MC05g0849 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview
NameMC05g0849
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptiontranscription factor DIVARICATA-like
LocationMC05: 7394048 .. 7423387 (+)
RNA-Seq ExpressionMC05g0849
SyntenyMC05g0849
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: utr5CDSpolypeptide
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TTACAAAATCTTAACACAAATTCTACTCACAATAGAAACCGTATAAACTAAAGTCATGGTTACATTTAAGAAATATATTGAGTTTATTATCACGTTGAAATTGTGATTAAAAATAAAATTTAGAAGTTTTTAAATGTCCATGTATCAAAACGAACATTTTGAAAGTATAAAAACTAAATATGAAAGTACTAAAATGAAAATTTTAAAAATACAAATACCAAAGTAAACTATATCTTTAAGATCTTTTATATAGTTGTCACAATGCAAATTCTCTCTTTATTCCGATTTGAAGAAAAATTCTTGTAAGAAAGACTTGAAGTTACATATTATCTCTTACTTACTCAGTAACTACAACAGCCAAAACGAACAATAGTTCAGCGGTAATTGACATATACCTCCAATCATGAGGGTGTGAGTTTAATCTCCACTCCCACATGTTATACCAAAAAAACTACAACACATCTCTATTATTCTTCCTCTCTCGTTCTCTCTATCACTTATTATTATTTTCAACTTTTTTTTATTTTATTCTACTGATATTTGTTGGTTTCATCCATATATATATCGACATTTCATTAAATTAGAACTTCGATATTTTGCATAGATATTGATAATTTAAATCTTGTTAATAATTTTATATGCACGTGAGTTGTTTATTTACTATTTCTCGATCTCTCCCTCCATACTTTCCACCGTGATTTTATTTATTTTACTAGAGATATCAACCTGATGTAGGAAACATTTAGGATTTTCTTTTTTGTTTTTTTTAAGTTAGCTTAATTCTGTTACTTTTCTTTATATAAAGATTTAACTTATCTTCGCATCTTGTTAAGTAGATCACTATGTATTTATATTTTCTTCTTTTTTAGTAGAATAAACAAGGAGAGATTCTAACACCTCTGATCTTTATAGATGTATTCGGTGACTGATACAAAATTTTACTTTAGGGTACAAATGCATATAAATATAATGGAAAAAATATAAATTTTAAACTTGAACTTGGCAGTGTGATAATTTTCACATGTATAGTAAATTTTACCCTTAAATAGATTTTCAAGTGAAAATTTGTTGAAAAAAATATTATTGTTTGTCAAATGAATTAAAAAAATTGGCTTGAAATAATTGATAAGATTAAAAAAAATGACATTAGAGATATTTTTTAGCTTAAATTTGTAAATTTTGACAAGTAAGATTACTTATTACTAAATTTTGTGTATTAATCAAACTTAATTTAAAAACTTGTCTTTTATTAAATTAGTGAATTTTTTAGACTTTTTTATTAAACAGAAAAAATTATGACATCTATATAAGTCTAGGGTCTACGATAATGAATTTAAATTTATTAAAAAAACATAATTAGATATAAGAATTAAAATTATTTATTTTAAATAAAAAATACATTTATTAGAAAAACAATATTTATAAATCAAAATTGGTTTGAGATTGAATAATATCCTAATAAAAATATATTTAAAAAGAAAAATTAAAAGAAAAAAGAAAAACCAAAAAATATACTAGCTATAACTCGAAGTAGGACGTTGATGCTAATATATTTGAAAAAAATAATTAAAAGAAAACAAAAAAAGAATGCTAATATATTTCAAAAAATAGTAAAAAATAAAACTAAAAAGCCTTAAAAAAGAAAAACAAAAAAAAAGTAAAAATAAAAAGTGCACTTGTTAGTACGTGACCAGGGAACACAAAAGAAAGGAGCACGGAATTAGTAGGATGGAAAACCACGTGGGCAGAAAGAAAGTAAGAAGAAAGAAGAAAAAAAAAAGACATTTTTTTAGTACAACGGGAGAAGACATAACTATACTGTGTATATGTAAAATCCAGGGTGCACATGCCCCGTCACCGGAGGTATGTAATAATCTTGACCAATTAAACTACGGTTAATTATAATGTTTATTTGTATGATTTATAGTTTTTATTTGATCAACAAATAATTTTATTTTCAAGAAAATATTTTTTAAACTTATATATATGATATAATATCGAGTGCGTCAAAGCAAACACAATTCAACGGTAATTAACATATATCTCCAACTAAAATGTTATGAGTTTGAATCTTTATTCCCACATGTTGTACTAAAATATATACATGTATATCGACTAGTGCACTATTGTATACTGAATCATTACAATTAATCTAGACATATACCAGATGTAGTTGAATTTCTAAAAGTGGATTTTTTTTATTATTATTTTTTAATCTTTTTCCCGGTTCATCTCACAATTGAAGTGATAAAGCGTTGATAGAAGTTTAAAGATTGGAAAAAGTACAAACTTCTTCCACTAACGACATAAAGCTGCTGATAATTAATTGGCTATGTTTGGCGCCAGATTTATAATTATCTAAAACATATTTATAAATCAATTAATTGAATAAAGTAAAAAATTAAACTTATTAGTATCAATAAGGTGATCTTATACTAAATTTAAAAGTAATTTATTTTTTAATACAATGTGTAATAAAAAAATTAAAAGGAACTTAACCATTTTAATGGGATTAAAATGGAACGACACTTATAAGTCTAATTTTTTTTCTCCTATAGATAATTGAGAATGATGAATTTATTTACTTATTTTAATGTTAAAAATAAATTTGAAATGATTTATTTATTGTTATATAATATAAAATTATAGCTAGCAAGATCATAGGCAACCAAATTGGAACTTCATACATGTACACAGTACACACTCAATTATAATTAGTTAAATTACTAAAAAAAAATGATCAAATGTATATCATTTTAGGTTTGTTCATCTTGTCAACAAGAATTTGAGAGATTGAATGGGTCCAAAGTGGAAAGGCCATATAAGGTTATAACATTACATAACAACGTTGTTGTGTGGTTCTAAATTGAAAGGTTGAAGTTGTAAGTACTTAGAAGGTGAAAAGCAGGTCATTGAAATGGGAAAAAGTGGATAAAAGATATATTAATTTAATAAATCTGAGATATAGTTATTGAAGATAAATTTAAATCGAAAATAAAAGAAATTGTTTCGAAGACCATATAAGTTTGAGAAATTTCTAAATGGTCCATTCACTTTTGGAATTGGAGGCTTTGTAAAATATATTAATTTAATAATATGAATTTAGGTTATCAAAGTGAGGCTTGGCACGTCGATATAAACGTAATTCCTATGCCAATGACAGCACGCTGGATCCTATCACTGCTGTAATTATGTGCGCACTTACAGTCAATGAAATGAAATTTTTCTCTCTTTAATTCTCTACTGACTGCTGGTTTTTCATTTTTTTGCAGAGGAATTGTGTGTGGCAGCATCCGATGATTCCCGTAGAGAAGCAGAAGCAGATGCTCAGTCTTCCCTTTGATTATGTGACCTTGCTGAACAGCCAATTCAACCCCAACAATCAATTTTACGGCGATGTTTCGAGCTCTGGTTTTGCTCCGATATGGCAGTTGGACAATGTAATGCAAGCCAACAACTTTCCTGGTGAAATTCCCTTCGACTTCAATGCCTCTGTTCAAATTCCTTCTTTCGCTGCTGCTGCTGATGAAAATAACTTCCGTCCTACGATTCCTTTCAACCTCAATGTCATTACTCCAAATACTGTGACGTTGCCGAACACTCAATTCACCACTTTCACTCCAGCTTCTCAAAACAACCTCTATAACTATAACCCCAACAATCAATTTACAGCTTTCAGTTCTGCTCCTGAAAACAACCTCCCTCACAACCCCACATCGATCTCCGTCAATGTGGGCAATCAGTATACTGGTTTGCTCTCCGATGTCATCAACTTCGACTCCGCACGACATAAGATGAAGAAACTGGAACACAAGTACGACAGCAGGCCTGTTTCAGAGACACAGTTTAACCAAGACTCCGTTTTGGATCAGAAACGTCCGTTGGAGTTCTCTTTGCAGCCGACCAATCGAATTCAAATTGTTCCCACGGATGCAGAAAACGAGTATAATTATACTGGTTTGCTCTCGGACATCATCAATTTCGACTCTGCACCAGATAAGAAGAAGAAATTCGAATCTTGGACGGAAGACGAGCACAAGTGAGTAACACACCCAACAAAAATAACCCTAATCTCCTCAGTTTTTGTTTTAACTCTGTTCAGACTCTGTTTTTTTTTTTTTTTAATCATGTTGCAACGGCTGTTTCAATTTGGTTGCAGGTTATTTTTGATTGGACTCCTGAAATTTGGGGAAGGAGATTGGAAAAACATAGCTACCAAAATTGTGCTCACTAAATCACCCACCCAAGTTGCAAGCCACAGTCAGAAATTCTTCCTCCGACAGCGCGTGCCGGAGCAGAATCGGAAAAGGTTGAGCATTCACGACATCACCACCGTAGAT

mRNA sequence

AAACTGAATTGTTGCAGAATTAGGTTCTTCAATGGCGTATAATCCAGGAAACCCTAATTCTGCAATTCTACTTCCTTATGGCGGCACAACGACACCGTTTTTTGGTTATTCTCTTCCGTTTTCTTCTTCTTCTGCAGCTTTTACTGATGAGTGGACTTGGGAAGAACACAACACCCTTGAGCTGGCTACTCTGTCGATGCTGGAGAACAGCCCTGATCGGTGGCTGGTGATCGCCGATCAAATTCCCGGCAAGTCGGTGGCGGAGGTCATCAATTATTACTTGGCCATGCTTCGGGACCTGGCGCTCCAGAGGCAATTGCAGTCGCTGGAGTACCAGGTTGCGCCGCCGCATCAACTGCCGGAGGTTAGTGGCGAGCTGAATGGCGACCCGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAAAGAAAACTTTGGACGGAAAGAGAACACGAGTTATTTTTGATTGGACTCCTGAAATTTGGGGAAGGAGATTGGAAAAACATAGCTACCAAAATTGTGCTCACTAAATCACCCACCCAAGTTGCAAGCCACAGTCAGAAATTCTTCCTCCGACAGCGCGTGCCGGAGCAGAATCGGAAAAGGTTGAGCATTCACGACATCACCACCGTAGAT

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTATAATCCAGGAAACCCTAATTCTGCAATTCTACTTCCTTATGGCGGCACAACGACACCGTTTTTTGGTTATTCTCTTCCGTTTTCTTCTTCTTCTGCAGCTTTTACTGATGAGTGGACTTGGGAAGAACACAACACCCTTGAGCTGGCTACTCTGTCGATGCTGGAGAACAGCCCTGATCGGTGGCTGGTGATCGCCGATCAAATTCCCGGCAAGTCGGTGGCGGAGGTCATCAATTATTACTTGGCCATGCTTCGGGACCTGGCGCTCCAGAGGCAATTGCAGTCGCTGGAGTACCAGGTTGCGCCGCCGCATCAACTGCCGGAGGTTAGTGGCGAGCTGAATGGCGACCCGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAAAGAAAACTTTGGACGGAAAGAGAACACGAGTTATTTTTGATTGGACTCCTGAAATTTGGGGAAGGAGATTGGAAAAACATAGCTACCAAAATTGTGCTCACTAAATCACCCACCCAAGTTGCAAGCCACAGTCAGAAATTCTTCCTCCGACAGCGCGTGCCGGAGCAGAATCGGAAAAGGTTGAGCATTCACGACATCACCACCGTAGAT

Protein sequence

MAYNPGNPNSAILLPYGGTTTPFFGYSLPFSSSSAAFTDEWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD
Homology
BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8S9H7 (Transcription factor DIVARICATA OS=Antirrhinum majus OX=4151 GN=DIVARICATA PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 128.6 bits (322), Expect = 7.6e-29
Identity = 76/197 (38.58%), Postives = 112/197 (56.85%), Query Frame = 0

Query: 30  FSSSS-----AAFTDEWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYL 89
           FSSSS     +  T  WT  E+   E A     EN+P+RW  +A+++PGK+V +V+  Y 
Sbjct: 10  FSSSSWFLEESRSTTRWTAAENKAFENALAVFDENTPNRWERVAERVPGKTVGDVMRQY- 69

Query: 90  AMLRDLALQRQLQSLE--------YQVAPPHQLPEVSG----------------ELNGDP 149
                  L+  + S+E        Y  + P  L   SG                  +G P
Sbjct: 70  -----KELEDDVSSIEAGFVPVPGYSTSSPFTLEWGSGHGFDGFKQSYGTGGRKSSSGRP 129

Query: 150 AEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRV 198
           +E++ KK   WTE EH+LFL+GL K+G+GDW+NI+   V+T++PTQVASH+QK+F+RQ  
Sbjct: 130 SEQERKKGVPWTEEEHKLFLMGLKKYGKGDWRNISRNFVITRTPTQVASHAQKYFIRQLS 189

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FNN6 (Transcription factor SRM1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRM1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 1.4e-22
Identity = 64/178 (35.96%), Postives = 100/178 (56.18%), Query Frame = 0

Query: 41  WTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLALQRQLQSLE 100
           W+ E+    E A  +  + S +RW  IA  +PGKSV ++  +Y  ++ D+    +++S  
Sbjct: 12  WSREDDIAFERALANNTDESEERWEKIAADVPGKSVEQIKEHYELLVEDVT---RIES-G 71

Query: 101 YQVAPPHQLPEVS-------------------GELNGDPAEKKNKKRK---LWTEREHEL 160
               P +  PE S                   GE N     K +++R+    WTE EH L
Sbjct: 72  CVPLPAYGSPEGSNGHAGDEGASSKKGGNSHAGESNQAGKSKSDQERRKGIAWTEDEHRL 131

Query: 161 FLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTV 197
           FL+GL K+G+GDW++I+   V+T++PTQVASH+QK+F+R     ++R+R SIHDIT+V
Sbjct: 132 FLLGLDKYGKGDWRSISRNFVVTRTPTQVASHAQKYFIRLNSMNKDRRRSSIHDITSV 185

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8A9B2 (Transcription factor MYBS1 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MYBS1 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 100.9 bits (250), Expect = 1.7e-20
Identity = 69/202 (34.16%), Postives = 104/202 (51.49%), Query Frame = 0

Query: 31  SSSSAAFTDEWTWEEHNTLELATLSMLENSP-------DRWL-VIADQIPG-KSVAEVIN 90
           ++++AA    WT E+    E A  +     P       D W   +A  +PG +S  EV  
Sbjct: 8   TTTTAAAAAAWTREDDKAFENALAACAAPPPADGGAPDDDWFAALAASVPGARSAEEVRR 67

Query: 91  YYLAMLRDLA------LQRQLQSLEYQVAPP--------------HQLPEVSGELNG--- 150
           +Y A++ D+A      +     + E   APP              H+  E  G   G   
Sbjct: 68  HYEALVEDVAAIDAGRVPLPRYAGEESAAPPDGAGAAAAASKDGGHRRDERKGGGGGYDG 127

Query: 151 ----DPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKF 197
                 AE++ +K   WTE EH LFL+GL KFG+GDW++I+   V++++PTQVASH+QK+
Sbjct: 128 GKSCSKAEQERRKGIPWTEEEHRLFLLGLDKFGKGDWRSISRNFVISRTPTQVASHAQKY 187

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LH59 (Transcription factor MYBS1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MYBS1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 100.9 bits (250), Expect = 1.7e-20
Identity = 69/202 (34.16%), Postives = 104/202 (51.49%), Query Frame = 0

Query: 31  SSSSAAFTDEWTWEEHNTLELATLSMLENSP-------DRWL-VIADQIPG-KSVAEVIN 90
           ++++AA    WT E+    E A  +     P       D W   +A  +PG +S  EV  
Sbjct: 8   TTTTAAAAAAWTREDDKAFENALAACAAPPPADGGAPDDDWFAALAASVPGARSAEEVRR 67

Query: 91  YYLAMLRDLA------LQRQLQSLEYQVAPP--------------HQLPEVSGELNG--- 150
           +Y A++ D+A      +     + E   APP              H+  E  G   G   
Sbjct: 68  HYEALVEDVAAIDAGRVPLPRYAGEESAAPPDGAGAAAAASKDGGHRRDERKGGGGGYDG 127

Query: 151 ----DPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKF 197
                 AE++ +K   WTE EH LFL+GL KFG+GDW++I+   V++++PTQVASH+QK+
Sbjct: 128 GKSCSKAEQERRKGIPWTEEEHRLFLLGLDKFGKGDWRSISRNFVISRTPTQVASHAQKY 187

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FKF9 (Probable transcription factor At5g61620 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g61620 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 4.3e-16
Identity = 42/80 (52.50%), Postives = 56/80 (70.00%), Query Frame = 0

Query: 118 GDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLR 177
           G  A +K KK K WTE EH  FLIGL K G+GDW+ IA   V T++PTQVASH+QK+F+R
Sbjct: 98  GKTAHEK-KKGKPWTEEEHRNFLIGLNKLGKGDWRGIAKSFVSTRTPTQVASHAQKYFIR 157

Query: 178 QRVPEQNRKRLSIHDITTVD 198
             V ++ ++R S+ DI+  D
Sbjct: 158 LNVNDKRKRRASLFDISLED 176

BLAST of MC05g0849 vs. NCBI nr
Match: XP_022133209.1 (transcription factor DIVARICATA-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 144 bits (364), Expect = 3.50e-39
Identity = 85/195 (43.59%), Postives = 116/195 (59.49%), Query Frame = 0

Query: 18  GTTTPFFGYSLPFSSSSAAFTDEWTWEEHNT--LELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKS 77
           G  +P F  S  + S   A +    W  H     E A + + ENSP+RWL IA  IPGKS
Sbjct: 3   GPPSPSFRVSDDYWSPKTAPSSPAPWTRHQDKIFEHALVMVPENSPNRWLRIAGLIPGKS 62

Query: 78  VAEVINYYLAMLRDL-------------ALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAE 137
            AEV  +Y A++ DL             A    + SL    APP  L E   +    P E
Sbjct: 63  PAEVSYHYDALVSDLLDIDSGRVELPSYAEDDSVASLPETEAPPPNLSEKPSKSR--PNE 122

Query: 138 KKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPE 197
            + KK K WT++EH+LFL+GL KFG+GDW++I+  +V++++PTQVASH+QK+FLRQ   +
Sbjct: 123 TERKKGKPWTKKEHQLFLLGLKKFGKGDWRSISRNVVISRTPTQVASHAQKYFLRQESAK 182

BLAST of MC05g0849 vs. NCBI nr
Match: XP_020212063.1 (transcription factor SRM1 [Cajanus cajan] >KYP69140.1 Myb-like protein J [Cajanus cajan])

HSP 1 Score: 141 bits (355), Expect = 6.66e-38
Identity = 78/176 (44.32%), Postives = 108/176 (61.36%), Query Frame = 0

Query: 40  EWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLALQRQLQSL 99
           +WT       E A L++ E+ PDRW  IADQ+PGKS AEV ++Y A++ D+    ++ S 
Sbjct: 16  QWTRFHDKLFERALLAVPEDMPDRWQKIADQVPGKSAAEVRDHYDALVHDVF---EIDSG 75

Query: 100 EYQV------APPHQLPEVSGELNGDPA------------EKKNKKRKLWTEREHELFLI 159
             +V      +PP      +G  + D A            + + KK   WTE EH LFLI
Sbjct: 76  RVEVPSYVDDSPPRAPTAAAGTSSWDSANQISFGSKPKQGDNERKKGTPWTEEEHRLFLI 135

Query: 160 GLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 197
           GL KFG+GDW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   ++ RKR SIHDITTVD
Sbjct: 136 GLSKFGKGDWRSISRNVVVTRTPTQVASHAQKYFLRQNSVKKERKRSSIHDITTVD 188

BLAST of MC05g0849 vs. NCBI nr
Match: XP_023003417.1 (transcription factor DIVARICATA-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 140 bits (353), Expect = 1.23e-37
Identity = 77/170 (45.29%), Postives = 109/170 (64.12%), Query Frame = 0

Query: 41  WTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDL---------- 100
           WT  +    E A + + ENSP+RW+ IA  +PGKS AEV ++Y A++ D+          
Sbjct: 27  WTRHQDKIFEHALVMVPENSPNRWMKIAGLVPGKSAAEVRDHYDALVSDVQNIDSGRVEL 86

Query: 101 ---ALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFG 160
              A +  L S E +   P QLPE + E          KK K WT++EH+LFL+GL KFG
Sbjct: 87  PNYADESLLSSPERE--SPGQLPEKASE---------RKKGKPWTKKEHQLFLLGLKKFG 146

Query: 161 EGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 197
           +GDW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   +++RKR SIHDITTV+
Sbjct: 147 KGDWRSISRNVVITRTPTQVASHAQKYFLRQESAKKDRKRSSIHDITTVE 185

BLAST of MC05g0849 vs. NCBI nr
Match: XP_022963148.1 (transcription factor DIVARICATA-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 138 bits (348), Expect = 6.89e-37
Identity = 74/168 (44.05%), Postives = 106/168 (63.10%), Query Frame = 0

Query: 41  WTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLA--------- 100
           WT  +    E A + + ENSP+RW+ IA  +PGKS AEV ++Y A++ D+          
Sbjct: 27  WTRHQDKIFEHALVMVPENSPNRWMKIAGLVPGKSAAEVRDHYDALVSDVQKIDSGRVEL 86

Query: 101 --LQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEG 160
                +  S   +   P QLPE + E          KK K WT++EH+LFL+GL KFG+G
Sbjct: 87  PNYADESLSSSPERESPCQLPEKASE---------RKKGKPWTKKEHQLFLLGLKKFGKG 146

Query: 161 DWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 197
           DW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   +++RKR SIHDITTV+
Sbjct: 147 DWRSISRNVVITRTPTQVASHAQKYFLRQESAKKDRKRSSIHDITTVE 185

BLAST of MC05g0849 vs. NCBI nr
Match: XP_023518498.1 (transcription factor DIVARICATA-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 138 bits (348), Expect = 6.89e-37
Identity = 74/168 (44.05%), Postives = 106/168 (63.10%), Query Frame = 0

Query: 41  WTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLA--------- 100
           WT  +    E A + + ENSP+RW+ IA  +PGKS AEV ++Y A++ D+          
Sbjct: 27  WTRHQDKIFEHALVMVPENSPNRWMKIAGLVPGKSAAEVRDHYDALVSDVQKIDSGRVEL 86

Query: 101 --LQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEG 160
                +  S   +   P QLPE + E          KK K WT++EH+LFL+GL KFG+G
Sbjct: 87  PNYADESLSSSPERESPCQLPEKASE---------RKKGKPWTKKEHQLFLLGLKKFGKG 146

Query: 161 DWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 197
           DW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   +++RKR SIHDITTV+
Sbjct: 147 DWRSISRNVVITRTPTQVASHAQKYFLRQESAKKDRKRSSIHDITTVE 185

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BVC4 (transcription factor DIVARICATA-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005863 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 144 bits (364), Expect = 1.69e-39
Identity = 85/195 (43.59%), Postives = 116/195 (59.49%), Query Frame = 0

Query: 18  GTTTPFFGYSLPFSSSSAAFTDEWTWEEHNT--LELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKS 77
           G  +P F  S  + S   A +    W  H     E A + + ENSP+RWL IA  IPGKS
Sbjct: 3   GPPSPSFRVSDDYWSPKTAPSSPAPWTRHQDKIFEHALVMVPENSPNRWLRIAGLIPGKS 62

Query: 78  VAEVINYYLAMLRDL-------------ALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAE 137
            AEV  +Y A++ DL             A    + SL    APP  L E   +    P E
Sbjct: 63  PAEVSYHYDALVSDLLDIDSGRVELPSYAEDDSVASLPETEAPPPNLSEKPSKSR--PNE 122

Query: 138 KKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPE 197
            + KK K WT++EH+LFL+GL KFG+GDW++I+  +V++++PTQVASH+QK+FLRQ   +
Sbjct: 123 TERKKGKPWTKKEHQLFLLGLKKFGKGDWRSISRNVVISRTPTQVASHAQKYFLRQESAK 182

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A151TQ52 (Myb-like protein J OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_008325 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 141 bits (355), Expect = 3.22e-38
Identity = 78/176 (44.32%), Postives = 108/176 (61.36%), Query Frame = 0

Query: 40  EWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLALQRQLQSL 99
           +WT       E A L++ E+ PDRW  IADQ+PGKS AEV ++Y A++ D+    ++ S 
Sbjct: 16  QWTRFHDKLFERALLAVPEDMPDRWQKIADQVPGKSAAEVRDHYDALVHDVF---EIDSG 75

Query: 100 EYQV------APPHQLPEVSGELNGDPA------------EKKNKKRKLWTEREHELFLI 159
             +V      +PP      +G  + D A            + + KK   WTE EH LFLI
Sbjct: 76  RVEVPSYVDDSPPRAPTAAAGTSSWDSANQISFGSKPKQGDNERKKGTPWTEEEHRLFLI 135

Query: 160 GLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 197
           GL KFG+GDW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   ++ RKR SIHDITTVD
Sbjct: 136 GLSKFGKGDWRSISRNVVVTRTPTQVASHAQKYFLRQNSVKKERKRSSIHDITTVD 188

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KMG9 (transcription factor DIVARICATA-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497033 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 140 bits (353), Expect = 5.93e-38
Identity = 77/170 (45.29%), Postives = 109/170 (64.12%), Query Frame = 0

Query: 41  WTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDL---------- 100
           WT  +    E A + + ENSP+RW+ IA  +PGKS AEV ++Y A++ D+          
Sbjct: 27  WTRHQDKIFEHALVMVPENSPNRWMKIAGLVPGKSAAEVRDHYDALVSDVQNIDSGRVEL 86

Query: 101 ---ALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFG 160
              A +  L S E +   P QLPE + E          KK K WT++EH+LFL+GL KFG
Sbjct: 87  PNYADESLLSSPERE--SPGQLPEKASE---------RKKGKPWTKKEHQLFLLGLKKFG 146

Query: 161 EGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 197
           +GDW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   +++RKR SIHDITTV+
Sbjct: 147 KGDWRSISRNVVITRTPTQVASHAQKYFLRQESAKKDRKRSSIHDITTVE 185

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HGW8 (transcription factor DIVARICATA-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463444 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 138 bits (348), Expect = 3.34e-37
Identity = 74/168 (44.05%), Postives = 106/168 (63.10%), Query Frame = 0

Query: 41  WTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLA--------- 100
           WT  +    E A + + ENSP+RW+ IA  +PGKS AEV ++Y A++ D+          
Sbjct: 27  WTRHQDKIFEHALVMVPENSPNRWMKIAGLVPGKSAAEVRDHYDALVSDVQKIDSGRVEL 86

Query: 101 --LQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFGEG 160
                +  S   +   P QLPE + E          KK K WT++EH+LFL+GL KFG+G
Sbjct: 87  PNYADESLSSSPERESPCQLPEKASE---------RKKGKPWTKKEHQLFLLGLKKFGKG 146

Query: 161 DWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 197
           DW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   +++RKR SIHDITTV+
Sbjct: 147 DWRSISRNVVITRTPTQVASHAQKYFLRQESAKKDRKRSSIHDITTVE 185

BLAST of MC05g0849 vs. ExPASy TrEMBL
Match: F6I586 (Uncharacterized protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_19s0015g01170 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 137 bits (344), Expect = 4.94e-37
Identity = 87/192 (45.31%), Postives = 113/192 (58.85%), Query Frame = 0

Query: 24  FGYSLPFSSSSAAFTDEWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYY 83
           FGY L +SSSSA     WT  E+  LE A L   E  PDRW  IA+QIPGKS  +V+ +Y
Sbjct: 3   FGY-LDYSSSSAR--SGWTRSENILLERAILMFPEEIPDRWYKIANQIPGKSTIDVLEHY 62

Query: 84  LAMLRDLALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGE-------LNG--------DPAE-KKNKK 143
           + +++D        S+++ +     L E  GE       + G        +P+  K+ KK
Sbjct: 63  IKLIQDTDAI-DFGSMDWYIPSMWGLKEDEGEEVSGLKDMKGGTSSTKEEEPSHFKERKK 122

Query: 144 RKLWTEREHELFLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRV--PEQNR 197
              WTE EH  FL GLLKFG+GDWKNI+   V T++PTQVASH+QK+F RQ+    E+ R
Sbjct: 123 GAPWTEEEHTWFLQGLLKFGKGDWKNISRHCVTTRTPTQVASHAQKYFARQKSGNAEKRR 182

BLAST of MC05g0849 vs. TAIR 10
Match: AT3G11280.1 (Duplicated homeodomain-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 6.6e-28
Identity = 71/177 (40.11%), Postives = 99/177 (55.93%), Query Frame = 0

Query: 31  SSSSAAFTDEWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDL 90
           SSSS +    WT EE+   E A     E+SPDRW  +A  IPGK+V +V+  Y       
Sbjct: 27  SSSSGS----WTKEENKMFERALAIYAEDSPDRWFKVASMIPGKTVFDVMKQY------S 86

Query: 91  ALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDP------------AEKKNKKRKLWTEREHEL 150
            L+  +  +E    P    P  S  L  D             +++  KK   WTE EH  
Sbjct: 87  KLEEDVFDIEAGRVPIPGYPAASSPLGFDTDMCRKRPSGARGSDQDRKKGVPWTEEEHRR 146

Query: 151 FLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITT 196
           FL+GLLK+G+GDW+NI+   V++K+PTQVASH+QK++ RQ    ++++R SIHDITT
Sbjct: 147 FLLGLLKYGKGDWRNISRNFVVSKTPTQVASHAQKYYQRQLSGAKDKRRPSIHDITT 193

BLAST of MC05g0849 vs. TAIR 10
Match: AT3G11280.2 (Duplicated homeodomain-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 6.6e-28
Identity = 71/177 (40.11%), Postives = 99/177 (55.93%), Query Frame = 0

Query: 31  SSSSAAFTDEWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDL 90
           SSSS +    WT EE+   E A     E+SPDRW  +A  IPGK+V +V+  Y       
Sbjct: 27  SSSSGS----WTKEENKMFERALAIYAEDSPDRWFKVASMIPGKTVFDVMKQY------S 86

Query: 91  ALQRQLQSLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDP------------AEKKNKKRKLWTEREHEL 150
            L+  +  +E    P    P  S  L  D             +++  KK   WTE EH  
Sbjct: 87  KLEEDVFDIEAGRVPIPGYPAASSPLGFDTDMCRKRPSGARGSDQDRKKGVPWTEEEHRR 146

Query: 151 FLIGLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITT 196
           FL+GLLK+G+GDW+NI+   V++K+PTQVASH+QK++ RQ    ++++R SIHDITT
Sbjct: 147 FLLGLLKYGKGDWRNISRNFVVSKTPTQVASHAQKYYQRQLSGAKDKRRPSIHDITT 193

BLAST of MC05g0849 vs. TAIR 10
Match: AT5G58900.1 (Homeodomain-like transcriptional regulator )

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 6.6e-28
Identity = 70/176 (39.77%), Postives = 102/176 (57.95%), Query Frame = 0

Query: 41  WTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDL-ALQRQLQSL 100
           WT  E+   E A     +N+PDRW  +A  IPGK+V++VI  Y  +  D+ +++  L  +
Sbjct: 34  WTAAENKAFENALAVYDDNTPDRWQKVAAVIPGKTVSDVIRQYNDLEADVSSIEAGLIPV 93

Query: 101 E-YQVAPPHQLPEVSG-----------------ELNGDPAEKKNKKRKLWTEREHELFLI 160
             Y  +PP  L    G                    G   E + KK   WTE EH+LFL+
Sbjct: 94  PGYITSPPFTLDWAGGGGGCNGFKPGHQVCNKRSQAGRSPELERKKGVPWTEEEHKLFLM 153

Query: 161 GLLKFGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 198
           GL K+G+GDW+NI+   V+T++PTQVASH+QK+F+RQ    ++++R SIHDITTV+
Sbjct: 154 GLKKYGKGDWRNISRNFVITRTPTQVASHAQKYFIRQLSGGKDKRRASIHDITTVN 209

BLAST of MC05g0849 vs. TAIR 10
Match: AT5G04760.1 (Duplicated homeodomain-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 8.6e-28
Identity = 70/170 (41.18%), Postives = 100/170 (58.82%), Query Frame = 0

Query: 38  TDEWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDLALQRQLQ 97
           + +WT  E    E A +   E SP+RW  IADQ+  KS  EV  +Y  ++ D+    ++ 
Sbjct: 3   SSQWTRSEDKMFEQALVLFPEGSPNRWERIADQL-HKSAGEVREHYEVLVHDVF---EID 62

Query: 98  SLEYQVAPPHQLPEVSGELNGDPA----------EKKNKKRKLWTEREHELFLIGLLKFG 157
           S    V P +     +     D A          E + K+   WTE EH+LFLIGL ++G
Sbjct: 63  SGRVDV-PDYMDDSAAAAAGWDSAGQISFGSKHGESERKRGTPWTENEHKLFLIGLKRYG 122

Query: 158 EGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 198
           +GDW++I+  +V+T++PTQVASH+QK+FLRQ   ++ RKR SIHDITTVD
Sbjct: 123 KGDWRSISRNVVVTRTPTQVASHAQKYFLRQNSVKKERKRSSIHDITTVD 167

BLAST of MC05g0849 vs. TAIR 10
Match: AT5G05790.1 (Duplicated homeodomain-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 116.3 bits (290), Expect = 2.8e-26
Identity = 65/172 (37.79%), Postives = 99/172 (57.56%), Query Frame = 0

Query: 38  TDEWTWEEHNTLELATLSMLENSPDRWLVIADQIPGKSVAEVINYYLAMLRDL-ALQRQL 97
           +  WT EE+   E A     +++PDRW  +A  IPGK++++V+  Y  +  DL  ++  L
Sbjct: 28  SSSWTKEENKKFERALAVYADDTPDRWFKVAAMIPGKTISDVMRQYSKLEEDLFDIEAGL 87

Query: 98  QSLE-YQVAPPHQLPEVSGELNGDPAEK----------KNKKRKLWTEREHELFLIGLLK 157
             +  Y+   P    +V    + D   K            +K   WTE EH  FL+GLLK
Sbjct: 88  VPIPGYRSVTPCGFDQVVSPRDFDAYRKLPNGARGFDQDRRKGVPWTEEEHRRFLLGLLK 147

Query: 158 FGEGDWKNIATKIVLTKSPTQVASHSQKFFLRQRVPEQNRKRLSIHDITTVD 198
           +G+GDW+NI+   V +K+PTQVASH+QK++ RQ    ++++R SIHDITTV+
Sbjct: 148 YGKGDWRNISRNFVGSKTPTQVASHAQKYYQRQLSGAKDKRRPSIHDITTVN 199

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Q8S9H77.6e-2938.58Transcription factor DIVARICATA OS=Antirrhinum majus OX=4151 GN=DIVARICATA PE=2 ... [more]
Q9FNN61.4e-2235.96Transcription factor SRM1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRM1 PE=1 SV=1[more]
B8A9B21.7e-2034.16Transcription factor MYBS1 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MYBS1 PE=3 ... [more]
Q8LH591.7e-2034.16Transcription factor MYBS1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MYBS1 PE=... [more]
Q9FKF94.3e-1652.50Probable transcription factor At5g61620 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g6... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022133209.13.50e-3943.59transcription factor DIVARICATA-like [Momordica charantia][more]
XP_020212063.16.66e-3844.32transcription factor SRM1 [Cajanus cajan] >KYP69140.1 Myb-like protein J [Cajanu... [more]
XP_023003417.11.23e-3745.29transcription factor DIVARICATA-like [Cucurbita maxima][more]
XP_022963148.16.89e-3744.05transcription factor DIVARICATA-like [Cucurbita moschata][more]
XP_023518498.16.89e-3744.05transcription factor DIVARICATA-like [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1BVC41.69e-3943.59transcription factor DIVARICATA-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005... [more]
A0A151TQ523.22e-3844.32Myb-like protein J OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_008325 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1KMG95.93e-3845.29transcription factor DIVARICATA-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497033... [more]
A0A6J1HGW83.34e-3744.05transcription factor DIVARICATA-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114634... [more]
F6I5864.94e-3745.31Uncharacterized protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_19s0015g01170 PE=4 SV=... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G11280.16.6e-2840.11Duplicated homeodomain-like superfamily protein [more]
AT3G11280.26.6e-2840.11Duplicated homeodomain-like superfamily protein [more]
AT5G58900.16.6e-2839.77Homeodomain-like transcriptional regulator [more]
AT5G04760.18.6e-2841.18Duplicated homeodomain-like superfamily protein [more]
AT5G05790.12.8e-2637.79Duplicated homeodomain-like superfamily protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR001005SANT/Myb domainSMARTSM00717santcoord: 127..177
e-value: 6.5E-6
score: 35.6
coord: 37..89
e-value: 3.6E-5
score: 33.2
IPR001005SANT/Myb domainPROSITEPS50090MYB_LIKEcoord: 123..175
score: 6.759824
IPR001005SANT/Myb domainCDDcd00167SANTcoord: 131..170
e-value: 1.52098E-6
score: 41.7922
IPR001005SANT/Myb domainCDDcd00167SANTcoord: 40..87
e-value: 1.38635E-4
score: 36.3994
IPR017930Myb domainPFAMPF00249Myb_DNA-bindingcoord: 128..173
e-value: 4.2E-7
score: 30.1
IPR017930Myb domainPROSITEPS51294HTH_MYBcoord: 123..179
score: 16.091963
NoneNo IPR availableGENE3D1.10.10.60coord: 39..86
e-value: 2.3E-10
score: 42.2
NoneNo IPR availableGENE3D1.10.10.60coord: 129..180
e-value: 1.2E-14
score: 56.2
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR44042:SF41DUPLICATED HOMEODOMAIN-LIKE SUPERFAMILY PROTEIN-RELATEDcoord: 40..197
IPR006447Myb domain, plantsTIGRFAMTIGR01557TIGR01557coord: 126..178
e-value: 7.5E-14
score: 49.8
IPR043363Transcription factor DIVARICATA-likePANTHERPTHR44042DUPLICATED HOMEODOMAIN-LIKE SUPERFAMILY PROTEIN-RELATEDcoord: 40..197
IPR017884SANT domainPROSITEPS51293SANTcoord: 131..179
score: 9.572439
IPR009057Homeobox-like domain superfamilySUPERFAMILY46689Homeodomain-likecoord: 125..179
IPR009057Homeobox-like domain superfamilySUPERFAMILY46689Homeodomain-likecoord: 39..90

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MC05g0849.1MC05g0849.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0003677 DNA binding