Spg011044.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg011044.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold4: 27966411 .. 27980494 (-)
Sequence length1416
RNA-Seq ExpressionSpg011044.1
SyntenySpg011044.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGATGATGGGAATTTTAATCTTAATGCATTTTTTGATGACCCTCTGTTTGACAATGAGCTGATAGATATAGATTTGCCTGATTTTGAAAATGAATTGGAATTACCTGCTTTTGAGAATGAAATGTCTGCAATTGATGATTTGCCTAATTTTGAAAATGAGATAGAAATGCCTGAAGTTGATGATTTGTCTGACTTTGAGAATGAGCTTGAAATGCCTGCGTTAGATAATGAGCATGATTTCCATGGAGATGATTACTTGATAGATGATAATTTTGAGTCTGATCATGATAATGCTGAATCTATCGAGTCTGATCCAGATGAATATAGAGTCAGACCCTGAAAGTGTGAATAATTTTGATTCAAGTCCTAATGATGTAAATAGTATAGAATCTGACCCAGAGGAGCTTGAATTCTTTAATTCTTCTGATAATGAGTCATATGATAGCTTGGTATAATCATTTTTCAATACTGAGTTTGAGGAATCTTCTGAGCATGTAGATATTGAATCTGATGAATGGATAGACATAGTTGATAGGTCATTCTTAGATCCTAGACCAGTAGATATCATAATGCTGGATGACTCTGTGAATAACTGTTTTGAAAATAGAGACTTAGAAAAGAGATTTGATGCTGCTACATATTTTTTGAAATGTTATTATAACAATCTCTTTAGTGATGATGGGCCAGGGGAAAGTTTTTTTTTTCTCCCCTGTTTGCAGTGTGCAATTCGGTGTGAGATTTTCGGCAAGGCCCGGAGGACTATGAAAAATTTTATTTCGAGCCTCTGTGATCGTGTCGAGCCTCGTCTAGCTAAAGACGTTAAAGAAAGCGCTGCTTGGGAGGCAACCCAAGGATTAAAGTTTAGGTACTTGTTTTTCCGGTAAATAATTTTCTTTGCTTCGTGATCTAATTTTTTGTTTTGCAGGATCACCTTAGCAAATCCCAAGGCTCCAAGAATCCCATTTTTCTGGAACCAAAGGAAGAGGATGAATTGCTCCTAACTCAGGGAAGTCTCAGTATCCCTCTTTATGCTTTATTGTTTATAAACATTAGGGACAATGTTTAGTTTAAGTTTGGGGGGGAGGCGGCTTTCGTTGTGTTGAGCATATTTAAATTCCGTTGGATGCATGAATAGATAACCATGATAACCAAGGATGTGATTTTAGAAGTTTTGGGAGAAAATGGTTTATATGTTGTGGAATCTGGGAGCATAGCAGAAATTGTGAAATTTTAAAATTTTTTGATACTTAGTTTTGATGTCTAAAGCATGCAATAGACTTATCTAATGACATCTTTGAAAATCTAGATTCTTATTATGATTTTTAAAGTTTGTTGTCACCCCGATAGGCTTAGTTTCTAATACTAGGAAGTTCATGCTTGATTGTTCTAAAGAACTAGGTAGAAAAAAAATGTTATGCCTACTGAGAGAAAAGCAACAAAAGAAAAGAAAAAGAGAGAAAAGAAAAATCTGTTGAAAAAGAAATTTTTTGCTTGCACAAAAGAAAAAGCCTAGGGGTAAAAAAGCTACCTGCGGTGTGATCAGTTAGGCCAACCAGAGAATAAAATTCGGGTTAAGGGTCCCTGCACCGTAGTGTGAAAGCTAGTACCATTATATATCAAAATGCAAGTTTGGGGGAGTAGCAAAAGAAAAAGAAAAGTGAAAAATATTTGAGTTTAGCTCCCCCATGAAAAATAAAAATGTCAGGCGCCCTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGATAGTAGAACTCCGACCTATTAGGGGTTCTTAACCAGTGTAGGGGGAAAACAAATGGAGAAAGCCATAAGACTAATCTAGGTTAGTAAAAGAATCAGTAGATAAGTCTTGAGCATGTTATTCATTAATCTTAAGTTCAAACTATTTTAAGATTTCTTCATGAGTATGTGGTGCTTGCTTATTCCACTTGCATGTTTTCCATTCTATCTTAAAAGTTCCAAAATCATTAAGGCTTGAGTGATTCTATTTCATGCATCTTTCGAATTTATTTTGCTCGGGACTAGCAAAAGCTTAAGTTTGGGGGTGTGATAGCGGGCAGAAATGTCGCTATTTTAGTCCTAATTTATTAAGCTTTTGGGCGCTTTAATTGTGTTTTTATTGAAGAAATCTTAAATAAATCATTATTTTGTCTTTAGGAGCACTTTATGGATTTTTGGTGGAAAATGCCCTAAAATGAGCCATCCAAAGCCCAAATTTCCATGCATCGGTCAAGGGGAAGCCCAAGAAGTCAACCATGAGGAAGAGGTCCAAAAAGAATTGAAGTTGGCCCAATTTCAAGACCCCACTTCCCATTAAAAAAAAAAAAAAAACTCTTTCTCCATTTTATTTTTTTCCTTGATTGATCAATTTTACTCTTTAATTGCTTTAATTTCTAAATTCATTTTAATTGCATGTTCTGGTCCCTAAATATTGTTTCCCCCTAGTAATTTTAGTGTCCAAGGAATTTTTGCTTTGCTTAATTTTCGCTTCGCCTCCCTATGGATTCGATACTCGGAATATTTTTGTTTTATATTACTTGCGGCCCGTGCACTTGCGGTATTAGTAGCGGTGACGTGCAACAGGGCTACTAAACCAATTAGGTCTAGTGTTCTATTTATAGAAGAGTGGTCATGAATAAAATATTCAATTAAATCAATCTTTTCCAAAATTGATTCAATCTTATTCCTTATTTAATCAATACAAGATCAATGAATTCCATAATTGATTAATCTTTTCCACAAATGACTAATTACTTCCATAAGTGATTAGATTATTTCCATAAATGATTAATCACTTCCATAAGTGATTAATTATTTCCATAATTGATTAATTCCCGATTAATTAATTCTTTAATTTATTAACCACCAATTAAATATCACATATTTAATTTTCGGTCTTGAATTAATTAATTTGCCCAAATAGATTTTAGGCCTTAAAATTAATTAATTCATATTTGAACTCTTTCAAACTTCCATTAATTTAATGTGACTCAAATTTATATTAATATTTGAATTTCTTCAAATATTAATTTCTCTCATAATAATATATCAATATATGTTATATTGTTTCCCTTAGTAAATTGAACATTTTCAATTTAAATTTATTACTTAGTTGCCTCAAATTACTTTATGAGCTACCAGTGGGACCTAATGGACCTGCAGATCAGAAGCTACAATGATGTGAGATTAATTGGTCAAACTCATTAACCACATTAATCAATATTCATTAACTGTGTGTACATTCCACTATAGACTCACAGTTGCACTCTTATCACTGCAGACATGTTTTCTGTGTCCACGGATATAGACCAATATCGACTAGTAAGTCCTTCACGAGTGTCCGTAACCCCAACTGAGTCAAATTATCGTTTTACCCCTGGGTTACTTCTATTTCCTTAAGTACCAGTTCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTGTGGTCCAACTGTAACGCCTCGAAATTCCAAGGTAAAATTCTTTTCAAACCTTGAGTTAACTTCGAATTTAATTAATTCCTCGTGTTCGTATTATATATTTATATATTAAAATTTTGTCGGAATTTATTTTACCTTCATGAATTCTTGAATTTAAAGAATTAGGAGGGGAAGGTTGGAATGGTAGGGTCCAATTGTTAATTCCTTTGAAGATTAATTTGGACCTTAATTATAAAAGGAAACCCTAAGTGAATAAATGAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAAGAAAAGGAAGTAATCTTTTTTCCCTTTCAGCCGCCCACACAACCCCCCCTTCGTGCGTTTGCGTCTTCTTCCTCCAGCCACGGTCTCTCTCCCTCTCACCTTGCCGTCCGACTGCTGCCGCCTGAAGCTCCAGACGCCGTCGACCATTGAGCTGCCACCGTCCGTCGTGTGGTCCCAGCCCTCCGTCGCGCGCCGCTCAATCGCTCGTTGAGTTCGTCTCGCGCGCTTCGCTGCTGTTGTTCGAGTTGTTGTCGCCGCCTCACATCCTTGGAGTTTCAGCAGTGTGAGTATTGGCTGGAGTTGGGTACATTTTCTTGAGTTAGTTGTTTCCCATGTTGAGCTTTATCGTTGGTTTATTGGAGATTTAGATAACTCAATATGTTCGAAATTTAGTTTCAGCCTTAATCAGTCGTTCTCGGTGTTCAAGCTTCGGTTCTCAGCCATTTACGCTTCTGTCCAGCGAAGTGACTTAGATTGGGTAAGGTTCCTTGTTCGTTGAGTCCCATTCTTAGTTTTGTTGTTAATCGAAGCTAACCCATTCCCTATTGAACCCGATTTTGTGTTACCCATTCGTTTTTGGGTTGAAAATTTCAGAGTTTAGCTATTCGGAGGTGCTGTCCAGTAGAGATTGAGGCTAGTTTTCGAGTGGGTCTTTGTGTTGTGTGCTTTATTTGGCTAAGAATAAGGAGAGGTCTTAAAGGAAGGAATTGGTGAGTTGTTCTCATTTGAGTTTAGGTAATTTATCGACTGAACCTACTTCCAAATTTTCAACTTAAGTGTTTGACTTTACAGATTGTGATGTATTGTAGGTTCGAAAGGAGATTTTGTTTGGGAGGTTGTTGGTTGTGTGGTTGCGTTGGTTGCTAATTCAGGTAAGTGACCTTACTACTAGGAGGCTTATGCTAGGTTGGGAACTGTGTGTTGGTGGCATAAGCTTCATGCGTGAACTTTTCTTATGTATGTGACTCATGCTATAAGATGTTGTGTACTTATGGATATATGAGTGATTGAGGAGGATCTATGTTGTTACGCTGCTGTGCATGTATGAAGTTAATGTGCCTGAGGGGGAAAAATGCCTCATGATATAGTTTTATGCTGCATTTATAACATATGATAGATTGTTGTGGGACTGCATGCATAAATATGATGTTTTTTCTTATGAACCTTAAATGTTTGCATGACAATTACCTTAGAGGAAAAAAAAACTTGATGTACATCTAGAGGAAAGTATGGTATTGATAGGCTAGACTTGCCTCCTACTAATTGGGTGCCAACTAACCGTTAGA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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGGATGATGGGAATTTTAATCTTAATGCATTTTTTGATGACCCTCTGTTTGACAATGAGCTGATAGATATAGATTTGCCTGATTTTGAAAATGAATTGGAATTACCTGCTTTTGAGAATGAAATGTCTGCAATTGATGATTTGCCTAATTTTGAAAATGAGATAGAAATGCCTGAAGTTGATGATTTGTCTGACTTTGAGAATGAGCTTGAAATGCCTGCGTTAGATAATGAGCATGATTTCCATGGAGATGATTACTTGATAGATGATAATTTTGAGTCTGATCATGATAATGCTGAATCTATCGAGTCTGATCCAGATGAATATAGAACTCACAGTTGCACTCTTATCACTGCAGACATGTTTTCTGTGTCCACGGATATAGACCAATATCGACTATACCAGTTCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTGTGGTCCAACTGTAACGCCTCGAAATTCCAAGCTTCGGTTCTCAGCCATTTACGCTTCTGTCCAGCGAAGTGACTTAGATTGGAGTTTAGCTATTCGGAGGTGCTGTCCAGTAGAGATTGAGGCTAGTTTTCGAGTGGGTCTTTGTGTTGTGTGCTTTATTTGGCTAAGAATAAGGAGAGGTTCGAAAGGAGATTTTGTTTGGGAGGTTGTTGGTTGTGTGGTTGCGTTGGTTGCTAATTCAGGTAAAGGCAAAGGCGTTCAAGAGTTCTGCTGTATTGATACCCCCGCTGGCATGTCTCCTACATGGACGCCTTGGATCAATACGTCTGTATCGAATACAAAGCGGGTCGTATCACATAGCGTTACCAGGATAAGATATAGACCTATACCAGATACCCCTACTAGCATGTCTACTACATGGACGCTTTGGATCAATACGTCTGTATCAAATACAAAGCGGGTCGCATCTCATAGTGTTACCAGGATAAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTATGTGACACGGCCCACCTGTTATTCGATACAGATGCAATGATCCAAAGCATCCATGTAGGAGACATGCGGGTGGGGGTATCCTATGCAATGAGAGGGACTGTCCTTAGATTTGTATGGGACCCCTGGGGTGGGGTGAAAGGTATCCCATTCATTCTCCTACTCTCAGAGAATTCTCCCAAAGGCTCCCACAAGTCTCCTGCCTCTAGAAGTCTCAGAGTCATACCGGTAAATTGCGACGCTGTCACGATTACAGCACGCGCTAGAAATTCGCAACAGGACGGTTCAAGGCTGTTGGGCGGTCCGATTCACGCGGTCTGGCTGGGCTGGGACCAATTTGTTCCGGTTCAGCTGGAATTTAGCTCGGTTCGTGATTTTCGTAGCTGGTTCGAAGTGGTTCGGGTTGGTTCGGGCGGTCTAGACCAGTATTTGGAGCTGCAGAAGGACTTTAAGGATAGAATATAG

Protein sequence

MDDGNFNLNAFFDDPLFDNELIDIDLPDFENELELPAFENEMSAIDDLPNFENEIEMPEVDDLSDFENELEMPALDNEHDFHGDDYLIDDNFESDHDNAESIESDPDEYRTHSCTLITADMFSVSTDIDQYRLYQFSSNEQPVCGPTVTPRNSKLRFSAIYASVQRSDLDWSLAIRRCCPVEIEASFRVGLCVVCFIWLRIRRGSKGDFVWEVVGCVVALVANSGKGKGVQEFCCIDTPAGMSPTWTPWINTSVSNTKRVVSHSVTRIRYRPIPDTPTSMSTTWTLWINTSVSNTKRVASHSVTRIRDKAGYLILVTLCDTAHLLFDTDAMIQSIHVGDMRVGVSYAMRGTVLRFVWDPWGGVKGIPFILLLSENSPKGSHKSPASRSLRVIPVNCDAVTITARARNSQQDGSRLLGGPIHAVWLGWDQFVPVQLEFSSVRDFRSWFEVVRVGSGGLDQYLELQKDFKDRI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spg011044.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg011044.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg011044.1 vs.
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BLAST of Spg011044.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg011044Spg011044gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg011044.1-cdsSpg011044.1-cds-scaffold4:27966411..27966645CDS
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Spg011044.1-cdsSpg011044.1-cds-scaffold4:27968147..27968172CDS
Spg011044.1-cdsSpg011044.1-cds-scaffold4:27968304..27968428CDS
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Spg011044.1-cdsSpg011044.1-cds-scaffold4:27973689..27973786CDS
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
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