Spg019598.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTATTCAGCGGTGGGTCTCGGTATAGAGGGCTGAAATCGAAGCTGGGAGTATTTCGCTTAAGTCTCAAATTGATTAAGGTTTGAGGTATCTCACTATTGTGTGATTTGTGCGATTATTGTACTCTATTGTTGACTATCGCTCTTAATAAAATTCTCATAAGTTGAAGTGGATGTAGACCGAAAGGTTGAACCACTATATATCCTCATGTCTTTTTCTTTATTGCTTGTTTTGTTTGCGGCTGGAAATTTGCGTTCTGATTAGGCATATTATAAGTTGGCTTAAAATTTACAAGTGGTATTAGAGTCCTGGGGTGTAGCCGTGTCGGGTAGAATTCTCGAGTGCTGACCAAAGAAAAGTTGTGAGCCTTGAAGTAGTCATGGGGAGATCCGTGGTTGGATTCTATTGGGCAGGTGATATGTCCTGGATAAGAGTAAGAACTTTCGATAAAGTGGTGAAGCCTAGAGAGTTGGACGGAAGATGACTATTTGAGGGGAGGCTTGGTGGTACTTTGTTCGAGAGGAGGATTATTGGGAGTGCGACCAAAGTCCCACATTGGCTAGACAAGGGGATGATCATGGATTTATAAGGGAGGACAAGTATCTCTATTGGTATGAGGTCTTTTGGGGTGAACAAAAAGCAAAGCCATGAGGGCTTATACCCAAAGTGGACAATATCATACCATTGTGGAGATCTGTATCGTGTCCGTTGTCCCTTACGTAGACAATAACTCAATCATTCAGCAAAACTATGAATACAATCAACAGAAGAATAATCTAAAGACTATGTAAGAAATGATCACGCATACAAATAAAAAGAAACATTGTTACTTATATCGCCTATCCTCGAATATAGAGAGAATCCGTTGTAGACAAATACTTTTCCTTCCATGCCTAAAACATAATCAAAGCAACATGTGTGTGTTCGACACTGCCACCAAATTAAACTTGCAGGAATTATATGTCACAAGCGCCAGAACAGTTCCTCAGCAAAAGCCCCCGAACCATTGAAGCATTTCATCGAACATTAGTCGGTGTATCGTTCAAAGCATCAAACCGACATAACAGACTTCTCTTTCAGGACATTTTAAACGAATACACAACCAAAATTGCGGAATTTAAACGGTATCTTGCCAATTGAAACATTACATTCTCAAAATCTTACCTCCACTGGATTCCAGAAACGCGTACATAAAAGTACAAATCTCGAGCGAGAGAGAAATAGAAAAGGCGAACAAACCAAATGTGCACTTGAAAAAAAGAGAATTGGACCAAAAGAAGGAAAAGGGCGAAACCTGAGAAAAGCTCGAAGCAAATCTCTGCAAACGGACAACAACTATTCTCAAAATCTTGTAAGGCAGGAAAACATAAGCACAAACCACGTCCCAATTTGCCGCAAGGCCTTTTTTTTATAGATATATTCGGCTATTGTTATAAAAAAATAAAAAAAAGTACAAGTTTAATTCCTAAACTTTCGATTATGTCAATTTGGTTCCTAAACTTTAAGAGTGTAAAAATGTCCCAAAACTTTCAATTTTGTGTCCAATCAGTCTCTCGACTTTAAGAAATATCCAATAGGCCCTTAAACTTTTACTTTCGTGTTCAATAAGTCCCTCAACTTTCAATTTTGTGTCTATAAGTCATCGACCTATTCGAACATTTTTTAAAATTTACAAGCCTATATTATGTGAGTAATTTCTTGAATAATGTAATTTTAAAAAGAAATGAAAAAATAAGTCATCGAGCTATTCGAATAGACAAATGTCTTACCACCGGAGAGAAAATCTCATTACAATCAACTCCCTCCTTTTGAGTGTATCCCTTGGCTACTAGCTTAGCTTTATACCTAGGCTTTTTGTTACCTCATGTACCTAGCTTGATTTTATAAATCCACTTTGATTGAATGAGTTTCTGTTTAGTAGGCTTTAGAACCAATGATCACGTCTGGTTCTCGAATTCTTTCCTTTCCAGTTCTTTTTCTCAGCTCTCCCTTTGGCTATAAGTAACTCTCCTTCCCTGCGTTCTTTTTTAATTTCGAGATTTCTAGTCTTCAAGGCATCCAACACAATATCCATGGTCAGCGAATCCCTTCCATATTTAATTGCAACCTTAACTTCTCGAAATGAATTCGGCAAAGAATTCAAAAGTATCACTGCTTGATTATTATCCGACATCTTCTCACCGATGTTATTGAGATCAACTACGGTCTTTTGAAATTCATCCAAAGAATTTCTCCTTTAGATATAACTTATTTTGCAGAGACTTTGTCAGATAAAGGTTCTCGAGCTTCTTCCATAACTCAACCGTGGTAGTTACCTCATTCACTTGCCTAAGCACTCCATCTGAGAGATAGAGTATAATGGTTGAACAAGCAATCTCATCCATTTCCTTCTTATCATCTTCTGTGAGTGTCGTCGGAAGGTCCTTTGACATAAGATTTTAGCTACCTTTTGTTGCACCAAAAGAGCTTTAATCTTCTTTCTCCATAGACCGAAATCACTCTTCCCATCAAATCGAGCAACGTAGAAACGAGTCGACATTGAAGACATTAATCAATATGTACCTCACAGAGTAACCGAGCAAAGAATGGAAACACAAAGGCACTAAACCACGAACCTCCAAACTTTGGATCAAATGGAGCTCTGATACCACTTGTAAGGGACAACAAACACGACACAAATCTCCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGGGCATAAGCCCTCATGGCTTTGCTTTTGGTTCACCCCAAAAGGTCTCATACCAATGGAGATACTTGTCCTCCCTTATAAACCCATGATCATCCCCTTATCTAGCCAATGTGGGACTTTGGCCGCACTCCCAACAGTCTACCCTGCATATTTTGAAAATTTTATTTGTTAAAGAAATAAGGGTGCAAATTTCCCCCTTTGAATCACACCTGAATTCCTAGGTAGAGAGAATCCATCCTTGATCTATGGCCAATTTTGAATTTTTGTGGAGATTGGTGTCAATTTTGTCTATCTTGTTGTCTTCCCCATCTATTACTGCATCAATATTTTTGTTCTAATTCTGATTTTTGAGTTTTTTTCTGGGTATTGAAGAGACGTAATTGGCGATGTCAAAGTATGAATTTCCGAGGCTTCCACGGGCAGATATTGCATTGCTACTAGCACAGTGTCAAATTGCTGCTGTAACAGAGCGGGACCTTCTTCACCCGTCACCAGATTTGGTTTCAGATCTTTACACACGTTTAATGATCTACCTTGACTTGCTCCATGAGTAATTCCTCTGATTATGGCATTTCCTTTAACAAGTATTTGAACTGTTTTTTGAAAGGATGGAGAAAGAGAAAAGTTTATTGACGTGTTACTATGTCAGCATTCACTCCTTTCAACGTTTTGATATTTGTGAGGTTTATAGTGTGGATTTTATGTCAAACAACTCTATTTGGTCAGATTTTTATTTCTTTCTTCTAAGAAAATTTAATATTGCATAGAAAGATAGGATAATGGTATTATTTCTCCGTTTGTTGATAATAGGAATTGTTGTGACCCATAATTCACGTTTTGTTTCCTAGAGAATTAAAATTATGGAAGTTTTTTCTTCTCTTTGGAAGAGTAAAATACCAAAGAAGGTCAAATTCTTTGTGCGGTAGGTTTTGCACGGATGTGTCTTTCTACGTGTCTATTTCCTGACCTTTTGGTAATTATAAGCTTGGTTTAGTCCTTTTGGATTGAAGTATGTTTCTTTAGCTAGTGTTTGAACTCTTTTTTGTGGGCTTATTGTTGTATGCCCTTGTACATTCTTTCATTTTTTCAATGAAAGCTCGGTTTCTTACCTAAAACAATATCAATGTGTTCATGAAGTTCCCTTACTCCTTTTCCATTCTAGATCTTTGGAGTGTCATACTGTGAACTTGTTTATTTCTCTATGCTTAGAATCCTTTTTAAGAAAGATTATATTTCAATTTTGTTTGTTATTTGTGCAGGGAAGACCAAGGACTAGTTGAGTTTGCTGCCTTGGATCAGCTTGAGAACCCCGATCTGCTTATGGATTCAGTTCGGATAATGAAGTTGCACAACAGAATAAAGCATGTCATTGCTTCTCTTGACTGTCCAAAAAAGTTTACATTGAAAGATTTGATAAAACCTGAAGGAGATAGGACTGGAATTTTCCTTAGTGCAATGTTGAACTTTTGCATTCACAAGTACGAACTTTTATCTTCTTCTTCTCTATGGTTGTCACTTTCTCTTTACGAGAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAACACTAGTGTAACAAACTATTAGTTTGACCCTGAAGGTCTTTATGGGTTTATCAGCTAACTTAGGGTGTAGTATCTCAACCAAGGAATTTCTACTCAATTTTCGTCTTATTAATGGGATTCTAGACCTAGTCAATTGTAAATAATTGTTAGTAAACATCTCAATTAAATGAGTTTATTATTTAACTACCAGTTACTACTTATGTTTGCCCCATTTATATTAGTTTGGCTCATCACATTATTTGAATGAAAGCGACAGCTTCTTGCTTATTGTTAATTTGATTATAGGCTTAATTAGATGTTTTTGTAGTTCAATGGCATTGTGCACTAGTCAACATATTCTGATAAATTTTCTAGCTTGTCATGGTAGGTTTATTTTCTTTATGATTGGATGAATGGGGTGAAGTAACAAAAATTTATCACTTCAATTTATTATATTTTATTGTTGTCATGCTTTCTTATTTGTAATACATCCCACGGGCTGGGGCACAGCTCCATGCTTTCGTGTTGGTAATTACATCCAAAAGCTCAATTTTCTTATTGAATAGGCAGGGGCTTCCCTACAGGGTGCTTTGATAAGGATATGTATCATTTTATTGTCTTTTAAATAAGTTTCATCATTATAATCTCTAAAATGTTGCATGATATATATCTATGGAAATATGGTTTTTCATAAAAGAATAGATAGATTTATATTGACTCAGTTATGACTCTTGTATTTCCATTTGAAGAGATGC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MSKYEFPRLPRADIALLLAQCQIAAVTERDLLHPSPDLVSDLYTRLMIYLDLLHEEDQGLVEFAALDQLENPDLLMDSVRIMKLHNRIKHVIASLDCPKKFTLKDLIKPEGDRTGIFLSAMLNFCIHKDAKITLHTPVMDELSTLGDQQREWEVKISQLNAEIAEYNEAREREIPFVQEIDAKVKELQQTIGGLNNQQMSLRASIRKLKDKAGEMDEKVILGQVNTFERLSRVMPLWLALFVASFVGKQREILIICCGIVVLLTLSRASSLRFLGFKLQANAVELLQNPVSSFFHQKIKEDFGVIRLIKFFSDKEWFFECAVWPSTGGRRTIQVPAGLNKKGWYVFWEMIRDFSLKIHSYENQSNRLFFNNLEGLPALVNDSEGQVFPNSYAEVVKRGGSMKNSFSLEDSARNVKIVTEEAYWVRKNWDVLEIDLESSLVVSRLMAHYSWKNVKIALEDFFKSSILINPFMDDKALIQVADGCLDISMNGKWKKFGNLHLKLELWSSEIHSQPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNFCGFIPADINVKIGNKFEFSLRFGDINALEDKNLKFDSIRKLSVNDFSNSLDEIRVKQVILDEEVDLVNEGVRLNESSFISCYQEEFNAAMGSPKVASMHDEHINYTGCNESPSKMINDSNYNLKDDIQQRSSNINSENGLIQSKEFGLVEFSKKKSALLLEKNFNANGKVYNAICSDFNGAFSDGVVHESQDLLSTPFHDLPLGLNCCNVVEDESIVPKVLLLEKSVELPKEKAEISRSKEALMEEVSVNFIGPVEFAKEKSALLLENDFNANGKVFNGINSEICKAFTDGALHESQVLLFSPIQDIPSGLKCCNAVGLESNEPFVPKALKKKYESFPLHYSRRKYEKSEILDSIPINSNYNLDVIEESCSQSLLPALNQSRCCQTNLNELSNSTSSNQYILSNIQSDPSLTKGVFIPSSKVENKVDQSYSSPIDSDNDSVVSISSVEAENQYLNDENNELLEEDSFALAFNRIFQNNEDISEVQLNDCDVSATPLVSVPSKFSSLLEDCDIQLKEIQPFLPPEQSENCGISSRFLISMEWDVMFDKSRVSKQFSCERDQFNEVLGSPKGASLHEKALMKSSRSGQVEIV Homology
BLAST of Spg019598.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6588803.1 (Kinetochore protein NUF2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 7.4e-105 Identity = 197/219 (89.95%), Postives = 208/219 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022927739.1 (probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita moschata] >XP_022927740.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita moschata] >XP_022927741.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita moschata] >KAG7022576.1 NUF2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 7.4e-105 Identity = 197/219 (89.95%), Postives = 208/219 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023529466.1 (probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023529467.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023529468.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 7.4e-105 Identity = 197/219 (89.95%), Postives = 208/219 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022989268.1 (probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita maxima] >XP_022989269.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 2.2e-104 Identity = 196/219 (89.50%), Postives = 207/219 (94.52%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038877491.1 (kinetochore protein NUF2 homolog [Benincasa hispida] >XP_038877492.1 kinetochore protein NUF2 homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 389.0 bits (998), Expect = 1.4e-103 Identity = 199/219 (90.87%), Postives = 204/219 (93.15%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RXJ0 (Kinetochore protein NUF2 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUF2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 229.6 bits (584), Expect = 1.9e-58 Identity = 111/228 (48.68%), Postives = 167/228 (73.25%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10173 (Kinetochore protein nuf2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=nuf2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 3.1e-05 Identity = 47/186 (25.27%), Postives = 92/186 (49.46%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIG6 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434552 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 3.6e-105 Identity = 197/219 (89.95%), Postives = 208/219 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JNW1 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 1.0e-104 Identity = 196/219 (89.50%), Postives = 207/219 (94.52%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5E4 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503319 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 369.4 bits (947), Expect = 5.5e-98 Identity = 188/219 (85.84%), Postives = 198/219 (90.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWL1 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024175 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 367.1 bits (941), Expect = 2.8e-97 Identity = 187/219 (85.39%), Postives = 200/219 (91.32%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KNL7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G488740 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 4.7e-97 Identity = 187/219 (85.39%), Postives = 196/219 (89.50%), Query Frame = 0
BLAST of Spg019598.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G61000.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: mitosis; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinetochore protein Nuf2 (InterPro:IPR005549); Has 50972 Blast hits to 29793 proteins in 2070 species: Archae - 902; Bacteria - 7404; Metazoa - 23628; Fungi - 4156; Plants - 2312; Viruses - 158; Other Eukaryotes - 12412 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 229.6 bits (584), Expect = 1.3e-59 Identity = 111/228 (48.68%), Postives = 167/228 (73.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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