Tan0014829 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0014829
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG06: 26212110 .. 26221950 (-)
RNA-Seq ExpressionTan0014829
SyntenyTan0014829
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGGATGTAAAAAAAGTGGATGAGGGCATATTAGTTGAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGACGAAGTGCAAATGCAGAAAGTGAATGAAGAGTATGGATGGTCACATGCATAACATAGAGTCTGAGCTCAAGGACATTAAGAGGTTGTTGCGTCGGCTTGTTAAGGTATTTTGACTTCCATAATCAATGCTTACCTTTGCATTGCAGGATCTCAAGAAAGTAATTCGTATTATGTGATGCAAGCGAAAGACATCGACTCATCGAAGCATCTTGGGCCACCGTCGAGAGGAACGATGATGTTGGTCCATCTGAAGGTGGCGAAGGGGACCAACCTAAAGAACATAAGGTTAATGATGTCTCCAACGAGTCGATGGAATTGGATGACAAGGATGACAGTAGAGAAAGGGACCATTATAACAAGGACTCTGAGCAGAAGGAAAGCGACCTGCAACCATTGCAGGGAGACGCGCATGATGACTCATATGAAGATCCTTACTCGGTAAGCTTTATGACTACTTTTTGTAGTTTAGGGTCCATTTACATGTCCATTTACAAGTCCATCTAAATGTTCGCATTCTTTTCATTCGTAGGGTGAGGTACATGTATTGTGCTCACTGTCGACGATGGATATGACAAGCGATGTTAAGATCTGAAGGGATTGAATCCCGCAGCGAAAGCGATTGTGAATCGCGTGTTCTTAATTTTGTTGTATGGATCTCATAAACAAGAACTAAATCTAAAATTAAGCATGCTTCTACAAGATGGACAACAATAAATTACCTTTGAAGAACTCTTTTCTTCAAGTGCTCCTTTTCCCACGATCACGATCTCAGCAACTCGAACCCGAACGATCACGGACACTACCACCGGATCTTCTCCGTTGTTCTCTAGGTGAGGGAGGAATGTGGGTTTCCTTAGGATAAGGTGTGGGGTTGTGAGAGAGGTTGTGAATGGAACTTTTCCAATAACACAACTATGTAATTCTTTAGGGTTTCTCAAAAAGCATCTCACAAAGTTGCATCTCATGCAACTATTTATAGGGAAATGGGATGGAAATTACCATCCTATCCCTCCTTCATTCTCTCATTAGTATATAGTTTATATGTGAATCTAATTCACATTAAAACCATATATTATATTAATTATATCACATATAACTGATATAACACCTCATATATGAAATTGAACACTTCAATTTTATTCCTAACTTTATACCCTCAATGTTACCATGTTGAGCCAACGGAGGGACCTAATGGACCTACAGTTCATGAGCTCCAATGATGTGAGATTAACTGATCAAACTCTTTGATTTAGTTAATCAATATTCATTAACTACAAGTCACTCCACTATAGACTTGTAGCTGCACTCTCCTCACTGTAGATTATATTGTGTCCATTGATATAATCATTACCCATGAGTCGATCCTTCACAAGTTGTTCGTAATCATGGCTAGATCAAATTACTGTTTTACCCCTGTGATTACCTCTTTGTTCCTTAAGCACTACTGATCCTCTAATGAACAACAAGTCTAAGGTCCTACCATAGACTCATACCCTCATAGAGGGCGGGGCCCTGTTGTTCAAGACCTGGAGTCAGTTCTTAAGGGAACAACCTATCTAATTCGTTAGAGTAGGAATGAGTGAATTCCATCTTGCATAGTTAAGTCCCTAGCTACCTACGAGGTTCTGTCCCTGAGAAGGTAGGCTTATTGAGTTGGATACAGGCCACTCTCACCCATACTAGTCTAAGGACAAACCGCTATAAGTAGGAGTTCTTAACTTGCTCAGGATCAGGTCGAGTCACTAATGACCATCCATAAATTATCAGTCTTATCCTGTTAACGACGTTATACTAGTTAGACTAATAATTTGCAGTCCGGTCTTGTATGAACTCTTCATACAGGATACCCCCACTCGCATGTCAACCACATGAATGAGTTGGATTACCTCATTTGTACTAATTACAAAGTGGGTCGCATCCATGGTGTTACCAGAATAGGGTTTCCAACCTTATTCTTATACCATAGACCCTTTTAGGCTATACTCTTGAACACAATCCAAATAGTGTCTACTACACTGATGTTCAAGATATATTATAGCCTTGGGGCTTAGTTTATTGGATTTATAGAGCAAGAATATAATTTCATCAACACAAATAACTCTTTATTTATTTGATTAAAATTACATAAGTTTAGGGCACAAATCCCAACAATCTCCCACTTGACCTAAAGCTTGTGGAGTATTAAAACATTACAATAATGTAAATACAATAAACTAGGGCATTTAAACCCTTTGTACAATATACTCGCACTTGCCCTAGTGAGGGAAGACTTGTAAACCTAGACCTTCTAGGTGGCTCTAAAAAACTTTAGCCGTGAGAGCCTTTGTAAAAGGATCAGCAACGTTGTGCTTTGAGGCTATCTTCGTGACGATCACGTCCCCTCGATGCACGATCTCCCGGATGAGATGATATTTTTGCTCTATATGCTTTCTCCTCTTGTGACTTCGAGGTTCCCTTGAATTTGCCACGACACCACTGTTATCACAATACAGCGTGATGGGCAAACTCATATTTGGAACAACTTCTAAATTTAGCATGAATTTCCTTAACCAAATGACCTCTTTTGCTGCTTCATAAGCTGCTACATATTCGGCCTCCATGGTGGAATCAACGATGCATCCTTGCTTGACGCTTCGCCATACTACAACTCCTTCTTTAAGAGTAAATACTGACCTTGATGTAGATTTCTAAGAATCTTTATCAGTCTGAAAGTCAGAATCCGTGTATCCTGTAAGGATCAAATCCTTAGCCTCATACACAAGCATGTAGTTCCTTGTTCTCCGTAGATACTTAAGGATTGTTTTTACCGTTGTCCATTGTTCAGGTCATGGATTGGATTGATACCTACTGACCATTCCAACTGCAAAATAGATTTCTGGCATAGTACACAACATGGCGTACATCAGACTCCCAACAGCTGATGCATAAGGAATCCGTCTCATATCCTCAACTCATTGAGGTGTCTTAGGACATTGTTCCTTAGACAAATGAACTCCATATCTGAAAGGCAATAAACCCTTTTTGGAGTCTTGCATCTTAAACCTCGACAACACTTTGTTTATGTAAGATGTTTGAGACAAGGCTAGTGTTTTATTCTTCACCCAAATCTTTCATTTGGAATTGCGTAGCTAAACAATTCTTAATGTCATTAAGATATCATACATCATTCCCAATGAGTAGGATATCATCCACATATAGAACTAGGAATGCGACAGAACTATTGATGATTTTCTTGTAGACACAAGGTTCATCATCATTCTGGTCAAAACCAAAAGATTTGATTGACTCATCAAATCTTATATTCCAGGACCTAGAGGCTTGTTTCAGTCAATAGATGGACCTTTTAAGCATGCAAACTTTTTGCTCTTGTCCTAGTTCAAATAATCGTTTGGGTTGGTCCATGTAGATGTTCTCGTCAATATTGTCATTTAAAAACGTTGTCTTGACATCCATTTGTCATACCTCATAGTCATAATATGCGGCAATGACAAGTAGGATACAGATAGACTTTACCATAGCAACAGGTGAAAAGGTTTCCTCATAGTCAACCCCTTCAACCTAGGTATAACCCTTTGCTACTAGTCTAACTTTAAAGGTTTGCACCTTCCCATCTACACCACGCTTTCTCTTGTAGATCCACTTACAACCTATAGGTTTTACCCCATCAGGTTTATCTACAAGATCTCAAACAGAATTGAAGTACATAGACTCCATTTCTTAGTTCATGGCTATGACCCATTTGTCTTTGTCTTTGTCAATCATCGTTTGATTATAAGTCGATGTATCCTCGCAGTCGTCATCTGGTATAACAACTTGGGTTTCAGATAAACCCATGTAACGGTCAGGTTGTGTTATAACCCTTCCACTACGTCGATGCATACTCAACTCTTTAGATGGACTCTCTTGACTAGACAAGCTAGTATCAACAACTTTTGTTGACGTACTAGTTTTATTAGCAACCTTTGCTATTGTTCCGTCTAACTCACTTAACACAATTTTACTTCTTGGTTTGTGGTCCCTTATGTGGTCCTCTTCTAAGAAAATGATATTTGTCAACACAAAAACCTTATCTTCCTTAGGATCATAGAATAAACCACCTCTTGTATCTTTTGGGTAACCTACGAATAGACACAATTTTGAACGTGAATCCAACTTCTTTGGATTTATCACAAGCACATGTGTTGGACAACCCCAAATTCTGAAATGACATGAAATACCTTTACGTCCTTTCTAGAGTTCAAAAAGTGTTTCAGAAACTCTTTTTTATGGCACATTTTTCAAAATGTATCCCGCAGTCTCTACTGCGTAACCCCAAAAAGAATTAGGGAGATGAGCATAACTCATCATTGATCGAACCATGTCCAACAGGGTTTTATTTCTCCTTTTCGATACACCGTTTTACTGTGTAGTACCGGGAGCTGAGAGTTGAGATGTAATTTCATGTTCTATCATATAGTTCTGAAATTTTAAATCCATGTACTCTCCACCTCGATCTGATTGAAGCGTTTTAATTGTTTTACCTAATTGATTTTCAACTTCAGTCTTGAATTCCTTGAACTTTTTAAGTGCTTCAAACTTATGTTGTATTAGGTAAATATGCTCAAATATAGAATAATCATCTATAAAGGAGATGAAATATTCATATCCTCCTCTAGCTTTAACACTCATCGGACCACATAGGTCTGAATGTATAAGTTGAATGAGTTTTTTGGCTCTATAACCTTTTCCAGTAAAAGGTCTTTTAGTCATTTTGCCTTCTAGGCAGGATTCACATACAGGTAAAGGATTTTCTTCTAACTCATTTAGAAGACCATTCTTTAACAGTCTCTCAATCATATTGAGGTTAATGTGACTCAATCTAAAATGCCAAAGATGAGCATTTTCTTTAGGAGAAATTTTACGTTTCTTAGTTTGTGTGTTTGCAGTTTTAAATAATTCA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mRNA sequence

ATGAAGGATGTAAAAAAAGTGGATGAGGGCATATTAGTTGAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGACGAAGTGCAAATGCAGAAACGAAAGACATCGACTCATCGAAGCATCTTGGGCCACCGTCGAGAGGAACGATGATGTTGGTCCATCTGAAGGTGGCGAAGGGGACCAACCTAAAGAACATAAGGTTAATGATGTCTCCAACGAGTCGATGGAATTGGATGACAAGGATGACAGTAGAGAAAGGGACCATTATAACAAGGACTCTGAGCAGAAGGAAAGCGACCTGCAACCATTGCAGGGAGACGCGCATGATGACTCATATGAAGATCCTTACTCGCATACGGAAGCTGACTCGGAGGTCGTTGAGGTGGTAGCGAAGGTTAATGATGCTCAACCTCGCCGATCAAAGCACAAACGAAGAACTGGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGGATGTAAAAAAAGTGGATGAGGGCATATTAGTTGAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGACGAAGTGCAAATGCAGAAACGAAAGACATCGACTCATCGAAGCATCTTGGGCCACCGTCGAGAGGAACGATGATGTTGGTCCATCTGAAGGTGGCGAAGGGGACCAACCTAAAGAACATAAGGTTAATGATGTCTCCAACGAGTCGATGGAATTGGATGACAAGGATGACAGTAGAGAAAGGGACCATTATAACAAGGACTCTGAGCAGAAGGAAAGCGACCTGCAACCATTGCAGGGAGACGCGCATGATGACTCATATGAAGATCCTTACTCGCATACGGAAGCTGACTCGGAGGTCGTTGAGGTGGTAGCGAAGGTTAATGATGCTCAACCTCGCCGATCAAAGCACAAACGAAGAACTGGTTAA

Protein sequence

MKDVKKVDEGILVEKKKKKKTKCKCRNERHRLIEASWATVERNDDVGPSEGGEGDQPKEHKVNDVSNESMELDDKDDSRERDHYNKDSEQKESDLQPLQGDAHDDSYEDPYSHTEADSEVVEVVAKVNDAQPRRSKHKRRTG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 35..142
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 46..122

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0014829.1Tan0014829.1mRNA