Carg15641 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTAATCAATTGCACGGTTACAGCTCTGTCTACGGCGCGGGACCTGCCACTTCAACTGCCACTGCCACTGCCACTGCCACTGCCACTGCCACTACACCTCTTCCCGCCGCATACTCGTCTTCCCGCTCCCTCTCCGACATCGTCTCCGGCCGTTACCTCGTGTCAGACTCGCTGGCCTCCGGTTTCTCCATTAAGCACTCTTTTATTGATCGTGGTACCACCATGTATTCGACCCAGAATGAAGCCCTTAGGTTATCCGCCGCCGACATTGTCCCAAGAACGTCGCATTCGGTCTCTCAATTTTCTTGGCCGGGTTCTGATGCTGCTACTGCTCTGGACTCTGTTGTTTCTGGCATCCAACGTTCTTCTGACGGTAAGTTTTATTCGCTGTCTACTTGAATCTCTTGGAAAATCACTTTAGAAAATACGTAAAATAATTAGTTGAGTACTTGGACATTAACTTAAAGTTTCACGAAAACGAGGCCGAATGAATTTGTTCACTTCTGCTTTCAGAAAACATCACCGATGGGATACTTTCATGTTTTGATTCTTTTTCCTGCTTTCGCATGACCACCAATTGGCATTCGTGATCATGGGGCTTTGGTTTGGCTTCAGTGCTTCCATTCGTGCTGTTCGCTGTCTTTTTCTTTATTATATATGGGTGTTTATGTATTTTGTTAATAGCATTTTTTCTTGTTTTTCTTTTCTTGATGGAACTTTACATATGATTTGTGGCCTAAATTTCCATGATGTTCGTGTCGTTTTATTTTCTTCCATATCTTCGGTATATTGGACGAACATCAACCCAAACAATAGTTCAGTACCAAATCGGAGAAGATAGTAGTACTTATTCTCTTACTTTCTCTCTGTCATGGCTAGTTGGATTTCCATATGGTTTTCGTTGCAAAGTATTTTATATAGAAGCCATTTTCTTCTCTGGAGACTGGAACTATGGTGTTATAAGTCTCAAGTGATTCATGCACGCCCCCTATGTCGTATGCATAATTTTATGTATGGGGTTCGATGTAATGGTTTGTTTTCATCCTGCTGCTGTACAACTAAGTTGCACCATAACAGTATGAAGCAGCCTTAAATTGATAAGATCTATGTAACTTCATGCAGACAGTTTATTTTCCTGTATATATTTTGAAAACGTTATATTTTACATAATCTACTATATTTAATTTCTAAATCTATACAGCCGAGATAGTAGTGCTAGAAATACTTATATAGTAACGTACATGTTTGTCTTTCTTGTACATATTTGTCTATTATGTACAATAGTGCTCTACGATCAGACTGTTTTGGGTTCCTATAACACTTTGGGGCAAAGTGAAGCCTGGTATACTTCAAATTCTTTAGCCAAGCGTCCTAGATTTGAAAGTACAAGCAATTTGCATGTATATCCACAGAGGCCAGGAGAGAAGGACTGTGCCCACTATATGCTCACAAGAACCTGTAAATTTGGAGATAGCTGCAAGTTTGACCATCCTATTTGGGTTCCTGATGGTGGAATCCCAGATTGGAAAGAGGTGACTGTTTTCTGCTATCTTTCATACCTATAAAGATGAATTATGATCGACAAAGAAACAAATACTTTATAGGCATATACATTAAAGGGTTTATCACATATGCTTAAAATTAAGAGTGAGTGATCTGGGGTTTGGTGTTAGTAATTTGAATGATATCTTGATTTTGTGCTGTATTCGATGCCACCTTTTCTCTATGCTGTGTAGAAATATCATTTTTTTAAGCGGTTGATCTTTCCTTTTTGCTAGCTGAACTTATGATTTGGAAAAATATATTCATGTAAATTATGATGCAGTGCTAGCTTTCTATTCATTGAATTGATGTGGGGGCAATTCAGTAATTGCATATTTAATTAATTCTTGAATTTGTAGTTCTTGAGTTGTATTTGGATAATTATTGGAAGCCATAATCCATGTACTTCTTTATGACTAGGAATACAGTTTAGGGGATTTTATTAGGTAGTCAGGTGTGATTAGCTTGAGTTTGAATTATTTTGAGATTTGGACTTACTACTCAGAAAATATAGATTTTTCATTAAGTTCTATGTTGAGAATTATTGTAAATTAGGAATATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGAAAGTTCAAGTTATTCATGCTTTATTTATTTTTTCCCTTCAATTGTCCTTTTCTATTATCTAAGGGATTCAACATTATCGATATAATGTGTGGTTTATCCATTCATTTTATGTTCTTTCCTTTTGATATATATATACATATATATACATATATATATATATAAATTGAAAGGAAACAATTTCATTGATGAATGGAGGAGTTAATAGGCTCTCAAACTCCAAAAGATAAATTACATGAAGGACCTCTTAATAGAAATTTAAGAAGAAAGACTATAATTGTTAAACTGTCTAATATTTATATTAGACTTCTTATAGTTATACCTCCCTCATTGTAAATTAGGAAGGTTTTTTTATAAACACCATGGATGATGCATCCCTTTTGTAAATTTTAATCATCAATGAAATTGTCTCTTTTCAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAAAATCTTGGACACTCCAAAATTTGACACGTATTGGACATTTCAACACGCCAATGTTGAGTATGTATTGGACACTGACACTCTTAATGCTTGTTGAACACGTATTGAACACTTATTAGCACAATAGATGTGTTAGATAGTAGTTGTACAAAATCAATGTTATTCTATCATTTGTTAGAAAAATATTGAACACTTGACTTTAAATAAATTTTGAAAGTGAATTGCTAACTTATTTATTTAAGCATATAAATTCATAAACTTATTGTCTTTGAATTTTCTTCTGGTATAAAAGTGATGTATATTCAAAAATGTATATTTTAACATGTGTGCCCTTGTCATATTTATGTTCTAGAATTTTAAAAATTGACATGTCACCATTTTCGTGTCGTGTCGTATCTGTGTCTTGGATCCACATCGTGTTTCTTAGCTTTTCAAGATATCCGAACTACTGACAAAAAGAAGCCTAAAATCCTTCAATTAAACAAAGAAAACTGAGAAGCATGAAGAAACAAGACTATGAAATTCTTTGAGAGCTTGCTAACGGAAACTGAACTAAAGGAACTGTTAGGAACCATTGGAAGGCTATTTTATCTATGTTATTCTTCTTTTCTAAGTTTTGAATCTTTGTTATCGGGGATGACTCAGTTACTGGTTTTAGGCTGGATTGTGGGATCCCATAACCTTTATTAAAGTTTGCTTCAGTGATTTCTATCGTCTTGTAGTTGGGACAATGTGTCGTACATCTTTAGCGTCTTTGCGCTCTGCCCAATTACGTATTTCCAACTTTTATTTTTCTATGTTTTGCTGAATGAGTTTCAAAGACGTATATGTGGACTCCCAATACTTATAGGGCGTTTTCATGAAACTCCAATCTTTTATCCATTTCACACCCTCATGTCCCTCGTTCTTTCTCTTAATTGCAAAAGGTTAGGATCTCCAAATCCTCTACGCTTATCTAGTTAGGGGTTCATTGGTATGTCATATGTAAATGTGCTTAGGGTATTTGGATCATGCTTCATGGGGTTGCCATTTTGCGCACTTGATATGGGATAGAGGTGCACAATAGATCTTATCCTTCGATGATGGAGGTGCTGTTTCAAACTGTTTTTGGGGCGAGGGGGGTCTTTTTGATATGCAGCTTTCTTTTCTATTTTGTGGAATATCTAGCTTTAGAGGAATTGAAGAATTTTTGGATGGCTTGAACACCTAGTTAGGTTTCTGCATGGGCCACCATTTTGGTGCCAAGTTAGGTCCTTTGCCAAGAATGAATTGAGTTGCATAATTGTTCCTAATAATAGATATGGTTAACGTTTCTAAGTATCTGTTTTCCAAATTCTTTTGCGCTTGTAGTCTTAAGGTAGCTTGTGCTTCTAATACCATTTTATATTGCTTTCTCCAATGGCTGTTTATCTCATCTATAATTTATTTAGGTCCCACAAATAACTAGTAGTGAAGATCTCCCAGAAAGACTTGGGGAGCCAGATTGTCCAGTGAGTTCTATTTTAAATATTTTATCCTTCACATCTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTTGAAGTAATATGCACTTATATTTCTTGCATTACTTCACGACCTTTTTGATTCCTGCAGTACTTTTTGAAAACTCAACGATGTAAATTTGGTTCAAGGTGCAAGTTCAATCACCCTAAAGATACGTCTGAATCTGTGGTAAGTTGTATGAACCTGATGTCTTCAAGCTTTATTCTTGTTTTGGGTACCTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTGATATGTATTATGTTTTTACTATTTTCAGGGTGCTGAAAAATCTGATGTTTCGTCCTTACCTGAGAGACCATCTGAGCCACTGTGTGCAGTAATATACACATACACACACAGGCACACACATGTTCTTTACTAATATTTTAGGCGTACAAGTCGGGTATAGACATATTGTTTGATTTTTTCCCCTGCAGTTCTATGTTAAGACTGGAAATTGCAAATTTCGTGTTAACTGCAAGTTCCATCACCCAAAAGATATCCAAATTTTATCTGGGGAAGTTAATGGAAATAGCGAACAAACTTTGATGGAAGCTAATACAGAAGGAAGAATTGGAGACTTCAAGCTTGTTAAGCCTCCTGTTTCATTTTCTCCGGCATTAATACACAATTCTAAAGGACTTCCAATTAGACCGGTAATAAATTGGATTACAATTGTAGAAGTTTAAATATTTATTTTCTTGTATCCCAGAGGATGTCAGTATTTTTAATACTCTATTTCTTTTGTGTTGCCAGTTACTTCTCTTTCTGGAATTATGGTTCAAGTCTTAGTGGAAAATTCCAGTCTTAATAAATTGTTTTGCATTAGACAAGATCTAAATTTTACCAAACAACTTTCTTGTAACAGGGTGAAGTGGATTGTCCATTCTACTTGAAAACGGGCAGGTATATGAGCA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MANQLHGYSSVYGAGPATSTATATATATATATTPLPAAYSSSRSLSDIVSGRYLVSDSLASGFSIKHSFIDRGTTMYSTQNEALRLSAADIVPRTSHSVSQFSWPGSDAATALDSVVSGIQRSSDVLYDQTVLGSYNTLGQSEAWYTSNSLAKRPRFESTSNLHVYPQRPGEKDCAHYMLTRTCKFGDSCKFDHPIWVPDGGIPDWKEYFLKTQRCKFGSRCKFNHPKDTSESVGAEKSDVSSLPERPSEPLCAFYVKTGNCKFRVNCKFHHPKDIQILSGEVNGNSEQTLMEANTEGRIGDFKLVKPPVSFSPALIHNSKGLPIRPGEVDCPFYLKTGSCKYGTTCRYNHPDRNAINPSTPAMVSAANMNIGISNPSNAIYQAVDPRLIQPLLGSSSSIYPRRPGQIECDDAIICPYYLKTGTCKYGSTCKFDHPPPGEVMAMDTKEKISRHDVTSLVNEYVSINNLLHPSRKKRIVCDDRLHSIFGRKTIGRIKIHDMLEPHFAENQDESDDDFSYSSDETENLLNTLKRENGKTPGRKLSQKTRVLVNPNTSFAAMVPGNINLVYLRKSLVEDLVKDHETFESKLIGSFVRIKSDPHDYLQKYTHQLVQVTGVKKVSIPGDLGTRFLLHVSNVMKDVSICMLSDEKFSEEECKDLDLRVKSGLVKRLTIAEVQQKVEALHVDITKHTAEEQSRIFREIPQVIADEPEFQGIYGSANQGDNVTNEGDETKLQVRREVSDDTNQGEIAFGSNPNVDIYVAENRTAASMSNVEEFAECRRSVLDEEQPPQPVESTYNSRLNETELINEVDKGWLANEQIKESRVINLSDDELPRGEELDWNSTLRSLIWYYLDPQGDVQGPFCLASLKNWKDADYFPPDFKSDFRYSSVGKLTRATGDPSFRSVEEGVEEKEEFQVLTATTSYYNDIVIVDTPESRMLLLDSSSTTFRFSLIFNFYPLKGNSDLLNCAAIVDADNVHSILYKEQIWTGSYWDEFASLPAIIPEGPIAIFGLGGGTTAHLMLASWPSLQLEGWEIDGILIDKARDFFGLSDLEKHSDDGGILNIHIGDALDPSARISGGYAGIVIDLFSDGDILPQLQQVGKWLELKERLMVGGRLMINCGGNVVKVTDNGICSEVSSTDSFLPRNSVIQALSEAFPKQLCWKKLPKEKGENYVALTGPFPELESWSAVVPEPLRASVKEWRPYERL Homology
BLAST of Carg15641 vs. NCBI nr
Match: KAG7012085.1 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 37, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2442.5 bits (6329), Expect = 0.0e+00 Identity = 1206/1206 (100.00%), Postives = 1206/1206 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. NCBI nr
Match: KAG6572491.1 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 37, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2234.5 bits (5789), Expect = 0.0e+00 Identity = 1146/1306 (87.75%), Postives = 1153/1306 (88.28%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. NCBI nr
Match: XP_022952579.1 (zinc finger CCCH domain-containing protein 37 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 870.9 bits (2249), Expect = 1.3e-248 Identity = 440/508 (86.61%), Postives = 440/508 (86.61%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. NCBI nr
Match: XP_023554149.1 (zinc finger CCCH domain-containing protein 37 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 866.7 bits (2238), Expect = 2.4e-247 Identity = 437/508 (86.02%), Postives = 438/508 (86.22%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. NCBI nr
Match: XP_023554021.1 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 836.3 bits (2159), Expect = 3.4e-238 Identity = 432/479 (90.19%), Postives = 434/479 (90.61%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q941Q3 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 37 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HUA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 421.4 bits (1082), Expect = 3.5e-116 Identity = 211/425 (49.65%), Postives = 267/425 (62.82%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZDJ6 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 8 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0616400 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 345.9 bits (886), Expect = 1.8e-93 Identity = 180/413 (43.58%), Postives = 227/413 (54.96%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FT92 (Uncharacterized protein At5g08430 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g08430 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 282.7 bits (722), Expect = 1.9e-74 Identity = 194/508 (38.19%), Postives = 268/508 (52.76%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84W91 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 32 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g47850 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 162.5 bits (410), Expect = 2.9e-38 Identity = 102/358 (28.49%), Postives = 148/358 (41.34%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7N8 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 57 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ZFN3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 160.6 bits (405), Expect = 1.1e-37 Identity = 97/318 (30.50%), Postives = 150/318 (47.17%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GM41 (zinc finger CCCH domain-containing protein 37 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 870.9 bits (2249), Expect = 6.1e-249 Identity = 440/508 (86.61%), Postives = 440/508 (86.61%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HZR7 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468398 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 831.2 bits (2146), Expect = 5.3e-237 Identity = 429/479 (89.56%), Postives = 433/479 (90.40%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLQ2 (uncharacterized protein At5g08430 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455126 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 829.3 bits (2141), Expect = 2.0e-236 Identity = 428/479 (89.35%), Postives = 432/479 (90.19%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GM64 (zinc finger CCCH domain-containing protein 37 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 820.5 bits (2118), Expect = 9.4e-234 Identity = 420/508 (82.68%), Postives = 420/508 (82.68%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HW69 (zinc finger CCCH domain-containing protein 37 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468399 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 813.9 bits (2101), Expect = 8.8e-232 Identity = 416/508 (81.89%), Postives = 421/508 (82.87%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. TAIR 10
Match: AT3G12680.1 (floral homeotic protein (HUA1) ) HSP 1 Score: 421.4 bits (1082), Expect = 2.5e-117 Identity = 211/425 (49.65%), Postives = 267/425 (62.82%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. TAIR 10
Match: AT5G44600.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 3.5e-79 Identity = 154/300 (51.33%), Postives = 194/300 (64.67%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. TAIR 10
Match: AT5G08430.1 (SWIB/MDM2 domain;Plus-3;GYF ) HSP 1 Score: 282.7 bits (722), Expect = 1.4e-75 Identity = 194/508 (38.19%), Postives = 268/508 (52.76%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. TAIR 10
Match: AT5G44590.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 265.4 bits (677), Expect = 2.3e-70 Identity = 152/323 (47.06%), Postives = 187/323 (57.89%), Query Frame = 0
BLAST of Carg15641 vs. TAIR 10
Match: AT5G23480.1 (SWIB/MDM2 domain;Plus-3;GYF ) HSP 1 Score: 185.3 bits (469), Expect = 3.0e-46 Identity = 159/535 (29.72%), Postives = 250/535 (46.73%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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