Spg027414.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg027414.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold7: 42706887 .. 42717230 (-)
Sequence length1323
RNA-Seq ExpressionSpg027414.1
SyntenySpg027414.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GGTAACTTTACCTTTACTTTTCAGTTGCCTTTTCTCTCTCCCCGAGTCTCTTCTTTCCCACTCTCTGCTCAGTACTCTCCCTCCCCAAATCTCTTCTCTCTCACTCTCATCGCTGTCATTCACCTTGCCATCGCTCGTCGTCGTTGTGGGTAGCGTTTCGCCGACACCTAGCTGTTGTTCGTGAGTTTTTTCTCAATCTGACCATGGTTCGTGGGTCTACCGCAACTCGGCCTCCACCGTTCTTGGATTTTTCTTCGCTGTCCAGATCTTGCGACCTTGAGGTTTCATTCAAGCTTTCAGGTTCAATTCATAGGTCTAGATCTACATTTTCCCTGCATTGTGTGGATTTTCCTACTGTTTCTTCGATTAAAAAAACGACGAACTAAAAATCCAAAAACCAGTTTCTTCTGATTTCCATGTCTCCGAAAAGAACTTTTTCATCTTCTTCCCCACGATTTTCAACCTCTCTCTCTCTTTTAACTTACTTTCTTCTGTTAGGTTCTCAAATGCAACACAATCCTCCCTCCGATTTCCTTTCAGGCAAGTTTCTCTCTCTCTATCTCTCTTCATTTTGCAAGTTCCCTGTTTCAACATTGAAAAAAAGAGTACAAACTGTGAGTAAGGGGAAGAAGTTCGTATTCTTTTGAAATCCAAGTGTTAATAGTTTGAAGTAGCTCGAAAATCTAATGGGTCGATAGCAGTTTGCATTGTATCCCTTTTTCTTCCAATCTGATGCAACAATGCTTAATTTTGGGAGTTTTGAGTGCGAGCAATCAATTAGTTTTCGTTGTTTGATTTTGTGTTTATTTGATTTTTAGTAATGAATGATTGGATTTCTCTGTTGTGGAAATCTGGCAAAGGATTAGAGATGGCGGGACTTGGGAATGTTCTTGGCCTAATGGATTTGATTGCAAAGTGTTTGTGAAAAATGCTTGTATGAGCTAATGAAAGATGAATTTTAAATTTTTTGCCTTTGATATTATTGTTGTTCTGTTGGTTCTTTTGGTGATTGTGTTTGACAATCAATGCAAGGAAATTGAAGTTGATCCTTTTTTGTTTCTTTGTCTGACATGGTCTCTTAAATTGTTTTTCACCCTATTATCTACAAGTTGAAGACAATTGCTTCTGATGCTAGATTGTTTTGGGTTTTCTATCTAGTTTTCCTCTTGTTGTGTTGTGATTTCAAGTGATAACAGTTCCAATGTGCTTTTCGATCTTGCGAGTTCCGAAATTTGGAGTCCACAGTTTAGCTAATTTATGGAGGGAAAATTTTCATCCCTTGAACAGGAATTATGGTCAACCTAGAGCATGTAAAGTATTTTGTTCAATGATATGTTTTGACAATGAACAAGTGACCGGTTATCCACTATAAGTATTTGCTATATATCTCTCCAGTCTTCCTAAAACCTCTCTCTGTGAAATGAAATGAAAATTAAAGGGGATATTATATGTTTAATTTTTGGGCAATAATTTATTCACGAATCTTGCATGTCTTGTTTTCTCTACTCATTTAGATTTTGCACCAGTGTAGAAGCTTCAGACATCTCAGAAACTTTTCTCACCTACACTTCACCTGGTAATTTTGATTACAGCTTCTCTATATACTTGTTTAAGCTCACATCTCATGCAACTAGTTCAAATATAAATTTTGAAAGTTGAAGTCCGAATGGGACTTGTAACTTTGGTGGTTGTTCTTTCCCTTGTTTTATTTTTATGTGAATGATCCAGGTTATTTCCCCTTATAAGTTTGCATGCATGGTTGGTATACTTCTCTACTTAGGTAAAGTAGTTCTTCTCTTGCCTTGCATTATACATTCAATATAGGTATGTTAGTTACCTTTAGTAACTCCTCATGGGGTGTTTTCATGATGTTCAAAGTCAAGCGCAAGGATAGTGATGTCGGCCAAAGGGGTGATTTCTTTCTTTTTCCCCATTTTATCCCATACCTATTTCTTATTGTTGTTTGAATTTTGGTGTTTTTATGGATTTTACCTTGTTTTATGAATGGTTGATTCTCAATTATGGTCCACATTGGATTCTAATCTTATCCAAATTTGTATGCTTATCCTCTTGTTTTGTTGGTTCAAATATTCTTGTACATTTGAGGTTCTTTTCCTATTGGAATAGTAGTTAGACATTCAGAACAGAATAACTTTTTAGTTTCTCAGGTTAAACAAATCTGAATGGTTTTAACTTCTTTGGATAATCTAATGGATCTGTTTAATTTCTAACTTCCTGGTAATTTAAATATAAACCAATACCCTTCACAAGGATTAAACATTTTTATGGATATCCATAGTGCATTAACGATTTTGTTTCCCTTTAATATTTTTTTTGAATGGGAGGAAATTAAATTTTAGGTGGAAATATGATGCATACTATCATTAATATAAAAAAACAATAATAAAATCCAAATATGAGTGCCCAATGTCAAGTTCAAACGATAGGAAAAAACTACCATGAAAATTGATCGCCATCAAAGTCATGGGATGGAGTAGCAGTGCTCTGAATCCTTGTCTTTTTGTAACTTTGTTTTTCTTTATTTTTTCTTCTAATTACGATTGATGGATTGATCTCCCTACTTTACACCTTATTTCTTTGTTTTCTACACTCATCTTTTTATTGCACAACAGTTTAAGTCACTACAAGAAAATATGTTTTCTACGACAAGTTTTTAGCGACGCAGCAAAAATAAGCCGCTAAAGATGACTTTCAGCGGCACCATAAACCAAATATCGCAATAATATATTTTTCAGTGACACGATAAAATTACATGTCACTAATAGTTTCAGAGACGTATAAATTCACGTCACAAAAAAAAATTATTTTTAGCAACATGTTTATCATGTTGCTAAAAGTTGTGTTTGGGGTCACTAAAAGTTTTACTTTTTATCACGTTTTAACATGTAATTTTTAGGGCTTTTTTTTTTACGGCGCCTCTATTTCCTTCCCTTTTCCCTCAATTCAGTCGTGCCTCCTTTTCCCTCTCTCCCTTGATTTCTACCGTCTGCCAAGTCGAAGCTGGCCGCTCAGGTCACGTACGACGCCACCACTGTCGAATCTCACCGTCGAAGGTCGCCGCCCACTGTCGAATCTCGTCGTCGAAGGTCGCCGCCGAAGGTCAGATCGAAGTTCAGTTTTACCTCTCTCCCTCGAGCTCAATTCGTCGCCAAATCCCATTTTCCCTCTCTTTCAAGTTGAGTTTTGCCGTCGAATCCCGTTTTCCCTCTCTCCTTCGAGCTCAATTCGCCGCCTGTTCCCCGCCGTCGCCTGTCCATGTCGCTCAGGTCGCCGCCGCCCATCCACATTGCTCAGGTCCTCACCACCCGTCAACGTCGCTCAGGTCATATTTATAGTTTTACAAAGCATCATAGATTATAATACTCCTATATTGAGATGTTTACTATGTTTGAAACTTTTTTTTAAAAAAAACTTGATATTAATTTGGAGTAGAAATCTTTATCAACTTGTAGATAAGTGCATCCTTTGACATTCGCTTAAGTAGAGACTAAAAAGATATAGTTGGAAGAGATGATGAATTGTTGTAGTATAGTAGAGCGAAAGCTTGAAGTGAAATTGAAAGATATAGTTGGTAGAGATGATGAATGGTTGCACTTAATTCTTTTAGCCAGTTTAGTTGGATTCATTGATAGACTTATTTGATACTTTGTTGTTAAATTGAGTTGTTTCATTGCAAAAGGTCTCCATAGTTTGAGTTAAGTGAAAAAGTTTGAGTTGTTATGATAAGGTAAGTTTCACATGTTTTCCATTAAGTTATTATGTTTAGGAAGGTCAATACCTTGTTGCACTTAGTTCTTTTAACGAGTTTAGTTGTTTTCATTGATAAGTTTATTTGGAGCTATATGGTAATTGATAAATTCATTTTGTTTAGTTTTGAATTGTTTATGGAGCTAGTTTAATTATATAAGCATTTGTATTGTTTGGAGAACAAAAGTGGTGTCATGCGTTAGCTGTCGTGAATGACTAGAATCATAATACATACATGTTATTTTCTAATTTGGCTGAACAAATAAGTACAACATTTTTATAAATGAACGCTTCATTCATATAAAAAGTAATTGTATACGATTGTTCAATCAAACATGAAATAGAAATTAAGTTCCTCTTAATCTTGGGAACAATTAACAAACTTTCTAAAAGTAAGAATTTATTTCTAAAAAATAACTTTGCAGCAACCACTGCTTTAACTGAAACGACATCTCCTATTCTGCCCCTAAGTGTCATTTCACCATCTTTCAGCTGTCGAAAAGAATTTTTTTCCTGAAAAGAAGAGCAAACATGATTAGTTGCTCCTGAATCAAGTATCCAGGCAAACTCATCATGCTCTACTAGGCATGTTTCTAAAAACAAGTAAATCAAATTTACCTTCCTTTTCCTTCTTTTTCTCAGCAGCCGCGGGAGCATTCCCCTTGTATCCTTCTTCTCATGAATCTTATTGATAGAAGAGTTCTGAGACGCAGCTTTAGATCCAGATGGTGAATGATAACTCTCCAAAAGGGAGTTATTTAGACCTTATTTCTATATTGATTTACGTGTCTTTTGTGCTTAATCAGGTTTTAGATAGATATTATATGTTTTAACCCATTTGGAAGAATGGAAGCTTTGGAAATTATTTTGTGCAGAATATGTTGCTGGGCGACTTAAGGGAGCAAAATCTGTGCTGGAGCAAAGCTGGGAGCAAAACTGCCACGTCATAGTTCGTTAGCCAATTTAACAAACTGAATTCTGTTAAGCTATTCTCAGCTTTATGGAGCAATGAGAGTCATCCACGTGTCTAGGTCAACCTAATTCAAGCCTCCTATCACTCTATAAAAGGAGATAGCAGCCCAAGTCAAATTCATTCCACTTTTGAGGACGAGATCACTCTCATTTCCATTTTGGGAGCCGAATAGAGGAGAGAGATTGGATACCATCAAGGACACCATCATTTGCAAGCTGATCAAGGGAATTAATATTTTCTTGTATTACTTTGTGAATAT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mRNA sequence

ATGGTTCGTGGGTCTACCGCAACTCGGCCTCCACCGTTCTTGGATTTTTCTTCGCTGTCCAGATCTTGCGACCTTGAGGTTTCATTCAAGCTTTCAGTAATGAATGATTGGATTTCTCTGTTGTGGAAATCTGGCAAAGGATTAGAGATGGCGGGACTTGGGAATGTTCTTGGCCTAATGGATTTGATTGCAAAGTGTTTTCGTGCCTCCTTTTCCCTCTCTCCCTTGATTTCTACCGTCTGCCAAGTCGAAGCTGGCCGCTCAGGTCACGTACGACGCCACCACTGTCGAATCTCACCGTCGAAGGTCGCCGCCCACTGTCGAATCTCGTCGTCGAAGGTCGCCGCCGAAGGTCAGATCGAAGTTCAGTTTTACCTCTCTCCCTCGAGCTCAATTCGTCGCCAAATCCCATTTTCCCTCTCTTTCAAGTTGAGTTTTGCCGTCGAATCCCGTTTTCCCTCTCTCCTTCGAGCTCAATTCGCCGCCTGTTCCCCGCCGTCGCCTGTCCATGTCGCTCAGGTCGCCGCCGCCCATCCACATTGCTCAGAATATGTTGCTGGGCGACTTAAGGGAGCAAAATCTGTGCTGGAGCAAAGCTGGGAGCAAAACTGCCACCCGAATAGAGGAGAGAGATTGGATACCATCAAGGACACCATCATTTGCAAGCTGATCAAGGGAATTAATATTTTCTTGTATTACTTTGTGAATATGGATATGCTTACTCAGATTGTAACATCTCAGAGGCACGCACCAACAGGCTACCGAAGGGTAAGACAACTGTTGGTAATTAGCCTAAGAGTCCCTATCTTATTCAAGAGTTCACGGTGTTTCGAATCCTATGATCAGGCCCTCCGAAGGGATGGTTGCGCTAGGACAACACGCAGGCAGACCATAGGACTCTCACGATACGAACTAAGGGCGGAGACCGAGGTCAGTTCCCAGGTAGGAGGCGTCGAGACGCTTGCGATGCTGCGGTTTGTTCTGATCTCAACATCTGCGAATCGGGACAGCGTCTCGACGCTGATGCGTTTGGATCACTTTGCTGGGCAAAAACAGCGTCTGTTCTTTGATGATTCTAAACCTACACCAAAGGCCTCTATTTATAAGAGTTCTTGGCCTTCAATTCGTGGTAATTTGGTGCTGAAAGGATCCTCCAAAAATGGGAAAAACGCCAGCCAAATTAGGAAAATTTCAAATCTGGAAAACTGCCTAGCGTCGCAACGCTGTCCCTTCAGATATGGAAAATTGCTCTCGGATTGCCCTAGCGTCGCGACGATGTGGGCTAGCGTCATGACGTTGTTCGCCAGCTTGATCTCCAAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTTCGTGGGTCTACCGCAACTCGGCCTCCACCGTTCTTGGATTTTTCTTCGCTGTCCAGATCTTGCGACCTTGAGGTTTCATTCAAGCTTTCAGTAATGAATGATTGGATTTCTCTGTTGTGGAAATCTGGCAAAGGATTAGAGATGGCGGGACTTGGGAATGTTCTTGGCCTAATGGATTTGATTGCAAAGTGTTTTCGTGCCTCCTTTTCCCTCTCTCCCTTGATTTCTACCGTCTGCCAAGTCGAAGCTGGCCGCTCAGGTCACGTACGACGCCACCACTGTCGAATCTCACCGTCGAAGGTCGCCGCCCACTGTCGAATCTCGTCGTCGAAGGTCGCCGCCGAAGGTCAGATCGAAGTTCAGTTTTACCTCTCTCCCTCGAGCTCAATTCGTCGCCAAATCCCATTTTCCCTCTCTTTCAAGTTGAGTTTTGCCGTCGAATCCCGTTTTCCCTCTCTCCTTCGAGCTCAATTCGCCGCCTGTTCCCCGCCGTCGCCTGTCCATGTCGCTCAGGTCGCCGCCGCCCATCCACATTGCTCAGAATATGTTGCTGGGCGACTTAAGGGAGCAAAATCTGTGCTGGAGCAAAGCTGGGAGCAAAACTGCCACCCGAATAGAGGAGAGAGATTGGATACCATCAAGGACACCATCATTTGCAAGCTGATCAAGGGAATTAATATTTTCTTGTATTACTTTGTGAATATGGATATGCTTACTCAGATTGTAACATCTCAGAGGCACGCACCAACAGGCTACCGAAGGGTAAGACAACTGTTGGTAATTAGCCTAAGAGTCCCTATCTTATTCAAGAGTTCACGGTGTTTCGAATCCTATGATCAGGCCCTCCGAAGGGATGGTTGCGCTAGGACAACACGCAGGCAGACCATAGGACTCTCACGATACGAACTAAGGGCGGAGACCGAGGTCAGTTCCCAGGTAGGAGGCGTCGAGACGCTTGCGATGCTGCGGTTTGTTCTGATCTCAACATCTGCGAATCGGGACAGCGTCTCGACGCTGATGCGTTTGGATCACTTTGCTGGGCAAAAACAGCGTCTGTTCTTTGATGATTCTAAACCTACACCAAAGGCCTCTATTTATAAGAGTTCTTGGCCTTCAATTCGTGGTAATTTGGTGCTGAAAGGATCCTCCAAAAATGGGAAAAACGCCAGCCAAATTAGGAAAATTTCAAATCTGGAAAACTGCCTAGCGTCGCAACGCTGTCCCTTCAGATATGGAAAATTGCTCTCGGATTGCCCTAGCGTCGCGACGATGTGGGCTAGCGTCATGACGTTGTTCGCCAGCTTGATCTCCAAGTAG

Protein sequence

MVRGSTATRPPPFLDFSSLSRSCDLEVSFKLSVMNDWISLLWKSGKGLEMAGLGNVLGLMDLIAKCFRASFSLSPLISTVCQVEAGRSGHVRRHHCRISPSKVAAHCRISSSKVAAEGQIEVQFYLSPSSSIRRQIPFSLSFKLSFAVESRFPSLLRAQFAACSPPSPVHVAQVAAAHPHCSEYVAGRLKGAKSVLEQSWEQNCHPNRGERLDTIKDTIICKLIKGINIFLYYFVNMDMLTQIVTSQRHAPTGYRRVRQLLVISLRVPILFKSSRCFESYDQALRRDGCARTTRRQTIGLSRYELRAETEVSSQVGGVETLAMLRFVLISTSANRDSVSTLMRLDHFAGQKQRLFFDDSKPTPKASIYKSSWPSIRGNLVLKGSSKNGKNASQIRKISNLENCLASQRCPFRYGKLLSDCPSVATMWASVMTLFASLISK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spg027414.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg027414.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg027414.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg027414.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg027414Spg027414gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42706887..42707141CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42708610..42708728CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42709750..42709768CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42710364..42710559CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42712207..42712325CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42712520..42712587CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42713916..42714262CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42716310..42716412CDS
Spg027414.1-cdsSpg027414.1-cds-scaffold7:42716931..42717027CDS


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg027414.1-five_prime_utrSpg027414.1-five_prime_utr-scaffold7:42717028..42717230five_prime_UTR


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg027414.1Spg027414.1-proteinpolypeptide