATAAACATAAGTCAAAATTACAAACATTAAAATGAATATTTTGAACATATAAGAACCAAAATAAACTAAAATTAAAAGTACAGACACTCAACTCAAGTAGTATTTAAGGGTCATTTGGATTGACTTTCTAAGTGTTTATAAGTGTAAAAAAAAATATTCATAAACACTTAGAAAGTCAATACAAACGGACCCTTAAACGTTTTATTTTATTTTTCTACAATAGGTAAGAAAGAAGAATATAATATTTTTATTGAGTGAGATGTATTCATCTTTGTGCATTCTGTCCTAATCACACACAAAGAAAAAAAAATTAAAAAAAATTAAAACGAAGTAAAAAAGAGATTTACACAATTGGGTAAAATGCAAAAAATAGAAAATAGGTGCATTCATCCATAGTACTAAATTTCCGTGACATGTTGATATTTTCATGCTTCCATAGATTTCGATATCGACATGAGGAGTGAATAAAATTTTCCATTACATCGTAGAAAAACCCACAAAAGATAAAAATTTATTAAATGGTCGATTGACCTAAAAGTTTAAGCTGATGGGTAAAGTCAAATTTAAATTTAATATTTATGTCATTTAACAAGAAGCTAACTTGCTCGACCTCTTAAACCAACCTAATCTGATACTAAGTTAAATCGTCGATTGACCAAAAAGCTTAAGTTAATAGGTGAACGTAAATTTATATTTAATATTATATTATCTAACAAAAAAATAATAAACTAAATATTAATAATGTGTACATAATATAAATAATAGACATATTAACTTATTTAAAAATTATAAAATATTTATTTACTAATTAAATTTTTTTTGTTTTTATAATTTTTTAGAAAATATCTATGAAAATCAATATTTTACCAAAATATTTTTTCATAAAATTAGGATTGGAATATTTTCACCGACATTTTAAACCTTACATTCGTCAAATATTTTCTAGTTTTATCTACATTTTAATATGCACCGACGGAAGCAGGAGAAAATACGTGGCAAAAGTGCATAGTCTGAGTCATTGATTTGTTGCCGTCAATTTCTGTGAAATCCGTGCAGCGTTGAGCAGCACCATCCCGCCACAGGGCACGTAAGACCTACACGTGTCACCTCTGTGGACACGTGTCAATCAATTTTGCAAGGCGGGAAGCTTATTTATATGCTCGATTTCATTCCATTACTCACAAAGCAAGCAAAAACAAAAATTACGAAAAATACAGAAGCAAAAGCTAAAGTCCAATTCGTAAAAGAGAGGAAAAAAAAAACAATGGCATCTCACAATCAGAGCTATAGAGCTGGTGAAACCAAGGGACGAGCTGAGGTATTTGTAGACAACGTTTGATAATTTTTTGTTTTTTTCTTGATGACTTTTTGTTTCTAATTCTTCAAAAACAAAATACGTTTGATAATGTGTTATTACTTTTATTTTTTCTGATTCTTAATTTTTTTCATAATTATTTTGGCTTAATGTTTTAGAAAATATCATTTTGGACTCTATTTATTTTAGTTCCATTATTAAGTTATGCTCATATTGCTTAGAATATTAAGAGTAATGTTAGTGATAATATAATATTAAATTTATCTTGCCTTAATTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTACATTTTTACTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTACATTTTTACTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTACATTTTTACTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTACATTTTTACTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTACATTTTTACTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTACATTTTTACTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTACATTTTTACTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTATGTTAAGATCTTCTACATATCTCAAACTAGCCCAGTGAGAGAAAATGGTAGTGTTTATCCAATTTTAAATTCACCTTCACCCACTAAATTTAGTTTTAAATTTTT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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGAACGTTGAGCAGCACCATCCCGCCACAGGGCACGTAAGACCTACACGTGTCACCTCTGTGGACACGTGTCAATCAATTTTGCAAGGCGGGAAGCTTATTTATATGCTCGATTTCATTCCATTACTCACAAAGCAAGCAAAAACAAAAATTACGAAAAATACAGAAGCAAAAGCTAAAGTCCAATTCGTAAAAGAGAGGAAAAAAAAAACAATGGCATCTCACAATCAGAGCTATAGAGCTGGTGAAACCAAGGGACGAGCTGAGGTTGGAATGAGAAGGAATGAAGGACTTCAGATCCTCGGGATCAATAACAATTCTTGTCAATATTGCAATTTATTAGAGAGAGGTTACACCAATGAACCGCCTTCAAATCTTAAATCCAAGTTGAAAGTGTGGGCATCTCATCTGAATTGA

Protein sequence

MNVEQHHPATGHVRPTRVTSVDTCQSILQGGKLIYMLDFIPLLTKQAKTKITKNTEAKAKVQFVKERKKKTMASHNQSYRAGETKGRAEVGMRRNEGLQILGINNNSCQYCNLLERGYTNEPPSNLKSKLKVWASHLN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 66..87

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi02G027300.1Lsi02G027300.1mRNA