Tan0021021.1 (mRNA) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTGCAAAATGGCGAGCTCTGCAGCATCGCCACCGCTATACTTACAGCGCCGTCGTCTTCCCTCACTCCTATGTCGATTCTCTCAATTCCTTTCAATCCCAACACCAATCCTCTTCAAAATTCTTCACTGAATTACTCGAACTGGTGTCATTAAACTCCGTTTACGCCCAAGTGAATCACGCCAAGAAAGTCGCTTCCGCTTTTGCCGAGTTATTGGCCAATGGAGACGAGGATTTGGTGTCCAAAGCCGCGCGGTTTTACTTGGAGGTTTTGTTCTGTGAGAACTCCCAGCCTTTGCATCGAACCCTCGTTTCCACTTTGGCCAAAAGCCGTAAATTTCAGGATTCATTAGGAGAGTGTTTCAGGAATCTATGTGAGGAGCATAGTGGTGTTCAACAATGCCAAGGGAAGCGGTTCTGTGTGTCGAGGGTGGCTTTATCGGTAATGGGTATGCCTAAACTGGGCTATTTGGTGGATGTGATTAGAGATTGCGCCATTTTGGTTGCTAGGGATATTGTTTTTGGCTTGGACTCTGTGGTTAAGGAAACCAATGAGTGGGCTAGGCCTTCTCCAATTGTCATGGAACAGTGTCAAGAGGCTTTGTCTTGCTTGTATTACTTGCTCCAGCGATTTCCCTTCAAGTTCCAGGAAGATTCTAGTGTTATGGAGATGATTGTGAGTACCATTTTAAGCATTCTGAAATCCTTGGCTTTTTCCAGGGATTGTTATGTGGCAGCTGGGGTTAGTTTCTGTGCTTCTCTGCAAGTGTGCCTCACCTCGGACGAACTTGGGGTGCTCATCTTTTATGGATTTTTTGAACAAACTAACCACATTTCATTTTTGAAGTACAAAAGTGAGTTTAAGAATGCTGTTGCGAAGGTTCCTTATCAAGGGAATTTCTGCACTGAAATTCAAACTTTTTCGGTTTTGAGTAGACTCTGCTTTATCAGGGGGATTCTGACAGCAATTCCAAGACCTGTGCTCAATATACAATTTTCTATGACCGAGGGAGATTTGAATGGCCATTTAGGTTGTCTAAATAGTGGTAACTCTGTCGAAACAATACTCTATGATGGGATTTTGTCTGAGCTGTGTAACTATTGTGAAAATCCTACAGATAGCCATTTTAACTTTCATTCATTGACTGTACTGCAAATTTGTTTGCAACAAATAAAAACCTCCTTAGTTAGTGATCTTACTGATACATCCTGTAGTTATGATCCACTCCCTGAGGAGATGGGAAGTCGAATACTAAGAATCATGTGGACTAACTTGGATGATCCTTTAAGTCAAACTGTCAAACAAGTGCATCTAATTTTTGATCTCTTTTTAGAGATTCAATCCTCACTTTGCTGGTCAGAGGGCAGCGAGAAAATAAAGTTGTACTTGCAAAAAATCGCTTTTGATCTTCTTCATTTGGGTTCTCGCTGTAAAGGGAGATATGTTCCTTTAGCCTCTTTGACCAAGAGGTTGGGTGCGAAGGCATTGTTAGATATGAGTCCTTCCCTGCTATCAGAAACTGTACACGCATACATTGATGATGATGTGTGCTGTGCTGCCACCTCTTTCTTGAAGTGTTTCCTTGAGCACCTACGTGATGAGTGCTGGAGTAGTGATGGTATTGAAGGTGGGTATGCACTATACAGAGGCCATTGCTTGCCCCCCGTTCTGTACGGACTTGGTTCTGGGATATCAAAGCTGCGCTCAAACTTGAACACTTATGCTCTTCCAGTATTGTTTGAAGTTGACCTAGATGGTATATTTCCTATGCTTTCTTTTATCTCAGTCTGGCCTAGTTCAGTTGACAATGGAGTTCTCTATCCTGTTAATAATCAAGGTATTATGGAACTGAGAGTTGAACAGAAAGTGGCCATTTTTATTTCATTGCTAAAAGTATCTCGTTCACTTGCTTTGATTGAAGGAGACGTTGATTGGCTAGAGGAACCTAGCTTAGAGCAACAATCTGTCCATGAAATAGAGTATTTTAGTTGTCATGCTCTTGTTTTCATCAAGGGAGTAAAGGTTCAAATCCTTGTTGATTGGCTTGTATTGGCGTTGACACATGTTGATGAGTCACTTCGTGTGGATGCTGCAGAATTTCTTTTCTTAAACCCGAAAACTTCTAGTCTGCCATCTCATTTAGAACTTACCTTGCTGAAGAAAGCAATACCATTGAATATGAGATGTAGCTCTACAGCTTTCCAGATGAAGTGGACTAGCTTGTTTAGAAAGTTTTTTTCTCGAGTACGAACAGCTTTGGAGAGACAATTCAAGCTGGGTAACTGGATACCACTTGCTTCTTGTTGTAATAGTGAAAGCTATCCGCAAAATGGAAGTGAGCAAATTATAGCTGGTAGAGCGGATGCTCTTTTTAATTTTATGAAGTGGTTGAGTTGCTTTCTGTTTTTCTCATGCTATCCTTCTGCACCTTACAGGAGAAAAATTATGGCGATGGATCTACTTTTAGTAATGCTTAATGTTTGGTCAATTGTTCCTTCTAAACGAAAGTCTAATGAAAGTCTTCTCCAACCCTATAACGAAGGAATTACTTTACCTGATTCTGTTCTTTTGTTAGTTGGATCAATCATTGATAGTTGGGATAGACTGAGAGAAAGTTCTTTCCGTATATTGCTGCACTTTCCTACTCCACTGCCTGGCATTTCTAGTGAATATATGGTGGGAAAAGTTATCACATGGGCGAAAAAGTTAGTTTGCAGTTCACGTGTCAGAGAAAGTGATGCTGGAGCACTAACATTACGGCTTGTATTCAGAAAGTATGTCTTGGATTTAGGCTGGATAGTCAGAGCTTCAGGTGATGTTGGTTGCTTAGATTCTGAGCTTAAATTACCAAAACTGGGTGAGGAGATATGTAACTCAACCCATCCGGTGGTTGAATATTTGAAATCCTTGATTGGTTGGTTGAATGTCTCTGTAACTGAGGGAGAGAGGAATCTCTCTGAAGCATGCAAAAACAGCTTTGTTCATGGCGTGTTGCTCACTTTGCGCTATACTTTCGAGGAGTTGGATTGGAATTCAGATCTTGTGCTATCTAGTGTCTCAGGGATGAAAAGTCTACTGGAAAAGCTTTTGGAGCTTGTGATGCGAATAACCTCTTTGGCACTCTGGGTGGTTTCAGCAGATGCCTGGCATCTTCCTGAGGATATGGATGACATGGTTGATGATGATACCTTTCTGCTGGATGTTACAGATGAGGCTGATGTGTCCATGTCCTCGTCTGAGCTCCAAGATAGTAAGGATGAAGCTACAGTAAATTCAAGAACATCGGAACAGAGTGTGATGGTTGGCTGTTGGCTTGCCATGAAAGAGGTATTTTACTTTTTGATTGTCTCCGATTCATTCATTTGGTAGTCAGAGCCAAACTACCCATAGAATTTCTTCATCCTAGCGTTTATTCATCCTGCAAAAAAAAAAAAAATTCATTCATTTGGTAGCCTTCCTTACATCTAGTGTTACTTCTTATCTCTCTCTACTTTCTTTAGGGTCTAGAATTTTTACTTACGACTAGCAAGTAACAGTGAATGTAATAAATTGAACTGAAGAAATGTTAACGCCCATAGTAATCATCATTATACTAGGGAATTATATTTAATCTCAGGATGGGAGTTGAGATCGTTTGTTCACGGTGGATATTTCCCTTGATCTCTTTCTGCTGGCCATTTGCAGGTTAGTCTTCTTTTGGGAACAATCACAAGGAAGCTGCCTTTGCCTGCTGCTTCTGATTCAGTTGAATCTGATCCCAGTGCTTCCATTATATTAAAGCAAGATGAAGTACTCAATTTAAGACAACTTAAAGTGATTGGTGACCACTTTTTGGAAGTTCTTTTGAAAATGAAACACAATGGTGCAATTGATAAGACAAGGGCGGGATTTACTGCTCTTTGCAACCGCTTACTTTGTTCAAATGACCAAAGGTATGTATCTTTTATAGTTTTTGCATGAATTCAAGCTTCCATATCTTATATTTCATTCCTTGTCCTAGAAAGGTAGGGAAAATAAAATTGTTTTGCTTGTACTTTAATTAAAAATCTCGTAGTGTCTTTATGTTTTGGGAAAATTCAAGGATTTTAGGAAAAATTCAAACTTTATCCTTGAATTCGGACTCATAACCTTCTCGAGTCATTAGCTTTTCTGGCTTTATCTTGGTGTAATAATATCTCTCCTTTTTGCAATTATAGTTTGAGCTTTCTTTGATCCAAATATCTTGCTGGTGTCGTTTTTCTTTGAAGACCAATCAATTTTGTATTAGGACACTTGGATTAGAGAGAAGTTTTTTGTAACTCTCTTGGATTGGGGACTTTCCCTTTCTTTTTTAATCCCCCCTGTTTAAATTACTTTTTCTATAGTATAATATAATATGTTGCCTTCAGCCTTTTTTTTTAAATAACTTTTATGGATTAAATTTTGTTTTAAAAAAGGTTAATTAACTTTTATGGAAAAAATAAATTTTTTTGTATAAATTTGCACTTTAAACTTCAATTTAATTAAATTGGACGATAGACTTAGTTAATTGTTGTAATTTATGCCTTCTATTCAATTTCCACTAATTCATCCCTAAGTTTAATGAAAAGAAATGTGAAAATTTTTATAAAATCACTAATATCAAGTTTTACACAAATTTAAGTTGGATTAATGTACAAATATTGATTAAATAACTCTTCCAAAACTCCTAAATTTAAACAAAAATGTAGCTCTAACGTCATTTTTTCTTTGAATTCTTATCAATTTTGTACCATACATATGTTTTATAATTCATTGAAAATATATGCTAATACTTTTTTGGATTTATAATTCTTTAAACTATTATTTTTGTATTTTTCGAGTAAAAAACACTTTTGGTCTCTAGGATTTAAACTACTTCCTATTTGTTTACTAAATTTTAGAACTAACACTTTTAGTTTTTGATATTTGAACTTAGTTTATATTTGATTCTATGAGATTTCAAAAGTGAGAAGGGGATCTTTTCACTTTGT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MSAKWRALQHRHRYTYSAVVFPHSYVDSLNSFQSQHQSSSKFFTELLELVSLNSVYAQVNHAKKVASAFAELLANGDEDLVSKAARFYLEVLFCENSQPLHRTLVSTLAKSRKFQDSLGECFRNLCEEHSGVQQCQGKRFCVSRVALSVMGMPKLGYLVDVIRDCAILVARDIVFGLDSVVKETNEWARPSPIVMEQCQEALSCLYYLLQRFPFKFQEDSSVMEMIVSTILSILKSLAFSRDCYVAAGVSFCASLQVCLTSDELGVLIFYGFFEQTNHISFLKYKSEFKNAVAKVPYQGNFCTEIQTFSVLSRLCFIRGILTAIPRPVLNIQFSMTEGDLNGHLGCLNSGNSVETILYDGILSELCNYCENPTDSHFNFHSLTVLQICLQQIKTSLVSDLTDTSCSYDPLPEEMGSRILRIMWTNLDDPLSQTVKQVHLIFDLFLEIQSSLCWSEGSEKIKLYLQKIAFDLLHLGSRCKGRYVPLASLTKRLGAKALLDMSPSLLSETVHAYIDDDVCCAATSFLKCFLEHLRDECWSSDGIEGGYALYRGHCLPPVLYGLGSGISKLRSNLNTYALPVLFEVDLDGIFPMLSFISVWPSSVDNGVLYPVNNQGIMELRVEQKVAIFISLLKVSRSLALIEGDVDWLEEPSLEQQSVHEIEYFSCHALVFIKGVKVQILVDWLVLALTHVDESLRVDAAEFLFLNPKTSSLPSHLELTLLKKAIPLNMRCSSTAFQMKWTSLFRKFFSRVRTALERQFKLGNWIPLASCCNSESYPQNGSEQIIAGRADALFNFMKWLSCFLFFSCYPSAPYRRKIMAMDLLLVMLNVWSIVPSKRKSNESLLQPYNEGITLPDSVLLLVGSIIDSWDRLRESSFRILLHFPTPLPGISSEYMVGKVITWAKKLVCSSRVRESDAGALTLRLVFRKYVLDLGWIVRASGDVGCLDSELKLPKLGEEICNSTHPVVEYLKSLIGWLNVSVTEGERNLSEACKNSFVHGVLLTLRYTFEELDWNSDLVLSSVSGMKSLLEKLLELVMRITSLALWVVSADAWHLPEDMDDMVDDDTFLLDVTDEADVSMSSSELQDSKDEATVNSRTSEQSVMVGCWLAMKEKYKFSDLSFLYRLCKLTESWMDQLMERTTAKGQTVNDLLRRSAGIPAAFIALFLAEPEGSPKKLLPRALKWLIDLAEKLLQNPIDTDCKIGNFSKLPSTELGQDTESVSPHETYTSEKASKIRDEGVIPTVHAFNALRAAFNDTNLATDTSGFSAQAIIVSIRSFSSPYWEVRNSACLAYTALVRRMIGFFNVHKRESARRALTGLEFFHRYPALHRFLLDELKVATESLDDGYSGNSESNLAKVVHPSLCPVLILLSRLKPSTIASEAGDDLDPFLFMPFIRKCSSQSSLRIRILASRALTGLVSNENLPSVILNIVSGLPVDDNTMMAPESGILLGATATTQHASYNRIHGILLQLISLLDTNCRNLADISKKSQVLNDLVEVLAPCSWMARRGYCSCPIVSTSFLRVLGHMLSIVRTCPRSRNFYIIRNLLLDLSTESLDVETSHELLYYDPTLAELRQQAAICYFNCVLQPFDEEDDAVLQKSQRSQSDEDVPATVIDYPFSQLQERLIRSLQDPCYEVRLSTLKWLFKFLKSTEYSAVFYDLSSHEIRTIDHWIKTSLQSLLTELLSLEKNHRCLYYILKNLFAWNMSQFQKFGKEKGTEEVVYIGEMDCGSVLQFWDKLVSLYKRTRHAKTRENTIRCMGTCIKHFAVLCSTSIVSGAMTTNSPKDKISNNLEKFHACITLFTDLIRQHSDASEPVNMRTAAADSIIASGLLEQAEIFCDFVFDNQIPQETSNSYFEQREYVNMYAHQILNIWSTCIMLLEDEDDVIRKRLAADVQKCFSTERTTTSSNVPNQVEQVIGSSFEYLSSIFGHWVLYFDYLAKWVLSTENFAVSQADPVRRVFDKEIDNHHEEKLLISQTCCLHMEKLSKSKLVALWDTQWFINYLVGLRKRFFHQLIKFSDEHLSKHGGFDWIGGAGNHKDAFLPLYANMLGFYALSNCIINGKTQVNMQPLITEVVEIGKIISPFLRNPLISNLYLLVIRIHKEVIDVNRDHKIPDLGHEVIWESFDPYFLLR Homology
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8C754 (Thyroid adenoma-associated protein homolog OS=Gallus gallus OX=9031 GN=THADA PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 176.8 bits (447), Expect = 2.6e-42 Identity = 295/1404 (21.01%), Postives = 546/1404 (38.89%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8C750 (Thyroid adenoma-associated protein homolog OS=Canis lupus familiaris OX=9615 GN=THADA PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 163.7 bits (413), Expect = 2.3e-38 Identity = 255/1198 (21.29%), Postives = 458/1198 (38.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8C756 (Thyroid adenoma-associated protein homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Thada PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 3.0e-38 Identity = 255/1185 (21.52%), Postives = 448/1185 (37.81%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8C752 (Thyroid adenoma-associated protein homolog OS=Chlorocebus aethiops OX=9534 GN=THADA PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 162.5 bits (410), Expect = 5.1e-38 Identity = 249/1187 (20.98%), Postives = 456/1187 (38.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6YHU6 (Thyroid adenoma-associated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THADA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 161.4 bits (407), Expect = 1.1e-37 Identity = 260/1253 (20.75%), Postives = 471/1253 (37.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6580971.1 (Thyroid adenoma-associated protein-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 3686.7 bits (9559), Expect = 0.0e+00 Identity = 1867/2202 (84.79%), Postives = 1974/2202 (89.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038903869.1 (thyroid adenoma-associated protein homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3682.5 bits (9548), Expect = 0.0e+00 Identity = 1871/2200 (85.05%), Postives = 1977/2200 (89.86%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022983680.1 (thyroid adenoma-associated protein homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 3682.5 bits (9548), Expect = 0.0e+00 Identity = 1857/2201 (84.37%), Postives = 1974/2201 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022934862.1 (thyroid adenoma-associated protein homolog [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 3680.6 bits (9543), Expect = 0.0e+00 Identity = 1863/2202 (84.60%), Postives = 1974/2202 (89.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023528451.1 (thyroid adenoma-associated protein homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 3672.9 bits (9523), Expect = 0.0e+00 Identity = 1858/2202 (84.38%), Postives = 1973/2202 (89.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J6K6 (thyroid adenoma-associated protein homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482224 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3682.5 bits (9548), Expect = 0.0e+00 Identity = 1857/2201 (84.37%), Postives = 1974/2201 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3Z3 (thyroid adenoma-associated protein homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441902 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3680.6 bits (9543), Expect = 0.0e+00 Identity = 1863/2202 (84.60%), Postives = 1974/2202 (89.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UJ45 (Thyroid adenoma-associated protein-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G008110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3662.8 bits (9497), Expect = 0.0e+00 Identity = 1857/2201 (84.37%), Postives = 1965/2201 (89.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B8Q1 (uncharacterized protein LOC103487009 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487009 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3662.8 bits (9497), Expect = 0.0e+00 Identity = 1857/2201 (84.37%), Postives = 1965/2201 (89.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BVK0 (thyroid adenoma-associated protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005108 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3652.4 bits (9470), Expect = 0.0e+00 Identity = 1860/2203 (84.43%), Postives = 1971/2203 (89.47%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021021.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G55160.1 (unknown protein; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF2428, death-receptor-like (InterPro:IPR019442); Has 357 Blast hits to 330 proteins in 163 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 144; Fungi - 118; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 45 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 2192.2 bits (5679), Expect = 0.0e+00 Identity = 1212/2223 (54.52%), Postives = 1512/2223 (68.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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