Tan0011780 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTAACTTTCTCTTCTCCCTTCCAGACTCCCTCTTTTATTACGCAGATTCCCTCGTTTTTCGACTCTCTCTCTCATTCTTCTCCTTTGTTTCTCTGATTTTCTTCCTCAAATTCCATCGTTCCTCTAATTTCTTCCTCAAACTCCCTCGTTTCTCTATTTTCTTCGATTTGGTTCCTTAGAGACCCTCGTTTTCGATGGAGATCGAGTTTGATCTAGGGTCAGAAGAGCGATTTTCGGGTTCGATTTTGGGGTCGGAGGAGTGATTGGTTCAATTTCTCGTTTTCTACCCAGATTTGTAAGTCTGCCTCTCCATCCTTCATGAAATCATTCGATTCATTATTTTTTTACATACCACAATCATTGTTCTTGCAAGATCCATAACCTCTTCTCCTTCTCTGTTGAATCGACCATTTTTTTCAATTTCTTCCCACAGTCGTAAATCCTAACAATGGATGTCGCATGTCGATTTCCTTGCTCTCTCCATCTCACTCCCCCTGCCGTCTATTCCCTAAGACTCGTCCCTTGTCAAAGTCCTTGCTTTTCCTCTATATGACAATTCCCTCATCCACTACTAACCTATCAATAGATGGGTTAGTTCGCCTGAACTCATGTTCTATCTGAGGGATGAGTGAGGAATTTCATGGTAGGTGAGTTGATTTGGTATGTAGAGCTTGATGGAGGGTTGAACGACAGGTAAGTTTTCTACCTTTCCAGCCGATGATGAGAATTTATTTTTTTACATAACATTTTTCTTCTATGATTATGCATACTGATTTGTGGTTAAAATTTTTTCCTTCTATGATTATGCATATTGATATGTTGTTAAGATTTTTGTTCTTCTATGAGTATGCATACTGATTTGCAGTTGATTTTTTTTTTAGGTTTAGCAAGTTGTCCATGATTTTTGCGTGCTAATTTGTTATTGGACTTTTAGCATTTTCCTTCATCATATTGTTTTTATTTATCATACTGATTTGTTCAATTTTAGTGCATACTGATATGTTCTAGTTAATATTTGTCCATGTCTATGTGTTGTATTACATTGATGAAATTTATTTTACTATGAGTCAAAGTTTTCCTGAGGCGGATTTTTTAAGTTTTACATGCTTTTTTCTACAATCTTCTCAGACATTTATATTTTATATTGAATGAATTTCATCTACCTCATTTATTATAGATTTTTGGATTTTTAAATACCACCTACCTTCTCTTGGATACTTGCAATAATTTATTACCATGAATGAACTTCATTATTTCATTAGAAGTAGGTGGGAATACCCCACTTCCTCCTTCTATATATTGTACATGACCTACATGTTTTCCATTTGAATATTGTACATGACCTACATGTTTTCCATTTGAGAATATTCCACTGTCTTCCATATTTTTCTAATCCATTAAGTACCTCCTAAACGTGATTTCCTTTCAAAGTCATTTTATCCGCTTCAAGTACAATGTTGGACGATAACAACATGTTGCCTTATTCACGACCACATCACTCGAGAGATAGGGTCGACTACAATGTTGGATGAGGTCGAGGAAGCTGACTTTGCATCTAGTGTTGTTCGTGGGAACAACATACAATTTATTGAAACCTCGAACGAATGGATCGTATTTAGAGATAGCTTGGCTAAGCGAATGTTCACGCATGGGAATAGTCGTGATGAATTTTCTACTTCTGCATGTATTTTTTGTTTTCAATCGAACACCAACTCGGGTATAATTTATGTATGTGTGCTTGTGATGTAGCGGATGAAAGGAATCGAATCCCAAAGCGGAAGCGATTGTGAATCGCGCGTTCCTAATTTCGTTACATCGATTACATTCAAGAACTAAAACAACTAGATTAAGAATAAAAACAGAATATGGACAGCAAGAAATACACCTTTGAAGAACTTTTCTTCAAGTGCTCCTTTCTCCCACGATCACGATCTCAGCAACTGGAACACGAACAGATGAAGACACGACCACTGGATCTTCTCCGTTGTTCTCTAGATGAGGGAAGAATGTGGGTTCCCTTTAGGTGAGATGAGATGTTGTGAGAGAGAGGTTTGTGTTTTGGAACTTTTCCAACAACATAACAAATGCCTCAAATTACTTGACCTAGTTGCATCTCATGCAACCATATATATAGGGAAATAGGATGGAAATAACCATCCTACCCTTCCTTTATTCTCTCATTAGTATATGGTTTATATGTGAATCTAATTCACATTAAAACTATATATTATTATCAATTATATCATATATAATTGATATAACACCTCAGGTATGAAATTGAACACTTCAATTTCATTCCTAACTTTATACCCTCAATTTTACCATGTTGAGCCAACGGAGGGACCTAATGGACCTACAGTTCATGAGCTCCAATGATGTGAAATTAACTGACCAAACTCTTTGATCCAGTTAATCAATATTCATTAACTACAAGTCACTACACTATAAACTTGTAGCTGCACTCTCCTCACTGTAGATTATATTGTGTCCACTGATATAGTCATTACCCATGAGTCGACCCTTCACAGGTTGTTCGTGATCACAGCTGGGTCAAATTACCATTTTCTCCCTGTGATTACCTCTTTGTTCCTTAAGCTCCACTGATCCTCTAATGGACAACAAGTCTAAGGTCCTACCATAGACTCATACCCTCATAGAGGACGAGGCCCGTTGTTCAAGACCTGGAGTCAGTTCTTAAGGGAACAACCTATCTAATTCCTTAGTGTAGGAATGAGTGAATTCCATCTTGTACAGTTAAGTTCCCAGCTACCTACGAGGTTTTGTCCCTGAGAAGGTAGGCTTGTTGAGTCCATGCACCACTCTCACCCATACTAGTCTAAGGACAAACCCCTATAAGCAGGAGTTCTTAACTCGCTCGAGATTCAGTCGAGTCACTAATGACCATCTATAAATTACGAGTCTTATCTCATTAGCGATTGTTACTGCTGGTTAGACTAATAATTTGTGGTCAGGTCTTGTATGAACTCTTCATGTGATGCCCCCACTCGCATGTCAACTACATGAATGAGTTGGATTACCTCATTTTGTACTAATTACAAAGTGGGTCGCATCCATGGTGTTGTTATCGGAATGAGGTTTCCAACCTTATTCTTATACCATAGACCATTTAGGTTATATTCTTAAACACAATCCAAATAGTGTCCACTACACTGATGTTCAAGATATATATATTATCAAGATATATATTATAACCTTGAAGCTTAGTTTATTGGATTTATAAAGCAAGACTGTAATTTTTTCAAAACAAATAACTTTTTATTTCTTTGATCAAAATTACACAAGTTGTAGGGCATACATCCCAACAATCTCCCACATGACCCAAAGCTTGTGGAGTACTATTACAGTGATGTAAATGATGGAGATCGGATCTCCTTGAGCAGCGGAAACGAATTTGGAATCGTAATATGCAAGATTGTTTTGTTTAAAAAACAAAAATCCATACATTGACAAAAACATACAGAACAAGCATGCTTTTAATCTAATTGAAACATGGAGATATATATGCAAACGTGTTTAGTTTAACAATTAAACTAAAAAGAATAAAAATGATATTATTACCTTTGTAGACTTTCCTCAGCAACTTGTTGCTCTAAAGGTTGTACAACAAATCAACTTCTCTGTTTTCCAGCAGGACACCACCAACAGAGTATACCTTCTATATCTCTGAGTGCTTAGATCTTCCTTGGTGGGAAGGATCCAACAATTGGAAGAATTGGGAATTAGAGAGTGAGAGAGAGAGTTTTTTCTTCACAGGAATTTTCCAATTGCAAAAACAGTAAGCACTCTTCAACATCACCCCTCTTCTCCCTGTTAAACTGTCGATAGGGGGAAGAAGGAGGGTAGTGGGAACGTGTCTGGATGACACGTTTCCTTATTTTATTATTAAAATAATAATTATTAAATCAAATTTAATTAATAATATAAATCATATTTAAATAATACAAATTAAATATATGATATTTAATTTGTATTAAATCTCATTTAATCATATTACCCTTTTAACCTATAGTTTTAATGTACATCCAGTGCACATTAAATTTTAATCAATAGTTTTCAAATGCGAATCACATTCACATTTAATATAATATTTGAACTCTTTCAAATATTCAATTCTCTCCTATAATTTAATATGAATCATATTCACATTAAATTTATAATATATAGTTCCAAAACTATATATTATATCGTATCCATATACATTAAATATATTCCCTAATGAATTTGAACATTTCAAATTCAAATGATCTAAGAACCCTTTACGAGCTAAAAGGTGGACCTAATGGACCTCTGGATCGTAAGCTCCAACGATACGAGATTGCTTTTGTTAATCTCATTAACCTCCCAATCAACATTCGTTAAGCTGCGGAACACTCCACTAAAGTCCCACAGCTGCACTCTTCTCACTGCAGATATATTTCTGTGTCCATGGATATTGACCAATAACAGCAAGTCAATCCTTCACGAATGTTCGTAACACCTGCTGGGTCAAATTACTTTTTTACCCCTGGGTTACATCTTGTACCTTAAGTACTAGTGCTCCTCTAATGAACAATTTGTTTGTGGTCCTACCAACAAACAGAGTCCCTCTCGGGCCAATGAGAGGGTCCGACCCTTTGTTCAAGTCCTGGAGACACCACTTGAGGGAACATTCCTCTACATACCCTAGTAGGTGGGAAGGAGTGAATTCCGTCTTGCTAAGTTAAGTTCCAGCCGCTCACTCGGTCTTGTCCCCAAGAAGGTAGGCATATTGAGTCGGTGAATCTGGCCACTCTCACCCATACTAGTCAAAGGACAATTCCTCTAATGAACAATTTGTTTGTGGTCCTACCAACAAACAGAGTCCCTCTCGGGCCAATGAGAGGATTGGGCCTTTTGTTCAAGTCCCGGAGACACCACTTAAGGGAACATTCCTCTACTTACCCTAGTAGGCGGGAAGGAGTGAATTCCATCTTGCTAAGTTAAGTTCCCAGCCG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ATGAAACATGAGATAATCATGAAGGGCAACATGGAGAATGACGTAAAGAAGAAAAAGAACCTAGCATTAAAGTCTACTCAAGCTCAAGACGGTTCTGAAAGTGAGAATGAATTAAATGATGATGAATATTCGTATCTGGCAAAAAAGTTCAAGAGGTTTCTTAAAAAGAAAATTTTCTCCAAGAAAAGTAACAGTCAAGAGGGAAAGGGAGAAAAGAGCAATAGGGACGCAATTATATGTTTTGAATGTAAGAAGCCTGGACACGTGAAGTGTGATTGTCCACCAAGGAAGTCATCTTTGAAGAAGAGCAAGAAGGCCATGAAAGCTACTTGGGATGAAAGCGACGAGAGTGAATCTGAAAGTGAAGGAGAAGAAGCCAACCTCTGTTTTATGGCATTCGGAGACGATGACGATGATGATGAGAAAATCAGAGAGCCTCGTGAGATGAAGTTGAAGGAAGAAGAAGAAAGGGGTTTTTGGTTTAATGCTAAAGAAGAAAGGGAGAAAGTTCAATCCAACCTCCCATGGCAGCAAGGTGAACATTTCTGCCCAGTTCTGATATTTTGA MKHEIIMKGNMENDVKKKKNLALKSTQAQDGSESENELNDDEYSYLAKKFKRFLKKKIFSKKSNSQEGKGEKSNRDAIICFECKKPGHVKCDCPPRKSSLKKSKKAMKATWDESDESESESEGEEANLCFMAFGDDDDDDEKIREPREMKLKEEEERGFWFNAKEEREKVQSNLPWQQGEHFCPVLIF Homology
BLAST of Tan0011780 vs. NCBI nr
Match: XP_038895919.1 (uncharacterized protein LOC120084093 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 2.6e-44 Identity = 101/143 (70.63%), Postives = 118/143 (82.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. NCBI nr
Match: XP_038885875.1 (uncharacterized protein LOC120076181 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 182.6 bits (462), Expect = 3.2e-42 Identity = 102/149 (68.46%), Postives = 118/149 (79.19%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. NCBI nr
Match: XP_022143648.1 (uncharacterized protein LOC111013509 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 2.1e-41 Identity = 98/143 (68.53%), Postives = 118/143 (82.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. NCBI nr
Match: XP_038882256.1 (uncharacterized protein LOC120073483 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 177.9 bits (450), Expect = 7.9e-41 Identity = 94/127 (74.02%), Postives = 105/127 (82.68%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. NCBI nr
Match: XP_031741720.1 (uncharacterized protein LOC116403915 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 134.4 bits (337), Expect = 1.0e-27 Identity = 78/150 (52.00%), Postives = 106/150 (70.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CR79 (uncharacterized protein LOC111013509 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013509 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 1.0e-41 Identity = 98/143 (68.53%), Postives = 118/143 (82.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUJ5 (uncharacterized protein LOC111024159 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024159 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 4.1e-27 Identity = 76/137 (55.47%), Postives = 101/137 (73.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TZF4 (Zf-CCHC domain-containing protein/UBN2 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold216G00480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 2.3e-25 Identity = 73/145 (50.34%), Postives = 101/145 (69.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E1G2 (Zf-CCHC domain-containing protein/UBN2 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold64G00350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 2.9e-25 Identity = 73/145 (50.34%), Postives = 100/145 (68.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0011780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DY46 (uncharacterized protein LOC111025259 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025259 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 117.5 bits (293), Expect = 6.1e-23 Identity = 68/126 (53.97%), Postives = 88/126 (69.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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