Spg030462.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg030462.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold6: 31960045 .. 31967068 (-)
Sequence length570
RNA-Seq ExpressionSpg030462.1
SyntenySpg030462.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTGTTACGTCTGGAACGATTTTCTAATCAAAACAGCAGCTTGTTCTCGGTTTTCTTCTTCGATTTCAGCCGCGGTTTGTTCAATTTTTATCATAAAAGCTTAATCTAGACCCGGACTTACATAGGACTCGATTTTAAATAAAATACCCGAAACACCGGGCCCTTACATGATCAACATCACATAATTATAAAATCTATGGCCATAAAATTAACCCAAACAGTTCAATGCAAACCGAACATACATTATGCATAAATCCCACCTATTAGAGCCTATCGCAAATTTTAATATCAATTAATAGGGACAGCAATGGCTCTGATGCCGTTTGAAGGGGATGAAAGCCCCGGCGCAGCGGAAGCGCATCGAAAGGACCTTGCGCCGTATATTAATTAACATTAAAATACCGTTATGAAAAGGCAAAATAAAACTTTAAACACACTTTAAAGCCGCTGAAAACGCTATAAACATGCTGAAAAAGGTTTGAAAATAAAACTATTTTTATTCTCATGCTTTTCTAAGGAAAAAGGGAAAGAACCGTTACAAACCTTCGTTGTAGACTTGATCGTTCTTGGCCAACGATGCTCCAACGAACGAAAACGCAATGACTCTTTCTTGATTTATTCGCTGGATATTTTTCTTCAAAGACACAATAACCACAGAGGTTACACCGGTATGTCTCTAAGTCTAGGAGGCAAAAGACTTGTGGGAGTCTTACTCTAAGAGGGAGGCTAGAGAGAATTCTAGGGTCTTGTCTTATGAGTCTAGGAGCAAGAGGGCTACTAAACCAATTAGGTCTAGTGTTCTATTTATAGAAGAGTGGCCATGAATAAAATATTCAATTAAATCAATCTTTTCCAAAATCGAATCAATCTTATTCCTTATTTAATCAATCCAAGATCAATCAATTCCATAATTGATTAATCTTTTCCACAAATGACTAATTACTTCCATAAGTGATTAGATCATTTCCATAAATGATTAATCACTTCCTTAAGTGATTAATTATTTCCATAATTGATTAATTCCCGATTAATTAATTCTTTAATTAATTAACCACCAATTAAATATCACATATTTACTTTCCGGCCTTGAATTAATTAATTGCCCAAATAGATTTTAGGCCTTAAATTAATTAATTCATATTTGAACTCTTTCAAACTTCCATAAATTTAATTTGACTCAAATTTATATTAATATTTGAATTTCTTCAAATATTAATTTCTCTCATAATAATACATCAATATATATTATATTGTTTCCCTTAGGAAATTGAACACTTTTAATTTACATTTATTACTTAGTTGCCTCAAATTACTTTATGAGCTACCAGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAATGATGTGAGATTAATTGGTCAAACTCATTAACCAAATTAATCAATATTCATTAACTGTGTGTACATTCCACTATAGACTCACAGTTGCACTCTTCTCACTACAGACATATTTTCTGTGTCCACGGATATAGACCAAGAACGACTAGTTAGTCCTTCACGAGTGTCCGTAAAACTAGCTGGGTCAAATTACCGTTTAACCCCTGGGTTATGTCTATTTCCTTAAGTACCAGTTCTCCTCTAATGAACAACCTGATTGTGGTCCAACCATCAAACAGAAAACCCTCTCGTGCCATTGAGAGGGTAGGGCCCTTTGCTCAAGACTCGAAGCCACCACTTAAGGGAACACTCGTCTACTTCCCTAAAGTCGGGAAGAAGTGAATTCCTTCTTGTATGATTATGTTCCCAGCTCCCCACTAGGTCTTGTCCCCAAAATGGTAGGCTTATTGAGTCGGCGTATTGGCCACTCTCATCCTTAAAAATCAAAGGACAATCCCTCATGAGCAGGAGTCCATAATCAACTCAGGATTAAGACCAAGTTGTCTAGGTCGTCCTAGTGAAATAGAAAACCAACTAGTTTAACGGTGTTATAACCAGTGGTTACTATTTCGCAGTCCAGTTTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCCCACTCGGATGTCTCCTACACGAACGCGTTGGATCATAGCGTTTGTATCAAATACAAAGTGGGCCGTATCCGTAGTGTCACCAGGATAAGGCACCCAGTCTTATCCCTATACTATAGACCCTTTAGGCTGTTTCGTGAACGGTGATCCCCATATGTCGCTACATATAGTTCAAGACTCATATTACAGCCTAGATGTCTAGTTTATTGGATTAGGGTTATTTTAGGCAAAGACAAATATAAAATAGCTAATAACATTTAATGGAAAAATATATCAATATTATTTCATTAATATTCAGTCAACGATTACATTCACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAACCCAAAAAGGTTAATGTTTAAAACGTTCAAATTCGGAATAGGATACAAAAGTTGGTTATATACGATATTTAACGACATATTGGTTTAATTTGGAATTAAACTTAAAATGAGAGTTGGTTGTATTTAAATATGATTTAAATATTAAACACGTGAATAGAGATTCATGTTCGAGAAATTTCGTTTGGAGAAAAGTTGGTATTGAGCAAATAATATTAATTTAATATAAGATATTAAATGAATTAATTTTATTATTATTTTAGTTAAATAAGATTTTATTTAAATTAAAATAAAACAAAAATTAAAATTAGAAAGTGGGAATTTTCAGATTAATTAAATTAAAAAACAAAAATTAGAATTTTTGAATTTTGGAAATTAAAAAATGCCTATTTTTTGGAGGTGGTGGATTTTGACTAAGCCATGGGCTCAAGCCCTTCTTAAGACACTTAATTAAGCACCAAATTGGTGTCAATCTTGGTTGAATCCTTTTTGCATGTTTTCATCTATACATACATGCTAGAAAGGTGAAGAAATTAACGTTCATATGTACTGAAATGCTGCTAAAATTCTCCCAAACTCTCACAACACTCAAACCCATTGTTCAACTTTGAACTTCAAGCTTTCCTTTCCAATTCCTATCAATTAAGGATCCCACAATCTGTTCCAAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGTTTGTCCAAGATCCATTGGTGTGAAGATTAAAGCCTCGGATTACACGAATTGGGAGCTACAAGAGGTAGGTGCATCTTTGCTCTGTTTTTCCTCATATGAACAACGTGTGTTCTTGGATCAAATTGATGAAATTGTGTGCCAAAGATCCAGAACTGCTTCCACATGTTTGGTATTAACTCCTTCAATTGGTATCAGAGCATGGTTTGGGCACCCAATTTGCATTAATTTGATCATAGTGTGTAGAATTTACATGTTGATTTTTTCTGGCTGCTGAAATGGATATATTACGGTTTTGGCAATTTATTTCTCTTTAATTTGTTAATCAATTTCCAATATTATTTGTAATAATTTAGTTATTGATTGCTCAAAATTGCCAAAACCGATCCATTTTAGTGTGATTTAATTAATTATGCATGGATGGATGTATGTTTTAATTAAATAGCCTATAATATGCATAAAACATGTCATATAGATTTAAAATCCCACCATAGGAAGCATGATACATGCATTAAGTATGTTATAATTAGTTATAATATTAAGTTGCATGCATGTTTAGGTTTCATGTTAGATGCATGTTGAATGAATTAATTATCTTATCATTCGATTATATAAACGTTATATTAACTAAACGAAAACGAAAAAAGCATGCTGCATGAAACTTCCTTAGCTCGATTTAAAGCATTTCGATCAAATAAAAGCATGTTATATGTTAATGTTGTTTTAATCGTTATATAACCGACATAGATATTTAAAATCTATAACTAATATAAAAGCATGCTCTCTTAGGGTTAAAATGAACTCAAAGATCAATCAATGCAAAATTAGTTTTAGGTCGATAACTTGTAAAGCTAAGGTTACAAAACAACTCACCCGGTTAGATGTTGTCTAAGGCTAGAGGTATTTAAGTTGACAGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGGCATCGAGCCGGTACTTGAGTTAGGTTAACTTGGTTTTATGAGCATGTGTGAGCGATGTGAGGTTATAATATGAATTTATCACTTAGACATTGTAGGTTAAGTCCTTTTTTCGGACTTATCACCTAGACTTAGGTAAAGTTTATTAGCCGAGTTCTATCTAAGTCAAAATTTAAACCCTAAAACATAAAAACGAGATATTTTAAATCGAGTTTTTACTCTCACGACCCCCTATGTTCACATCATGAGATACATGCTCGGCTTCGTGTCGCCCTGGGAACGGCCTCCCTTCGGAGAGCATTAAGCATAGATCAATACCAAGGTGGATGGGGAAAGTGTTCATAGTAAGTGGGAGAAGGACGCGTGACAACGTATCCTATGGTCTCCACCCCTCGGTTGCACTGTGAGATTCTTATGATCTGCCTGCGTGTCGTCCTGGTAGTGACCACCTCTTCAGAGGGCTTGATCATAGGATTCAGAACACCGCAAACTCCAGAAATGGATAGGGTCACTTAGGTTAATTACCAATAGTTGTCTTTCCTAACGGTAGCCTGTTGGTGCGTACCTCTGGGATCTAGTTGTCAGGGTAATTGCAGGCGCAACTAGAGGATGATATCTGGACCATGTCTATGTGGGCAACATAGATAGTGTTCTTCCGTCGTTTGCAGTGCCTGAGTAAGTTGCAGACGCAAAAGGTGGGCAATCTAATGCTACTGGTTGATACTATTTGAATTTCCCCGCTTATTTCATGTCTTTACCGTTTTCATTTACTTGATTTTCTCTATTTTTTTCTCCAATTAAAGGCCCATTCAAAAAATATTTCTTTGGTTACTATCTTCGTGGTTGCAAATTTAGAGGAGGTTCTTGTGTTGCAGAATCTTGTGTTTTTCGACTAGTCACTGATAGCGAGCATAGCTAGCTAGTTTTCCCTAATTAATTTAGCTAGTCTTTTATAATTTATTGGCCAAAATTATGCATTTATGTGTTGTATTTGTAGGAAATATAGTTTTGAGCCAATTGGATGTTCGGGATGCGAAAAGAAGCTGAAGAATGAAAAAAGAATCAAAGTTGGAAGATTGAAGATAGGTGCATCCGCAGACCAACGTCGAGACGCTGCTCTTTGGGCGTTTCGACGTTGAAATTCTATATTTGGAGTTTTCATTCTTAAAAAAAAATATATATATATATTCATAGCGTCGCGACGCTCTCGGCGAATTTTCCAAATCCGCAGTATCGCGACAGCGTCGCGACGCTGTCTATAGCGTCTCGACGCTGTCGGCAGATTTTCTATAAATTCATCATTTTGTGCTACGGATTGGGGGAGTCCAATTGGTTAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTGGCTAAGGAGTGGGAATCAAGCGAGAGGACGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCCAGTTTCGACGGATTTGAGTTTTCCTTTCTCTTTCCCTTAACTCTTGTAGTTTTTATGGCTTTTCTTACAATTAGTGTTTGTGGTTTAAAGACTATGAATTTCTAGTTGTTTGTCTTAGGGATTGATGTAGTTGTTTTAATTGTTGGATTGATTTTTGGTATGAATGTGCTTTTATTTTATGCATGCAATTTTGTGTAATGCTTTCAATTACTTGATCACTAATTGAATGATTTAAGTATTGAATCTAACTCGGGAGAGAGGATTTGGCCTAAGACTTGCCTTGTTTAATTGCATGACTAGAGTAGAAATTCTAAGTTTGTGACGGGATTTGGAATATCTCTAGAAGTATAACAAGGATTAAACCGAATAATGCCTTGCATGTTAATGAACTTAGATAGGGATATCAAGTTAGTTATATGCATGAGAATCAATTATACTCGGGAGAGGTAATCGTGATAAAAGTTCCCTTGGCTTGTAGAATAATTGCACAATCAATTCATTCCTATTAATCAATCCTCAATCTTAAATAATGAAATCAATTCTCTAAGAGTCTTTCCCTTTGAGTCTCCACCTTTATTTTATGCTTTTTGTCTTTAGATTTATCTTTATCTTTAAGTTTTGCTCCCTAAATAAAATTGGACAAGATTATTCACGGTACTTAATTTGCTAGAAAACCAATCCAGAGGACGACACTCGTTTTACACGAAAACACTATATTATTACTTGACCCGTACACTTGCGGTAAGCAATTTGCGCATCAAGTTTTTGGCGCTGTTGTCGGGGATTGGCATATTTAGTTAAATTAATATTGTGGAAAAATTGTTCGGTCTTAATTTAGGGTGTATTTTTATTTTTATTTTTTTTAGGTAGATTGCATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTCCATAGTTGTAATTCTCCTTTTTAGTTCTTTCCTTTTGTGATTGATTTTTTCCTTATTTGTTTTTGTTTTCCTTTTTTCCTTTTCTTTCCTTTTTTGTTTGAGTCTTAGTCCTTTGTTCTTGTTGGGTTATTATTTGATTGGAAGCCTAATTATCATTGTTGCTTTGATTGATTTGAATGACTTTTTATTCAACACCATATTCCAATTTTTCATCTTCAAGTTTTACCCCTTTAAAAGAAAATTCTTCCTTAGAAAGCATAGTTCAAAATTATATTGAGGAGTCTAGAGCGAGGAGTCTAAAATTTTATGAAATTATAAGAGGACTTCAAACCCCAAAGGAAGTTAGTGAGGTGGGATCCACTTCCATAGGATGTCTAGTGAGTCATGTGGCCGGTGACTCATTGGCACCCATTCATGAGCTTAATTCTTTCGATCTTGCTAAGGATGAGCAGTTAGGGGTGAGTTGCATTAATAGTGGGGAAGAATTGGAGAGTTGTAGCACCTATCAAGAACATGTTTGTGAGGAAGAAAAAGAAAATGAGCTTGCAGTGACAGAGGAAGTTCAAGAGGTAGAGTTTGAGGTTGAAAAGCCTTCGTCTGATTTATCTTCTCCATCCTTTGTAGATTTTGATTGTTCTTTTTTCTATTCTCATGAGTCAGTTTTAGAGTCCGAGTCTCTTTATTTTGATCTTTCTCCTTTTATGTTTATTTAA

mRNA sequence

ATGTTGTTACGTCTGGAACGATTTTCTAATCAAAACAGCAGCTTGTTCTCGGTTTTCTTCTTCGATTTCAGCCGCGGGACAGCAATGGCTCTGATGCCGTTTGAAGGGGATGAAAGCCCCGGCGCAGCGGAAGCGCATCGAAAGGACCTTGCGCCAAAACCCTCTCGTGCCATTGAGAGGGTAGGGCCCTTTGCTCAAGACTCGAAGCCACCACTTAAGGGAACACTCGTCTACTTCCCTAAAGTCGGGAAGAAGATCCCACAATCTGTTCCAAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGTTTGTCCAAGATCCATTGGTGTGAAGATTAAAGCCTCGGATTACACGAATTGGGAGCTACAAGAGGTAGGTGCATCTTTGCTCTGTTTTTCCTCATATGAACAACGTGTGTTCTTGGATCAAATTGATGAAATTGTGTGCCAAAGATCCAGAACTGCTTCCACATGTTTGATACATGCTCGGCTTCGTGTCGCCCTGGGAACGGCCTCCCTTCGGAGAGCATTAAGCATAGATCAATACCAAGGTGGATGGGGAAAGTGTTCATAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGTTACGTCTGGAACGATTTTCTAATCAAAACAGCAGCTTGTTCTCGGTTTTCTTCTTCGATTTCAGCCGCGGGACAGCAATGGCTCTGATGCCGTTTGAAGGGGATGAAAGCCCCGGCGCAGCGGAAGCGCATCGAAAGGACCTTGCGCCAAAACCCTCTCGTGCCATTGAGAGGGTAGGGCCCTTTGCTCAAGACTCGAAGCCACCACTTAAGGGAACACTCGTCTACTTCCCTAAAGTCGGGAAGAAGATCCCACAATCTGTTCCAAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGTTTGTCCAAGATCCATTGGTGTGAAGATTAAAGCCTCGGATTACACGAATTGGGAGCTACAAGAGGTAGGTGCATCTTTGCTCTGTTTTTCCTCATATGAACAACGTGTGTTCTTGGATCAAATTGATGAAATTGTGTGCCAAAGATCCAGAACTGCTTCCACATGTTTGATACATGCTCGGCTTCGTGTCGCCCTGGGAACGGCCTCCCTTCGGAGAGCATTAAGCATAGATCAATACCAAGGTGGATGGGGAAAGTGTTCATAG

Protein sequence

MLLRLERFSNQNSSLFSVFFFDFSRGTAMALMPFEGDESPGAAEAHRKDLAPKPSRAIERVGPFAQDSKPPLKGTLVYFPKVGKKIPQSVPRPEDSREDPSVCPRSIGVKIKASDYTNWELQEVGASLLCFSSYEQRVFLDQIDEIVCQRSRTASTCLIHARLRVALGTASLRRALSIDQYQGGWGKCS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg030462Spg030462gene


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg030462.1-three_prime_utrSpg030462.1-three_prime_utr-scaffold6:31960045..31960436three_prime_UTR
Spg030462.1-three_prime_utrSpg030462.1-three_prime_utr-scaffold6:31962005..31962092three_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg030462.1-cdsSpg030462.1-cds-scaffold6:31962093..31962093CDS
Spg030462.1-cdsSpg030462.1-cds-scaffold6:31962747..31962841CDS
Spg030462.1-cdsSpg030462.1-cds-scaffold6:31963856..31964075CDS
Spg030462.1-cdsSpg030462.1-cds-scaffold6:31965330..31965428CDS
Spg030462.1-cdsSpg030462.1-cds-scaffold6:31966689..31966767CDS
Spg030462.1-cdsSpg030462.1-cds-scaffold6:31966993..31967068CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg030462.1Spg030462.1-proteinpolypeptide