Tan0008131 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGCCCTCCCGCCAAACCTCCCCAAAGCCCTAGTCTGCTGGTCCGTTTTCCCTCCACTCATTCTCATTGTCTGCAACTCCATGTTCCGTTGCCACCTCCAACTCCGTCTCTAAACCCTCAAATTCTCGAAGCCATAACTTCCTCTCAAGCTCCATAGTCTTACTCATAATATATCCAATTTCGTTGTGAACATTTTACTTTCCACTACCGGAGGATGAGTTTTGCCGCCTATAGAATGATGCACTGGCCTACGGGCATCGAGAACTGTGATTCAGGCTTCATCACCCATTCTCGCGCCGACTTCGTACCCGGTGTTACATCTCACACCGACGAACTCGAGTCCGACTGGCCGGCCCGCCGAGAAATGGGTCCAGTTCCTAATCTCGTTGTCACCGCCGGTAATGTCCTGGAGGTATATGTTGTTAGGGTTCAAGAAGAGGGTGGCAGTGAATCAAGAAGCTCAGGAGAAGTCAGGCGCGGTGGTATTATGGACGGAGTCTCTGGGGCCTCGCTCGAGCTTGTTTGCCACTATAGGTATGCTTCGAGTTTTGTCAATGTACACAAGGATTGTCATGCTAGTATGTTCAATCTTCAATGTTCTAACTAGCTTGTCAGAACATACACCGTGGAGCAGCTTTTTGTGAGCTCCTCAATTTTGGGTCTTTTTGCGTCTCATTTTGTACTTCTCATCAAATGATTGATAATATTATTTCTCGTAGGAAAGAAAAAAAACATGCGATTAGCTTTCCCGAGCATTTGCAAAGGAGGCCCCTTTATATGATCCTTAATTATCTGCAAAAAGCATATGCACCAACATCCTTCTACCTTGCTTGTTGACGCTGGATAATTTGGAAGAACATAAAAATTCCATCTACTTATTCTTATTCCTTCCATCTCTGTTGATTAAGATAAGTTCTGGAAATAGTCTGTGATTAATTTTTCTGTTTCAAAAGGGAGGGATAACCAGGAGTCCCTCATCGAAAAGAAACAAGAAGCTTAACATCTTTATAGAAAATAGAATTCTAGAAATAATTGGGTGTTCTTTTTTTAATACTCTAGCCTTCACAACTTTTTTCTTTGGGGGGGGGGGGGATTTTTATTCCAAGGAGTCGGCAGATCAATTACCATTGGCTGTTTAGTTTGTCCATCCATGGTGGATGGTGTAAGGTGTCATCAAGACAATTTAAACGATATGGTTGGAAGTCTATCTGAATCAAAGTAATGAATGCATGCCCAGGTCTTATGAAATATGAACTAATTTTTAAGTTTATTTTTTAAAATATAGAACCTAACTTTAACTAAGAGGAATGGAGTACAAAAAAAGAAAGTCATACAAAAAGATAGGCCGAAACCAAACACAAAGAACTACATAGGAAAGAAAAAGCTACAAGAAGGAACTCCAATTGTTGGTAATAGAGAACAAAGGAGTATTAGAATAAAACTTAGTCGAATAGAAACAAAGGAATCATTTAAGTGTACAAACTCCAAACCTCTCCTCAAGATCTCTCTACTCCCTTAAACACCCTTGTTTTCGTTTCTAGCAAGACGTTCCATAAAGCAGCAAAGAAGCTAATTTTCCAAAGAAATCTTCCTTTGTGTGGAAAAGAACGGTGTAGTAGGGCTTCCTATGCATATCACGTCGCTCTTGAGTTTACCACCTCCCCAAAAGATAAGAACTCGCTCATCTTCATTGTGAATGGGCAACTCTACAGAATGTGATTTAAATCCACTAATGCTTGTTTTCAAGTAATGAAGAGCATTAGTGAAGAACTAGAGTGGAAGATGTCAGATTTATTTTTGGTAAGCACTTGCTATTTTTTTTCAGTGATAATTTATTTTTCTCGCATCTTGCACAGGTTGCACGGTAATGTTGAGTCCATGGCAATTTTGTCTAGTAGAGGAGGAGATGGTTCCAAGAAGAGAGATTCAATTATATTAGTCTTCCAAGAAGCAAAAATTTCAGTGCTAGAGTTTGATGATTCTATCCATAGTCTCCGTACAAGGTGGGTGGAGTTGTCAAAGGAACAAGATCCTTGTTTGCCTTTTTGATTGTTCTCTACAAACATTTAGTCCTTCACATATGCAGGCTTATTTACTTTTAGACAAAGATAACGTACATAATCACAATCAGAAATAATTACATGGGATGTGTAAATTCTAAGCTTTTGGTATTTCATTTTGGCTATATGTGTTTCTACTAGAACTCTTTCTCATTGTCTGATCCATTAACACAATTGGGGACTGGGTAAGAAAAATTTCTAATTGTTGGATTCATATTTATCACAATTCTTTTGATTTTTCTATCTTTATTTTTTTGAAAGAAACATAATTGGTGCAAGCAGATAATTCTTCATTCTAGATTTGATATTTATGATGTTTTTTTTTGAAAGATGATATTCGAAGGCAATACAACTATATATTGGCGATAAAATGTATATTGGTACAGCCTTTTGGTTTTTATCAAGGTTTCTATAGAGTCCATGACAACTTGCATTTGGGTCAGATATATATATATATTTTTTGGAGAAGAAGCAAGAATTTCAATGAATGAAATTTACAAGAAGGAAGAATAAACAACCAAACATCTAAAGTGGATTACAAAAATTCTTCCACATATCTAATCAGATAATTTATGCAATATAGATGTTACTTTCTTATCAGGCTTCTGGTTTCAAACTACTTAATTGTCTTGTTTAGTTTCCCAAAATGGTTCCACATTATTAGTGAACTTCATCATCTTCTATTTAAGATTTTTGCATTTGTATTTGTTTTTTACTTTATAAAAACTTATAGAACCTAAACAATGCTGCATAACTAGAATCTTATGTTATATGTGGGAAAAGGGTTATTTGACGAGGTATTTAGTTAAGCTATCGACAACATAAAATAATAAAAAGGTTACTGTATTTGTAATTGTTAGATCAATTCATCTTTAGTAGCCTGACCAAACATTTTCTTTGACTTTAATTTTATTGTGACTTATATAATAAGACAACATACTTCTTTGTTAATGCACGACCATTGTGTAATTATTCAATCCTTCCAAATTCTTTCCTAACTGTTTCTTTCCTCCACCAGATAGATGTACAAATGTACTATGCTTGGAAAGAACTTGTGCAAGATGATACTCTGGTTATTTTATTATCTTAGTTGTATAATTTTCTTTTGCATCTGACAATTACCTTTAAGTGAATTTTCATTTGTAGCTCAATGCATTGCTTTGAGGGTCCACAATGGCTTCATTTGAAAAGAGGTCGAGAATCATTTGCAAGAGGTCCAGTGGTAAAGGTTGATCCTCAAGGCAGGTGTGGAGGAGTTCTTGTTTATGGTTTGCAAATGATAATACTTAAGGCTTCTCAGGTGTCTTTTGCCTTTCAAACTTTTTATTTGGATGTGCATGACAACTCAATGCCATGCTTTGTTGACATATAGTTCCTAATATCTTGTATAATATATTGGATAGAAAGAGAAACTATGTTGGATTAAGAAGTAGTTCTATCCACGGGCTTGTGTACTGTACTTTTATCCTGCTAAGTTTCACCATTTACAATGTTGCACACTGAACTTTGTGGAGGGGTTATCTGTACCCTTGCCCTTGGGTTGTTCTTTTGGCTTGTGTACTATATACCTTTATCCTTCAATTAAGTTTCACCATTCACAATGTTTGCTCATTGAGCTTTGGAGAGGGATTATCTCTGCCCCTTGCCCTTAGGTTGTTCTTTTGGCTTTATGTGAATATATTTCTCTATGTTTCTTATTAATAAATTGTTTGCACATTTTTTTAACAAGAAATAACTCTCCATTAAGATTATGAAAAGTGACTAATGCTCAAAAGATACAAACTTCACTCGGGAGTGAGAGGAAGCAAATAGGAACATCACACAAATCAAAAGAAACAAGAAAACAAACTACACAAAAGCCTCCCAACTAAGATAAATATCATTCAAAGAATAAGCCTCAAAAGGTTTGGAGAGTGTGCACCGAGATGGTGCCTTCAAGCATGTTGAATCAAATCTTTCCACTCACGAAAGACTTTTGCTTTCAAATATTCTTGAATTTCTTTCCCACCATAGTTCTGACAACAAAACCTTGATACCATTAACCCATGAACGTGTTGACTTTGTGGAGTGCTTTTATTGTTTCTTTCTAAAGCTTTAAAGTTATGTACTCTTATGTTTTATTGTCAGCTTGTTTCTTTTTTTTTTTTGGGTTTTTTTTCCTCACCTCTAAGCTTAGAGAGCACACCTTGGTGGGAGGAAACTTCAAACTCCAATCCTGAATGATCAAGAACCTATCAATTAGAGAGCACAATAATCGGTCTTGAGCAGTCTTCCGATCTTCTACTTTTTGCTTTTAGAAGCCCCTGTGAGAGCTATAAAGAAGATGTAAAATCTGGTGAGGATTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGATTCTGGATGCAGTCATCTTGTAAACTGGGAAAAGATCTCTCTGCCTTCGAAATATGGTGGGCCCGACCTAGATGCTTTTCAACAAAAGAATAGAGCGTTACTCTTGAAATGGCTTTGGAGATTCATTAGAGAAGAAGAAGCTCTTTGGAGGGAAGTTATTGTGAGCTACGGTCTCGATCAACCAGGTTGGTGCACCTTCCCTCCAAAAGGCAACTCAAAAGGTAGGACCTGGTTTGAGATTGCCAAAAATGGTGCTGTTATTTAATTATTTATTTTAAATAGTTTCCTTTCTTTTAAGGTGAACAAGGGCAGTCAGATTCGCTTTTGGAAAGATGTTGGAGATGCTACTCTAGCTTCTTCTTTTTCAATTATCTTTGGTATTTCGATGAAGCAAGAAGCTATTGTGGAAGAATGCTAGAGGAATGATTGGGATTTGGGCCTTAGAGGAGGCTTGTTTGATTGGGAGATTTCTTGTTGGATTGGACTGATTGAACTGATTGATGTCATGGCTAGGAGTAGGGGTTGTTGAAGCACTTTGGTCTTTAGAAAAGTCAAGGAGTT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MSFAAYRMMHWPTGIENCDSGFITHSRADFVPGVTSHTDELESDWPARREMGPVPNLVVTAGNVLEVYVVRVQEEGGSESRSSGEVRRGGIMDGVSGASLELVCHYRLHGNVESMAILSSRGGDGSKKRDSIILVFQEAKISVLEFDDSIHSLRTSSMHCFEGPQWLHLKRGRESFARGPVVKVDPQGRCGGVLVYGLQMIILKASQAGSGLVVDDEAFGNIGAISARVESSYLINLRDLDVKHVKDFVFVHGYIEPVMVILHEQELTWAGRVSWKHHTCMISALSISTTLKQHPLIWSANNLPHDAYKLLAVPSPIGGVLVVSANSIHYHSQSASCMLALNNYAVSADSSQDMPRSNFNVELDAANATWLLNDVALLSTKTGELLLLALVYDGRVVQRLDLSKSKASVLTSGIASIGNSLFFLGSRLGDSLLVQFSSGVGSSGLASSLKDEVGDIEVDAPTAKRMRRSSSDALQDMVGGDELSLYGSAPNNAESAQKNFSFAVRDSLINIGPLKDFSYGLRINADANATGIAKQSNYELVCCSGNGKNGALCILRQSIRPEMITEVELPGCKGIWTVYHKNTRGSSADSSRMVPDDDEYHAYLIISLEARTMVLETGDLLTEVTESVDYFVQGRTIAAGNLFGRRRVIQVYESGARILDGSFMTQDLNMVVTCNESGNGSEGCTVLSASISDPYVLLTMTDGSIRLLVGDPSSCSVSVSTPAAFGSSKKCVSCCTLYHDKGIEPWLRMTSTDAWLSTGVGETIDGTDGSLQDQGDIYCVACYDSGDLEIFDVPNFVSVFYVDKFVSGKSHLVDFQMSDLQKNSEKLDRNSQELNSHGRNESSQNMKVIEVAMQRWSGKHSRPFLFGILTDGTILCYHAYLFESTDSASKIDDSVSMENSVSSSNMSSSRLRNLRFLRVPLDIQGRDDMPNGTLSRRLSIFKNISGYQGLFLCGSRPAWFMVFRERLRVHPQLCDGPIVAFTVLHNVNCNHGLIYVTSQGVLKICQLPSTSSYDNYWPVQKVPLKGTPHQVTYFHEKNLYPVIISAPVHKPLNQVLSSMVDQDVGQVENHNLSADELQQTYSVEEFEIRILEPEKSGGPWQTRATIAMHSSENALTIRVVTLLNTTTKENETLLAVGTAYVQGEDVAARGRVLLFSVGKDVDNSQTLVSEVYSKELKGAISALASLQGHLLIASGPKIILHKWTGAELNGIAFYDVPPLYVVSLNIVKNFILLGDIHKSIYFLSWKEQGAQLSLLAKDFGSLDCYATEFLIDGSTLSLTVSDDQKNIQIFYYAPKSTESWKGQKLLSRAEFHVGAHVTKFLRLQMLSTTSDRASTTVSDKTNRFALLFGTLDGSIGCIAPLDELTFRRLQSLQKKLVDAVPHVGGLNPRSFRQFLSNGKVHRRGPDSIVDGELLCHYEMLPLEEQLDIAHQIGTTRSQILSNLNDLSLGTSFL Homology
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGR0 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CPSF160 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 2166.0 bits (5611), Expect = 0.0e+00 Identity = 1074/1459 (73.61%), Postives = 1255/1459 (86.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XWP1 (Probable cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os04g0252200 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 1875.1 bits (4856), Expect = 0.0e+00 Identity = 971/1470 (66.05%), Postives = 1149/1470 (78.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10570 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 650.6 bits (1677), Expect = 4.2e-185 Identity = 477/1492 (31.97%), Postives = 733/1492 (49.13%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A0R4IC37 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Danio rerio OX=7955 GN=cpsf1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 1.2e-184 Identity = 469/1488 (31.52%), Postives = 753/1488 (50.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10569 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=CPSF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 646.7 bits (1667), Expect = 6.1e-184 Identity = 484/1545 (31.33%), Postives = 748/1545 (48.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. NCBI nr
Match: XP_038887722.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2792.3 bits (7237), Expect = 0.0e+00 Identity = 1406/1454 (96.70%), Postives = 1429/1454 (98.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. NCBI nr
Match: XP_022973592.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022973593.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2767.3 bits (7172), Expect = 0.0e+00 Identity = 1396/1453 (96.08%), Postives = 1421/1453 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. NCBI nr
Match: XP_023520837.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023520838.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023520839.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2759.9 bits (7153), Expect = 0.0e+00 Identity = 1393/1453 (95.87%), Postives = 1420/1453 (97.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. NCBI nr
Match: XP_008441850.1 (PREDICTED: cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2755.7 bits (7142), Expect = 0.0e+00 Identity = 1392/1453 (95.80%), Postives = 1419/1453 (97.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. NCBI nr
Match: KAG7011474.1 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2752.6 bits (7134), Expect = 0.0e+00 Identity = 1389/1453 (95.60%), Postives = 1418/1453 (97.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7X9 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472174 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2767.3 bits (7172), Expect = 0.0e+00 Identity = 1396/1453 (96.08%), Postives = 1421/1453 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4E8 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485885 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2755.7 bits (7142), Expect = 0.0e+00 Identity = 1392/1453 (95.80%), Postives = 1419/1453 (97.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY93 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439584 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2748.8 bits (7124), Expect = 0.0e+00 Identity = 1388/1453 (95.53%), Postives = 1417/1453 (97.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKI9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G074280 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2738.8 bits (7098), Expect = 0.0e+00 Identity = 1385/1453 (95.32%), Postives = 1415/1453 (97.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DTM4 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023895 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2604.3 bits (6749), Expect = 0.0e+00 Identity = 1313/1362 (96.40%), Postives = 1336/1362 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. TAIR 10
Match: AT5G51660.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 160 ) HSP 1 Score: 2166.0 bits (5611), Expect = 0.0e+00 Identity = 1074/1459 (73.61%), Postives = 1255/1459 (86.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. TAIR 10
Match: AT4G21100.1 (damaged DNA binding protein 1B ) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 3.8e-24 Identity = 281/1343 (20.92%), Postives = 482/1343 (35.89%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. TAIR 10
Match: AT4G05420.1 (damaged DNA binding protein 1A ) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 3.7e-19 Identity = 88/329 (26.75%), Postives = 153/329 (46.50%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. TAIR 10
Match: AT4G05420.2 (damaged DNA binding protein 1A ) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 3.7e-19 Identity = 88/329 (26.75%), Postives = 153/329 (46.50%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008131 vs. TAIR 10
Match: AT3G55220.1 (Cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) A subunit protein ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 5.2e-05 Identity = 83/364 (22.80%), Postives = 140/364 (38.46%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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