Tan0005687 (gene) Snake gourd v1
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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATGCAGTGAGAAGAGAAATAAAAATAATGAAGTTGTTTATGCATCCTCACATAGTACAACTATATGAGGTTATAGAGACACCAACTGATACCTACGTAGTGATGGAATATGTCAAATGTGGAGAACTTTTTGATTATATTGTGGAAAAGGGTAGGTTGAAGGAACATGAAGCTCGTCGACTTTTCCAACAGGTATCGTATGCTAATTACAAAGTGCTTTTAGAATGACTTTTGAAAGAGAGATATATTAATTAAGTACTTTTTTAAAAAGCGTTTTAAATGATATTGGATGATTTTTTTTTTTGGACAGATAATATCAGCAGTGGAGCACTGCCACAGAAATATGATAGTTCATAGAGATCTTAAGCCTGAGAATGTTCTATTGGATTCCAATTTCAATGTAAAGATAGCAGATTTTGGTTTTAGCAATATGATGTATGATGGCCATTTCCTCAAAACAAGTTGTGGGAGTCCTAACTATGCTGCTCCAGAGGTACAAGTTTTTACCACTTAATCAAAATATGAACTACGACACTGTTTAATTTTAATAACTATTTTGATTTTTTATTTTATGTTTTGAAAATTAAGCTTAAAAATATTATTCCTACCATGAATTTCTTTAGTTTGTTATCCTACTTTTTATTTAGATTTTTAAAAATTAAGTCAAATTTTAAAAACTAAGGTTCCGTTTGATAACCATTTTATTTTTCGTTTTTAGTTTTTAAAAGTTAAGCTTATTTTCACATAATTCCTCTACAATAGGTATCATCTCCCTTAAATAACCATTTGAACTCTTAGCCAAATTCTAAAAACAAAATCAAGTTTTTGAAAGCTACTTTTTTTAGTTTTCAAAAGTTGGTCTTGTTTTTGAAAACATAGGTACAAACTAGATAAGATAACATATAAACTCATTGGTAAAAGTATTATTTTTAGGTTTAAATTTCAAAAACTAAAAACAAAAAACAAAATGGTTATCAAACAGGGCGGGGCCTAAATGAGTGTTTTTTATTTTGGAAGTTTGTTTTTGTTTTCAAAATTTAACTAAAAATTGAAATGTTTCTTTTAAGAAAGATAAATTCGTTACAGGGAAATTGAAAGAAAATAAGTTTTAAGTTTCAAAAATCAAAAACAAAAAATGAATACTTATCAAACGGCTATGTTACTTTGGGTAACTAAAAATGTTTAAAAACAGTTCGTAGTGTTTGATAACGAATAAAAAGTAGATTTATTTTATTTTATTCTTTTTTAAGAAAAACTTAAAGTGATTGTCTGAAATCACTTAACATTTGTAACAAAACAAAAGTGTTTTAATTAAAAGTGCTTTAATCACGAATTACGTACATGTTACAAAAACTTCTATTAGAAGTGGTTTAAAGAAAAAAAGTGTTTAAACATAAGGTAATCCATAATATAACTACTCTTAGAAACGCGTTTGAAATTCCCCTAATTTAATTTTGAAGATTGATTCAACCATTTTACAGGTTATTTCTGGTAAATTGTATGCTGGGCCTGAAGTAGACATATGGAGCTGTGGGGTTATATTGTACGCACTTTTATGTGGCTTTCTTCCTTTTGATAATGAAAATATCGCCATCCTTCACCAAAAAATTAAGGTATATCTTAAAATTTATCATCTACAATCTTAATCTAAATTATAGATTTAAATCTCATTTTGGACTCCATACTTTCGAGTTTGTTTCATTTCATTTTAATCTCCAAACTCTCAGAATGACAATTTTATTTTCAAACATTGAAATTTTTGTCATTCAACTTTTAAAATGTCTATTTTTGTCCTTAAATTTTTCGTAAAAAAAAACATTACAGTCTTTACCTTTATTATATTTTTAACAAATGAATGATATAACTTCAAGTATGTATACTAGTATATTAATATGAGCATAAACGAATATTGATGGAAAAATAATACAATAAAGGTCAAAATAGTTACTTTTAAAAAAGTTTAGAAACTAAAATAGAGAAATTGAAAGTTTAGGGGACCAAAACAAAATAATCTTAAAAGTTCAGGACCAAAATGAATATTTTAAAAGTTCAAGAACCAAAACGATCAAAATGATGTTTAAACGTAAATTATAAAGTATTAAATTTGAATTTATATCGGAGGATTGTTCTTACCATATTTTTTTTCCTTTAATGCATAAATATTTGATGATACCTAAAAATTATTTTGAATGTTCTTTAGAATGGAGTTTATAGCCTTCCAAATTTCATATCACCGGCTGCAAGAAACTTGATCTCAAAGATACTTGTAGTTGATCCATTGAGACGAATGACTATTCCTCAAATTCGCAAGCATCCATGGTTTCAAGCTCATCTTCCTCGCTATTTAGCTGTGAAACCAATGTACATCATCCAACAATTTGAAAAGGTTAGTGATTACTTTCGAAATTAGCTTATCTCAATCAAAAGGCAGACAAACTTTTTTTTGGTTAAAATTTCATGCAAACTTATTTGAAAAATATTTTGAATTAGTTATTTTTTAATGATTTGGTATTTACACTAAAGTAAAAAAATGTCTACAATAGCTACGAAAAATTGTTGTAATAGATGTTTTATAGCTTTTTTCACAAAGTCCTAACACCAAATGCTATTAAAAGTCTGAAACTTTTTATAGCATTTTAAAAAGTTATATTAAAAGTCTTTTAATCGCATAAATTCCTCTGGTTAAAATCTATGATAAGATTTTATAAATGGTATAAAAATTATTTTAGTAATCTACGATAGCATTTTAGTAATTATAACATTTATTCATAGTTATAAATATTTATTTTTCACTCAAACAAAAGCTATAATATACTTTTGAATTGTTAATTTTTTTGCTATTATTGTATCTTTTGTAGCTTTTGAAGTTTATTCATAGTGGCATTATTCATGTTTCCTGCCTTATTTCAAATTAGAAGTAAAATAATAAATAAATAATCTACAAGAATAAATATACAATCAAAATGAGTCTTTATTTAAGCAAATATTCCTTCAAGATTTACATTATCCCACTTACATTTGATACAAAATATATACTTTAACAATCTATTGTTTACGAAAATAAATATAGTGACGAATATCAACATAGTGATGACATAAAATACTAACTTTGTCAATCACTATTCATTTAATTACTAAATAGAATAAAAATATATAACTCGAGCTAGTTGTGTTCGTGACCAAGAACTTTCAATAATATTGTTTCATCAACATACAAAAAAAGTCATAAAGAAATAAATAACAAAGAGCATTTACTCAAATAAAATAATGATTAACAAATCAATATTTAATTAATAATATATCAATGTACCTGCTGATTAAAACTTTGTCAAAAACCATAGAACTGCACTATCAATAACATTTTCAATGTAGGGTCTCAATAATTATGCTCTTTCAAATAAATTTAAATATATTAATTAGCTAGTTAATGACGTTTTAACTATTTGCACTATGCAATTTCAAGAAAGGAAGAAAAAAACACTAACAAAGAAACCAACAAGAAGTCAAGAATTCCTATATAGATAACTACCCCCAACCCCACAACATAAATTTATAGTATCTCACATCCCTAGTAATAGCTAGTTAATGACGCTCTTTTCTAACACACATTTACAAGAACAGAAGTATTTACAAGCATTTTCTATAACACCTCCAAATTTTAACCTAATCTACGGAATGACACTAAGCTAACAATCTATATGTTCCAAAAATTTTGACAACATAACAATGTAACTACAACAATACCAAAAATTTTACCTAACACCTATTGGTAAAAAAGATAACACTTCTATATCTAGAGTAACCAAACCACGACTCCCAACTCTAACTCACAAAGTTATGAAAGACTCAAAAAATGAGCAAACATTCTAGATATGTAAAGTACTAGACCAATTCATTAATTTCCAGCAAACACAATCCAAAAGGTAAAGTAACCTAAATGTCTATCGTTAAACTTTCAACACAAATAATAAACCTAAGATATCATTCACTCAAACTTAAACATTTTAGGAAGGAAGCAACATTCCAACAACTACCCTACAAGTAAACATAACCAACTACAACAGTATTTCAACGAGGTCCTACTCTTTTCTAACAAGCATGTACAAGAAAAGAAGCATTTACAACTAGCATTTGCTAACTTAATCTAGGGAATGTCACTAACCTAACAACCAATATGCTTCGAAAATTTCGACAACACAATGACATGACTACAACATAATATAAAAAATATTACCTAGAATTTGTTGGTAAAAATCCTTGATGAACTTGTTATCTGTGGACCTTCACGCTTGATCCTACAATTAGAATCTTTCATAGATATATAATTTGTTGGAGTATGTGGGCCTCCATAAATATGCATTGGGTTTCTTTTAGACATCAACTCAAACTCTAACTGTGTAATGACTCGCAATTTTGGCCTAATCTAGGAGCGTACAACCACCATGTCCCAAAAAATTTCAACAACATAACAGCTTCCGCACAACAATACCAAAATTTTTACAAGTACTTGTTAAACGAAAACATACTTCTAAGCCAGATAACCAAATAATTGAACAAAACTTTGAATCACTAATCATTTATAAATTCAGAATTTTTTTTATGAAAAGCCAACCTTTCATTGAGAACAAATGAAATAATACAAGGACATACAAAAATAAAGCCCACAAAAAATGAGACATTAACGAAAAGGGCTCAAGTCTAATAAAATGAGATTAAGCGAATAATTACAAAAAAATCTTCGAAACCGAAGCTCAAAAATAAGCATAAAATCTAACTAGGCTATTTATTAAAATGCTATATTGAAAAGCTATAATAGGTCATATTCCTTGTAGTGTGATCATAGTGCTATTTTTGTAGGCACTTGTTGCAATGTAGGGGTTATGCGGTAGTGATTTGTAAATAGAATGAATGTTGTTCATGACCTAGTCGTATTGATTAGAGTGGTTTTTAAGGTTAGTGGTCTAATTAATGGGTTAGTGGTTGGTTCTTTA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MNAVRREIKIMKLFMHPHIVQLYEVIETPTDTYVVMEYVKCGELFDYIVEKGRLKEHEARRLFQQIISAVEHCHRNMIVHRDLKPENVLLDSNFNVKIADFGFSNMMYDGHFLKTSCGSPNYAAPEVISGKLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGFLPFDNENIAILHQKIKNGVYSLPNFISPAARNLISKILVVDPLRRMTIPQIRKHPWFQAHLPRYLAVKPMYIIQQFEKIDEDVLQKVVLMGYFDSNKLVQSLHNKCQNQGTVTYYLLLGDRFPISGGYLGAESQELIEPNHMPPVVATMPSFEHLKNNQVVGITPQIQVNGKWALGLQAKANPRDIMMKVLTVLQELNVYWKKIGDYNMKCKLTPTHHQAMPCNLAFNNPSIFLEINNVTPLQNVVKFELQLYKMQEEKYLLDLQRIQGPQFLFLNLCATFISQLRVV Homology
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38997 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KIN10 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 584.3 bits (1505), Expect = 1.1e-165 Identity = 293/450 (65.11%), Postives = 351/450 (78.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P92958 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KIN11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 4.0e-155 Identity = 277/452 (61.28%), Postives = 348/452 (76.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q852Q2 (Serine/threonine protein kinase OSK1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=OSK1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 548.9 bits (1413), Expect = 5.3e-155 Identity = 272/448 (60.71%), Postives = 342/448 (76.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8BBT7 (Serine/threonine protein kinase OSK4 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=OSK4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 536.2 bits (1380), Expect = 3.5e-151 Identity = 271/453 (59.82%), Postives = 343/453 (75.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q852Q1 (Serine/threonine protein kinase OSK4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=OSK4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 536.2 bits (1380), Expect = 3.5e-151 Identity = 271/453 (59.82%), Postives = 343/453 (75.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. NCBI nr
Match: XP_023007674.1 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 735.3 bits (1897), Expect = 3.0e-208 Identity = 363/441 (82.31%), Postives = 399/441 (90.48%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. NCBI nr
Match: XP_023529960.1 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 728.8 bits (1880), Expect = 2.8e-206 Identity = 362/441 (82.09%), Postives = 397/441 (90.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. NCBI nr
Match: XP_022933490.1 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 727.6 bits (1877), Expect = 6.3e-206 Identity = 360/441 (81.63%), Postives = 398/441 (90.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. NCBI nr
Match: XP_038892877.1 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 716.5 bits (1848), Expect = 1.5e-202 Identity = 358/442 (81.00%), Postives = 388/442 (87.78%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. NCBI nr
Match: XP_008452375.1 (PREDICTED: SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 707.2 bits (1824), Expect = 8.8e-200 Identity = 357/446 (80.04%), Postives = 386/446 (86.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L5M8 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500223 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 735.3 bits (1897), Expect = 1.5e-208 Identity = 363/441 (82.31%), Postives = 399/441 (90.48%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F510 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440895 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 727.6 bits (1877), Expect = 3.0e-206 Identity = 360/441 (81.63%), Postives = 398/441 (90.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BUG9 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493434 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 707.2 bits (1824), Expect = 4.3e-200 Identity = 357/446 (80.04%), Postives = 386/446 (86.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CT90 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014121 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 688.3 bits (1775), Expect = 2.1e-194 Identity = 354/448 (79.02%), Postives = 386/448 (86.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L5N8 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500223 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 673.3 bits (1736), Expect = 6.8e-190 Identity = 332/406 (81.77%), Postives = 365/406 (89.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. TAIR 10
Match: AT3G01090.1 (SNF1 kinase homolog 10 ) HSP 1 Score: 584.3 bits (1505), Expect = 8.0e-167 Identity = 293/450 (65.11%), Postives = 351/450 (78.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. TAIR 10
Match: AT3G01090.2 (SNF1 kinase homolog 10 ) HSP 1 Score: 584.3 bits (1505), Expect = 8.0e-167 Identity = 293/450 (65.11%), Postives = 351/450 (78.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. TAIR 10
Match: AT3G01090.3 (SNF1 kinase homolog 10 ) HSP 1 Score: 584.3 bits (1505), Expect = 8.0e-167 Identity = 293/450 (65.11%), Postives = 351/450 (78.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. TAIR 10
Match: AT3G29160.1 (SNF1 kinase homolog 11 ) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 2.9e-156 Identity = 277/452 (61.28%), Postives = 348/452 (76.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005687 vs. TAIR 10
Match: AT3G29160.2 (SNF1 kinase homolog 11 ) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 2.9e-156 Identity = 277/452 (61.28%), Postives = 348/452 (76.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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