PI0028770 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAGTGTTCACTTCTAGTCCACGGCAAGAGCAGACTGTTTTCTTCCTTTCTCTTCTAAGTCCGACGCCATGGATGAACCCATTTCATCCAACGCCGAAACTCCACTTCCAACCAACTCAGACCAAGGAAACTCGGTAAATGGAGACGAACCCATGCCCGACCTTCCTCAGAACCCCACCGATTCTTCTTCCTCCGACTCCGACTCTGAAGACGACGAATCCGACCAAAACCTTCAACTCCTGTCCCTTCAATCTCAGCTCTCCTCCAATCCCTCCAACTACGATGCTCATGTTCAAGTAATTTTCCTCTTCTTTCTTTAATGCCTTTTCCCCCATCATTTCTTCACCCATTTCTGCATTTACTAACTTTTACTTTCATTTTGACGCCCTTTCCTGGTTCTTCTACTCTGTCTTTCTCATTCCCACTACTTCAGTACATAAAGCTTTTGAGGAAAATTGGTGACATTGACAACCTCAGGAAAGCAAGGGAAGCAATGAGTGAGATATTTCCATTGACCCCTTCAATGTGGCAGGAATGGGCCAAGGACGAAGCATCTATTAATACTGGGTAATCTCGTCCATTTGTTTCCTCTCTTGGTTGTTATACTGTTGCTCCCTAAATCCATTTCTGTTTCTGTGCCATTCTTAACATCTTCTGGGTTGGATTTGTTCTGTTAATTTCGAAGTACTAACAAGTTCTTGAAATTTTATGGAAAAGAAAAAAGGATATTGGATTTCTCTTAATTCTCTTGTTGGCAGTTGGCTATTTAACACTGGTTAATTCTGCTCTCTATGCTTTTGCAGACCTGAGGCTCTTGCTGCAATTGAGAGACTATATGAGCGGGGGGTGTTTGATTATCTGGTTTGTATTGTCGTGTCATTTGGAGATTAGCCCTTGGTTTTACTAGGCATGTTACATGTTAGACTGAAGAATGTTAGCATATTACGAATTCTACTTTTGCTGCAAGCATCAATAGTTTCACCATACATGTCCTTTTATTCTTGAACGTAATGTGAAAGTTTGAAACCTCATATTATAAATCTATAAACTTCACCTATTGTCGAATTTAACCAATTGGATCTTGGGCTTTTACGTCCAAACAGTTGTTTTCTTATTTAATTTTATTTTTATTTTCAACAGCTAATTAGTTGCTTTGGAAATGAATATGGTTGTCTTTGAAACTCAGTTTTCTGCCTGAGTTTCTACTTTTAATGCATATAATGAATCCTTTTAGAGTTGCTTTGTAATTATGCCTGTTTTATTGAGAATGACGATATTTTGAACTTTGAAGTTGTAGAGGGTGTCATGATGTTTGGTTAACTTTTCACTATGTTATGCAGTCAGTTTCTCTTTGGCTTGACTACTTAAATTTCATTCGAGAGTATGATCCATTGGTGCAAGATTGTGCAACTTCTGGAATTAAAAAGGTTAGAGATTTATTTGAACGTGCTCTCACAGCCGCTGGTTTGCATTTCACTGAGGCTGAAAAATTATGGGAAGCATATAGAGATTTTGAGAAAGCCATATATCAAACCATTGCTGAAACTGATGCTCAGGTTTGAACCTCTTTTCTAATTTCTTTTAATGTTTATGGCATCTTCCAGTGTTTTACAAAGCCCTCTCGGGCGTGCCTAGGCTCAAGGCGCCAAGGCGAGGCTCACAAAATAAGGCGTGCTCCTTTTGTGAAGCCCCAAGGCTCAAAACCCTAAGCCTTGGGGCTTTTTCATTATTTTTAAAAAATAGTAATAATTAATGGTTTTCCTTCTTTATTAACTAAAAGAATCAAATTTACTAAGCCTAAATGCATAATTTCTTGTGTTTGGGATCTTTATTTTCCATATTTCCACTTCAACTATGTTTTCTCTTTTTTAATGTAATATTTTTTATATGTAGTGCGCTTCACAAAATAATAGTCTGCGTCTTTATGTGGGCCTTGTGCCTTGGGCATTTAAAAACACTAGTATCTTCTATGAGGTCTTGTTAGTTTGTATGGGCTTGGCCCGTGGAAAGAGATTTGACCTAAATCTCTTTCCTTTTGTATAAATCCCCTTCCTTTTTTATTTTGTATTCTTCTCTATTAATTCTAGCATGTTAGTTGTTTGTATTTACAAGTAAATTAAGAAATACATTACAGACTCGTGGTTTTTCTCCCGGTACTCGGGTTTCCACGTAATTCGGTGTCCCTTTTCTTTACCGCTTTCAATATGGTATCAGAGCGGGGTAAAGATAAAACCCAAGACACCGAATATGAGGAAACCAGAGCTAACCACGAGTACGTTGCCGCCGCTGATATGAATGCCGCCGTTGCCGCCGCTGATATGAATGCCGCCGTCGCCGCCGCCGTGGACTCCGCCATGGAAAAGGTGGTCCAAAAGCTTCAGAAGATGCCGGCGGCCATGTCTGCCACCTCCGCGGAGTCGTCCGGTCAACACAGCGCCGTAGATCTGCATCACGCGCTGCCGCTGTCGGGCGCATGGACCCATGCGCCGCCGTCTGTGAGTCTCACCGCCCAGACGAATGGCTTCGCCTTGCCGCCGCCAGTCCAGCTGTCAAACCCTTCTGCCAATACGCACACTCACGCGCCGCCGCTGCCCTCCGACCATAGACAGCTGCCTATTCCGACCACCCAGCTGCCGCTGTCTGTTAATCCTTCACAGCAGCCTTTCTTCGGCGAGACCTCGGCGCAATCCAAGAACCTGGTAACTTCGTTCCCTACTCGAACATCAAACTTTATAACTGGTTCTATGGTTCCCTCCATAGGTAATTTTTCAGGAGAAAAATTGAATGGCCAGAATTTTTTCTCTTGGTCCCAGTCGATCAAGATGTTTCTTGAGGGACGCCAACAATTTGGGTTTCTGACTGGTGAGATTCCCTGTCCTCCACCTGGCAATGATCAAGAATGCCTTTGGAGAGCAGAGGACTCCTTTATTCGGTCCATGCTAATCAATAGTATGGAATCTCAAATAGGCAAGCCGCTCCTATATGCTGCTACAACAAAGGATCTCTGGGACTCCACTCAGAAACTCTACTCGAAACGTCAGATGCTTCCCGTCTGCATACCTTGAGAAAACAAGTCCATGAATGCAAGTAAGGAGCAATGGACGTCACTTCTTACTTTAACAAACTTTCCCTGTTGTGGCAAGAGATGGATCTGTGTAGAGACATTGTTTGGGATACCTCTAACGACAGTTTACAGTTTGCCAAGATAGAAGAAGCGGACCGTGTGTATGATTTTCTCGCCGGCCTCCATCCTAAGTTTGACACTGTTTGTGGTCATATCCTTGGCCAAAGGCCTCTCTCATCCCTGATGGAAGTCTGCTATGAAGTCCATCTTGAAGAAGATCGCACGAATGCCATGGGTGTCATAACTACTCCTACCACCGACTCTGCCGCCTTTAGTGCTCGATCTTCCAACCCCGATCATGAGAAAAACAATGGTAAACCAGTTCCCACCTGCGAGCACTGTAAGAAACCATGGCACACTAAAGATCAGTGTTGGAAGCTTCATGGACGTCCTCCAGGGGGCAAGAAACGCTCCTCCAATGACAAACAGAGTTCTGGACGTGCCTACATGAGTGAGTCTACGGGAACATCTCAACCGTCTGGTACTACTGTTAACCAGAACGGTCCCAATTCACCCTCCAAGTTAGGAGCCATTACTCAGTCAGGTATGCCTCAATCTCTTAGTCTTATTAGTGTTGATGGGAAGAATCCCTGGATTCTCGATTCGGGAGCCACCGATCACTTGACAGGGTCCTCAGAACAGTTTGTCTCTTACACTCCTTGTGCCGGTAATGAAAAGATAAGAATAGCTGATGGCTCTTTAGCTCCTATTGCTGGGAAGGGACACATTATTCCCTTTAACGGGCTATCCCTCCAGAATGTGTTGCATGTGTCTAAAATTTCCTATAACTTACTGTCTATAAGCAAGATCACTAACGAGCTGAACTACAAAGCAACCTTCTTACCTGATTCTGTTTCCTTTCAGGACTTGAGCTCGGGGAGGACGATTGGCACTGCCCGGCATAGCAGGGGACTCTATCTCCTTGATGATGATGTCTCTACTAGTAATGTCTCTAGGACTAGCTTATTGTCTTCTTATTTTACTACTTCTGAACAAAACTTTACTTATATAAAGCATCTATTTCCTCATCTCTTCTCTAATATTGATGTGTCCTTATTAACCTGTGATGTGTGCATTCGAGCCAAACAACACTGGGTCTCATTTCCCTCTCAACCATATAAACCAACCCAACCTTTCACCCTTATCCATAGTGATGTGTGGGGCCCCTCCAAGGTCACCACCTCCTCTGGCAAACGGTGGTTTGTGACCTTCATTGATGACCATACCCGTCTTACCTGGGTCTACCTTATCACTGATAAATCTGAGGGCCCCTCCATCTTCCAAAATTTCTATCAGACCATCGAAACTCAATTTAATGCAAAGATTGCAATCCTTCGGAGTGATAATGGTCGAGAGTTCCAAAACCATACCCTTGGTGAGTTTCTGACTTCCAAAGGGATTATTCACCAAAGCTCTTGTGCTTATACCCCTCAACGAAATGGGATTGCTGAGCGAAAAAACTGCCACCTTTTGGAAGTTGCTCGTTCTCTCATGCTCTCTACTTCTCTCCCCTCCTATCTATGGGGCGATGCTGTGCTTACTGCAGCTTACCTCATCAATAGGATGCCCTCTCGTGTCCTGCACCTCCAAACACACCTTTAGAGTGTCTTAAAGATTTGTATCCCTCCACCCGCCTCATTTCTGAGGTTCCCCTCCGTGTGTTCGGATGCACGGCCTATATGCATAACTTTGGCCCTAACCAGACAAAATTCACTCCGCATGCTCAGGTGTGTGTGTTTGTTGGGTATCCTCTCCACCAGTGGGGCTATAAATGTTTTCATCCTCCTTCCCGAAAGTACTTTACTACTATGGATGTTACCTTTCGCGAGGATTGTCCTTACTTTCCTGTTAGATATCTTCAGGGGGAGAGT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MDEPISSNAETPLPTNSDQGNSVNGDEPMPDLPQNPTDSSSSDSDSEDDESDQNLQLLSLQSQLSSNPSNYDAHVQYIKLLRKIGDIDNLRKAREAMSEIFPLTPSMWQEWAKDEASINTGPEALAAIERLYERGVFDYLSVSLWLDYLNFIREYDPLVQDCATSGIKKVRDLFERALTAAGLHFTEAEKLWEAYRDFEKAIYQTIAETDAQAKEKQVQLIRSIFHRQLSLPLSNMSSTLEAYKAWEMEMKQGCALDTESNYSDGVPTQVASTYRRALDMYNARVQLEDQISKQDLTDTERLHQYIIYLKFEQSAGDPARVQVLFERAIADFPVSVDLWLDYTRYMDKTLKVGNIVRNVYSRSTRNCPWIGDLWVRYFLALERSHASEGEIASVFEKSLQCSFSTLNEYLDLFLTRIDGLRRRISSGVQLEDALEYSLIKETFQRASDYLSPQLKNSEVLVRLYAYWARLEINLGKDLDSARGVWESLLKICGSLLAAWEGYIAMEVELNHINNARSIYKRCYSKRFPGSGSEDICHSWLRFEREFGSLEDFDHAVRKVNPRLEELKSYKLQIDDSENPVKQSDHSKRKLGGHAPNVESPAKKLKDSAHGPKKVTEKGKAQLQNVDDQTGDIRGRVKRHDDASDQQMNDSVQEKGKVYNDQCTAFISNLNLKVTYDHLRDFFQDVGGVVAIRILHDKFTGKSRGLAYVDFSDDAHLEAGVAKNKQLLLGKKISIARSDPKKGGHGMDRAGGGKRFESRSSSKEPHKANEQPSGLRKHGGNSVELKGKNTFAVPRNVRALGWTADKPKTLEQDDEEPKTNDEFRKLYFKG Homology
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3DJT0 (Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 OS=Danio rerio OX=7955 GN=sart3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 1.1e-86 Identity = 224/748 (29.95%), Postives = 357/748 (47.73%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5REG1 (Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=SART3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 310.8 bits (795), Expect = 4.5e-83 Identity = 219/749 (29.24%), Postives = 364/749 (48.60%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q15020 (Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SART3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 1.0e-82 Identity = 217/741 (29.28%), Postives = 362/741 (48.85%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9JLI8 (Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Sart3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 304.7 bits (779), Expect = 3.2e-81 Identity = 211/753 (28.02%), Postives = 365/753 (48.47%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9USY2 (Uncharacterized RNA-binding protein C1861.04c OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPBC1861.04c PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 142.1 bits (357), Expect = 2.8e-32 Identity = 159/718 (22.14%), Postives = 289/718 (40.25%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCC2 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1591.2 bits (4119), Expect = 0.0e+00 Identity = 801/829 (96.62%), Postives = 817/829 (98.55%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CUH2 (Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold45G001220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1404.8 bits (3635), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/776 (92.40%), Postives = 732/776 (94.33%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FHD1 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445777 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1402.1 bits (3628), Expect = 0.0e+00 Identity = 711/827 (85.97%), Postives = 758/827 (91.66%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I352 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470118 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1382.5 bits (3577), Expect = 0.0e+00 Identity = 704/827 (85.13%), Postives = 753/827 (91.05%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E2W5 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1374.0 bits (3555), Expect = 0.0e+00 Identity = 713/829 (86.01%), Postives = 729/829 (87.94%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. NCBI nr
Match: XP_008460582.1 (PREDICTED: squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1591.2 bits (4119), Expect = 0.0e+00 Identity = 801/829 (96.62%), Postives = 817/829 (98.55%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. NCBI nr
Match: XP_004142811.2 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648565.1 hypothetical protein Csa_009024 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1553.1 bits (4020), Expect = 0.0e+00 Identity = 782/829 (94.33%), Postives = 806/829 (97.23%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. NCBI nr
Match: XP_011655427.1 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1546.6 bits (4003), Expect = 0.0e+00 Identity = 781/829 (94.21%), Postives = 805/829 (97.10%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. NCBI nr
Match: XP_038876547.1 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1506.1 bits (3898), Expect = 0.0e+00 Identity = 756/832 (90.87%), Postives = 791/832 (95.07%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. NCBI nr
Match: TYK15070.1 (squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1404.8 bits (3635), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/776 (92.40%), Postives = 732/776 (94.33%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. TAIR 10
Match: AT4G24270.2 (EMBRYO DEFECTIVE 140 ) HSP 1 Score: 818.1 bits (2112), Expect = 6.2e-237 Identity = 441/830 (53.13%), Postives = 574/830 (69.16%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. TAIR 10
Match: AT4G24270.1 (EMBRYO DEFECTIVE 140 ) HSP 1 Score: 817.8 bits (2111), Expect = 8.1e-237 Identity = 441/830 (53.13%), Postives = 574/830 (69.16%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. TAIR 10
Match: AT2G16940.2 (Splicing factor, CC1-like ) HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 2.9e-08 Identity = 33/105 (31.43%), Postives = 55/105 (52.38%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. TAIR 10
Match: AT3G26420.1 (RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 7.1e-07 Identity = 44/139 (31.65%), Postives = 63/139 (45.32%), Query Frame = 0
BLAST of PI0028770 vs. TAIR 10
Match: AT2G16940.1 (Splicing factor, CC1-like ) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 1.2e-06 Identity = 39/167 (23.35%), Postives = 76/167 (45.51%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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