MELO.jh101225.1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGAAGGTGGTCGAGCTTCCGATCCATTTGGGCATGTTCTCATAGTCCTTCGAGTATCTCGAGTAGTGAAGTGGCATTTGAAAGAAGCTGCCTCCTCCATTGTTCTGATCCATTGTTTTTTTTAATGGGGTGTGAGGTTTGGTGAGTTTTCTTTTATAGGGAAGAAGGAAAGTGAGAGGGAGGCACAAGAGGCATGGAATTGGTCACAAGGATCGTTTGATACAACTTCTGTCTTCTCATATGCTATGTGTTTATTGCTCATCACCAACTTTAAATAGAAACATAATAATAATAATAATACAAATAGAAAAATCAAAAAAATTAATTAAAAACGAATAATATAAATTAACAAAAACCTCTTAAACCAAAAATCCAACAATTAAAAATCCACCTAAATACAAAATAATAAAACCAACCTCTAATTCATAGATTGGAATTCCAGTACACAACCCAATTCTTTGAGATGAGAGAGTTCGAGAAATTGAGATATCTAGCAAACTGATGAAAGCTTAATTTCTCCACAAGTCTCAACAGCAACATTAACATTTTGTTAGATTTTGTTGAAGATTTTGTCTAAAAGTTTTTTTTTTTATGGGGAATATCTTTGACTAAATATCTTTGATTAATGAATTAATTAAAGGATGAGATATTCGAAGGATAAAAGATTTTCCATTATCTTAGGAATCTTATTATTTATCTTTAAAAGAAAAGAAGATTTATACATATAATATATATATATATATATATGTATAAATAGGTTGTTACTGTGACGATTTTGGGTGACGAAAAAAAGAGAAACATAAGTTGAAGAAGATTGTTTACGTCAAAGGTCGTCTGCAGAAGCTACCAGATTCTAAAGGTATTATAATCTTATGTCTATGAGATCGACATGTTGATCTAAGTTGCAATAATTGATGAGTAATAGACGAGACAGTGGTTTGTATGATATTGAGATCTTTAGAGGGATTTAAAGAGGTTGTCAAAGATATTCACTCATGTGTTCAGGGGGAGCCTGAAGCCAAACATCGTGAAGAAAAGTAATTTAGGGGGAGCTTGGAGTCTGATGTCAAGACACATGCTATTAAGTCATATAATTGAATAGAGCACCATATATTGTATTGATGTATATTGACTTAAGTGAATATTAATAAAGATTACTCATCAGGGCTGTGTACAGCTCCTCAGACGTAGGCAATATTGGCTGAACTGGGTTACCAAAGTTTCTTGTGTTATTCTCTTATGATGTCCCTCTAGTTATTACAAAAGTTAGTATCTTTAGTATTAACTGAATAATTAATTATCTCACTGTTTTTTCAATTGGTATCAGAACGGGTTGTTAGATCATGGAGATAATCAGAGAGGGACCATTAGCTTCTCGTCCTCCTGTACTGGATGGAAAAAATTACTCATATTGGAAGCCTCGTATGATATTCTTCATTAAAATATTAGATGGAAAAGCATGAAGAGCCCTTGTTGCTGGTTATGAACCTTCAATGGTTACTGTGGATGGAGTATCAGTGCCAAAACCTGAAGTTGACTGGACAGATGCTGAAGAACAAGCTTCGGTTGAAAATGCTAGAACTATAAATGCAATCTTCAATGGTGTGGATTTAAACGTGTTCAAACTTATTAACTCCTGCACTACTGCTAGAGAAGCTTGGAAAATATTGGAAGTTGCATATGAAGAAACTTCTAAAGTGAAGATATCCAGATTGCAGTTGATAACTTCAAAATTCGAAGCTTTGAAAATGACTGAAGATGAATCAGTCTCTGAATATAATGAGAGGGTTCTGGAGATAGCTAATGATTCACTACTGCTTGGTGAAAAGATACCTGAGTCTAAAATTGTTCGCAAAGTGTTGCGCTCTCTACCAAGAAAGTTTGACATGAAGGTCACTGCCATAGAAGAAGCCCAAGATATAAAAATTTTTAAAACTTGATGAACTATTTGGGTTGCTACTTACTTTTGAAATGGCTATATCAAATAGAGAAAACAAGAAAGGTAAGGGGATTGCCTTTAAATTTGCATATAAACAGGAGACTACTGTAAATCAGTCTGATAATGAAGTTAATCAGGACGAGTCAATAGCTCACTTAACGAAACAATTTTCTAAGATGGCCAGGAAGTTCAAAAGTATGAATAATGCTCAAACAACAGTCAAAACTGAAAGACATGATGGTGAGAAATCTACAAGAAAGGTTAATGATTTCTCATACAAAAGAAATAACGACTATGGTAAGAAAAAAGAAGATGTAATGAGGTCTTTTAGATGTAGAGAATGTGAGGGATTTGGTCATTATCAGGCTGAATGTCCCACGTATCTCAAAAGACAAAAGAAAAACTATTATGTTACCTTGTCTGATGAGGACTCTAATGATATCGAAGTTGATCATGGCATGAATGCCTTCACAACATGTATTACAGAAATCAATCTTGATGATGATAGTGAGTGTTCTGATATTGATGAGGATGAAGAGCTAACGCTTGAAAAACTCAAAATGCTGAGGAAGGAAGACTTGGAAGCCAGAGCTATTCAAAAAGAAAGAATTCAAGATTTGATGGAAGAAAATGAACGATTGATGGGAGTTATATCATCTCTAAAAGTGAAATTGAAAGAGGTTCAAAATGAGTATGATCAGACAATTAAGTCTTTGAAGATGCTAAATTCAGGTACCGACAACTTAGACTCAATCCTGAACTCAGGACAGAATGGTTCGAGTAAATATGGTCTTGGGTTTGATGCCTCCATGGGGAGTGCCAAGTTTACATCTGAAGTAAGATTTGTTCCTACTTCAGTAAAAGCAATAACTGAACCAACTTGTACAACTGCGATTACCAATACACTTGCTAAATCTTCCAGATGGATCTGTTATTGCTGTGGTCGAAAAGGTCATATTAACAAGAGACAGGAGGTATTAGCAGAAGGTAAAATTTGAAAATGATTAGAATAATTTTATATTTGCCAAATGTAACAGAAGTATAAGGGGAACTCACATGGTTTGGAGAGTGAAGACATCTGAGAAGTGCAAGATTGCATTTACAATAGTTCAAACCACTAATGGTGCTTGGTACTTTGACAATGGATGTTTAAGACATATGATTGGCAATCGATCATTCTTTACTGAATTAGAGAAATGTGCCTCAGGTCATGTTACTTTTGGAGATGGAGTCAAAGGAAGAATTATTGCAAAAGGAAGCATTGGTAAAAGTAATATACCCTGTCTTAATGAAGTTAGATATGTGGATGGTTTGAAGGCAAGCTTGATTGGTATAAGTCAACTATGTGACCAAGGATATAGTGTAAACTTTAACAACACTGGTTGTGTAGTTACGACAAAAATAATCAAGTATTTATGAATGGTAGACGACAAGCAAATAAATGTTATCATTGGAGCTCCAATAGCTCATACATATGTCACTTAACTAAAATAGATCAAATCTGGTTGTGGCATAGAAAATTGGGGCACATAAGCTTGAGAAGCTTAGATAAAGTTATCCGAAATGAAGCTGCTGTAGGCATTCCTTCTTTAGATATCAATGGCAAATTCTTTTGTGGTGACTGTCAAGTTGGAAAGCAAACTAAAACTTCTCACAGAAGTTTAAAGGAATGCTATACAATCAAAGTTCTTGAACTCCTACATCTTGATCTTATGGGTCCCATGCAAATTGAAAGTTTGGGTGGAAAGAAGTATGTTTTGGTTGTTGTGGATGATTATTCCAGATTTACTTGGATTCGATTCTTAAAAGGAAAATCAGATACTGTTAAAATATGTATCAGTTTATGTTTGAATTTGCAATGAGAAAAGGGGCAAAAGATAATTAGGATCCGTAGTGATCATGGGAAGGAGTTTGATAATGAAGATCTTAATAATTTCTGCCAGTCGGAAGGAATATAACTTGAATTTGCTGCTCCCATAACTCCTCAGCAAAATGGAGTAGTTGAACGGAAGAACAGAACTTTACAAGAAATGGCTCGAGTTATGATACATGCCAAAAATTTACCTTTAAATTTTTAGGCCGAAGCTGTTAACACAGCATGTCATATTCATAACAGGGTTACTATTCGATCTGGTACGACAGTCACATTATATGAACTATGGAAGGGAAGGAAGCCAAATGTTAAGTATTTTCATATTTTTGGAAGTATTTGTTATATTTTAGTCGATAGAGAGTATCATCGAAAGTGGGATGTGAAATCTGAACAAGGAATCTTTCTTAGATACTCTCAGAATAATCGAGCTTACAGAGTCTTTAATATTAATTCAGGAACAGTTATGGAAACAATCAATGTTGTGGTAAATGATTTTGAATCTAATGTCAACCAATTTAATATTGAGGATGATGAGACTTCTATTATACCTGATGTTACTTTTACCCTTCTTAAGGAAATACCTAAACATCATTCTTAGCTAGATGGTACGAATATAAACTAAAAAAAAACTGATAAAGTTATGGAATGAAACCGTACTTGTCCCGTCTGCACATGTGAAAAAGAATCATCCTCCAAGTTCCATAATTAGTGATCCTTCAGCTGGAATCACTACCAAAAAGAAAAAGAAAGTAGATTACTTAAAAATGATTGCTGATTTATGTTATGTCTCAGCAATTGAACCCACATCTATTGAGATTGCTCTCAAGGATGAATACTGGATAAATGCCATGCAAGAAGAGTTACTTCAATTTAAGCATAACAATGTGTGGACCTTTATTCCTAAGCCTGACGGGATGAATGCTATGGGAACTAAGTGAATTTTTAAGAATAAAACTGATGAATCAGGATATGTAACAAAGAACAAAGCTCGTTTAGTGGCTTAAGGTTATGCTCAGGTAGAAGGTGTTGATTTTGATGAAACTTTTGCACCTGTTGCCAGAATTGAAGCTATTCGCCTTCTGGCCGGAATATCTTGTATCCGCAAATTTAAATTGTATCAAATGTAGTGCCTTTCTAAACTGATACTTGAATGAGGAAGTCTATATAGCTCAACCAAAAG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MRRWSSFRSIWACSHSPSSISSSEVAFERSCLLHCSDPLFFLMGCENGLLDHGDNQRGTISFSSSLPKPEVDWTDAEEQASVENARTINAIFNGVDLNVFKLINSCTTAREAWKILEVAYEETSKVKISRLQLITSKFEALKMTEDESVSEYNERVLEIANDSLLLGEKIPESKIVRKVLRSLPRKFDMKETTVNQSDNEVNQDESIAHLTKQFSKMARKFKSMNNAQTTVKTERHDGEKSTRKVNDFSYKRNNDYGKKKEDVMRSFRCRECEGFGHYQAECPTYLKRQKKNYYVTLSDEDSNDIEVDHGMNAFTTCITEINLDDDSECSDIDEDEELTLEKLKMLRKEDLEARAIQKERIQDLMEENERLMGVISSLKVKLKEVQNEYDQTIKSLKMLNSGTDNLDSILNSGQNGSSKYGLGFDASMGSAKFTSEVRFVPTSVKAITEPTCTTAITNTLAKSSRWICYCCGRKGHINKRQETSEKCKIAFTIVQTTNGAWYFDNGCLRHMIGNRSFFTELEKCASGHVTFGDGVKGRIIAKGSIGKSNIPCLNEVRYVDGLKASLIAIEPTSIEIALKDEYWINAMQEELLQFKHNNHVYKLNKALYGLKQAPRAWYERLTIYLGDKGYSRGGADKILFINRTSSELISDPRTSHLTAVKRILKYVHGTSDFGILYSFDTTSTLVGYCDVDWAGSPDDRKNTSGGCFFVGNNLISWFSKKQNCLSLSTAEAKYISIGSACTQMIWMNNMLQEYGFTQETMTLYCDNMSAVDISRNSVRVRGWRFTSTPPRRPYWLPYEKSQGEASSRLHEFVLPESVPVVGESSVPASSIAHAPRVPTTTMSDMNSDDWDDESSSTEGVFIPTSVGDHEFVPDDVPGDISAAPMGQPNDRRDEDEFIREFIVNLPDEFNDPSSPDYQTVHIRRFKFVISSTVVNGFLGNVINVDCSPLSPSTDVYMASLLSEKPTPITSASSDEDKSFYKAWEISNRLSLMFIRMTVANNIKSTIKKIEDAKEFMKSVEKCSQLESTDKSLAGTFMSTLTNIKFDGSHTIHEHILEMTNLAARLKIIGMEVNENFLVTFILNSLPSEYEFDLSIDNDPISFSQAIKGDNSTKWLDAMKEELKSMNDNKVWNLVELPKESKRVGCKWVFKTKCDSNDNIERYKVRLVVKGYTQKDDIDYKETFSPVSKKDSLRIIMALVAHYDLEFHQMNVKTVFLNENLDEKVFMDQLEGFMVEGKERMVCKLKRSIYGLKQASRQWYLKFNDTITSFDFKENIVDRLIYLKISGSKFIILVLYVDDILLATNDFGLLCQTKEFLSKNIEMKDMDEASYVIEIETISYVSIVGSLLYVQTYTRPDISFAMDMLSRHQSNQEWIIGKLQRKF Homology
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0041441.1 (gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24315.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 862 bits (2227), Expect = 1.70e-296 Identity = 506/761 (66.49%), Postives = 508/761 (66.75%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. NCBI nr
Match: TYK30437.1 (F5J5.1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 635 bits (1638), Expect = 1.45e-197 Identity = 506/1464 (34.56%), Postives = 610/1464 (41.67%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0035966.1 (F5J5.1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 634 bits (1635), Expect = 4.46e-197 Identity = 505/1470 (34.35%), Postives = 608/1470 (41.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0033000.1 (putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK03409.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 597 bits (1540), Expect = 1.49e-191 Identity = 412/892 (46.19%), Postives = 465/892 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. NCBI nr
Match: TYK03068.1 (gag-proteinase polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 569 bits (1466), Expect = 2.09e-187 Identity = 312/406 (76.85%), Postives = 338/406 (83.25%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P10978 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 5.1e-55 Identity = 129/345 (37.39%), Postives = 185/345 (53.62%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P04146 (Copia protein OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=GIP PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 176.0 bits (445), Expect = 2.9e-42 Identity = 110/329 (33.43%), Postives = 169/329 (51.37%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94HW2 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 172.9 bits (437), Expect = 2.5e-41 Identity = 106/334 (31.74%), Postives = 168/334 (50.30%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZT94 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE2 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 172.6 bits (436), Expect = 3.2e-41 Identity = 106/331 (32.02%), Postives = 167/331 (50.45%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CV72 (Secreted RxLR effector protein 161 OS=Plasmopara viticola OX=143451 GN=RXLR161 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 1.6e-16 Identity = 39/102 (38.24%), Postives = 65/102 (63.73%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TIF9 (Gag-pol polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold205G00860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 862 bits (2227), Expect = 8.22e-297 Identity = 506/761 (66.49%), Postives = 508/761 (66.75%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E2Y4 (F5J5.1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold349G00460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 635 bits (1638), Expect = 7.00e-198 Identity = 506/1464 (34.56%), Postives = 610/1464 (41.67%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T169 (F5J5.1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold56G001730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 634 bits (1635), Expect = 2.16e-197 Identity = 505/1470 (34.35%), Postives = 608/1470 (41.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SQ17 (Putative mitochondrial protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold121G00050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 597 bits (1540), Expect = 7.20e-192 Identity = 412/892 (46.19%), Postives = 465/892 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BVP5 (Gag-proteinase polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold46G001710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 569 bits (1466), Expect = 1.01e-187 Identity = 312/406 (76.85%), Postives = 338/406 (83.25%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G23160.1 (cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 ) HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 1.8e-47 Identity = 92/226 (40.71%), Postives = 144/226 (63.72%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. TAIR 10
Match: ATMG00820.1 (Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) ) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 6.2e-16 Identity = 46/117 (39.32%), Postives = 69/117 (58.97%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. TAIR 10
Match: ATMG00810.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 6.5e-13 Identity = 32/96 (33.33%), Postives = 56/96 (58.33%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. TAIR 10
Match: ATMG00240.1 (Gag-Pol-related retrotransposon family protein ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 1.2e-06 Identity = 28/75 (37.33%), Postives = 40/75 (53.33%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh101225.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G05360.1 (Zinc knuckle (CCHC-type) family protein ) HSP 1 Score: 47.8 bits (112), Expect = 8.5e-05 Identity = 76/301 (25.25%), Postives = 126/301 (41.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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