Spg035450.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg035450.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold3: 4169015 .. 4176403 (+)
Sequence length714
RNA-Seq ExpressionSpg035450.1
SyntenySpg035450.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTCTTTCTTAGCCACCGACCCTTTCCCTCACTCTCTTTTCTTCTTCTCCATGAATCCTCGCCACCGATTGTTGTTCCTTCATCTTCGATCACCTCCGACGAGCGCAAGGGTCTAGGCGATGGGGTTCAGCGGTTTCAACGGCTTCACGCGACGACAACGAGATTAATCTATCTCTCAGTTTTCTCTCTCTTTTCCTCTCGATCTTTGTCGATCTCTCCCTCTCTCCCTCGCGCAGACCTTCCTCGGATTCGAGCATCATCTTCAGCGAGAACAACAGGCTTGGACGCACGACGACAACAACAAATTTTGGCAGGTCCTCCACACGAACAGTTTAGCAACATCAGGTCTTCATTTTTTTTCAGCGATCCCAGTGCAGCGACACAACTTTGACGTGTTCTCGAGTTGGGTAGGCGACGTGCAGGTAGCGTGGGAAATATTTTTAAGATTCAATTTCTAGTGAATTTATCGATTGGAGTTTAGTTTTTTAATTTCTAGGTTTTGGTTTTGTAATTTCAAGATACTGGAGATTCCATGGGTTCTTTTCAAGTATCTCATGGAGAAGTTGGCATCTTGCTTGACCAACTCAATTTAGAAAGTGACATTCTACCGAGAAAAAAATGATTAACAAAAACGAGAATAAAATCTGTTGGAATTCTCATTTTCAAAATCTTTTGAAAGTTTTCATTTTCCCTCCTGTCTAATGGAGCTTTTTTTTAGGGGGGGGGGTTGTGGTTGACTAATTTGCTACCCGAGAAGAAAACTAAAATCTATAAGAAGGGAAGTACATGAACATTTTCTTATACGAGGAGAAGGTTGCTTTTATAAGCATTTGTTACTGTGAGAAAACATACATATTCATATAAGCAATATATGGAAAACATTTTAATATTGATTACGCTAGTTGAAAAAGGAATGGGGACCTCATGATTTAGAGAAAAAGATGTAATTGGAAGTATGTAGGTTTAGTTGATCGCTCGACAATCTAATCTGTATACCCTTTTTCTTCCAATCTGATGCAACAATGCTTAATTTTGGAAGTTTTGAGTGCGAGCGATCAAAATTAGTTTTTGTTGTTTGATTTTGTGTTTATTTGATTTTTAGCAATGAATGATTGGATTTCTCTTTGTGGAAATTTGGGAAAGGATTAGAGATGGCGGGACTTGGGAATGTTCTTGGCCTAATGGATTTGGTTGCAAAGTGTTTGTGAAAATGCCTGTATGAGCTCATGAAAGATGAATTTTAATTTTTTGCCTTTGATATTATTTTGAAATTGAAGTTGATCCTTTTTTGTTTCTTTGTCTGATATGGTCTCTTACATTGTTTGTCACCCTATTATCTACAAGTTGAAGACAATTGCTTTGGATGTTGGATTGTTTTGGGTTTTCTATCTAGTTTTCCTCCTGTTGTGTTGTGATTTCAAATGATAACAGTTCCAATGTGCTTTTCGATCTTGCGAGTTCTGAAATTTGGAGCCCACACTTTAGCTAATTTATGGAGGGAAAATTTCCATCCCTTGAACAGGAATTATGGTCAACCTAGAGCTTGTAAGGTATTTTGTTCAATGATATGTTTTGACAATGCACAAGTGACCGGTTATCCACTATAACTATTTGCTATATATCTCTTCAGTCTTCCTAAAACCTCTCTCTGTGAAATGAAATGAAAATTAAAGGGGATATTATTTGGTTAATTTTTTGGGCAATAATTTATTCACGAATCTTACATGCCTTGTTTTCTCTACTCATTTAGATTTTGCACCAGTGTAGAAGCTTCATACATCTCAGAAACTTTTCTCACCTACTTTCCCCTGGTAATTTTGATTACAGCTTCTCTATATACTTGTTTAAGCTCCCACCTCATGCAACTAGTTCAAATATAAATTTTGAAACTTAAAGTCCAAATGGGACTTGTAACTTTGGTGGTTGTTCTTTCCCTTGTTTTATTTTTATTTTTATGTGAATGATCCAGGTTATTTCCCCTTATAAGTCTTGCATGGTTGGTATACTTCTCTGCTTAGGCAAAGTAGTTCTTCTCTTGCCTTGCATTATACATTCAATATAGATATGTTAGCTACCTTTAGTAATTCCTTATGGGGTGTTTTCATGATGTTCAAACTCTTATTAAAAAGAGGATGTTCGCAAGATTCTCGAGTGCAAGGATAGTGATGTGACTGATGTCGGCCAAAGGGGTACTTTCTTTCTTTTTCCCCATTTTATCCATATCTATTTCTTATTGTTGTTTGCATTTTGGTGTTTTTATGGATTTTATCTTGTTTTATGAACGGTTGATTCTCAATTTTGGTCCACATTGGATTCTAATCTTATCCAAATTTGTATACTTATCTTCTTGTTTTGTTGGTTCAAATATTCTTGTACATTTGAGGTTCTTTTCCTATTGGAATAGTAGTTAGACACTCAGAACAAAATAACTTTTTAGTTTCTCAGGTTAAACAAATCTGAATGGTTTTAACTTCTTTGGATAATCTAATGGATCTGTTTAGTTTCTAACTTGTTAGTAATTTAAATATAAACCAAGACCCTTCACAAGGATTAAACTTTTTTATGGATATCCATGGTGCATTAAGGATTTTGTTTCCCTTCAATATTTTTTTGAATGGGAGGAAATTAAATTTTAGGTGGAAACATGATGCATACTCCCATTAATATAAAATAATAATAATAATAAAATCCAAATATGAGTGCCCAATGTCAAGTTCAAAAGATAGGAAAAAACTACCATCAAAATTGATCACTATCAAAGTCATGAAAATTGATCGCTATCAAAGTCATGGTATGGGTACTATGACTATCCTGCAGTTATGGTAGTCATAGTTTTGTTATGATTTTTGTTGGTAAGTTTGTTTTCCATTGAGTTGTTATGTTCGCATTCTGATCTTTTAATAAGTTGTTACACTCTCGTTTATGAGGATCACTACATTGATGCACTTTGTTGTTTGAATAAGTTTAACAATTTTGGTTGATAAGTTTAGTTGTTTCATTGAAAATGTTTTGATCATTTGAGTTACGTTTAGTCTCATTTGTTTCTCGTTAAGTTGCGTTTATGAGAATCGCTACATTGTTGCACTTAGTTACCTCTGAAATCTGTGATTCCAAGCTTTTGTGTGTAGTTTTGCTCTTCGCCTAGAGGTTTTGACTTCAAGCTTTTGTTAACAAAGATGGTTGAAGGTTTCTAGATCTTGAGAAATATGAGGTAATAAGTAAATCTTTTGAAATGGTGCTTTTATTCTCAAGGATTTCTTTCATTAGTTTTCACTCATTTCTCTTCCTCAAACCTTTGAACAAAACACATAAGCAAACAACCTCATCCCCCAATTTTCTGCTCTTCATTGCAAACTAATGAAAGAACATTCCTGCTCACAATATGGAGCTTAGCTGTTTCTTATTTTGTATACATTTTTCTATTTCCTTTCGTTTCTTTACCATGTATGTGTATATATATCTATTTATTTATTTATATTTTAAACGTTTGTTCTCTCTCTGTTATTTTTTTTTACAAAGAACATTTATGTTTTTCTTGTAGAGGATTTTTTCAATAGTGTAGACTTTGCTATCTCTTTAAATATTTGTTATGTTTTTAAACTTGAGTTAGTCAATATTCATATGATTTATTTCTTTGAACTTTGGTTAGTGAAGCCTTGTGCATTCAGAGTAATAATAATTATCTTGTGGTTATCCTTTGCTCATAATAATCTTGTTCAGATTCTTAGCAATAGTATATTAGCTTTCACAAATCAAATATATAGAAAAGAAGAGAGAGAAAGAGGAATGGTGTGTGTAGTTCGTTAAATGTAAACTGTTCTTTTCTTTGAAAGAAAATTCACTAATAGGTTGGTTTGTGCAAGCCATTGTCTAATCAATCATGTTTAGAACATAAGTTTCCTATTTAAAATTTCCTTTGTTAATAAAATACTCCTTTGAGTTTGTTTGTTTAAAACATAGGCAATGTAAATGCATATATACAGAGACTTTTGTATCTATGGTTTTTGTTCAATATACAATCTTGTAGTTATATGCTCCTCGTTGTGTACCCTCCAAAACTTACATATTTATATATATTTGTGGGATTTGAAAATAAAGAACATTCTTTTTGTCTAAGCTTAGTTTGGCATTACATTTTTTAAGTCTTCTTTAAATTGAAGCTTTGTGTGATTTTGAAAGTTATGGCTTTTAGTTCTTGAACTAGTATTTTCTATCTTTCCAGTAGTGGCAACAAAATTTTATCTATGTAACTTTTTTACTTCCTAATGTTATGTATAGGACAACCCATGTATAGTGGTATGGTGGAGGATTGTTGTGGCTATAACACTGTAAGCCAACTTAATGAGAAAAGTATTATATCCATCCCTCCAAGAGCCTGTTAAGGCACCATTCTTTTTCTATTTGAAGGTTGAGAGAGTTAGAGACGTTAAATGGAGAGTGGAGCTCGAGGCTATGTCTAAGAGCTGAAATTGAAAGTATTTTGGACGATTAGCACTGTGATTACGACGTTGACAAAGCAACACGTGTTGGCAGAGGTGGTGGAAGAGCATTATTTGGGGATGGAGAGACTGGTTTTTAGAGTCAAAGGAGGCGTAGGCATTGTGTGTCAGAGTGTAAACTTCCAAACAAAGCTCATTTTGTCCTGTTTACATATCATGAATCATATACCTTTGCCTAGTTTGTAAGTTTAGCATCATTGTTTCAATGAGCTCTCGATTTACTTTCTTTGGTTTGTTGAGCTTGTATAGATTTTTGCGCTGTTGATGTACTTTGAAGATGTGTTACTGTTTTTGCTTAATGTGAAGTAGATTTTTTCTTTTTTTGTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGTTGTATTTGAGAGCTTTAGTTGGGGAAATTTTGAGGTTTTTATTTGATTGTTTAAACATTCAAAGGAAAAATGACAAATGACTAATTTCTGCAAGGATTTTGTGTTGCGTTATGTTGTGTATGCTTGGTGATATAACACTAATTAACAG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mRNA sequence

ATGTTCTTTCTTAGCCACCGACCCTTTCCCTCACTCTCTTTTCTTCTTCTCCATGAATCCTCGCCACCGATTGTTGTTCCTTCATCTTCGATCACCTCCGACGAGCGCAAGGGTCTAGGCGATGGGGTTCAGCGGTTTCAACGGCTTCACGCGACGACAACGAGATTAATCTATCTCTCAGTTTTCTCTCTCTTTTCCTCTCGATCTTTGTCGATCTCTCCCTCTCTCCCTCGCGCAGACCTTCCTCGGATTCGAGCATCATCTTCAGCGAGAACAACAGGCTTGGACGCACGACGACAACAACAAATTTTGGCAGGTCCTCCACACGAACAGTTTAGCAACATCAGATTTTGCACCAGTGTAGAAGCTTCATACATCTCAGAAACTTTTCTCACCTACTTTCCCCTGTTTTGCTCTTCGCCTAGAGGTTTTGACTTCAAGCTTTTGTTAACAAAGATGGTTGAAGGACAACCCATGTATAGTGGTATGGTGGAGGATTGTTGTGGCTATAACACTGTGTATACGTCCATTGTGCAAGGGATCTTTGTGCGTGCTTTTATTATTTCTCGAAGAGCACACGAATACAATGATCTCACAGCATCACAAAGTAAAGGTTGTGCCTACCGTTTACAAGGAAGTGAAAGGAAAGGTTATAAAGTCAAATCAGGTGATGAGGATTACTACGAACCGGGTGATGCTGAGGAAGAGGTCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTCTTTCTTAGCCACCGACCCTTTCCCTCACTCTCTTTTCTTCTTCTCCATGAATCCTCGCCACCGATTGTTGTTCCTTCATCTTCGATCACCTCCGACGAGCGCAAGGGTCTAGGCGATGGGGTTCAGCGGTTTCAACGGCTTCACGCGACGACAACGAGATTAATCTATCTCTCAGTTTTCTCTCTCTTTTCCTCTCGATCTTTGTCGATCTCTCCCTCTCTCCCTCGCGCAGACCTTCCTCGGATTCGAGCATCATCTTCAGCGAGAACAACAGGCTTGGACGCACGACGACAACAACAAATTTTGGCAGGTCCTCCACACGAACAGTTTAGCAACATCAGATTTTGCACCAGTGTAGAAGCTTCATACATCTCAGAAACTTTTCTCACCTACTTTCCCCTGTTTTGCTCTTCGCCTAGAGGTTTTGACTTCAAGCTTTTGTTAACAAAGATGGTTGAAGGACAACCCATGTATAGTGGTATGGTGGAGGATTGTTGTGGCTATAACACTGTGTATACGTCCATTGTGCAAGGGATCTTTGTGCGTGCTTTTATTATTTCTCGAAGAGCACACGAATACAATGATCTCACAGCATCACAAAGTAAAGGTTGTGCCTACCGTTTACAAGGAAGTGAAAGGAAAGGTTATAAAGTCAAATCAGGTGATGAGGATTACTACGAACCGGGTGATGCTGAGGAAGAGGTCTGA

Protein sequence

MFFLSHRPFPSLSFLLLHESSPPIVVPSSSITSDERKGLGDGVQRFQRLHATTTRLIYLSVFSLFSSRSLSISPSLPRADLPRIRASSSARTTGLDARRQQQILAGPPHEQFSNIRFCTSVEASYISETFLTYFPLFCSSPRGFDFKLLLTKMVEGQPMYSGMVEDCCGYNTVYTSIVQGIFVRAFIISRRAHEYNDLTASQSKGCAYRLQGSERKGYKVKSGDEDYYEPGDAEEEV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg035450Spg035450gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg035450.1-cdsSpg035450.1-cds-scaffold3:4169015..4169361CDS
Spg035450.1-cdsSpg035450.1-cds-scaffold3:4170767..4170827CDS
Spg035450.1-cdsSpg035450.1-cds-scaffold3:4172145..4172202CDS
Spg035450.1-cdsSpg035450.1-cds-scaffold3:4173295..4173344CDS
Spg035450.1-cdsSpg035450.1-cds-scaffold3:4174583..4174679CDS
Spg035450.1-cdsSpg035450.1-cds-scaffold3:4174798..4174851CDS
Spg035450.1-cdsSpg035450.1-cds-scaffold3:4176357..4176403CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg035450.1Spg035450.1-proteinpolypeptide